RTPCR實驗方法大全(抽提RNA,RT,PCR)2
關于平臺期和線性期的問題,實際上線性期是指數期,只不過碰巧2的冥和2的倍數是相同的。看上去任何一個時期都可以,實際上是不對的,因為牽涉到酶促動力學的問題,這個我也不懂,有一些專門的文章,好像,涉及到很多化學的東西。我們學醫的,也沒必要知道那些,但是其中主要是因為模板引物酶原料和buffer之間的關系,這種反應單靠改變其中一種成分沒有用的,酶一直是過量,再加酶也沒用,引物ntp都是這樣。煙鬼正傳,最好選線性期的開始階段,但是要在你的凝膠成像分辨范圍內,所以選一個這兩種的契合點。給你一張圖你就明白了,再開始的時候酸的是切線,這圖我在 *** 帖過。關于引物設計,再可能的情況下,除了常規要求之外,最好兼顧跨內含子(不過,根據要求,還可以專門設計隔內含子的,這樣還可以用于基因組PCR)、長度小于500bp-600bp等等。 引物當然要設計成一樣的退火溫度,即使不再一管中,也要一樣的,要在一臺機器里啊。我的引物占了冰箱一格,大部分......閱讀全文
RTPCR原理與實驗操作步驟2
二、實驗器具的處理與準備1、塑料制品:(包括槍頭、EP管、勻漿管等)先將DEPC水從容量瓶中倒入瓷缸中,將塑料制品逐個浸泡其中,其中小槍頭需要吸管打入DEPC水,過夜,然后高壓,再烤干備用,實驗前將槍頭等放入吸頭臺,再高壓一次(EP管)2、玻璃制品:泡酸過夜,沖洗干凈,蒙錫紙烤干備用(DEPC水泡)
RTPCR實驗方法總結(1)
RT-PCR實驗有三步:抽提RNA,RT,PCR。?要求:?1.做RT前必需測RNA濃度,逆轉錄體系對RNA量還是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不會出太大問題。?3. PCR,按常規。但如需擴長片段,則對前兩步要求較高,需要有完整的cDNA存在,不是單改變Mg2+濃度、
microRNA-RTPCR實驗方法介紹
Stem-loop實時定量RT PCR 傳統實時定量RT PCR只能檢測到miRNA前體,而Stem-loop實時定量RT PCR技術可以解決這一問題。Stem loop實時定量RT PCR是一項高特異度、敏感度的檢測miRNA表達的實驗技術,包括設計具有莖環(stem loop)結構的
什么是RTPCR,RTPCR的定義與檢測方法?
1.定義:是以RNA為模板,聯合逆轉錄反應(reverse transcription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數細胞中少于10個拷貝的RNA模板。?RNA擴增包括兩個步驟: 在單引物的介導下和逆轉錄酶的催化下,合成RNA的互補cDNA;加熱后cDNA與RNA鏈解離,然后與另一引物退火
RtPCR實驗準備及與操作步驟2
六、需購置的Rt-PCR材料:(生工. Tel. 2236106.)Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00dNTP: 1支oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promegaM-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)RNasin: 1支 110
半定量RTPCR-(SemiQuantitative-RTPCR-)
RT-PCR?AnalysisSolutions10X RT Buffer10X?PCR?Buffer100 mM Tris pH 9.0500 mM KCl1% Triton X-10025 mM MgCl2use at a concentration of 1.5 mMLysis Solutio
RNA-提取策略及RT-PCR技術
第一部分RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常見
細胞RTPCR的經驗(偏向RNA提取)
做RT也做了幾次,有成功也有失敗,在園子中受益良多,把我自已的一個流程放上來,供大家參考.細胞RT-PCR操作流程實驗流程一 、取RNA:1、 處理細胞:(1) 貼壁細胞:先用無菌DEPC水配制的PBS洗細胞兩次,棄盡PBS后,直接向培養瓶中加入1ml Trizol,通過溶解細胞,通過移液管分次移出
競爭性-RTPCR:-競爭子-RNA-的構建實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 乙醇 雙蒸水 DNA 模板 [a-32P]ATP 儀器、耗材 RT
競爭性-RTPCR:-競爭子-RNA-的構建實驗
第一部分:競爭子的設計;第二部分:競爭子RNA的合成、純化和定量。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒乙醇雙蒸水DNA 模板[a-32P]ATP儀器、耗材RT-PCR 競爭子構建試劑盒實驗步驟一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑乙醇去除 RNA 酶的雙蒸水2. 核酸
競爭性-RTPCR:-競爭子-RNA-的構建實驗
試劑、試劑盒 乙醇雙蒸水DNA 模板[a-32P]ATP儀器、耗材 RT-PCR 競爭子構建試劑盒實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑乙醇去除 RNA 酶的雙蒸水2. 核酸和寡核苷酸DNA 模板(0.5~1.0ug 線性化的質粒模板或 0.1~0.5ugPCR 模板)3. 放射性復合物[a-3
Competitive-RTPCR-Strategy-for-Quantitative-Evaluation-2
Determination of Accuracy of the Competitive PCRTo test the precision of the results obtained with this competitive PCR, five different amounts of T (
RTPCR-PROTOCOL
RT-PCR PROTOCOL材料與方法…………………………………………………………????1.材料?………………………………………………………1.1?供試用組織(細胞)…………………………………1.2?主要儀器設備………………………………………1.3?主要試劑……………………………………………1.
Standard-RTPCR
RT-PCR or reverse transcription PCR refers to PCR that uses product of an RT reaction as template. In effect, the PCR amplifies cDNA fragments. In?one
RTPCR步驟
總RNA提取1. 取200mg組織,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。2. 震蕩30s。3. 加0.2ml氯仿,劇烈搖動30s,室溫3min。4. 12000×g,4℃ 離心,15min。5. 吸上層無色水相,移入另一EP管中(約0.5ml)。6. 加等體積異丙醇,-20℃,3
RTPCR之我見
本文討論的范圍包括RNA酶保護分析,northernblot,原位雜交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不談具體protocol,是因為各種書籍和kit說明書上都有,主要說一些原則,而且大部分是失敗和成功的經驗,還有小組討論結果以及各種書里七零八落看的內容,希望對大家有用。?基因表達的定義
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 雙蒸水 RT-PCR 緩沖液 MMLV 逆轉錄酶 SUPERaseINRNA 酶抑制劑 Taq DNA 聚合酶 總 RNA
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
已知線性范圍的循環參數和 18SrRNA 引物與競爭子的比例,就可以用自己的樣品去做相對定量 RT-PCR。下面配制的 PCR 反應混合物包含 9 個反應(4 個樣品、4 個非反轉錄對照、1 個不加模板的對照)及 10% 的額外份額。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑
RTPCR原理與實驗技術
一、知識背景:1. 基因表達:DNA——RNA——Protein單拷貝基因表達存在逐步放大機制,如一個蠶絲心蛋白基因——104個絲心蛋白mRNA(每個mRNA存活4d,可以合成105個絲心蛋白)——共合成109個絲心蛋白 。因此單拷貝基因的mRNA表達水平對于其功能水平的調控是非常重要的。2.?PC
相對-RTPCR:-樣品定量實驗
試劑、試劑盒 雙蒸水RT-PCR 緩沖液MMLV 逆轉錄酶SUPERaseINRNA 酶抑制劑 Taq DNA 聚合酶總 RNA 隨機引物dNTP 混合物 基因特異的正向引物基因特異的反向引物[a-32P]dCTP儀器、耗材 Quantu mRNA Universal 18S standards P
RTPCR實驗原理與步驟
【實驗原理】RT-PCR 是以RNA 為模板經逆轉錄反應(Reverse Transcription,RT)產生cDNA 第一鏈,再以cDNA 為模板進行PCR 擴增以檢測目的基因的表達情況。【實驗儀器】1. 恒溫金屬浴2. PCR 擴增儀【試劑及配制】RNA PCR Kit (AMV) Ver 3
RTPCR技術簡介和RTPCR引物的選擇
RT-PCR簡介RT-PCR是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用從RNA合成 cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cD
RT-PCR技術及RNA提取策略3
成功的RT PCR的要素1、高質量RNA 成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。RNA的質量決定了你能夠轉錄到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)選擇性分離poly(A)+RNA。不管起始模
RT-PCR技術及RNA提取策略1
第一部分 RNA 提取策略1、RNA降解的原因內源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因為人體細胞自身就是幾十分鐘(20min?)mRNA被降解一輪,所以不管是組織還是細胞還是液體狀樣本在離開其中細胞的最佳生活狀態后都應該盡快的被妥善的方法保存起來。外源性RNA酶也是一個需要注意的因素,最常
RNA抽提和標記實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 從組織培養收獲的細胞 在組織培養中的細胞 凍存的整個組織
RNA抽提和標記實驗
實驗材料從組織培養收獲的細胞在組織培養中的細胞凍存的整個組織試劑、試劑盒磷酸鹽緩沖液(PBS)TRIzol 試劑乙醇乙酸鈉EDTANaOHTris-ClTE 緩沖液固定化的 oligo-dT 引物儀器、耗材組織勻漿器熱循環儀熒光掃描儀實驗步驟實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他」1a.
RNA抽提和標記實驗
實驗方法原理 實驗材料 從組織培養收獲的細胞在組織培養中的細胞凍存的整個組織試劑、試劑盒 磷酸鹽緩沖液(PBS)TRIzol 試劑乙醇乙酸鈉EDTA NaOHTris-ClTE 緩沖液固定化的 oligo-dT 引物儀器、耗材 組織勻漿器熱循環儀熒光掃描儀實驗步驟 實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材
RNA抽提經驗
對大部分實驗人員來說,RNA 抽提比基因組 DNA 抽提要困難得多。事實上,現有的 RNA 抽提方法/試劑,如果用于從培養細胞中抽提 RNA,比抽提基因組 DNA 更方便,成功率也更高。那為什么同樣的方法用于組織 RNA 的抽提,總會碰到問題呢? ??組織 RNA 抽提失敗的兩大現象是: RNA 降
PCR(RTPCR)反轉錄-定性檢測方法
1、試劑 (1)10倍 RT 緩沖液:500mmol/L Tris·Cl(pH8.0),0.60 mmol/L MgCl2,400mmol/L KCl,10mmol/L DTT。 (2)10倍 PCR 緩沖液:100mmol/L Tris·Cl(pH8.3),500mmol/L kCl,15
Protocol-for-competitive-RTPCR
For quantifying mRNA, we use a competitive RT-PCR protocol with internal standard RNAs. These are added in a defined quantity to the RNA sample prior