劉默芳組：LARP7介導U6修飾及在生精細胞mRNA精準剪接功能
在較高等的真核生物中，大部分基因都含有內含子，在轉錄完成后需經過剪接（splicing）從mRNA前體移除內含子，以產生成熟、有翻譯活性的mRNA，這個過程由剪接體（spliceosome）催化完成。經典的剪接體包括五種snRNA（small nuclear RNA），即U1、U2、U4、U5和U6及與它們相互作用的蛋白因子【1】。其中，U6 snRNA處于核心地位，其保守性最強，且位于剪接體催化中心、為剪接體催化活性必需【2】。同時還發現，U6在后生動物中被高度修飾，包括末端的5 γ-單甲基化加帽和3 寡聚尿嘧啶化修飾，中間的2-O-甲基化、假尿嘧啶、m2G和m6A修飾等【3,4】。經過近40年的研究，研究者雖然已較為全面地揭示了U6生物生成的過程及其在剪接中的功能機制，但目前對U6修飾的調控機制及其在mRNA剪接中的功能還不甚了解。 之前的研究發現，在哺乳動物成年個體中，睪丸是轉錄活性最高、可變剪接最為豐富的組織【5】......閱讀全文
劉默芳組：LARP7介導U6修飾及在生精細胞mRNA精準剪接功能
在較高等的真核生物中，大部分基因都含有內含子，在轉錄完成后需經過剪接（splicing）從mRNA前體移除內含子，以產生成熟、有翻譯活性的mRNA，這個過程由剪接體（spliceosome）催化完成。經典的剪接體包括五種snRNA（small nuclear RNA），即U1、U2、U4、U5和
研究揭示LARP7在生精細胞mRNA精準剪接和精子發生中的功能
2月3日，國際學術期刊Molecular Cell 在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心/生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組的最新研究成果“LARP7-Mediated U6 snRNA Modification Ensures Splicing Fidelity and Sperm
劉默芳小組肝癌細胞糖代謝調控機制研究獲進展
缺氧是實體瘤普遍存在的現象，對腫瘤生物學特性具有重要影響。已有證據表明，缺氧可調控多個Warburg效應關鍵基因，是誘導癌細胞能量代謝“重編程”的關鍵因素之一，也是調控腫瘤進程的一個重要病理因素，但目前對缺氧誘導癌細胞糖代謝轉換的分子生物學機制還不完全清楚。中科院上海生命科學研究院生物化學與細胞
Nature：U6－snRNP在premRNA剪接中的作用
前體信使RNAs (pre-mRNAs) 被剪接體(它由五個被稱為snRNPs的子復合物組成)和其他輔助因子處理。每個snRNP含有一個由7個成分構成的蛋白環結構和一個相關的RNA分子。 施一公及同事獲得了U6 snRNP的Lsm蛋白環在有和沒有一個包含U6 snRNA的3′端的
歷時7年發《科學》論文，審稿人為延遲發表道歉
2021年5月，中科院分子細胞科學卓越創新中心（生物化學與細胞生物學研究所）的劉默芳團隊向知名學術期刊《科學》遞交了一份投稿。不久，編輯部就反饋了第一輪修改意見。看過之后，他們倒吸了一口涼氣。其中一位審稿人的意見長達25頁，里面密密麻麻的，全是質疑和問題。這位審稿人非常坦率地表示，他對論文里提到的一
劉默芳施惠娟發表Cell文章－發現人Piwi基因突變致男性不育
國際著名學術期刊《細胞》（Cell）于5月26日在線發表了中國科學院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組與上海市計劃生育科學研究所施惠娟研究組合作的最新研究成果“Ubiquitination-deficient Mutations in Human Piwi Cause Male Infert
何川、賈桂芳研究組發文：植物mRNA化學修飾m6A去甲基酶
近期，北京大學化學學院的何川、賈桂芳課題組在在高等植物N6-甲基腺嘌呤（m6A）動態可逆調控的研究中取得重要進展，相關工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transi
精子發育過程中蛋白質翻譯激活機制被發現了
據不完全統計，全球約有15%~20%的不孕不育夫婦，其中近50%是男性因素導致。環境污染、生活壓力、遺傳病等因素是造成男性不育的重要原因，但目前有一半以上不育男性無法明確其病因。中國科學院分子細胞科學卓越創新中心（生物化學與細胞生物學研究所，簡稱“分子細胞中心”）劉默芳研究組與國內外多家實驗室合
《科學》一項新研究為男性不育提供希望
我國近20年不孕不育率從6.9%增長到17.1%，其中男性病因約占40%。遺傳突變和基因表達異常是男性不育的重要病因。然而，精子形成過程中仍有許多謎題尚未破解。 中國科學院分子細胞科學卓越創新中心（生物化學與細胞生物學研究所）劉默芳研究組聯合上海交通大學醫學院附屬新華醫院黃旲研究組及國內外多家實
Cell：出人意料的mRNA修飾
Cell：出人意料的mRNA修飾 根據分子生物學的中心法則，遺傳信息是從DNA傳遞給RNA，再從RNA傳遞給蛋白質，其為活體生物中遺傳信息的解碼和翻譯提供了一種簡單的解釋。 當然在現實中，這一過程比近60年前DNA雙螺旋結構的共同發現者、諾貝爾獎得主Francis Crick
我國學者發現導致男性不育的基因突變
中科院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組與上海市計劃生育科學研究所施惠娟研究組合作，首次發現人類Piwi基因突變可導致男性不育，并深入揭示了其致病機理，為相關男性不育癥的早期分子診斷及精準醫療提供了理論依據。近日，《細胞》在線發表了該項研究成果。 據悉，在我國的不孕不育夫婦中，男性因素約占
科學家發現人類Piwi基因突變導致男性不育
中科院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組與上海市計劃生育科學研究所施惠娟研究組合作研究，首次發現人類Piwi基因突變可導致男性不育，并深入揭示了其致病機理，為相關男性不育癥的早期分子診斷及精準醫療提供了理論依據。5月26日凌晨，國際著名學術期刊《細胞》（Cell）在線發表了該項研究成果。劉默
小鼠粗線期piRNA指導精子形成
piRNA是新近在動物生殖系細胞中發現的一類與PIWI家族蛋白相互作用的小分子非編碼RNA，在哺乳動物的精子發生過程先后出現兩次表達高峰，分別被稱為前粗線期piRNA與粗線期piRNA。學者對在早期生精細胞中表達的前粗線期piRNA的作用已有所了解，而在減數分裂前后大量表達的粗線期piRNA的功能還
2024年，西湖大學施一公團隊合作再取進展
U2小核核糖核蛋白(snRNP)對pre-mRNA分支位點(BS)的選擇對于剪接前體 (A complex)的組裝至關重要。RNA解旋酶PRP5校對BS選擇，但其潛在機制尚不清楚。 2024年1月9日，西湖大學施一公及中國科學技術大學張曉峰共同通訊在Nature Structural & Mo
Cell：表觀遺傳新關注點—mRNA修飾
表觀遺傳學研究關鍵點是修飾DNA及其蛋白質支架的化學標記，越來越多的研究表明這些化學標記能告訴細胞，哪些基因是表達，哪些是沉默的，因而也決定了個體的表型性狀。 mRNA即信使RNA，在中心法則中扮演了重要角色，但此前一些科學家們認為這種RNA只是完成傳遞的作用，把細胞核中編碼的信息傳遞給蛋白翻
上海生科院發現小鼠粗線期piRNA在精子發育中的重要功能
不同于卵子含有大量母源mRNA和蛋白質支持早期胚胎發育，成熟精子中僅殘留微量的mRNA，但目前還不清楚精子細胞中大量的mRNA是如何在形成精子前被大規模降解清除的。piRNA 是新近在動物生殖系細胞中發現的一類與PIWI家族蛋白相互作用的小分子非編碼RNA，在哺乳動物的精子發生過程先后出現兩次表
生化與細胞所等研究發現小鼠PIWI/piRNA代謝調控機制
國際知名學術期刊Developmental Cell于1月13日發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所劉默芳組、王恩多組關于piRNA在精子發生后期觸發小鼠PIWI(MIWI)蛋白經 APC/C-泛素途徑降解的最新研究成果。該工作與李勁松研究員、上海計劃生育研究所施惠娟研究員、美國路
上海生科院等揭示缺氧誘導肝癌細胞糖代謝轉換新調控機制
國際學術期刊《歐洲分子生物學學會會刊》（The EMBO Journal）于9月7日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳組關于miR-199a介導缺氧誘導肝癌細胞糖代謝轉換的最新研究成果。該工作與上海胸科醫院教授婁加陶、東方肝膽醫院教授高春芳、瑞金醫院教授李彪、
科研人員發現精子細胞發育的代謝調控機制
國際知名學術期刊Developmental Cell(《發育細胞》)1月15日發表了中科院上海生命科學院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳組、王恩多組的合作研究成果，揭示了piRNA在精子發生后期觸發MIWI/piRNA“機器”清除的代謝調控機制，為代謝異常導致的男性不育癥的發生提供了潛在的分
Cell顛覆傳統認知：出人意料的mRNA修飾
根據分子生物學的中心教條（又稱中心法則），遺傳信息是從DNA傳遞給RNA，再從RNA傳遞給蛋白質，其為活體生物中遺傳信息的解碼和翻譯提供了一種簡單的解釋。 當然在現實中，這一過程比近60年前DNA雙螺旋結構的共同發現者、諾貝爾獎得主Francis Crick首次提出的要遠遠復雜得多。其一，有多
premRNA中存在的修飾及其對剪接影響
2018年10月7日 訊 /生物谷BIOON/--日前，作為“諾貝爾獎風向標”的拉斯克獎——拉斯克·科什蘭醫學特殊成就獎頒給了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特別成就獎獲得者），以表彰她在生物醫學領域，尤其是RNA生物學領域中所發揮
用siRNA或其生物合成前體RNAi誘導
通過轉染外源siRNA進行的基因敲低通常是不令人滿意的，因為該效應僅是短暫的，特別是在快速分裂的細胞中。這可以通過產生siRNA的表達載體來克服。修飾siRNA序列以在兩條鏈之間引入短環。得到的轉錄物是短發夾RNA（shRNA），其可以通過Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的轉
上海生科院等揭示miR155在乳腺癌發生發展中的新功能
國際學術期刊Oncogene 于4月11日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳研究組關于miR-155調控ErbB2-介導的乳腺上皮細胞惡性轉化的最新研究成果，揭示了miR-155在乳腺癌發生發展中的一種新功能和作用機制。 ErbB2是乳腺癌的一個重要致癌基因
細胞凋亡mRNA檢測
研究者們發現了很多在細胞凋亡時表達異常的基因，檢測這些特異基因的表達水平也成為檢測細胞凋亡的一種常用方法。據報道，Fas?蛋白結合受體后能誘導癌細胞中的細胞毒性T細胞（cytotoxic T cells）等靶細胞。Bcl-2 和bcl-X （長） 作為抗凋亡（bcl-2 和bcl-X）的調節物，它們
小鼠睪丸中MIWI/piRNA介導了mRNA的剪切
最新一期的國際學術期刊《Cell Research》在線發表了由中科院動物所和中科院生化細胞所共同完成的在小鼠生精細胞發生中MIWI/piRNA的功能機制的研究論文，報道了在小鼠睪丸中piRNA發揮著類似siRNA的功能，可以指導MIWI對于mRNA的剪切，保證小鼠配子的正常生成。本項研究工作是
小鼠睪丸中MIWI/piRNA介導了mRNA的剪切
最新一期的國際學術期刊《Cell Research》在線發表了由中科院動物所和中科院生化細胞所共同完成的在小鼠生精細胞發生中MIWI/piRNA的功能機制的研究論文，報道了在小鼠睪丸中piRNA發揮著類似siRNA的功能，可以指導MIWI對于mRNA的剪切，保證小鼠配子的正常生成。本項研究工
原發性生精功能衰竭的簡介
原發性生精功能衰竭是指各種下丘腦垂體疾病所致的生精功能改變，不同病因所致的原發性生精功能衰竭的程度類型不同，臨床上統稱非梗阻性無精子癥。 無精子癥的發病率在一般人群中約占2%，在男性不育中高達10-20%，睪丸組織學顯示從小管損傷到生精功能低下各種不同程度的生精功能改變。甚至在唯支持細胞綜合癥
復旦大學，中科院Cancer－Res發現癌癥轉移的新機制
生物通報道：來自中科院生物化學與細胞生物學研究所，復旦大學中山醫院等處的研究人員發表了題為“KRAS-NFκB-YY1-miR-489 signaling axis controls pancreatic cancer metastasis”的文章，發現KRAS通過激活NF-κB炎癥信號通路激活
上海生科院合作揭示炎癥促非小細胞肺癌發生的新機制
國際學術期刊Cancer Research 于6月23日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所劉默芳組與上海市胸科醫院婁加陶教授、中國科學院上海生命科學信息中心李黨生研究員等合作完成的關于miR-101/Lin28B介導炎癥促非小細胞肺癌（NSCLC）發生的最新研究成果
何川教授新發Nature綜述：mRNA修飾介導的基因調控
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，并由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m6A）是真