免疫學技術專題：染色質免疫沉淀芯片（ChipChip）
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點，ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。（2）染色體活性狀態的定量分析。（3）組蛋白修飾的功能研究。通過用酰基化或甲基化的組蛋白的特異抗體和沒有進行修飾的組蛋白的特異抗體，可以確定與組蛋白修飾有關的結合模式的變化。（4）聚合酶活性的定量分析。（5）精煉生物信息方法，用功能數據來確定啟動子的位置。二、具體實驗原理和實驗步驟 染色質免疫沉淀芯片流程圖三、GeneChip-TilingArray技術簡介Affymetrix公司于2006年1月24日宣布推出GeneChip（R）人類和鼠源嵌合芯片（TilingA，ray）系列產品。該系列芯片研究范圍大大超出已知編碼蛋白序列，可以對整個人類和小鼠基因組進行......閱讀全文
免疫學技術專題：染色質免疫沉淀芯片（ChipChip）
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點，ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。（2）染色體活性狀態的定
染色質免疫沉淀芯片（ChipChip）
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點，ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。（2）染色體活性狀態的定
染色質免疫沉淀技術的應用
隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域，要想提供蛋白因子直接調控的證據，需要直接檢測蛋白質-DNA的相互作用，而染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）就是一種研
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點及應用2
3. 染色質免疫沉淀Input對照：在進行免疫沉淀前，需要取一部分斷裂后的染色質做Input對照。Input是斷裂后的基因組DNA，需要與沉淀后的樣品DNA一起經過逆轉交聯，DNA 純化，以及最后的PCR或其他方法檢測。Input對照不僅可以驗證染色質斷裂的效果，還可以根據Input中的靶序
技術和方案18－染色質免疫沉淀
試劑、試劑盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制劑裂解緩沖液免疫共沉淀洗脫液TESTE儀器、耗材超聲波粉碎儀實驗步驟1.培養要分析的細胞。每一個樣品，需要在三角瓶中培養 50~100ml 細胞至 OD600 大約為 1。2.甲醛處理細胞交聯蛋白質和 DNA。加甲醛到細胞中至終濃度為 1%(37% 的甲醛按 1
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點
染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，簡稱ChIP）是研究體內蛋白質與DNA相互作用的一種技術。它利用抗原抗體的特異性反應，可以真實地反映體內蛋白分子與基因組DNA結合的狀況。下面我們就最基本的實驗步驟，實驗中的小技巧以及需要注意的問題簡單介紹一下。1.
Cell特輯：免疫沉淀
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊，主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文，評論性文章以及snapshots，涉及了同一領域的方方面面，更為重要的是這些文章由贊助商贊助，可以免費獲取。 蛋白與DNA之間
ChIPChip技術的介紹與應用
人類基因組計劃的完成開啟了一個新的紀元——功能基因組時代來臨，與基因信息相比較，人們更關注于基因的功能、調控網絡與信號通路等信息。表觀遺傳學研究與核內蛋白因子的功能分析成為基因表達調控研究的重要組成部分。結合了染色質免疫共沉淀與基因芯片技術的ChIP-chip技術的浮現使得全基因組范圍內DNA與蛋白
染色質免疫沉淀分析
真核生物細胞狀態是由內源和外源因素共同影響的，所有信號傳遞途徑的終點都是DNA 。DNA 通過核蛋白復合物組成染色質，染色質是基因調控的一個重要作用位點。轉錄激活因子和輔助抑制因子的研究顯示存在一種新的調節機制--" 組蛋白密碼" ，其信息存在于組蛋白的轉錄后修飾等過程中。該類修飾包括組蛋白磷酸
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法，來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布（用芯片或 DNA 測序）。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法，來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布（用芯片或 DNA 測序）。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
免疫學技術專題：組織病理實驗（一）
標簽： 組織病理組織學技術包括、組織學制片技術、胚胎學制片技術、組織化學技術、熒光組化及免疫組化技術、組織培養技術、各種特殊顯微技術、電鏡組織學技術。組織學技術不但應用于組織學本學科，并且廣泛應用于其他多學科，如生物學、解剖學、病理學、腫瘤學、法醫學、臨床診斷學等。實驗方法石蠟切片法冰凍切片實驗方法
免疫學技術專題：組織病理實驗（二）
（7）切成的蠟帶到20~30 cm 長時，右手用另一支毛筆輕輕將蠟帶挑起，以免卷曲，并牽引成帶，平放在蠟帶盒上，靠刀面的一面較光滑，朝下，較皺的一面朝上。（8）用單面刀片切取蠟片一小段，放在載玻上加水一滴，置于放大鏡或顯微鏡下觀察切片是否良好。（9）切片工作結束后，應將切片刀取下用氯仿擦去刀上沾著的
免疫學技術專題：非標記抗體免疫電鏡技術
一、原理標記抗體法雖然具有許多優點，但也存在一些難以克服的問題，如標記抗體的分子增大，對細胞膜和組織的穿透力減弱；化學交聯反應對抗體和酶的活性有所影響；結合物中未標記的抗體可與抗原競爭結合，影響檢測方法的敏感性等。不標記抗體法可以避免上述的不利影響因素，通過一系統的非標記抗體的免疫學反應，對組織中的
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點及應用1
序言隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學的研究逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域。研究某個蛋白因子的調控功能，可以通過對蛋白活性（激活或抑制其活性），蛋白數量（過表達Overexpression或基因缺陷型Knockout）, 以及蛋白功能（功能缺陷
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質，以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg，但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前，需根據不同
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質，以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg，但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前，需根據不同
自然染色質免疫沉淀實驗設計
1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima
ChIPSeq分析常見問題集錦
染色質免疫共沉淀測序（ChIP-Seq）是指對染色質免疫共沉淀（ChIP）獲得的DNA片段進行大規模測序，并能把所研究蛋白的DNA結合位點精確定位到基因組上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 這3種測序技術均可以用于ChIP-
北京大學Cell－Res獲染色質免疫沉淀測序技術突破
生物動態光學成像中心黃巖誼課題組與湯富酬課題組合作，發展了一種基于微流控芯片的微量細胞樣品處理與核酸俘獲方法，成功實現了針對1000個細胞的染色質免疫沉淀測序（ChIP-Seq），大幅減少了這類實驗中對樣品起始量的要求，并利用這一方法研究了組蛋白H3第4位賴氨酸的3甲基化修飾（H3K4me3）在
染色質免疫沉淀法（Chromatin－immunoprecitation，ChIP）
染色質免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP）是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具。它可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結合情況，還可以用來研究組蛋白與基因表達的關系。核小體組蛋白可以發生多種翻譯后的共價修飾，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等，這些
高通量測序的應用及前景
一、高通量測序的應用 高通量測序可以幫助研究者跨過文庫構建這一實驗步驟，避免了亞克隆過程中引入的偏差。 依靠后期強大的生物信息學分析能力，對照一個參比基因組（reference genome）高通量測序技術可以非常輕松完成基因組重測序（re-sequence），2007年van Orsouw
染色質免疫共沉淀（ChIP）
染色質免疫共沉淀實驗方法原理在保持組蛋白和DNA聯合的同時，通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體，染色質被切成很小的片斷，并沉淀下來。IP是利用抗原蛋白質和抗體的特異性結合以及細菌蛋白質的“prorein A”特異性地結合到免疫球蛋白的FC片段的現象活用開發出來的方法。目前多用精制的prore
染色質免疫共沉淀（ChIP）
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在保持組蛋白和DNA聯合的同時，通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體，染色質被切成很小的片斷，并沉淀下來。IP是利用抗原蛋白質和抗體的特異性結合以及細菌蛋白質的“prorein A”特異性地結合到免疫球蛋白的FC片段的現象
染色質免疫共沉淀（ChIP）
實驗方法原理在保持組蛋白和DNA聯合的同時，通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體，染色質被切成很小的片斷，并沉淀下來。IP是利用抗原蛋白質和抗體的特異性結合以及細菌蛋白質的“prorein A”特異性地結合到免疫球蛋白的FC片段的現象活用開發出來的方法。目前多用精制的prorein A預先結合
染色質免疫共沉淀（ChIP）
實驗方法原理?在保持組蛋白和DNA聯合的同時，通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體，染色質被切成很小的片斷，并沉淀下來。IP是利用抗原蛋白質和抗體的特異性結合以及細菌蛋白質的“prorein A”特異性地結合到免疫球蛋白的FC片段的現象活用開發出來的方法。目前多用精制的prorein A預先結
免疫學技術專題：斑點金免疫滲濾測定法（DIGFA）
基本原理斑點金免疫滲濾測定法是在斑點免疫滲濾測定法基礎上，改用膠體金標記物代替酶，省去底物顯色的步驟。試驗方法是以硝酸纖維素膜（NC膜）為載體，將試劑及標本滴加在膜上，通過滲濾而逐步反應。全過程可于數分鐘內完成，陽性結果在膜上呈紅色斑點。試劑及材料1. 滲濾裝置：為一塑料小盒（4x3x0.6cm
免疫學技術專題：中性粒細胞吞噬功能的測定
中性粒細胞（polymorphonuclear leukocyte，PMN）的功能包括粘附、移動、吞噬殺菌等，是機體天然免疫力的重要組成部分。試劑及材料1. 白色葡萄球菌2. 肉湯培養基3. 鹼性美藍液操作方法1. 菌液的制備? 將白色葡萄球菌接種于中，放37℃溫箱內培養12h左右；置水浴中加熱10
染色質免疫共沉淀（CHIP）的原理是怎樣的？
真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在。因此，研究蛋白質與DNA在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。 染色質免疫沉淀技術（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP )是目前研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。 染
染色質免疫共沉淀技術（ChIP）
真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在。因此，研究蛋白質與DNA在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。染色質免疫沉淀技術（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。它的基本原理是在活細