技術推薦|ChIP的新玩法
如果研究者們想知道蛋白在做什么,他們通常會采取直接的方式:免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有沒有在一起,ChIP能確定蛋白A是否與核酸序列B結合。 染色質免疫共沉淀ChIP可以鑒定與指定蛋白結合的DNA序列,其基礎理念能追溯到幾十年前。如今ChIP已經成為了表觀基因組學的一個基本工具,與新一代測序聯合使用可以實現基因組調控區域的定位和圖譜分析。 過去人們傾向于將大部分精力放在蛋白編碼區域,斯坦福大學醫學院的Michael Snyder教授說。“很明顯調控區域也是非常重要的。ChIP差不多是找出這些調控區域的最佳途徑。” ChIP實驗主要是通過交聯把蛋白質-DNA互作固定下來,破碎細胞并釋放其中的染色質。隨后將DNA打碎成小片段,用針對靶蛋白的抗體捕獲我們想要的DNA。最后去除交聯復原DNA,再通過PCR、DNA芯片或測序進行檢測。 ChIP的基礎理念多年來并沒有太大的改變,但開發者們一直在不斷進行著優化。 處理低量細......閱讀全文
ChIP-Chip E. coli
AbstractChIP-Chip stands for?Chromatin?Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin
ChIP-Chip技術的介紹與應用
人類基因組計劃的完成開啟了一個新的紀元——功能基因組時代來臨,與基因信息相比較,人們更關注于基因的功能、調控網絡與信號通路等信息。表觀遺傳學研究與核內蛋白因子的功能分析成為基因表達調控研究的重要組成部分。結合了染色質免疫共沉淀與基因芯片技術的ChIP-chip技術的浮現使得全基因組范圍內DNA與蛋白
染色質免疫沉淀芯片(Chip-Chip)
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點,ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。(2)染色體活性狀態的定
Tissue preparation protocol for ChIP
實驗概要This protocol ?describes how chromatin is prepared from tissue, which can subsequently ?be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). It is re
ChIP using plant samples
實驗概要?The ?immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies ?specific for certain histone modifications (chromatin ?immunoprecipitati
ChIP 新手心得
最近有不少戰友在做ChIP實驗,希望我的一點經驗對大家有幫助(本貼不談實驗步驟,最后我會附件一份說明書,有詳細步驟,另外建議像我一樣的新手用試劑盒,避免不必要的麻煩)一、原理轉錄從基因的啟動子區開始,由一系列的轉錄因子結合到基因的啟動子區,通用轉錄因子結合在基本啟動子區起始轉錄,而這個過程對基因的轉
ChIP using plant samples – Arabidopsis
實驗概要This protocol describes how chromatin is prepared from Arabidopsis, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). T
ChIP實驗技術經驗分享
染色質免疫沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,簡稱ChIP)是研究活體內蛋白質與DNA相互作用的一種技術。它利用抗原抗體反應的特異性,可以真實地反映體內蛋白因子與基因組DNA結合的狀況。隨著對基因功能研究的不斷深入,這項技術正越來越多的被應用于科研的各個領域
ChIP實驗技術經驗分享
染色質免疫沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,簡稱ChIP)是研究活體內蛋白質與DNA相互作用的一種技術。它利用抗原抗體反應的特異性,可以真實地反映體內蛋白因子與基因組DNA結合的狀況。隨著對基因功能研究的不斷深入,這項技術正越來越多的被應用于科研的各個領域。
免疫學技術專題:染色質免疫沉淀芯片(Chip-Chip)
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點,ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。(2)染色體活性狀態的定