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時至今日，我們體內許多細胞類型的工作方式，科學家們依然不清楚，比如對于保護機體不會患上嚴重疾病的免疫細胞。 DNA染色質的內部組織影響了每個細胞的功能，包括基因表達、DNA復制和DNA修復在內的一些基本的細胞過程。很久以前，人們就注意到易接近的染色質標記了一些調控序列，如啟動子、增強子、絕緣子和位點控制區域。這些元件與細胞類型特異性的轉錄因子互作，執行了一些指導細胞命運決定和發育的轉錄程序。 但是要了解“染色質可接近性”并不容易，ATAC-seq可以通過使用高通量測序對染色質可接近性核染色質區域進行分析，然而由于技術問題，在單細胞水平（scATAC-seq）進行的研究很少。 來自Sanger研究院的一組研究人員提出了一種簡單而強大的scATACseq新方法，可以觀測器官和組織內的微小單細胞。 這一研究成果公布在Nature Communications雜志上，由Sanger研究院發Kedar Nath Nataraj......閱讀全文
近年來，深度學習等人工智能技術在圖像識別，自然語言處理等領域取得了令人矚目的成就。人工智能技術應用于生命科學，對生物信息多個領域產生了重大的影響。深度學習算法借助于生命科學大數據的飛速發展，從海量大數據中自動高效地提取特征進行學習，極大超越了依賴人工提取特征的傳統人工智能算法，在醫療圖像處理、結
截止2020月7月27日，中國學者在Cell，Nature 及Science 發表了共計102項生命科學的研究成果，其中新冠肺炎領域占了近一半（共43篇）。iNature系統總結了這些研究成果： 按雜志來劃分：Cell 發表了30篇，Nature 發表了45篇，
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞轉錄
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞
麻省綜合醫院（MGH）、MIT布羅德研究所、哈佛大學近日在Science雜志上發表了一篇文章（3月31日），使用單細胞RNA測序技術，并結合癌癥基因組圖譜分析了星形細胞瘤（astrocytomas）和少突神經膠質瘤（oligodendrogliomas）兩種腦神經膠質瘤（gliomas）的細胞組
新一代測序 新一代測序(NGS)技術一路走來，逐漸褪下其神秘面紗，進入越來越多的實驗室。隨著時間的推移，NGS系統從“高端大氣上檔次”的大型平臺演化成滿足個性化需求的臺式測序儀。MiSeq、Ion Torrent和454 GS Junior這些儀器的上市，也推動了測序平臺的普及。同
2019年8月27日，北京大學分子醫學研究所，北京大學-清華大學生命科學聯合中心研究員何愛彬研究組在Molecular Cell雜志在線發表題為“CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling”的文章，報道了一種新的具有普
解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而，T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊，以便識別特定的外源蛋白，引發有效的免疫反應。 為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析，Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –
Aviv Regev是一位生物分析專家。現在，她正致力于繪制人體的每一個細胞。 計算生物學家Aviv Regev喜歡做一些看似不可能完成的任務。2011年，她與分子遺傳學家Joshua Levin合作，測試了RNA測序的幾種方法。科學家們在測試幾種技術的極限，以查看哪種方法表現最佳。他們用降解
俗話說，十年是個風水嶺，單細胞轉錄組技術發展至今十年間，在促進對生物學和疾病的認識上發揮出的巨大潛力有目共睹。那么，十年間單細胞轉錄組是如何發展至今的？又取得了哪些新的進展呢？今天，讓我們跟隨Sarah Aldridge和Sarah Teichmann兩位大神，一起來回顧單細胞轉錄組學技術十年發
單細胞三重組學測序技術（scTrio-seq）單細胞中三種組學之間的對應關系癌癥中兩個細胞亞群的DNA拷貝數差異 2016年2月23日，《細胞研究》（Cell Research）雜志在線發表了北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組、黃巖誼研究組和首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院暨北京大
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
Burroughs Wellcome 基金獎項設立以來一直堅持其宗旨：促進醫學科學家的學術研究，特別是發展資金不足的領域，給予全球最有前途的研究人員大力支持，以開拓未知領域的創新研究。今年，該組織將醫學獎（BWF CAMS）授予了醫生Charles Gawad博士。以表彰他在斯坦福大學的研究項目
去年Nature Methods盤點值得期待的技術中，就有單細胞測序，今年Science盤點更是將這一技術列為2013科研熱點的榜首。近期兩個研究組分別在Science，Nature Methods雜志上公布了單細胞測序技術的最新進展，分別介紹了這種“Solitary Sequencin
本文中，小編整理了多篇研究報道，共同聚焦科學家們在測序研究領域取得的新成就，與大家一起學習！圖片來源：Nature 【1】Nature：中國科學家使用單細胞測序來揭示人類胚胎植入的秘密 doi：10.1038/s41586-019-1500-0 近日，中國多家機構的一個研究團隊利用單細胞測
自2006年在全世界第一個實現單細胞全基因組測序，華人科學家張鹍教授在單細胞測序領域的研究一直處于全球領先地位。2018年11月，張鹍教授團隊因在單細胞研究領域的杰出貢獻，榮獲美國國立衛生研究院（NIH）兩項共計1400萬美元的研究基金，用于構建單細胞水平的人體器官3D圖譜，推動精準醫學進入單細
多年來，跟蹤一個單細胞的轉錄組，超出了我們的能力。但是現在，時代已經變了，新的單細胞RNA-seq方法，可以分析大量的細胞及它們的命運 多年來，跟蹤一個單細胞的轉錄組，超出了我們的能力。但是現在，時代已經變了，新的單細胞RNA-seq方法，可以分析大量的細胞及它們的命運。 我們都參加過大型生日派
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”，不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性，可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中，每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性，腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式（即“代謝重編程”）來適應不同的微環境，以滿足其對能量
本文中小編整理了多篇文章，來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力，與各位一起學習！ 【1】JAMIA：新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物 doi：10.1093/jamia/ocw022 科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上
世界上沒有兩片完全相同的葉子，細胞也是。然而，科學家們在進行現代生物學研究時，大多時候都考察的是細胞群體，而忽略了細胞異質性。 就拿神經細胞來說，大腦中有億萬個神經細胞，這些神經細胞在細胞形態，突觸連結，細胞結構，電生理以及生理功能上具有高度的多樣性。不同種類的神經細胞中，其基因組、蛋白組、化
世界上沒有兩片完全相同的葉子，細胞也是。然而，科學家們在進行現代生物學研究時，大多時候都考察的是細胞群體，而忽略了細胞異質性。 就拿神經細胞來說，大腦中有億萬個神經細胞，這些神經細胞在細胞形態，突觸連結，細胞結構，電生理以及生理功能上具有高度的多樣性。不同種類的神經細胞中，其基因組、蛋白組
近日，Bio-Rad公司和Illumina公司達成合作協議共同開發針對單細胞的新一代測序工作站，單細胞分析領域在過去幾年里發生著翻天覆地地變化，而兩家公司的這項合作也將會對很多競爭性技術的企業帶來一定影響。 Illumina公司 CEO Jay Flatley在本周舉辦的摩根大通
近年來，隨著精準醫療的發展，癌癥治療已經取得了長足的進步，其中借助免疫系統開發的多種治療方法被人們寄予厚望。雖然部分治療方法在臨床治療中已經獲得一定的成功，但大多數只對部分患者有效，并且還會導致耐藥、超進展以及免疫相關嚴重不良反應等問題。因此，了解免疫系統在癌癥治療中的表現，準確篩選最有可能獲益
澳大利亞加文醫學研究所的科學家開發了一種新的單細胞測序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），該方法兼備高通量、靶向、長讀長和單細胞測序特征，能夠高準確度和靈敏度的識別全長抗原受體序列，追蹤與癌癥免疫反應相關的免疫細胞。7
短短一個月內，齊碳科技、華大智造、塞納生物先后宣布完成融資。國產基因測序儀再一次沖上了醫療健康領域的熱點話題。 多年來，測序儀行業一直處在少數幾家國外巨頭的壟斷之下。華大智造近兩年的頻繁動作雖然吹響了國產測序儀反攻的號角，但是從目前的市場占有率上看，想要最終實現進口替代，可能還需要些時間。
要談測序，首先要向華人生物學家、DNA測序技術的奠基人吳瑞先生致敬。大家大多都聽過桑格，但很少有人知道吳瑞。其實吳瑞早在1968年就發表第一篇論文測定了DNA的堿基組成，1970年的新文章既測定DNA堿基組成又測定出順序，是真正的DNA測序第一人。而在吳瑞先生工作的啟發下，Sanger深入研究，
2018年11月，Namocell與CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞，并且將其進行單細胞測序，為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序（scRNA-s
每個細胞都是獨一無二的，但我們的研究對象往往是細胞群體，忽略了這些細胞之間的異質性。正因如此，單細胞基因組學研究受到了越來越多的關注。 單細胞基因組學領域近年來發展得非常迅速，為人們揭示了復雜生物學體系的許多重要線索，包括微生物群落的生態多樣性和人類癌癥的基因組。一月二十五日Nature Re
多年來，跟蹤一個單細胞的轉錄組，超出了我們的能力。但是現在，時代已經變了，新的單細胞RNA-seq方法，可以分析大量的細胞及它們的命運。 我們都參加過大型生日派對：在擁擠的房間里，與許多人聊天、吃飯和慶祝。但是，試想你并不知道壽星是誰，只是像一個局外者看待這個派對。你可能會覺得整個事件看起來與