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  • 細菌RNA制備實驗——革蘭氏陰性細菌中提取

    實驗材料RNA試劑、試劑盒STET氯仿乙酸鈉氯化銫無水乙醇EDTA儀器、耗材離心機分光光度計搖床實驗步驟1. 培養100 ml 大腸桿菌或500 ml 藍細菌至對數生長期,加入1/20體積終止緩沖液,置于冰上。2. 于4℃用JA-10轉子17 700 g 離心5 min 收集細胞。3. 用2 ml STET裂解液重懸細胞,加入100 μl 0.2 mol/l 的VRC,移入15 ml 聚丙烯管子。4. 加入1 ml 緩沖液平衡酚,振蕩1 min 再加1 ml 氯仿,振蕩1 min,于4℃用JA-17轉子10 000 g 離心10 min,收集水相。5. 加入1/10體積3 mol/l 乙酸鈉和2倍體積冰冷無水乙醇,于4℃ 10 000 g 離心10 min。6. 用2 ml 0.2 mol/l VRC溶液重溶沉淀。7. 用1:1酚/氯仿抽提2遍后......閱讀全文

    細菌RNA制備實驗

    革蘭氏陰性細菌中提取 革蘭氏陽性細菌中提取 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試

    細菌RNA制備實驗

    實驗材料 RNA試劑、試劑盒 STET氯仿乙酸鈉氯化銫無水乙醇EDTA儀器、耗材 離心機分光光度計搖床實驗步驟 1. ?培養100 ml 大腸桿菌或500 ml 藍細菌至對數生長期,加入1/20體積終止緩沖液,置于冰上。2. ?于4℃用JA-10轉子17 700 g 離心5 min 收集細胞。3.

    細菌RNA制備實驗——革蘭氏陰性細菌中提取

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    采用Trizol-溶液提取細菌總RNA

    實驗概要了解用Trizol 溶液提取細菌總 RNA的方法。實驗原理Trizol主要物質是異硫氰酸胍,它可以破壞細胞使RNA釋放出來的同時,保護RNA的完整性。加入氯仿后離心,樣品分成水樣層和有機層。RNA存在于水樣層中。收集上面的的水樣層后,RNA ?可以通過異丙醇沉淀來還原。無論是人、動物、植物還

    羅紅霉素如何影響細菌的RNA合成?

      羅紅霉素通過抑制細菌蛋白質的合成來發揮作用。  羅紅霉素屬于大環內酯類抗生素,它的主要作用機制是與細菌的50S核糖體亞單位結合,阻止氨酰tRNA與核糖體結合,進而抑制了細菌蛋白質的合成。由于這一作用,羅紅霉素對多種細菌都有良好的抗菌活性,特別是對某些革蘭陽性菌和一些革蘭陰性菌。

    反義RNA的調控細菌基因的表達功能

    反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補,因此在體外mic

    反義RNA調控細菌基因的表達功能介紹

      反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來,和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補,因此在體外m

    水生所揭示細菌RNA代謝調控新機制

      近日,中國科學院水生生物研究所張承才團隊關于細菌中RNA代謝調控機制的研究取得了進展。相關研究成果以《藍藻中RNase E受一個保守蛋白調控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in

    新發現!細菌RNA代謝調控新機制

      近日,中國科學院水生生物研究所張承才團隊關于細菌中RNA代謝調控機制的研究取得了進展。相關研究成果以《藍藻中RNase E受一個保守蛋白調控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in

    BIOG細菌RNA提取試劑盒使用說明

    特點◎提取RNA純度高,無抑制劑,A260/A280為1.8-2.0;◎產率高,同樣的樣本量提取的RNA更多。◎不含苯酚和氯仿等有毒溶劑,安全無毒。◎對于革蘭氏陰性菌和一般的革蘭氏陽性菌有較好的提取效果。試劑盒組成 組分 50次

    科學家發現首個細菌中的RNA修復系統

      美國伊利諾伊大學香檳分校生物化學系教授Raven H. Huang及其同事首次在細菌中發現了RNA修復系統。這是迄今為止發現的第二個RNA修復系統,第一個為噬菌體(可攻擊細菌的一種病毒)中的帶有2個蛋白的RNA修復系統。相關文章發表在本月的美國《科學》雜志以及《美國國家科學院院刊》上。  

    RNASeq,區分細菌和病毒感染新工具

      在臨床治療中,準確鑒定細菌感染和病毒感染至關重要,這關系到治療干預方案選擇和抗生素耐藥隱患預防。  例如下呼吸道感染(lower respiratory tract infections,LRTIs),不同病原體引起的不同疾病有著相似的臨床癥狀,讓醫生很難做出正確診斷。  如今,羅切斯特大學醫學

    抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗

    一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒儲

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    抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗

    實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料 N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒 儲存液緩沖液儀器、耗材 蛋白胨培養基蛋白胨平板N-表達質粒組合文庫培養板實驗步驟 ―、材料與設備1. 通過比較 β-半乳糖苷酶表達

    ATM機器究竟暗藏多少細菌?讓RNA測序來告訴你

      比起在銀行柜臺排隊取錢,使用自動柜員機(ATM)算是一種非常便捷的方式。不過,大家要小心,ATM可是暗藏了不少的細菌。近日,紐約大學的研究人員對紐約市多臺ATM鍵盤上的細菌和真菌進行測序分析,發現了一系列微生物代表,不過總體多樣性較低。  紐約大學的Maria Gloria Dominguez-

    研究發現非編碼RNA控制高毒力超級細菌感染致病

      8月13日,中國科學院上海免疫與感染研究所晁彥杰研究組在《自然-通訊》(Nature Communications)上發表了題為RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae  reveals a small RNA inhibito

    武漢病毒所在病原細菌小RNA調控機制研究中取得進展

      小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是細菌重要的轉錄后調控因子,廣泛參與調控細菌各方面的功能。由于不同sRNA調控的靶標及其調控機制不相同,多數已鑒定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的調控靶標及調控機制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物

    細菌提質粒最后一步為什么要加入無rna酶得水

    只要是純水就可以了,在無金屬離子輔助下,DNA酶一般不起作用。要沒RNA酶,可能是為了之后的實驗考慮吧

    中科院團隊發現抑制高毒力超級細菌感染致病的非編碼RNA

      近日,中國科學院上海免疫與感染研究所晁彥杰研究組在《自然-通訊》(Nature Communications)上發表了題為RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae reveals a small RNA inhibitor of

    RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)

    1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果

    RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)

    早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由

    RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)

    基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育

    RNA提取時RNA降解原因

    1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存

    定量PCR方法對水源中細菌RNA進行精確定量-人elisa試劑盒

    ?定量PCR方法對水源中細菌RNA進行精確定量 人elisa試劑盒前 言水源中病源微生物的存在情況與人類健康息息相關(21,28)。傳統的細菌培養檢測方法不僅耗時,而且無法確定細菌的存活情況;PCR方法的應用便使上述問題得到了解決,并由此發展出多種針對水體病源微生物的檢測方法(7,9,13)。但由于

    RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)

    一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后

    反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)

    最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA

    RNA分離與分析實驗_分離RNA

    實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60

    RNA干擾相關知識RNARITS)

    RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。

    RNA干擾相關知識RNARISC

    RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。

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