單細胞測序——“刻畫”肝癌免疫微環境的動態特征
肝細胞癌是世界范圍內死亡率排名第三的癌癥，其中中國的肝癌發病率居世界之首【1】。HBV的慢性感染是中國肝細胞癌發生的主要原因，其感染導致腫瘤微環境常伴隨慢性炎癥。免疫逃逸被認為是癌癥發展的標志之一，目前研究表明，腫瘤存在多種免疫逃逸機制，提出了研究腫瘤微環境中不同免疫細胞狀態的重要性【2】。而單細胞測序技術則是研究不同類型免疫細胞的狀態和動態的有力手段。 2019年10月31日，北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）張澤民教授、任仙文副教授聯合首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院彭吉潤教授以及勃林格殷格翰公司劉康博士，在Cell上發表了題為Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma的研究論文，結合10x Genomics和SMART-seq2兩種單細胞RNA測序技術......閱讀全文
單細胞測序——“刻畫”肝癌免疫微環境的動態特征
肝細胞癌是世界范圍內死亡率排名第三的癌癥，其中中國的肝癌發病率居世界之首【1】。HBV的慢性感染是中國肝細胞癌發生的主要原因，其感染導致腫瘤微環境常伴隨慢性炎癥。免疫逃逸被認為是癌癥發展的標志之一，目前研究表明，腫瘤存在多種免疫逃逸機制，提出了研究腫瘤微環境中不同免疫細胞狀態的重要性【2】。而單
單細胞RNA測序發現新的免疫細胞
最近在《Nature Immunology》發表的一項新研究，詳細檢測了一組新發現的免疫細胞（被稱為ILC）。通過對單個扁桃體細胞的基因表達進行分析，瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們，發現了三個以前未知的ILC子群，并揭示了關于“這些細胞在人體中如何發揮功能”的更多信息。 先天淋巴細胞（ILC）是
空間多位點測序，提供肝癌評估和免疫分型新思路
近日，上海交通大學醫學院附屬仁濟醫院肝臟外科/肝移植中心杭化蓮團隊和上海市腫瘤研究所王存團隊合作，在《基因組醫學》（Genome Medicine）和《信號轉導和靶向治療》雜志（Signal Transduction and Targeted Therapy）發表系列論文，提出評估肝癌瘤內異質性新方
雙RNA測序技術
在發表于《自然》（Nature）雜志上的一篇研究論文中， 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制，以及在研究中獲得的重要發現
環狀 RNA 測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
核糖核酸（RNA）測序
RNA在細胞中的穩定性較差，在實驗中也更容易受到核酸酶的攻擊。因為RNA是由DNA轉錄產生的，所以信息已經存在于細胞的DNA中。然而，有時也需要對RNA分子進行測序。雖然DNA測序給出了生物體的遺傳圖譜，但RNA測序卻反映了細胞中活躍表達的序列。為了給RNA測序，通常的方法是首先對從樣品中提取的
“RNA測序”通用模板新突破
通過檢測血液或尿液中少量的RNA來診斷或治療疾病是一個新興領域。隨著技術的進步，研究人員可以對RNA片段進行測序，但不同的人使用不同的方法來測序RNA，有時會得到不同的結果，這是影響成功的一個重大障礙，使得此領域很難取得進展。近來，密歇根大學Tewari教授的實驗室領導了美國和荷蘭的9個實驗室
肝癌免疫治療新的途徑，肝癌患者新福音
?肝癌是世界上第六大常見癌癥，是全球第三大腫瘤死亡原因，全球約45%的肝癌都來源于我國。肝內膽管細胞癌（iCCA）是第二大原發性肝臟腫瘤（約占10%-15%），僅次于肝細胞肝癌。對于iCCA的治療十分有限，手術治療是iCCA唯一的潛在可治愈手段。但在手術后，iCCA有著很高的復發率，iCCA存在異質
一文讀懂測序技術、腸道菌群、肝癌免疫治療的三角關系
腫瘤免疫治療是腫瘤綜合治療模式中最活躍、最有前景的一種治療手段，Science將其評為2013 年“十大科學突破”之一。腸道是人體內最大的淋巴器官，存在超過70%的T細胞，是絕大多數記憶T細胞的居住地。腸道菌群可以通過直接物理接觸、代謝產物以及腸道粘膜結構成分改變等多種機制與宿主免疫系統相互作用