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幾種常用的蛋白鑒定方法 傳統的蛋白鑒定方法，如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的 comigration分析，或者在一個有機體中有意義的基因的過表達通常耗時、耗力，不適合高流通量的篩選。 目前，所選用的技術包括對于蛋白鑒定的圖象分析、微量測序、進一步對肽片段進行鑒定的氨基酸組分分析和與質譜相關的技術。 1 圖象分析技術(Image analysis) “滿天星”式的2-DE圖譜分析不能依靠本能的直覺，每一個圖象上斑點的上調、下調及出現、消失，都可能在生理和病理狀態下產生，必須依靠計算機為基礎的數據處理，進行定量分析。 在一系列高質量的2-DE凝膠產生(低背景染色，高度的重復性)的前提下，圖象分析包括斑點檢測、背景消減、斑點配比和數據庫構建。 首先，采集圖象通常所用的系統是電荷耦合CCD(charge coupled device)照相機;激光密度儀(laser densitomet......閱讀全文
實驗步驟：3.1 PROTICdb 概述在輸入或瀏覽數據時，每個最終用戶需要一個 PROTICdb 賬戶（由您的管理員創建 ) 。作為一個新用戶，首先要創建一個新的項目。一旦建立，該項目就屬于這個用戶，這個用戶有權授予其他用戶訪問權限。為確保數據一致性的精確度，盡量不要用手動輸入操作。因此，
儀器、耗材DBMS實驗步驟3.1 PROTICdb 概述在輸入或瀏覽數據時，每個最終用戶需要一個 PROTICdb 賬戶（由您的管理員創建 ) 。作為一個新用戶，首先要創建一個新的項目。一旦建立，該項目就屬于這個用戶，這個用戶有權授予其他用戶訪問權限。為確保數據一致性的精確度，盡量不要用手動輸入操作
1 植物群體遺傳蛋白質組學 1.l 遺傳多樣性蛋白質研究基于基因組學的一些遺傳標記，如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
今天跟大家分享的是Orbitrap Exploris? 480的第1篇文獻，作者是來自丹麥哥本哈根大學的Jesper V. Olsen教授，文中對Exploris 480聯合FAIMS Pro的性能進行了全面測試，包括DDA與DIA鑒定，靈敏度測試，組織樣品測試，磷酸化樣品測試，以及TMT與DIA定
Skyline 中嵌入的 mProphet 軟件會根據同一肽段的多個子離子峰的 feature 進行打分。 Feature 包括子離子共流出峰形、保留時間偏差、 dotp 值、信噪比等。為了區分假陽性的子離子峰， mProphet 可以建立 decoy 庫，也可以將打分排名第二的肽段作為decoy，
500 ng Hela 細胞裂解液用相同的色譜柱，相同的色譜梯度，將 QE HF 切換至 DIA 掃描模式進行 3 次 DIA 數據采集。在一次掃描循環中，目標母離子質核比范圍 400–1000，四極桿的隔離窗口為 12 Da，包含 50 次 MS/MS 掃描。每一張 MS/MS 譜圖中
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用，不過，目前的應用還不是特別廣泛。那么，有問題了怎么解決呢?本文收集了相關的新手對于這項技術的常見問題與解決方法。希望能更好地幫助大家了解這項技術。 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級，什么時候做二級? 答：一級質譜鑒定的方式
如圖 4 所示，在不同儀器之間，有很多蛋白會重復出現，即被不同儀器同時鑒定到。在 60 分鐘的分離過程中， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 LTQ XL 得到到蛋白數目的 88% ， LTQ Velos 雙壓離子阱鑒定到了 Q-TOF 得到蛋白數目的 90% ，此外，還有 570 個
對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比
4. 質譜鑒定報告文件上傳PROTICdb 兼容以制表分隔的文本格式輸出的 Sequest 鑒定報告（見注釋 13) 。( 1 ) 為演示，訪問 http: //location 一 of/your/proticdb/home/demo. php。點擊 “formto o
液質數據中，不但含有蛋白藥序列表達是否正確的肽圖信息，其它雜質蛋白同樣可以被挖掘出來。然而，單純的雜質蛋白鑒定卻又是不夠遠遠的，其確切的含量信息同樣至關重要。沃特世PLGS軟件可以在肽圖液質數據中，進一步鑒定其中的雜質蛋白，并其相對含量信息進行分析。 一、“順便”完成的雜質蛋白鑒定與相對定量使用相應
蛋白質（Protein）是生物體中含量最高，功能最重要的生物大分子，存在于所有生物細胞，作為生命的物質基礎之一，蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用，因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。 現代研究結果發現越來越多的多肽
蛋白質（Protein）是生物體中含量最高，功能最重要的生物大分子，存在于所有生物細胞，作為生命的物質基礎之一，蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用，因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。現代研究結果發現越來越多的多肽同蛋白質一樣
膽管癌（CCA）是惡性度較高的消化系統腫瘤。因其發展隱蔽且臨床癥狀及體征出現晚，故給早期診斷帶來困難。原發性硬化性膽管炎（PSC）是導致膽管癌的主要原因之一。在非侵染時期，鑒定肝內的膽管癌及肝癌（HCC）是非常困難的。目前尚未有準確區分CCA，PSC，及HCC的生物標記物。為了尋找新的生物標志物，來
分析測試百科網訊 2016年8月11日，由遼寧省分析測試協會，遼寧省分析科學研究院主辦的“第四屆環渤海色質譜學術報告會暨遼寧省第十屆學術年會分會”在丹東召開（相關報道：第四屆環渤海色譜質譜學術會在丹東開幕 首次發布徽標）。大會上，眾位環渤海的
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。 自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大多數疾病并不是
摘 要 Orbitrap Fusion Lumos 是基于Q-OT-qIT 平臺的第二代“三合一”質譜，通過離子入口、離子透鏡、四極桿、ETD和真空技術等方面的深度改進，將儀器整體性能優化至極致。配合“三合一”質譜魔法般的功能，Orbitrap Fusion Lumos 能夠有效應對蛋白
1. 前言與其他真核細胞一樣，植物細胞中，糖基化通常發生在分泌蛋白質上，雖然在細胞質蛋白和核蛋白上也發現一些糖基化反應。根據寡糖部分和蛋白質骨架之間的連接方式，可將糖基化分為兩種類型：N -糖基化和 O-糖基化。植物中 N-糖基化研究最多。1.1 N-糖基化與其他真核細胞一樣，在植物細胞
布魯克·道爾頓公司 潘晨松 應用技術支持工程師 布魯克·道爾頓公司的潘晨松應用技術支持工程師在報告“全力打造基于質譜的科學工具”中，通過為客戶進行的實際樣品分析實例講解了micrOTOF-QⅡ液相色譜四級桿飛行時間質譜儀的功能和分析方法。 潘工程師介紹，micrOTOF-QⅡ
實驗材料鏈霉親和素-過氧化物酶 &
問題1、一級質譜和二級質譜有什么區別？什么時候做一級，什么時候做二級?答：一級質譜鑒定的方式主要為胎指紋圖譜(PMF)，即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定；二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較，鑒定出該肽段的序列并結合PMF的
蛋白質組學應用于誘導毛發重生的關鍵細胞分泌蛋白的鑒定思路脫發是目前非常難于有效治愈的一種流行病，近期研究結果證實真皮乳頭細胞早期分泌蛋白可以誘導毛發的產生。小編今天來給大家分享一篇通過蛋白質組學研究的手段尋找誘導毛發重生的關鍵細胞分泌蛋白的文章。iTRAQ-Based Quantitative
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用，應用前景十分廣泛。那么，有問題了怎么解決呢? 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級，什么時候做二級? 答：一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(peptide-mass mapping, PMF)，即利用質譜儀精確測量酶解片段的分
脫發是目前非常難于有效治愈的一種流行病，近期研究結果證實真皮乳頭細胞早期分泌蛋白可以誘導毛發的產生。小編今天來給大家分享一篇通過蛋白質組學研究的手段尋找誘導毛發重生的關鍵細胞分泌蛋白的文章。 iTRAQ-Based Quantitative Proteomic Comparisonof E
實驗方法原理 實驗材料 蛋白樣品儀器、耗材 質譜儀實驗步驟 鑒定數據庫中已有序列的蛋白質的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切點專一的試劑水解蛋白質產生的，通常用已知切點專一的蛋白酶。(2) 這些肽段的質量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精確測定。(3) 計符蛋白序列數據庫中的每一序列被
基本方案 其他方案 實驗方法原理 實驗材料
1、什么是iTRAQ？ iTRAQ技術，即同位素相對標記與絕對定量技術。該技術可對復雜樣本、細胞器、細胞裂解液等樣本進行相對和絕對定量研究，具有較好的定量效果、較高的重復性。由于其能夠同時對多達8種樣品進行標記分析,故在生命科學的各個領域得到了廣泛的應用。2、iT
實驗材料蛋白樣品儀器、耗材質譜儀實驗步驟鑒定數據庫中已有序列的蛋白質的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切點專一的試劑水解蛋白質產生的，通常用已知切點專一的蛋白酶。(2) 這些肽段的質量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精確測定。(3) 計符蛋白序列數據庫中的每一序列被實驗中所用水解試劑水
天津醫科大學 張鍇老師 2014年8月29日第三屆環渤海色譜質譜學術報告會在天津市萬源龍順莊園農業博覽館順利召開。大會邀請到多位色譜質譜屆專家學者做了精彩的報告。來自天津醫科大學的張鍇老師帶來了《組蛋白賴氨酸修飾的鑒定和定量研究》的報告。 在組蛋白賴氨酸修飾的生物學意義中張鍇老師表示賴