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    生物信息分析數據挖掘

    DNA芯片技術能夠在基因組水平分析基因表達,檢測許多基因的轉錄水平及在不同條件下的基因轉錄變化,顯示反映特征組織類型、發育階段、環境條件應答、遺傳改變的基因譜。基因芯片產生了海量的數據,僅僅進行差異表達分析還遠遠不夠,如何管理分析這些數據、從中挖掘信息已經成為利用這一技術的新的難點。芯片數據大量出現,新的問題隨之而來。如果將所有獲得的數據集中起來,我們能否將未知功能的新基因歸類到已知功能分類中?能否將基因表達與基因功能聯系起來?能否發現新類型的共調控基因?能否從芯片表達數據中得出完整的基因調控網絡?為了解決這些問題,聚類分析這種統計方法在生物芯片數據研究方面得到廣泛應用。一旦通過實驗確定了表達水平,接下來的聚類分析主要是找到那些有相似表達模式的基因(共表達基因)。因為許多功能相關的基因具有相似的表達模式,例如編碼蛋白質復合物的基因很可能有相似的表達模式,通過這些共表達基因的尋找可以對一些未知基因的功能研究給予提示。另外,共表達基......閱讀全文

    陳潤生院士等獲頒中國生物信息學終身成就獎

      9月27日,第九屆全國生物信息學與系統生物學學術大會在上海開幕。在為期2天半的會議期間,來自全國各地的700余名專家學者代表,將圍繞“新冠病毒研究與轉化醫學信息學”“單細胞組學分析方法與應用”“人工智能與生物信息學”和“腦科學與生物信息學”等生物信息學諸多傳統與新興領域進行研討與交流。  中國科

    臨床精準醫療必須重視的新興科學:臨床生物信息學

       由世界最大出版社“施普林格-自然”2016年出版的“臨床生物信息學的應用”在短短幾個月被下載近萬次,引起國際同行的廣泛重視和密切關注。該書融臨床信息學、醫學信息學、遺傳信息學、生物信息學和系統生物學為一體,詳細和系統地闡述了基因組學、蛋白組學、基因測序、基因表觀學、代謝組學、計算機數學、大數據

    腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能

      近年來,隨著測序技術的迅猛發展,單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質進行檢測,從

    從一代到四代,基因測序漸成生命密碼解讀者

      基因測序行業發展迅速,二代測序為主流技術。  當下,一代基因測序技術由于通量較低、測序時間較長,已經不能滿足研究應用的需要,以高通量低成本為特征的二代測序技術為目前應用最廣泛的測序技術,測序時間相較于一代技術大大降低。  基因測序作為精準醫療的重要一環,隨著技術的進步以及成本的下降,近年來發展迅

    專訪李廈戎:一個在生物領域創業的數據控

      李廈戎稱自己為數據控,他致力于機器學習算法和分布式系統的實際應用。目前他正在生物數據領域創業,創辦聚道科技(Genedock),希望用數據技術推動生命健康行業革新。李廈戎曾在中國最大的移動數據服務平臺友盟工作,他作為首席數據科學家,帶領團隊針對移動數據特點,構建了面向數十億移動設備的ID映射和用

    鄭洪坤:“云模式”引領基因科技服務 2.0 時代

      生物信息和科技服務行業正在經歷從1.0時代向2.0時代的變遷。在這個變遷的浪潮下,生物科研工作者,科技服務從業人員都面臨著哪些挑戰和機遇?從業十五年的百邁客CEO鄭洪坤認為:云模式,才是打開基因科技服務2.0時代的正確方式。  基因科技服務1.0時代:測序數據少,分析以標準分析為主且主要由服務公

    張玉奎院士等專家在2012年北京色譜年會上作大會報告

      2012年12月07日,北京,2012年北京色譜年會熱烈召開。促進了北京地區色譜以及色譜相關領域的技術應用與交流。圍繞“色譜新技術及其應用”的主題,展開多場報告,內容包括蛋白質組學、色譜技術、色譜與質譜、色譜與核磁共振、金屬組學、代謝組學、生物氣味研究、環境分析等。中國科學院大連化學物理研究所張

    生物芯片有哪些分類

    全球首個生物芯片產品問世雖然已有20多年的時間,但生物芯片分類方式仍沒有完全統一的標準。比較常見的分類方式有3種,分別是按用途、作用方式和成分來分類。(1)用途分類生物電子芯片:用于生物計算機等生物電子產品的制造。生物分析芯片:用于各種生物大分子、細胞、組織的操作以及生物化學反應的檢測。生物電子芯片

    向50年創新致敬, 一覽質譜領軍者的風采

      -訪賽默飛中國區色譜和質譜業務高級商務運營總監李劍峰賽默飛中國區色譜和質譜業務高級商務運營總監李劍峰(左)和分析測試百科網總經理卞利萍女士(右)  今年是賽默飛質譜業務成立50周年,在第三屆全國質譜分析學術報告會上賽默飛展出了向創新歷史致敬的一系列內容,參會者隨處可感受到紅色慶典的濃郁和熱烈。分

    生物醫學基因大數據:現狀與展望

      生物醫學大數據廣泛涉及人類健康相關的各個領域:臨床醫療、公共衛生、醫藥研發、醫療市場與費用、個體行為與情緒、人類遺傳學與組學、社會人口學、環境、健康網絡與媒體數據。  大數據(big data)是指由于容量太大和過于復雜,無法在一定時間內用常規軟件對其內容進行抓取、管理、存儲、檢索、共享、傳輸和

    中國學者建立首個一站式蛋白質組數據分析云系統Firmiana

      隨著蛋白質組學的飛速發展,其在生命科學和生物醫藥領域的重要作用和應用前景已經日益明晰。由此產生出的海量蛋白質組數據為蛋白質組解析和分析提出了更高的要求。然而,當今領域內蛋白質組產出大數據的實時、全面分析和知識挖掘能力成為了制約蛋白質組技術應用的瓶頸。遺憾的是,目前尚無平臺能夠完成從質譜原始文件收

    國家基金委八大學部公布“優先發展領域及主要研究方向”

      “十三五”期間,通過支持我國優勢學科和交叉學科的重要前沿方向,以及從國家重大需求中凝練可望取得重大原始創新的研究方向,進一步提升我國主要學科的國際地位,提高科學技術滿足國家重大需求的能力。各科學部遴選優先發展領域及其主要研究方向的原則是:  (1)在重大前沿領域突出學科交叉,注重多學科協同攻關,

    人工智能與數據挖掘驅動的腫瘤新藥研發

      人工智能作為一種旨在模擬、延伸和擴展人的智能的科學,人工智能正在以前所未有的廣度和越來越快的速度改變著世界的面貌。而在普瑞基準創始人季序我和梁晗看來,人工智能可以幫助我們更好地回答那些醫學中最為本質的問題,對于新藥研發、臨床診療和醫學基礎研究,都有著不可估量的價值。 道路  在癌癥診治的過程中,

    基因表達譜數據聚類分析相關內容

    DNA微陣列基因表達數據分析 對于基因表達譜數據的分析是生物信息學 的研究熱點和難點。轉化為數學問題,分析任務是從數據矩陣 M 中找出顯著性結構,結構類型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。對基因表達譜數據的分析是數據挖掘問題,所采用的方法包括通過可視

    2012中國醫學科學院蛋白質組學研討會大會報告

      中國醫學科學院藥物研究所 再帕爾研究員  來自中國醫學科學院藥物研究所的再帕爾·阿不力孜教授帶來了題為《基于LC-MS/MS技術的代謝組學分析方法研究與應用進展》的報告。   再帕爾教授首先對比了NMR、LC-NMR與LC-MS、GC-MS在代謝組學分析當中的優缺點,發現在代謝組學復雜樣本體系的

    基因檢測如果是支點,那桿杠呢?

      阿基米德曾經說過:“給我一個支點,我可以撬動地球。”筆者認為,未來健康行業的支點就是基因檢測,誰能找到合適的支點,就有機會撬動“地球”。但是,支點有了,撬動健康行業的桿杠呢?抬動桿桿的那只“無形的手”又在哪里呢?筆者會從三個方面來聊聊這個話題:“沒有唯一的支點”,“桿杠的效應”,“抬起桿杠的手在

    生物芯片實驗信號檢測及數據處理

    芯片實驗完成后,芯片就可以放人商品化的生物芯片掃描儀中進行掃描、識別、提取和分析(掃描儀的操作根據商家提供的具體操作執行)。掃描儀得到圖像后,必須對數據進行提取,才能進行后續的數據分析。圖像處理和數據分析是基因芯片研究的核心技術之一。對于SNP實驗結果分析較簡單,而對于基因表達譜研究、CGH分析及高

    科技部發布《“十三五”中醫藥科技創新專項規劃》

      分析測試百科網訊 近日,按照《中華人民共和國國民經濟和社會發展第十三個五年規劃綱要》、《“十三五”國家科技創新規劃》、《“健康中國2030”規劃綱要》等總體部署,為加快推進中醫藥科技創新發展,科技部特制定《“十三五”中醫藥科技創新專項規劃》:   “十三五”中醫藥科技創新專項規劃  中醫藥蘊含著

    化學藥研發實驗室信息化解決方案

      來源:研發創新平臺   iLabPower研發創新平臺可對化學藥研發實驗室的項目、人員、化合物信息、樣品信息、譜圖信息、實驗方案/記錄、化學/生物試劑、儀器/耗材等實現全面的數字化管理,建立統一高效的數字化創新平臺。解決了傳統管理模式對研發創新帶來的阻礙,引領實驗室研發模式的變革,更重要的是為

    化學藥研發實驗室信息化解決方案

      實施效果   來源:研發創新平臺   iLabPower研發創新平臺可對化學藥研發實驗室的項目、人員、化合物信息、樣品信息、譜圖信息、實驗方案/記錄、化學/生物試劑、儀器/耗材等實現全面的數字化管理,建立統一高效的數字化創新平臺。解決了傳統管理模式對研發創新帶來的阻礙,引領實驗室研發模式的變

    六部門印發《“十三五”衛生與健康科技創新專項規劃》

      分析測試百科網訊 近日,按照《中華人民共和國國民經濟和社會發展第十三個五年規劃綱要》、《“十三五”國家科技創新規劃》、《“健康中國2030”規劃綱要》等的總體部署,為進一步完善衛生與健康科技創新體系,提升我國衛生與健康科技創新能力,顯著增強科技創新對提高公眾健康水平和促進健康產業發展的支撐引領作

    美吉I-Sanger生信云樹立科研服務云平臺金標準

      云技術革命正迅速改變科研領域的生產方式和服務模式,以美吉生物I-Sanger為代表的生信云平臺,經過不懈探索努力和自身數萬科研用戶服務實踐,提出生信云平臺應具備的社會責任,以去中心化的設計理念,通過強大、快捷的交互功能,免費為客戶提供無限次的數據分析和增值服務體驗,致力于“讓人人都成為生信專家”

    "萬種原生生物基因組計劃"在武漢啟動

       “萬種原生生物基因組計劃”30日在武漢啟動。該計劃由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起,旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規模的原生生物遺傳資源數據庫。圖片來源于網絡  原生生物

    "萬種原生生物基因組計劃"啟動

      “萬種原生生物基因組計劃”30日在武漢啟動。該計劃由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起,旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規模的原生生物遺傳資源數據庫。  原生生物主要是由單細胞真

    GEN:大數據挖掘對癌癥治療的四大影響

      2016年1月在瑞士達沃斯召開的世界經濟論壇上的一個panel討論中,美國副總統Joe Biden當場要求臨床醫生和研究者舉例表示人類在抗擊癌癥中突破的障礙。當幾個重要話題浮現時,最重要的議題是“大數據”,具體而言,即“大數據”的收集、分析和應用。  研究者表示:“大數據”是有效的,這是因為有重

    EBioMedicine:鑒別出750多個生物標志物 助力癌癥早期篩查

      近日,刊登在國際雜志EBioMedicine上的一項研究報告中,來自英國謝菲爾德大學的研究人員通過研究在血液中鑒別出了788個生物標志物(Biomarkers),這些生物標志物或可用于開發針對一般人群的早期癌癥篩查測試技術。文章中,研究者表示,他們首次創建出了相關的癌癥血液生物標志物的全面列表,

    一步一步教你使用NCBI數據庫資源2

    6 基因組信息6.1 數據庫6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome數據庫收錄了850多種微生物、3100多種病毒以及1600多種真核生物細胞器的完整基因組數據以及將近50種動物、綠色植物和真菌的700多條染色體信息,總共收錄有6200多條序列,其中有882條是去年新增的序列

    2017年度國家杰青科學基金建議資助項目申請人名單發布

      根據《國家杰出青年科學基金項目管理辦法》的有關規定,現將2017年度國家杰出青年科學基金建議資助項目申請人名單予以公布。  建議資助項目申請人有違反《國家自然科學基金條例》《國家杰出青年科學基金項目管理辦法》或其他學術不端行為的,任何單位和個人均可在15日內(8月4日——8月18日)向國家自然科

    布魯克推出用于生命科學等領域的最新質譜技術及解決方案

      2014年6月16日,巴爾的摩,馬里蘭州——今天,在第62屆美國ASMS質譜年會上,布魯克公司(NASDAQ: BRKR)宣布推出多款質譜產品,這些產品除了能在應用市場和工業化市場發揮作用外,還可應用于生命科學研究、蛋白質組學研究、臨床研究等領域,另外,它還能為制藥/生物制藥/ CRO的客戶提供

    走好臨床質譜最后一公里 第4屆液質臨床應用培訓班閉幕

      分析測試百科網訊 2019年4月23-25日,由復旦大學附屬中山醫院檢驗科主辦,復旦大學生物醫學研究院 中國醫藥教育協會檢驗醫學分會 、上海市生物醫學工程學會檢驗醫學專業委員會 和美國臨床質譜協會(MSACL) 協辦的“國 家 級 I 類 繼 續 教 育 學 習 班 -第四屆液相色譜–質譜技術臨

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