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    定量PCR儀引物長度設定

    ① 引物長度 一般引物長度為18~30堿基。總的說來,決定引物退火溫度(Tm值)最重要的因素就是引物的長度。有以下公式可以用于粗略計算引物的退火溫度。 在引物長度小于20bp時:[4(G+C)+2(A+T)]-5℃ 在引物長度大于20bp時:62.3℃+0.41℃(%G-C)-500/length-5℃ 另外有許多軟件也可以對退火溫度進行計算,其計算原理會各有不同,因此有時計算出的數值可能會有少量差距。為了優化PCR反應,使用確保退火溫度不低于54℃的最短的引物可獲得好的效率和特異性。 總的說來,每增加一個核苷酸引物特異性提高4倍,這樣,大多數應用的最短引物長度為18個核苷酸。引物長度的上限并不很重要,主要與反應效率有關。由于熵的原因,引物越長,它退火結合到靶DNA上形成供DNA聚合酶結合的穩定雙鏈模板的速率越小。 ② GC含量 一般引物序列中G+C含量一般為40%~60%,一對引物......閱讀全文

    pcr實用技巧-2

    1.簡介寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用設計粗糙

    整理的PCR資料.供大家分享.2

    引物設計簡介1.寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設計也極大的影響擴增產量:若使用

    寡聚核苷酸引物的選擇

    1.簡介    寡聚核苷酸引物的選擇,通常是整個擴增反應成功的關鍵。所選的引物序列將決定PCR產物的大小、位置、以及擴增區域的Tm值這個和擴增物產量有關的重要物理參數。好的引物設計可以避免背景和非特異產物的產生,甚至在RNA-PCR中也能識別cDNA或基因組模板。引物設

    RT-PCR實驗方法大全

    RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。 3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單

    如何做好熒光定量PCR實驗

    熒光定量PCR實驗指南一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備;二、技術關鍵:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比

    PCR使用技巧

    基本PCR引物設計參數 引物設計的目的是在兩個目標間取得平衡:擴增特異性和擴增效率。特異性是指發生錯誤引發的頻率。特異性不好或劣等的引物會產生額外無關和不想要的PCR擴增子,在EB染色的瓊脂糖凝膠上可見到;引物效率是指在每一PCR循環中一對引物擴增的產物與理論上成倍增長量的接近程度。&nb

    聚合酶鏈反應(PCR)技術的發展和應用-2

    第五節 PCR各處應用模式  一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密碼子具有兼并性,如表22-4,單以氨基酸順序推測編碼的DNA序列是不精確的,但可以設計成對兼并引物,擴增所有編碼已知順序的核酸序列。用兼并引物時寡核苷酸中核苷酸序列可以改變,但核苷酸的數量應相同。兼并度越低,

    PCR各處應用模式

    一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密碼子具有兼并性,如表22-4,單以氨基酸順序推測編碼的DNA序列是不精確的,但可以設計成對兼并引物,擴增所有編碼已知順序的核酸序列。用兼并引物時寡核苷酸中核苷酸序列可以改變,但核苷酸的數量應相同。兼并度越低,產物特異性越強,設計引物時應盡

    PCR各處應用模式

    一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR  密碼子具有兼并性,如表22-4,單以氨基酸順序推測編碼的DNA序列是不精確的,但可以設計成對兼并引物,擴增所有編碼已知順序的核酸序列。用兼并引物時寡核苷酸中核苷酸序列可以改變,但核苷酸的數量應相同。兼并度越低,產物特異性越強,設計引物時應盡

    RT-PCR實驗方法總結大全

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    PCR技術 PCR技術的應用

    一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合

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    生物谷: RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。要求:1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單改變

    3分鐘了解:PCR檢測怎么做以及注意事項

    PCR反應的準備PCR反應體系10×擴增緩沖液10μl4種dNTP混合物(終濃度)各100~250μmol/L引物(終濃度)各5~20μmol/L模板DNA0.1~2μgTaq DNA聚合酶5~10 UMg2+(終濃度)1~3mmol/L補加雙蒸水100 μl其中dNTP、引物、模板DNA、Taq

    實時熒光定量PCR一種科學準確的定量方法

    實時熒光定量PCR——一種科學準確的定量方法實時熒光定量PCR技術于1996年由美國Applied Biosystems公司推出,由于該技術不僅實現了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規PCR相比,它具有特異性更強、有效解決PCR污染問題、自動化程度高等特點,目前已得到廣泛應用。本文試就其定量原理、

    QPCR常見問題及其分析

    一般來講,進行real-time qPCR MasterMix都是2×的濃縮液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR靈敏度高,所以每個樣品至少要做3個平行孔,以防在后面的數據分析中,由于Ct相差較多或者SD太大,無法進行統計分析。通常來講,反應體系的引物終濃度為10

    實時定量PCR應用中的優化方案

     聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction, PCR)自誕生之日起就決定了它不僅是一種高敏感、高特異的檢測核酸分子的定性方法,而且也是一個能對核酸分子進行精確定量的有力工具[1]。隨著分子生物學技術研究的不斷進展,定量PCR技術取得了突飛猛進的發展,不僅建立了一系

    QPCR常見問題及其分析

    一般來講,進行real-time qPCR MasterMix都是2×的濃縮液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR靈敏度高,所以每個樣品至少要做3個平行孔,以防在后面的數據分析中,由于Ct相差較多或者SD太大,無法進行統計分析。通常來講,反應體系的引物終濃度為10

    PCR簡介及污染的處理 高速離心機

    何謂PCR,簡單的說,PCR就是利用DNA聚合酶對特定基因做體外或試管內 In Vitro 的大量合成。基本上它是利用DNA聚合酶進行專一性的連鎖復制.目前常用的技術,可以將一段基因復制為原來的一百億至一千億倍。 PCR的要素基本的PCR須具備1.要被復制的DNA模板 Template 2

    PCR簡介及污染的處理

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    PCR實用大全2

    幾種常用特殊PCR技術幾種常用特殊pcr技術一、逆轉錄PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)RNA經逆轉錄后可作為PCR的模板。逆轉錄PCR(RT-PCR)常用于基因表達研究(定量pcr)和逆病毒檢測。設計RT-PCR引物時,應使引物分別位于不同的外顯子中,以便區

    什么是PCR陰性?

    舉乙肝的例子來說:通過酶免的方法查乙肝兩對半和通過熒光定量PCR的方法學查乙肝DNA小明得了肝炎,但他不知道自己得了肝炎,有一天身體不舒服或者正常體檢(比如入職體檢),他去看醫生,臨床醫生懷疑他得了肝炎(肝炎有很多種比如病毒性肝炎,也就是病毒傾入他體內后由于人體的三道防線沒能把病毒消滅掉,導致病毒在

    什么是PCR?

     定義  聚合酶鏈式反應簡稱PCR(英文全稱:Polymerase Chain Reaction),  聚合酶鏈式反應具體內容點擊: 聚合酶鏈式反應,簡稱PCR。聚合酶鏈式反應,其英文Polymease Chain Reaction(PCR)是體外酶促合成特異

    QPCR常見問題及其分析

    一般來講,進行real-time qPCR MasterMix都是2×的濃縮液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR靈敏度高,所以每個樣品至少要做3個平行孔,以防在后面的數據分析中,由于Ct相差較多或者SD太大,無法進行統計分析。通常來講,反應體系的引物終濃度為100-400

    PCR技術綜述

    前言      一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Po

    增加PCR特異性

    引物設計  細心地進行引物設計是PCR中zui重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。下面的指導描述了一個可以增加特異性的引物所具有的令人滿意的特點:  1.典型的引物18到24個核苷長。引物需要足

    增加PCR特異性

    增加PCR特異性(一)引物設計細心地進行引物設計是PCR中最重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。下面的指導描述了一個可以增加特異性的引物所具有的令人滿意的特點:1.典型的引物18到24個核苷長。引物需要足夠長,保證序列獨特性

    PCR使用技巧

    增加PCR的特異性:1. primers design這是最重要的一步。理想的,只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火的引物要符合下面的 一些條件a. 足夠長,18-24bp,以保證特異性.當然不是說越長越好,太長的引物同樣會降低特異性,并且降低產量b. GC% 40%~~~~60% c. 5&

    應用mRNA反轉錄擴增cDNA(RT-PCR)

                實驗方法原理 酶促催化使RNA反 轉 錄 為cDNA第一鏈。 一 條寡聚脫氧核苷酸引物先 與 mRNA雜交,然 后 由RNA依賴的DNA聚合酶催化合成相應互補的cDNA拷貝,后者

    應用mRNA反轉錄擴增cDNA(RT-PCR)

    RT-PCR技術可應用于:(1)構建大容量cDNA文庫;(2)鑒 定已轉錄序列是否發生突變及呈現多態性;(3)測定基因表達的強度。實驗方法原理酶促催化使RNA反 轉 錄 為cDNA第一鏈。 一 條寡聚脫氧核苷酸引物先 與 mRNA雜交,然 后 由RNA依賴的DNA聚合酶催化合成相應互補的cDNA拷貝

    逆轉錄-聚合酶鏈反應(RT-PCR,rtpcr)

    實驗方法原理 逆轉錄-聚合酶鏈反應 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板

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