孟德爾遺傳病是新生兒出生缺陷的重要原因之一。對于,這些疾病的診斷通常基于兒童的病癥、表型特點進行臨床判斷,同時通過細胞、分子檢測手段確認染色體水平的結構變異或基因水平的突變進行病因確認。傳統的細胞或分子診斷方法包括核型分析、芯片分析、目標基因的一代Sanger測序等,而隨著二代測序的發展,高通量測序在疾病病因尋找中逐步顯示出巨大的潛力。 二代測序方法中全基因組測序、外顯組測序和定向基因測序是最為常用的方法,各種方法各有其優勢。全基因組測序覆蓋了最廣泛的區域,可以檢測非編碼區的突變,但測序量要求大,費用高,測序平均深度低,發現的突變的置信度可能下降。疾病相關基因的定向測序所需的測序量最少,獲得的測序深度最大,但不適合用于罕見的、或者相關疾病基因研究不成熟的遺傳病。而外顯子組測序相比全基因組測序降低測序量,提高測序深度,使得突變的發現更加可靠,而針對所有編碼區域、部分表達調控、microRNA測序等全面的檢測,相比定向基因測序更加全......閱讀全文
簡單來說,外顯子組就是遺傳代碼中蛋白質編碼的組分,占整個基因組的1%-2%。測序儀每跑一次僅能讀取一定數量的堿基,但通過測序外顯子組,研究人員能更快地生成更多的堿基。與全基因組相比,它也可以用更低的成本做出更好的分
孟德爾遺傳病是新生兒出生缺陷的重要原因之一。對于,這些疾病的診斷通常基于兒童的病癥、表型特點進行臨床判斷,同時通過細胞、分子檢測手段確認染色體水平的結構變異或基因水平的突變進行病因確認。傳統的細胞或分子診斷方法包括核型分析、芯片分析、目標基因的一代Sanger測序等,而隨著二代測序的發展,高通量
貝勒醫學院分子和人類遺傳學兒科學系、人類基因組測序中心和德克薩斯大學健康科學中心的研究人員曾經報道稱,在3386名接受全外顯子組檢測的患者當中,有大約四分之一的患者被診斷為一種已知的遺傳疾病。 最近在《Journal of the American Medical Association》(J
全基因組或外顯子組測序的臨床應用,稱為臨床基因組和外顯子測序( Clinical genome and exome sequencing,CGES)。由于該技術檢測范圍廣,可以同時檢測2000多個基因的變異,對于臨床罕見病、疑難疾病、復雜疾病,特別是孟德爾遺傳病的診斷是一種強大而有效的方法。
全外顯子組測序(WES)和全基因組測序(WGS)對于罕見的孟德爾遺傳病的檢測能力最高只能達到50%,基于這兩種手段,我們對于遺傳多樣性帶來具體生物學功能差異和臨床疾病病因的解釋能力是十分有限的。Cummings課題組曾使用RNA測序(RNAseq)對肌肉疾病進行了準確的檢測,證實了RNAseq在
時間總是過得很快,2016年馬上就要過去了,迎接我們的將是嶄新的2017年,2016年,我國有很多優秀科研機構的科學家們都做出了意義重大、影響深遠的研究成果,發表在國際頂級期刊上。本文中小編盤點了2016年我國科學家發表的一些重磅級研究,以饕讀者。 --結構生物學 -- 1.清華大學 施一