PCRArray——基因表達分析疾病和信號通路的利器（三）
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物學和醫學研究的各個領域，包括：癌癥研究、炎癥和細胞因子分析、干細胞研究、神經生物學、信號轉導通路研究、細胞黏附和細胞遷移、生物標記分子篩選和驗證截止目前，QIAGEN 擁有ZL申請的PCR Array可以分析超過150條通路和特異的疾病類型。具體如下通路名稱供您參考：Adherens Junctions粘附連接Adipogenesis脂肪生成Aging衰老Allergy & Asthma過敏&哮喘Alzheimer’s Disease阿爾茨海默氏癥（老年癡呆）Alzheimer’s Disease阿爾茨海默氏癥（老年癡呆）Amino Acid Metabolism I氨基酸代謝IAmino Acid Metab......閱讀全文
PCR－Array——基因表達分析疾病和信號通路的利器（三）
RT2?PCR?Profiler?Arrays可用于生物學和醫學研究的各個領域，包括：癌癥研究、炎癥和細胞因子分析、干細胞研究、神經生物學、信號轉導通路研究、細胞黏附和細胞遷移、生物標記分子篩選和驗證截止目前，QIAGEN?擁有ZL申請的PCR?Array可以分析超過150條通路和特異的疾病類型。具
PCR－Array——基因表達分析疾病和信號通路的利器（一）
以前只要提到基因表達分析，人們就會想到熒光定量PCR；只要提到高通量基因表達分析，人們會首先想到基因芯片。雖然熒光定量PCR儀幾乎每個實驗室都有，但是做芯片就不一定每個實驗室都具備這個條件了。那么只有一臺熒光定量PCR儀是否也能進行高通量的基因表達譜分析呢？QIAGEN 推出的RT2 Profile
PCR－Array——基因表達分析疾病和信號通路的利器（二）
RT2?Profiler?PCR?Array操作流程 首先將RNA樣本反轉錄成cDNA第一鏈，作為PCR模板；接著將cDNA模板與合適的即用型PCR預混液混合，等體積加入到已經固定好基因特異性引物的同一個孔板的每個孔中，然后即可運行real-time?PCR循環程序。RT2?Profiler?PCR
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法（三）
PCR 芯片實驗體系 ? ?完整的PCR芯片實驗體系包括RT2ProfilerTM PCR芯片，RT2 Real-TimeTM ?SYBR Green PCR反應體系和cDNA合成試劑盒。所有這些組分均為基于SYBR ?Green的實時定量PCR反應優化。精心設計的引物和優化的PCR反應體系一起，為
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法
簡介：什么是PCR芯片？實時定量PCR是檢測基因表達最靈敏，最可靠的方法。通過在試驗過程中，實時監測熒光染料的信號變化，反映樣品中的基因拷貝數。實時定量PCR線性范圍廣（能達到5個數量級），因此可以檢測同一樣品中表達量極低的基因和表達量很高的基因。但是，由于實時定量PCR需要制備標準曲線和同時分析內
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法
?簡介：什么是PCR芯片？實時定量PCR是檢測基因表達zui靈敏，zui可靠的方法。通過在試驗過程中，實時監測熒光染料的信號變化，反映樣品中的基因拷貝數。實時定量PCR線性范圍廣（能達到5個數量級），因此可以檢測同一樣品中表達量極低的基因和表達量很高的基因。但是，由于實時定量PCR需要制備標準曲線和
Hippo信號通路和疾病
a. Hippo信號通路和癌癥癌癥是涉及異常細胞生長，可能侵入或蔓延到其他多個身體部位的疾病。雖然第一次發現Hippo通路是因為它可以通過促進細胞凋亡及抑制細胞周期來控制成像椎間盤生長，但是目前在動物模型中的研究已經將該通路的功能擴展到了其他癌癥，如乳頭狀腎癌，結直腸癌，卵巢癌，乳腺癌和胃癌。 Ca
通過qPCR開展基因表達譜分析
一提起基因表達譜分析，大家馬上會想到芯片。然而，并不是每個實驗室都具備這個條件。現在，利用每個實驗室都有的定量PCR儀，也能開展可靠的基因表達譜分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一種高度可靠且靈敏的基因表達譜分析技術，它利用實時定量PC
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法（五）
重復性 實時定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重復性強。為檢測重復性，2位研究者采用了同樣的總RNA樣品，分別進行了4次重復試驗。兩個人使用同種PCR芯片，但批號不同，并且每個人都分兩天進行試驗。比較兩位研究者分別做的4張芯片的原始Ct值。圖5顯示了比較結果的圖示和相關系數。每一組比較結果均獲得理
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法（二）
PCR芯片的設計和所包含的基因 96孔模式的每種RT2Profiler PCR芯片，含有基因特異性引物，可用于研究84個與某種信號通路或者疾病相關的基因。此外，芯片中還有設置了3個檢測實驗質量的對照。圖2為PCR芯片模式圖。由于每種芯片都是根據特別的信號通路或者特定的應用范圍設計的，研究者可以用它來
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法（一）
簡介：什么是PCR芯片？ 實時定量PCR是檢測基因表達最靈敏，最可靠的方法。通過在試驗過程中，實時監測熒光染料的信號變化，反映樣品中的基因拷貝數。實時定量PCR線性范圍廣（能達到5個數量級），因此可以檢測同一樣品中表達量極低的基因和表達量很高的基因。但是，由于實時定量PCR需要制備標準曲線和同時分析
PCR－Array－簡單實用的檢測基因表達的高通量方法（四）
RT2ProfilerTM PCR芯片特點靈敏度 研究者總是希望能檢測到表達量相當低的基因，有時候，研究者得到的起始總RNA量也很少，但仍希望能進行實時定量PCR檢測。為了滿足研究者的這些需要，Superarray嚴格檢測了PCR芯片系統的靈敏度。例如，Superarray使用PCR芯片檢測了一系列
什么是pcr－array？
pcr array 中文名稱就是PCR陣列，或者PCR芯片。運用高通量熒光定量PCR array 方法，在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關基因的多個基因的表達量變化進行檢測，芯片上的基因包括了與研究對象有確定關系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關基因
PCR－Array－技術原理
?PCR Arrays是分析一組特定基因表達的可靠工具，引物經過優化。每個96孔板、384孔板PCR Array都包含SYBR? Green優化的引物分析，可對相關的通路或疾病相關的基因進行細致的研究，并含有相應的RNA、DNA質量控制。PCR Arrays也可針對您特定的研究興趣對一些基因作定制化
PCR－Array－性能優勢
? 靈敏度：? ? 每個芯片使用至少1 ng或至多5 μg總RNA可獲得高于80%的陽性信號率，即使細胞中細胞因子的表達量很低，25 ng總RNA的陽性率也>80%。? ??? ? 重復性：? ? 圖為對比不同研究人員在間隔3個月的時間下使用不同批次的Human Drug Metabolism PC
基因信號通路的分類？
一是當信號分子是膽固醇等脂質時，它們可以輕易穿過細胞膜，在細胞質內與目的受體相結合；二是當信號分子是多肽時，它們只能與細胞膜上的蛋白質等受體結合，這些受體大都是跨膜蛋白，通過構象變化，將信號從膜外domain傳到膜內的domain，然后再與下一級別受體作用，通過磷酸化等修飾化激活下一級別通路。
基因信號通路的定義
細胞內各種不同的生化反應途徑都是由一系列不同的蛋白組成的，執行著不同的生理生化功能。各個信號通路中上游蛋白對下游蛋白活性的調節（包括激活或抑制作用）主要是通過添加或去除磷酸基團，從而改變下游蛋白的立體構象完成的。所以，構成信號通路的主要成員是蛋白激酶和磷酸酶，它們能夠快速改變和恢復下游蛋白的構象。從
Atlas?cDNA表達距陣(Expression－Array)
AtlasTM cDNA表達距陣(Expression Array)同時對588種/1176種關鍵基因做全景表達圖譜分析同時對大量已知基因的表達進行大規模高通量(High-htroughput)分析檢測關鍵基因在細胞關鍵功能中的角色只需簡單的雜交步驟就在數年前，核酸矩陣技術只能在資金雄厚的大實驗室開
FAO通路通過抑制失巢凋亡促進結腸直腸癌細胞遠端轉移
中山大學附屬腫瘤醫院腫瘤研究所徐瑞華教授長期從事消化道腫瘤個體化治療及抗癌藥物研究。該課題組利用NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array研究發現在非貼壁的結直腸癌細胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在轉移的腫瘤中，CPT1A表達上調，由CPT1A
FAO通路通過抑制失巢凋亡促進結腸直腸癌細胞遠端轉移
中山大學附屬腫瘤醫院腫瘤研究所徐瑞華教授長期從事消化道腫瘤個體化治療及抗癌藥物研究。該課題組利用NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array研究發現在非貼壁的結直腸癌細胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在轉移的腫瘤中，CPT1A表達上調，由CPT1A介導的
基因表達系列分析實驗（SAGE）（三）
58. 用 1：10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上觀察，分出感興趣的區帶。59. 把每一塊凝膠放入底部有約 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量離心管中（用 21-G 針頭刺的）。60. 把 0.5 離心管連同凝膠塊放入 2.0 ml 的硅烷化的離心管里
什么是基因信號通路？
信號通路是指當細胞里要發生某種反應時，信號從細胞外到細胞內傳遞了一種信息，細胞要根據這種信息來做出反應的現象。信號通路（signal pathway）的提出最早可以追溯到1972年，不過那時被稱為信號轉換（signal transmission）。1980年，M. Rodbell在一篇綜述中提到信號
BioMark?基因分析系統介紹
美國Fluidigm公司www.fluidigm.com創立于1999年，總部設在美國加州。其創始人是Steve Quake和Gajus Worthington(公司CEO)。Steve Quake是美國斯坦福大學教授，是微液流領域（Microfluidic Technology）的權威專家http
Atlas?cDNA表達距陣(Expression－Array)2
區分關系相近腫瘤的診斷工具 分析在腫瘤發生中起關鍵作用的基因的表達 588種與癌癥相關的cDNA點陣于一帶正電的尼龍膜上，另外還包括9個管家基因的質粒、噬菌體等陰性對照。cDNA按分子途徑和家族分類置于不同板塊，包括癌基因、抑癌基因、細胞周期相關基因和凋亡等。 Atlas? Mouse cD
FAO通路通過抑制失巢凋亡促進結腸直腸癌細胞遠端轉移
中山大學附屬腫瘤醫院腫瘤研究所徐瑞華教授長期從事消化道腫瘤個體化治療及抗癌藥物研究。該課題組利用NuRNA? Human Central Metabolism PCR Array研究發現在非貼壁的結直腸癌細胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在轉移的腫瘤中，CPT1A表達上調，由CPT1A
Nacia數字PCR在基因表達分析中的應用
華盛頓大學醫學院兒科和加利福尼亞大學圣地亞哥分校醫學院兒科的研究人員建立了一個穩定可靠的基于RNA磁珠提取和數字PCR的方法，可從糞便樣本中檢測與EE（熱帶腸病）關聯的人mRNA，靈敏度可達20拷貝GAPDH mRNA/200mg糞便樣本。已有報道表明病人糞便中存在人mRNA，可作為反應病人消化道病
Hippo信號通路及其在人類健康和疾病中的意義
Hippo途徑最早是在黑腹果蠅身上發現的，在過去的20年里一直被研究。Hippo途徑的基本發現和過程的時間表。在哺乳動物中，Hippo通路由幾個關鍵成分組成，包括哺乳動物STE20樣激酶1/2(MST1/2)、蛋白薩爾瓦多同源物1(SAV1)、MOBKL1A/B(MOB1A/B)、大腫瘤抑制因子
快速可靠的甲基化分析，無需亞硫酸氫鹽轉化
在甲基化分析中，亞硫酸氫鹽轉化通常是必經之路。它將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，之后再結合PCR、測序等技術分析甲基化狀態。聽上去似乎很簡單，但要想獲得漂亮的結果，卻并非那么容易。轉化效率如何?回收率如何?這都是需要考量和優化的因素。 最近，QIAGEN
NALP3炎性體與非感染性炎癥疾病及其通路研究工具
一、NALP3炎性體的結構和分布 NALP3炎性體是一類分子量約為700kDa的大分子蛋白復合體，由核苷酸結合寡聚化結構域樣受體（nucleotide-binding oligomerization domain-like receptors，NLRs）家族成員NALP3、銜接蛋白ASC
BioTNT－PCR－Array實驗操作（二）
三、數據導出后進行分析； 3.1?? 數據分析基本設置1.? 確定基線基線是qPCR擴增前期的熒光本底信號，一般都由儀器自動設置。不同儀器類型，基線的設置也略有不同，往往在熒光信號指數擴增階段的前幾個循環處，一般將定量PCR的前15個循環信號作為熒光本底信號，如果實驗數據中最低CT還小于基線的設置上