李勁松／陳子江／湯富酬實現核移植擴增人源精子的新方法
哺乳動物單倍體胚胎干細胞（haESCs）由于僅存在一組遺傳物質，因此是進行遺傳分析的理想工具。重要的是，當與CRISPR-Cas9技術結合使用時，雄激素性haESC（AG-haESCs）可以用作精子的替代品，并在生物水平上用于破譯基因功能。然而，迄今為止，只能在嚙齒動物中獲得AG-haESCs 。 2019年12月18日，中國科學院上海生化細胞所李勁松，山東大學陳子江及北京大學湯富酬共同通訊在Cell Research 在線發表題為“In vitro expansion of human sperm through nuclear transfer”的研究論文，該研究發現在低氧濃度的培養條件下，可以通過精子核轉移產生人類單倍體ESC。 包含精子基因組的hAG-haESCs在體外ESC衍生和增殖過程中穩定維持典型的印跡DMR。 令人驚訝的是，hAG-haESCs可以“受精”卵母細胞并支持早期胚胎發育，從而導致胚泡和二倍體ES......閱讀全文
李勁松/陳子江/湯富酬實現核移植擴增人源精子的新方法
哺乳動物單倍體胚胎干細胞（haESCs）由于僅存在一組遺傳物質，因此是進行遺傳分析的理想工具。重要的是，當與CRISPR-Cas9技術結合使用時，雄激素性haESC（AG-haESCs）可以用作精子的替代品，并在生物水平上用于破譯基因功能。然而，迄今為止，只能在嚙齒動物中獲得AG-haESCs
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
9月11日，國際學術期刊《細胞—干細胞》（Cell Stem Cell）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所徐國良研究組、李勁松研究組和北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組的最新研究成果Active and Passive Demethylation
湯富酬最新綜述：單細胞測序與干細胞
干細胞能夠分化成為機體內任何類型的細胞，既是研究人體早期發育的理想工具，也是細胞治療的寶貴資源。細胞間差異和異質性是干細胞群體固有的基本特性。如果我們對一群細胞進行組學分析，這些關鍵的信息就會被掩蓋。 單細胞測序技術是近幾年備受關注的強大工具，可以在同種干細胞中全面剖析細胞異質性，鑒定不同表型
陳子江團隊－人源分裂期胚胎介導高效的單堿基編輯！
基礎編輯器能夠在不引起雙鏈斷裂的情況下實現單核苷酸轉換，目前已成功應用于小鼠和人類胚胎的基礎校正。與小鼠相比，人類胚胎中的堿基編輯效率通常較低（低于30％），這常常導致鑲嵌現象，而且還限制了當前基礎編輯方法在人類胚胎中進行基因功能研究的應用。2019年5月2日，楊輝、陳子江團隊等人在Genome
北大湯富酬等人揭示人類胚胎發育機制
基因表達圖 近日，北京大學研究團隊采用先進的單細胞 RNA-Seq 轉錄組測序技術繪制出了完整的人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組圖譜，這一重要的研究成果發表在9月的《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。 由
北大湯富酬發表表觀基因組新成果
表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下調控基因的活性。基因表達在時間和空間上的表觀遺傳學調控，對于人類發育是至關重要的。近年來，表觀基因組已經成為了生物醫學領域的一大研究熱點。 北京大學的研究團隊對早期人類胚胎進行深入研究，獲得了胎兒大腦、心臟和肝臟的表觀基因組景觀。這一成果發表在十二月
北大湯富酬Cell－Stem－Cell點評重編程研究成果
將體細胞重編程為誘導多能干細胞的iPS技術有著廣闊的應用前景。但目前人們對iPS體細胞重編程的分子機制還知之甚少。這主要是因為目前iPS重編程的效率比較低，得到的細胞存在很大的異質性。 北京大學生物動態光學成像中心BIOPIC的研究員湯富酬和助理研究員文路在Cell Stem Cell雜志上
北大喬杰、湯富酬、黃巖誼發表環狀RNA新成果
早在幾十年前，生物學家們就發現了環狀RNA。與線性RNA相比，環狀RNA受到的關注比較少，一直被認為是剪切過程中發生的錯誤。隨著二代測序的發展，近幾年人們意識到環狀RNA其實是非常普遍的。這些分子廣泛存在于多種生物的細胞中（從古生菌、酵母、小鼠到人類），能夠通過不同途徑影響基因表達，很可能在細胞
2018單細胞測序盤點：北大湯富酬教授連發11篇論文
單細胞RNA測序技術隨著近幾年的迅速發展，已在多個領域，從早期胚胎發育到組織和器官發育、以及免疫學和腫瘤學開花結果。 2018年，這一領域國內外成果不斷，比如北京大學的湯富酬課題組就接連發表了11篇文章，獲得了單細胞測序領域的接連重要成果。 3月，這一研究組與中國科學院生物物理研究所王曉群課
湯富酬－喬杰再發文：繪制人類心臟高精度發育細胞圖譜
人類胚胎發育是一個極其復雜的過程，從一個單細胞的受精卵開始，首先經過著床前胚胎發育產生胚內和胚外組織，再到著床后原腸胚階段三個胚層的特化，進而到器官發生、分化、成熟，及至新生命的誕生。整個兩百八十天的胚胎發育過程從一個單細胞受精卵增殖發育形成含有上萬億個細胞的嬰兒，期間基因表達受到嚴密、精準的調
北大湯富酬、喬杰團隊Cell－Res表觀遺傳學新成果
生物通報道：2016年11月8日，國際著名期刊《Cell Research》在線發表了北京大學湯富酬、喬杰團隊題為“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”
湯富酬Nature－Cell－Biology發文－揭示人類消化道發育細胞圖譜
人類胚胎發育過程中食道、胃、小腸、大腸的細胞類型圖譜及其關鍵生物學特征。 消化系統是人體中最重要的器官系統之一，而消化道作為消化系統最重要的組成部分，其在食物消化、營養吸收、廢物排泄、抵抗微生物入侵等多個方面起著極其重要的作用。消化道主要由食道、胃、小腸、大腸組成。揭示這四種器官在人類胚胎發育
北大湯富酬、喬杰、付衛Science發表結直腸癌新成果
結直腸癌是胃腸道中常見的惡性腫瘤。基因組不穩定性、表觀遺傳異常以及基因表達失調是結直腸癌的典型分子特征。以往的單細胞研究只能分別檢測基因組、甲基化組或轉錄組，而不能以單細胞分辨率同時開展多組學研究。 為了更好地了解結直腸癌的發展，北京大學的研究團隊開發出一種單細胞測序方法，不僅能夠分析單細胞的
《自然—方法學》年度方法：單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道，將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重
Nature2015最佳評論文章：湯富酬、文路、馬曉婭入選
Nature雜志近日展開了一年一度的年終大盤點，評出了2015年的最佳評論文章。本次盤點選入了三名中國學者的兩篇文章，他們分別是北京大學的研究員湯富酬和研究員文路，以及云南大學的研究員馬曉婭。 湯富酬和文路在這篇文章中重點介紹了Grün等人開發的RaceID的算法，該算法能夠在復雜的細胞混合物
Nature－Methods－：北大湯富酬團隊揭示單個細胞內高階染色質結構
調控基因組元件的高階三維(3D)組織為基因調控提供了拓撲基礎，但尚不清楚哺乳動物基因組中的多個調控元件如何在單個細胞內相互作用。 2023年8月28日，北京大學湯富酬團隊在Nature Methods （IF=48）在線發表題為“scNanoHi-C: a single-cell long-r
Cell－Research解析小鼠原腸期胚胎胚層形成的表觀遺傳規律
細胞命運決定過程的調控機制是哺乳動物胚胎發育研究領域關注的重點。在哺乳動物胚胎發育過程中，具有全能性的合子會依次經過桑椹胚期、囊胚期、原腸胚期等，最終形成能夠發揮完整生物學功能的個體。其中，外、中、內三個胚層形成的原腸運動時期對后續胚胎發育藍圖的構建起著至關重要的作用。 表觀遺傳調控在哺乳早期
2022年度上海市科學技術獎復評專家名單出爐
2022年度上海市科學技術獎復評已結束，現公布參加復評的專家名單（按姓氏拼音排序）。 艾連中、白景峰、畢燕龍、蔡傳兵、曹家麟、曹俊誠、曹先常、柴洪峰、陳芬兒、陳剛、陳光輝、陳紅潔、陳紅專、陳建民、陳杰、陳俊平、陳凱、陳凱先、陳立東、陳立僑、陳平、陳啟軍、CHENQUN、陳韶紅、陳壽面、陳恕行、
Biology－of－Reproduction發表關于“人造精子細胞”的綜述
5月11日，中國科學院生物化學與細胞生物學研究所李勁松研究組受邀在生殖領域老牌雜志Biology of Reproduction在線發表了題為“Artificial spermatid”-mediated genome editing的綜述論文，系統地介紹了“人造精子細胞”的產生、優化和應用，
北大湯富酬課題組發表單細胞表觀多組學測序技術新成果
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
北京大學湯富酬等團隊發布單細胞測序技術最新研究成果
基于第三代測序（TGS）平臺的單細胞RNA-seq技術的進步加速了生物學研究。自2016年以來，已經開發了幾種基于TGS平臺的單細胞RNA-seq方法。由于受到低準確度和靈敏度的限制，它們要么結合基于NGS平臺的方法降低錯誤率，要么通過犧牲通量來提高檢測率。 2023年1月11日，北京大學湯富
陳子江/劉洪彬團隊揭示SSH2參與精子頂體形成的新機制
目前，世界范圍內育齡期夫婦不孕不育的比例約為8-12%，其中男性因素所致約占50%， 而精子生成異常是導致男性不育癥的主要遺傳因素之一【1】。精子生成是未成熟精子細胞經歷頂體形成等一系列細胞形態重塑事件，最終分化為具備運動能力和受精潛能成熟精子的過程【2】。位于精子頭部前段的頂體是精子特化的囊泡
北大湯富酬團隊首次在單細胞水平上從頭組裝人類基因組
基因組組裝受益于具有更高準確性和更高連續性的長讀長測序技術。然而，大多數人類基因組組裝需要來自同質細胞系的大量 DNA，而不會保持細胞異質性，因為細胞異質性會嚴重影響單倍型組裝結果。 2022年7月12日，北京大學湯富酬團隊在Nucleic Acids Research （IF=19）在線發表
人的單倍體胚胎干細胞的建立方法
5月17日，國際著名學術期刊Cell Research在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所李勁松研究組和上海交大仁濟醫院陳子江研究組的合作研究論文，該研究建立了來自人孤雌囊胚的單倍體胚胎干細胞系。?哺乳動物，包括小鼠、大鼠和猴，其單倍體胚胎干細胞的建立為遺傳篩選研究以及制
科研人員在生殖細胞中治愈小鼠遺傳疾病
12月5日，《細胞研究》期刊在線發表了中科院上海生科院生化與細胞所李勁松研究組和吳立剛研究組以及北京大學湯富酬研究組的一項合作研究成果，研究人員利用CRISPR-Cas9技術，在小鼠的精原干細胞中修復了遺傳缺陷，產生了完全健康的后代。專家認為，這項研究為人類基因治療提供了一個新的思路。 據悉，
上海生科院等建立人的單倍體胚胎干細胞
5月17日，國際學術期刊Cell Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所李勁松研究組和上海交通大學仁濟醫院陳子江研究組的合作研究論文，該研究建立了來自人孤雌囊胚的單倍體胚胎干細胞系。 哺乳動物，包括小鼠、大鼠和猴，其單倍體胚胎干細胞的建立為遺傳篩選研
上海生化細胞所發現受精卵DNA去甲基化重要機制
? ? ? ? 近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊《細胞—干細胞》。 該研究由中科院上海生
我科學家完成單個卵細胞的高精度全基因組測序
近日，由北京大學第三醫院教授喬杰、北京大學生物動態光學成像中心教授湯富酬和謝曉亮所領導的3個研究小組，共同完成了對單個卵細胞的高精度全基因組測序。成果發表在國際著名學術期刊《細胞》上。 2012年，謝曉亮課題組實現了對單個細胞全基因組的高精度測序，隨后該技術被應用到多項研究中。數據顯示，我國每
1100人！上海市2021年度揚帆計劃項目通訊評審專家名單
上海市2021年度“科技創新行動計劃”揚帆計劃項目通訊評審專家名單公布 上海市2021年度“科技創新行動計劃”揚帆計劃項目通訊評審已結束，現公布參加通訊評審的專家名單。 安紅梅、安平、安曉霞、安仲勛、包玉倩、鮑嫣、畢慶貞、卞振鋒、卜軍、步揚、蔡亮、蔡孟浩、蔡清萍、蔡新波、曹廣文、曹麗英、