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    在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術(二)

    四.CRISPR/Cas9技術與新一代測序技術的聯用 革命性技術總是發展迅速、應用廣泛的。作為另一項革命性的生命科學研究技術,DNA新一代測序技術在近五、六年得到快速發展和推廣。它已經用于生命科學相關領域的許多方面。同樣地,也可以用在CRISPR/Cas9相關的研究中。兩者之間的應用領域有許多交叉或重合。 1.高通量測序可用于檢驗CRISPR/Cas9基因組編輯的結果,以及進行脫靶效應的分析 編碼Cas9和sgRNA的片段通過質粒或其它途徑轉染進細胞后,Cas9在特異的位點對目標基因組進行切割,引起DNA雙鏈斷裂 (double-strand break, DSB),通過非同源末端連接(nonhomologous end joining, NHEJ)或同源重組(homologous recombination, HR),產生DNA的插入或刪除(indel),或者依賴于含有特異突變的同源模......閱讀全文

    強強聯合:在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術

      摘要:   CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗

    在CRISPR/Cas9相關研究中應用高通量測序技術(一)

    摘要:CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗,對相關內容

    2017年5月CRISPR/Cas亮點盤點

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    哈佛大學實驗室發現CRISPR/Cas9存在嚴重脫靶效應

      哈佛大學David R Liu實驗室利用體外篩選和高通量測序檢測CRISPR/Cas9的脫靶,針對CLTA基因的四個不同靶位點共設計了八條不同序列的gRNA,即每個靶位點有兩條gRNA,結果發現,四個靶位點均存在脫靶現象,脫靶效率最高可達 84%,同時CRISPR/Cas9的特異性僅與g

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    基因編輯進展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技術應用篇(下)

      上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。   一、大規模基因功能的篩選   盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基

    基因編輯進展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技術應用篇(下)

      上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。   一、大規模基因功能的篩選   盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基因型-表型關系仍

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究篇

      基因編輯技術是指對目標基因進行編輯,實現對特定DNA片段的敲除、插入等。自CRISPR/Cas9基因編輯技術問世以來,取得了一系列重大突破,并相繼在2012、2013、2015和2017年被Science雜志評為十大科學進展之一。因此,CRISPR/Cas9以其操作簡便和成本低廉等優勢受到了眾多

    魏文勝:CRISPR功能性篩選新方法

      自2013年Science雜志將CRISPR技術選為年度突破開始,這一新技術就給基因編輯世界帶來一場風暴:在過去的這一年半時間里,CRISPR方法已迅速席卷了整個動物王國,成為DNA突變和編輯的一種明星技術。   國內外各大生物實驗室的科學家們紛紛嘗試利用這種技術進行攻關,近期來自北京大學生命

    Nat Methods: 2014年值得關注的技術

      單細胞測序被評為2013年年度技術   2014 年首刊,《Nature Methods》雜志將2013年度技術(Method of the Year 2013)授予了單細胞測序(single-cell sequencing)。同時,雜志還介紹了2014年值得關注的技術,包括

    基因修飾小鼠(GEM)模型在腫瘤學研究中的應用(二)

    最近,CRISPR/Cas9系統也應用于靶基因的抑制(CRISPRi)或激活(CRISPRa)的遺傳修飾。這類修飾系統可用于研制相應致癌基因,和/或抑制TSGs基因的誘導和可逆激活小鼠模型。比如借助CRISPRa為基礎的系統,通過激活致癌基因的轉錄,達到研究其致癌潛力的目的。雖然CRISPR/Cas

    國外企業“妙招” 攻克長讀長測序技術中“DNA提取”的痛點?

      近年來,Pacific Biosciences、Oxford Nanopore Technologies、Bionano Genomics和10x Genomics等公司的長讀長測序和基因組圖譜技術越來越受歡迎。隨著相關技術的推廣應用,長讀長測序技術在快速、高效提取高質量高分子量DNA方面的痛點

    當“魔剪”CRISPR遇上干細胞,會撞出什么火花?

      自發現以來,基于CRISPR的基因編輯系統已經從根本上改變了研究者們操縱基因組的能力。近日,Cell雜志推出CRISPR特輯——Gene Editing in Stem Cells,用2個SnapShots、2篇綜述以及7篇論文,回顧了近階段基因編輯技術與干細胞之間“擦出的火花”。  Cell

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    2018年5月CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。  

    27篇SNC論文!他憑這些學術成就獲億元融資

      基因修飾動物是研究在發育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系統有效的應用于構建基因敲除和敲入小鼠。而楊輝團隊正好專注于該領域。  楊輝,30歲時,就成為中科院上海生科院神經所研究員;2015年,入選國家“青年千人計劃”;2019年,楊輝博士獲得國家杰出青年基金資助。  由楊輝創辦

    同濟教授用CRISPR制備瘦素缺陷大鼠

      Leptin(LEP)是由脂肪細胞分泌的蛋白質類激素,主要由白色脂肪組織產生。其前體由167個氨基酸殘基組成,N末端有21個氨基酸殘基信號 肽,該前體的信號肽在血液中被切掉而成為146氨基酸,分子量為16KD,形成Leptin。Leptin具有廣泛的生物學效應,其中較重要的是作用于下 丘腦的代謝

    Horizon Discovery又獲一CRISPR技術商業使用權

      Horizon Discovery是一家總部位于英國劍橋的跨國生物科技公司,具有十余年的基因編輯技術研究歷史。該公司于2014年在倫敦股票交易市場上市,是劍橋有史以來上市融資最多的生物高科技公司。公司至今已獲得十多個科技及創新企業大獎,其中包括女皇全英企業獎、“最有前途生物科學公司”獎等。另外,

    2019年8月CRISPR/Cas最新研究進展

      基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。圖片

    基因組技術來了,“人人基因”時代中國產業如何爭上游?

      何菊虹(化名)41歲時懷上了二胎,在西安一家民營醫院產檢“唐氏篩查”時,被醫生告知“一切正常”,但孩子出生后被確診為唐氏綜合征患者,一家人的生活從此陷入為孩子康復、治療的絕望里。  “如果當時就有無創產前基因檢測,這樣的悲劇就基本不會發生了。”深圳華大基因執行副總裁朱巖梅在朋友圈如此評論。  何

    BioTechniques:2015最受歡迎的技術文章

      BioTechniques雜志日前評出了2015年最受歡迎的十篇技術文章,涵蓋了對PCR、DNA提取、無細胞蛋白表達等常規技術的改良,以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微圖案化等新技術的應用。  1. Visual detection of isothermal nucleic aci

    顯微注射技術:跨越百年的不老傳奇

      江湖寒,刀鋒冷,人斷腸。問世間江湖,幾許清醒,幾許夢寒?狂歌以后,路遙遙,風沙厲!   ——古龍   時光荏苒,歲月穿梭,現已是公元2019年,回望2018,請允許小編以這古龍先生之詞懷金庸先生之作。2018,注定是不平凡的一年,生命科學領域可謂是悲喜交加,前有科學家利用單細胞分離與單細胞

    顯微注射技術:跨越百年的不老傳奇

      江湖寒,刀鋒冷,人斷腸。問世間江湖,幾許清醒,幾許夢寒?狂歌以后,路遙遙,風沙厲!   ——古龍   時光荏苒,歲月穿梭,現已是公元2019年,回望2018,請允許小編以這古龍先生之詞懷金庸先生之作。2018,注定是不平凡的一年,生命科學領域可謂是悲喜交加,前有科學家利用單細胞分離與單細胞

    4月王牌聚焦:紛紛擾擾的干細胞造假事件

      2014年的四月天氣波動頻繁,一會兒艷陽高照,一會兒又烏云密布,氣溫驟降。生命科學界竟也是如此:干細胞研究一會兒報道稱獲得了突破性的重大成果,但沒高興幾天,作者就已經承認造假了,就連iPS技術鼻祖山中伸彌也來湊熱鬧……  今年一月,日本理化研究所宣布,通過將皮膚等處的體細胞在弱酸性溶液中浸泡30

    CRISPR/Cas9與DNA條形碼的突破性“聯姻”:探索瘤內基因異質性

      腫瘤異質性作為癌癥生物學最主要的特征之一,是癌癥研究者必須考慮的問題。對處于正常組織背景下的腫瘤而言,可能包含多種不同亞型,這些亞型可能含有各自獨特的突變信息,這種異質性對癌細胞的耐藥性及腫瘤的復發起著關鍵性的作用。   論文第一作者Alexis Guernet突破性地將CRISPR/Cas9

    Science雜志最受關注的文章(11月)

      生物通報道:美國的《Science》雜志由愛迪生投資創辦,是國際上著名的自然科學綜合類學術期刊,與英國的《Nature》雜志被譽為世界上兩大自然科學頂級雜志。Science雜志主要發表原始性科學成果、新聞和評論,許多世界上重要的科學報道都是首先出現在Science雜志上的,比如艾滋病與人類免疫缺

    清華大學Nature子刊:將Cas9應用于分子克隆

      在4月21日的《自然實驗手冊》(Nature Protocols)雜志上,清華大學的朱聽(Ting Zhu)研究員與博士生姜文君(Wenjun Jiang)撰文,詳細介紹了利用一種叫做Cas9輔助靶向染色體片段(CATCH)的方法,靶向分離及克隆100kb微生物基因組序列的優化實驗方案。  朱聽

    基因編輯進展梳理 Part I CRISPR系統拓展及機制研究(二)

     兩篇研究揭示Cas4核酸酶對于CRIPSR免疫反應的重要性2018年3月27日的,Shiimori團隊在Cell Reports期刊上發文,證明了Cas4核酸酶是間隔序列前體臨近基序( PAMs )靶向選擇所必須的,有助于Cas1和Cas2選擇新的CRISPR間隔物,并賦予天然宿主S

    顯微注射技術介紹

    時光荏苒,歲月穿梭,現已是公元2019年,回望2018,請允許小編以這古龍先生之詞懷金庸先生之作。2018,注定是不平凡的一年,生命科學領域可謂是悲喜交加,前有科學家利用單細胞分離與單細胞測序技術揭示胚胎發育過程助力生命醫學研究,后有飽受爭議的世界首例基因編輯嬰兒的誕生[1],科學的腳步以超乎人類想

    盤點全基因組檢測CRISPR脫靶位點的幾種重要技術

      在2013年,來自麻省總醫院的研究人員發現使用CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶的一個重要局限:會在預期靶點以外的位點上生成多余的DNA突變。此后陸續有研究直接說明了CRISPR/Cas9存在嚴重的脫靶性,即該技術可以發生非特異性切割,引起基因組非靶向位點的突變,這樣會造成研究結果的不確定

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