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接著,作者對同類型樣本進行了m6A CLIP測序，對三個樣本分別進行motif分析后，發現三者共有將近有11,000個序列為GGACU的peaks（圖5 c）。將peak分別于轉錄本和基因組比對后，發現與YTHDF1 CLIP的結果十分類似(圖5 d，e)。對兩次CLIP實驗的peaks取交集后，發現共有將近30%的peak（圖5 g），IGV結果表明：YTHDF1的m6A位點與突觸形成關鍵蛋白（如Gira1，Grin1和Camk2a等）的m6A位點相近，二者可能通過m6A位點結合，調控蛋白的合成（圖5 h）。5. 首次繪制電休克小鼠的m6A RNA甲基化譜最后，作者建立了電休克小鼠模型，對海馬體的齒狀回結構的組織進行m6A RNA甲基化測序和轉錄組測序聯合，快速找到許多既發生m6A 甲基化表達量又發生巨大變化的基因，以供后續研究。總結：本篇文章表明小鼠海馬體中m6A RNA甲基化能夠調控......閱讀全文
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
m6A RNA甲基化是當前在LncRNA，環狀RNA等非編碼RNA之后最為火熱的科研明星，到底有多火？擺出數據告訴你！ 2019年才過去一半還不到，已發表文章數就已占去年的7成。RNA甲基化領域，不僅文章數量多，高分文章也有許多。據統計，僅2019年上半年就發表了多篇Nature，Cell
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究，首發推出了超微量RNA甲基化測序技術，首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案，云
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
文章導讀： 胚胎干細胞作為一種全能性細胞，通過增殖和分化，產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明，胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化，大多與細胞增殖[1-2]，免疫應答[4]關系密切。然而，對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天，分享一
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀D
在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物，HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA，circRNA作為一種新型環狀RNA，具有共價閉合環狀結構，在組織和血液中具有
文章導讀： 近日，四川大學華西醫院的周學東和袁泉研究組，聯合中山大學第一附屬醫院的林水賓團隊合作研究共同揭示了Mettl3介導m6A RNA甲基化調控骨髓間充質干細胞和骨質疏松癥命運的新機制。該研究成果以Mettl3-mediated m6A RNA methylation regulat
前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作為男性發病率第二的癌癥，嚴重影響了患者生殖健康和生活質量。由于前列腺癌受多種基因調控，且目前缺乏相關機制方面的深入研究，治療效果往往不甚理想。隨著高通量技術的發展，使研究PCa相關分子標志物基因和作用機制成為可能。目前，已有報道指出許多明星Ln
來自國家自然科學基金委員會的消息，8月18日國家自然科學基金委員會公布了2015年國家自然科學基金申請項目評審結果，其中面上項目16709項、重點項目624項、創新研究群體項目38項、優秀青年科學基金項目400項、青年科學基金項目16155項、地區科學基金項目2829項、海外及港澳學者合作研究基
本文中，小編整理了多篇重要研究成果，共同解讀科學家們在甲基化研究領域取得的新進展，分享給大家！圖片來源：Vossman/ Wikipedia 【1】Nature：母體維生素C調節DNA甲基化重編程和生殖細胞產生 doi：10.1038/s41586-019-1536-1 發育通常被認為是在
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人員開發的一款功能強大的綜合性基因組學可視化工具，借助于此工具，從事生物信息的科研工作者就可以輕松的分析查看多種基因組數據。除了直觀的查看序列信息及遺傳密碼中的序列變化或突變外，還可以查看拷貝數變化、染色質
【1】Nat Med：阻斷蛋白VCAM1可阻止年老小鼠的記憶喪失 doi：10.1038/s41591-019-0440-4 在一項新的研究中，來自美國斯坦福大學的研究人員發現阻斷一種將循環免疫細胞附著到血管壁上的蛋白---VCAM1---能夠讓年老的小鼠在記憶和學習測試中的表現與年輕小鼠一