高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹
1、高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹 微生物環境基因組學又叫宏基因組學,它是研究某一環境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落多樣性的一門科學,它是一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質(或獲得新基因)的新理念和新方法。 第二代高通量測序技術為研究微生物群落結構提供了新的技術平臺,并得到越來越多的應用和認可。與傳統的微生物平板純培養方法、微平板分析方法、磷脂脂肪酸法以及DGGE/TGGE/TTGE、T-RFLP、SSCP、FISH、印記雜交、定量PCR、基因芯片等分子生物學方法相比,具有如下優勢:(1)不需要對微生物進行分離培養和純化,因此該方法不受微生物人工培養特性的限制,(2) 能同時對樣品中的優勢物種、稀有物種及一些未知的物種進行檢測,獲得樣品中的微生物群落組成,(3)并且在文庫制備過程中,可以通過嚴格的技術手段將文庫制備過程所帶來的偏向性降至最低,所以應用高通量測序技術能準確地反映......閱讀全文
高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹
1、高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹 微生物環境基因組學又叫宏基因組學,它是研究某一環境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落多樣性的一門科學,它是一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質(或獲得新基因)的新理念和新方法。 第二代高通量測序技術為研究微生物群落結
高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹
1、高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹 微生物環境基因組學又叫宏基因組學,它是研究某一環境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落多樣性的一門科學,它是一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質(或獲得新基因)的新理念和新方法。 第二代高通量測序技術為研究微生物群落結
高通量測序在微生物多樣性研究中的應用
1、高通量測序在微生物多樣性研究中的應用介紹 微生物環境基因組學又叫宏基因組學,它是研究某一環境樣品中所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落多樣性的一門科學,它是一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質(或獲得新基因)的新理念和新方法。 第二代高通量測序技術為研究微生物群落結構提供了新的技術平臺,并
高通量測序技術在腸道菌群多樣性研究中的應用
近年來, 新興的生物技術, 主要包括基因工程、生物工程、發酵工程和酶工程。利用生物技術, 可以通過生物遺傳基因的重組,開發出新的優良品種和新的物種; 可以通過新陳代謝作用, 生產出許多有用的新有機物質; 可以通過酶促反應, 大大改善許多現有生產工藝的條件和效率。由于造紙工業的基本原料是生物體(
高通量測序技術在腸道菌群多樣性研究中的應用
在人體腸道中生活著數以萬億的共生菌群,它們的種類繁多,可達上千種,數量也很驚人,是人體細胞總量的10倍以上,迄今為止,仍有80%以上的微生物不為人知。這些腸道微生物和人體存在著互利共生的關系,對于維持人類的健康發揮著重要的作用。它們在腸道中保持著一種動態的平衡,能夠合成維生素、幫助人體從食物中吸收
高通量測序技術在腸道菌群多樣性研究中的應用(二)
二、腸道菌群與疾病發生之間的關聯1.? Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文獻報道腸道菌群與人類代謝疾病之間存在著某種關聯,為了研
高通量測序技術在腸道菌群多樣性研究中的應用(三)
一、飲食、能量攝取、肥胖與腸道菌群之間的關系:1.? A core gut microbiome in obese and lean twins——2009《Nature》——if 36.102.? An obesity-associated gut microbiome with increase
高通量測序技術在腸道菌群多樣性研究中的應用(一)
在人體腸道中生活著數以萬億的共生菌群,它們的種類繁多,可達上千種,數量也很驚人,是人體細胞總量的10倍以上,迄今為止,仍有80%以上的微生物不為人知。這些腸道微生物和人體存在著互利共生的關系,對于維持人類的健康發揮著重要的作用。它們在腸道中保持著一種動態的平衡,能夠合成維生素、幫助人體從食物中吸收營
高通量測序技術在無創產前檢測中的應用
染色體非整倍體是胎兒出生缺陷最常見病因之一,其中以21-三體綜合征、18-三體綜合征最為常見,占所有足月妊娠的0.2%~0.3%。對先天性遺傳病進行產前篩查和產前診斷是優生優育的重要保證。自1970年以來,針對上述胎兒染色體疾病的產前篩查和產前診斷已逐漸應用到臨床上,并在降低出生缺陷方面得到了良好的
高通量測序平臺發展及在臨床分子診斷中的應用
自2000年人類基因組計劃完成,測序技術得到了快速的發展。在美國ABI公司基于末端終止法的第一代測序基礎上,各大公司相繼推出了不同的NGS測序平臺。核酸(DNA和RNA)測序技術的發展推動了醫學對遺傳病分子特征的認識。以揭示疾病分子特征為目的的高通量測序,即下一代測序(next generati
在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術(一)
摘要:CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗,對相關內容
在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術(二)
四.CRISPR/Cas9技術與新一代測序技術的聯用?革命性技術總是發展迅速、應用廣泛的。作為另一項革命性的生命科學研究技術,DNA新一代測序技術在近五、六年得到快速發展和推廣。它已經用于生命科學相關領域的許多方面。同樣地,也可以用在CRISPR/Cas9相關的研究中。兩者之間的應用領域有許多交叉或
高通量測序的技術應用的介紹
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行從頭測序(de novosequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測
關于高通量測序的技術應用介紹
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行從頭測序(de novo sequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重
強強聯合:在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術
摘要: CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗
單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用
單細胞測序技術在腫瘤研究中有以下多方面的應用:腫瘤細胞異質性研究鑒定腫瘤內不同的細胞亞群,包括具有不同基因突變、轉錄組特征和表型的細胞。揭示腫瘤細胞之間的差異對腫瘤進展、轉移和治療反應的影響。腫瘤微環境分析解析腫瘤微環境中免疫細胞、基質細胞等的組成和功能狀態。研究腫瘤細胞與微環境中其他細胞的相互作用
高通量測序技術的應用
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行重頭測序(de novosequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測
454高通量測序研究土壤微生物的新手段
在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物質循環
454高通量測序——研究土壤微生物的新手段
在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物質循環的
單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用案例
以下是一些單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用案例:??**案例一:乳腺癌** 研究人員利用單細胞測序技術對乳腺癌腫瘤組織進行分析,發現了不同亞型乳腺癌細胞之間的基因表達差異和腫瘤細胞的異質性。他們鑒定出了具有干細胞特性的腫瘤細胞亞群,這些細胞可能與腫瘤的復發和耐藥性有關。這為開發更有針對性的治療
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
高通量測序的應用及前景
一、高通量測序的應用 高通量測序可以幫助研究者跨過文庫構建這一實驗步驟,避免了亞克隆過程中引入的偏差。 依靠后期強大的生物信息學分析能力,對照一個參比基因組(reference genome)高通量測序技術可以非常輕松完成基因組重測序(re-sequence),2007年van Orsouw
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
高通量測序技術研究進展介紹
第二代測序技術, 又稱新一代測序技術, 是相應于以Sanger 測序法為代表的第一代測序技術而得名。第二代測序中3種主流測序技術分別為依次出現的 Roche/454 焦磷酸測序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成測序(2006 年)和 ABI/SOLiD 連接酶測序(
454高通量測序——研究土壤微生物的新手段(三)
注:已用454焦磷酸測序法發表的文章總結1、Archaea predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in soils——?(2006) Nature 442: 806-809——if 36.1012、454 Pyrosequencing ana
454高通量測序——研究土壤微生物的新手段(二)
二、高通量測序在土壤微生物研究中的應用?1.1 研究土壤微生物的物種多樣性?微生物物種多樣性主要從對微生物類群即細菌、真菌和放線菌這三大類群的數量及其比例組成來描述微生物多樣性,或者按照微生物在生態系統中的作用將其劃分成不同的功能群(function group),通過某一功能群中物種的分類
454高通量測序——研究土壤微生物的新手段(一)
在陸地生態系統中,在土壤中生活有數量龐大的微生物種群,包括原核微生物如細菌、藍細菌、放線菌及超顯微結構微生物, 以及真核生物如真菌、藻類( 藍藻除外) 、地衣等。它們與植物和動物有著明確的分工,主要扮演“分解者”的角色,幾乎參與土壤中一切生物和生物化學反應,擔負著地球C、N、P、S 等物
高通量測序的相關介紹
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。 名詞解釋 根據發展歷史、影響力、測序原
單細胞測序技術在細胞呼吸研究中的應用前景
單細胞測序技術在細胞呼吸研究中的應用前景非常廣闊。未來,它有望幫助我們更深入地理解細胞呼吸的精細調控機制。通過對大量單個細胞的分析,可以揭示不同細胞類型和狀態下細胞呼吸的特異性變化,發現新的與細胞呼吸相關的基因和調控網絡。在疾病研究方面,單細胞測序能夠精確解析病變組織中細胞呼吸異常的細胞亞群,為疾病
時空分辨單細胞測序技術在腫瘤研究中的應用
時空分辨單細胞測序技術在腫瘤研究中有以下應用:腫瘤發生的早期檢測能夠追蹤腫瘤起始細胞在早期階段的變化,發現潛在的腫瘤發生標志,從而實現更早期的診斷。腫瘤異質性解析明確腫瘤內部不同細胞在空間位置上的基因表達差異,深入了解腫瘤異質性的形成機制和演化過程。腫瘤微環境研究分析腫瘤微環境中各種細胞(如免疫細胞