前一陣子一直在做雙酶切質粒重組,失敗了很多次,不過很快改善了 實驗方法,用2周重組了14個質粒。現就自己的體會,結合前人的寶貴經驗,談一下質粒重組的一些個人經驗。1、回收PCR產物:在進行PCR擴增時候,給引物兩端設計好酶切位點,一般說來,限制酶的選擇非常重要,盡量選擇粘端酶切和那些酶切效率高的限制酶,如 BamHI,HindIII,提前看好各公司的雙切酶所用公用的BUFFER,以及各酶在公用BUFFER里的效率。選好酶切位點后,在各個酶的兩邊加上保護堿基。雙酶切時間及其體系: 需要強調的是很多人建議酶切過夜,其實完全沒有必要,我一般酶切3個小時,其實1個小時已經足夠。應用大體系,如100微升。純化問題:純化PCR產物割膠還是柱式,我推薦柱式,因為割膠手法不準,很容易割下大塊的膠,影響純化效率。現在的柱式純化號稱可以祛除引物,既然如此,酶切掉的幾個堿基肯定也會被純化掉了。所以,PCR產物和雙酶切產物的純化均可應用柱式純化......閱讀全文
1、 在雙酶切載體時如果2個酶切位點靠得很近,必須注意酶切順序。因為有的限制性內切酶要求其識別序列的兩端至少保留有若干個堿基才能保證酶的有效切割。有的酶要求識別序列兩端有多個堿基的,則必須先切,否則就可能造成酶切失敗。2、 回收PCR產物:回收的PCR產物片段=1:10 ,一般取前者0.03pmol
5.有關融合蛋白表達載體的克隆 在構建融含蛋白表達載體時除了要注意插入片段的方向、讀碼框架與載體保持一致外,注意以下問題可能會減少一些不必要的麻煩,當外源片的插入載體起始密碼的后面,另一個基因的前面時,注意檢查插入后基因的兩端是否引入了新的終止密碼,特別是用到Klenow mung bean
限制性核酸內切酶產品選擇專題1)購買的限制性內切酶 帶有兩種不同的酶切緩沖液,該用哪一種? 每種限制性內切酶 帶有一管酶的最適反應液(通常是一種4-CORE反應液),可能還帶有一只MULTI-CORE反應液。 2)4-CORE酶切緩沖液體系是什么? 大多數(大約7
一、RNA 制備 模板mRNA 的質量直接影響到cDNA 合成的效率。由于mRNA 分子的結構特點,容易受RNA 酶的攻擊反應而降解,加上RNA 酶極為穩定且廣泛存在,因而在提取過程中要嚴格防止RNA 酶的污染,并設法抑制其活性,這是本實驗成敗的關鍵。所有的組織中均存在RNA 酶,人
第一章質粒DNA 的分離、純化和鑒定 第二章DNA 酶切及凝膠電泳 第三章大腸桿菌感受態細胞的制備和轉化 第四章RNA 的提取和cDNA 合成 第五章重組質粒的連接、轉化及篩選 第六章基因組DNA 的提取 第七章RFLP 和RAPD 技術 第八章聚合酶鏈式反應(PCR)擴增和擴增產物克隆 第九章分
雙酶切buffer的選擇: 1、U :Supplied with its own unique reaction buffer that is different from the four standard NEBuffers. Its compatibility with the fou
酶切基礎知識DNA酶切一般分為質粒直接酶切和PCR產物酶切第一節 DNA酶切及凝膠電泳 一.DNA的限制性內切酶酶切分析 限制性內切酶能特異地結合于一段被稱為限制性酶識別序列的DNA序列之內或其附近的特異位點上,并切割雙鏈DNA。它可分為三類:Ⅰ類和Ⅲ類酶在
連接反應的策略 可以采用幾種策略來進行外源DNA片段和質粒載體的連接。對此,可依據外源DNA片段未的性質,以及質粒載體與外源DNA上限制酸切位點的性質來作出選擇。(一)外源DNA片段未的性質帶有各種未的外源DNA的克隆方法見下表:──────────────────────
當我們已經獲得目的基因片段,選擇好適當的克隆(或表達,轉化)質粒載體, 并確定重組方案后,下面要進行的就是DNA片段之間的體外連接,從而獲得重組子。 此重組子可轉入相應的宿主菌中用于對目的基因的擴增以及目的基因表達(如現代基因工程藥物的生產),還可用于序列分析和轉基因等重要生物技術的研究中。&nbs
用于基因工程的工具酶一,限制性內切酶(Endonucleosase)(一)限制性內切酶(Endonucleosase)的發現與分類1) 50年代初發現細菌能將外來DNA片段在某些專一位點上切斷,從而保證其不為外來噬菌體所感染,而其自身的染色體DNA由于被一種特殊的酶所修飾而得以保護,這種現象叫做限制
酶切可用于:(1)獲得粘性末端進行連接;(2)驗證DNA重組是否成功;(3)驗證質粒酶切位點是否有效。實驗方法原理采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度
實驗方法原理 采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決:1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分
酶切實驗 實驗方法原理 采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行
在進行PCR擴增時候,給引物兩端設計好酶切位點,一般說來,限制酶的 選擇非常重要,盡量選擇粘端酶切和 那些酶切效率高的限制酶,如BamHI、HindIII,提前看好各公司的雙切酶所用公用的BUFFER,以及各酶在公用BUFFER里的效率。選好酶切位點后,在各個酶的兩邊加上保護堿基,其原則可
重組DNA是在體外用限制性內切酶,將不同來源的DNA分子進行特異地切割,獲得的目的基因或DNA片段與載體重新連接,從而組成一個新的DNA雜合分子。重組的DNA分子能夠通過一定的方式進入相應的宿主細胞,在宿主細胞中進行無性增殖,獲得大量的目的基因或DNA片段,此過程稱基因克隆。重組的DNA分子也能夠在
前一陣子一直在做雙酶切質粒重組,失敗了 很多次,不過很快改善了 實驗方法,用2周重組了 14個質粒。現就自己的體會,結合丁香園戰友的寶貴經驗,談一下質粒重組的一些個人經驗。1、回收PCR產物:在進行PCR擴增時候,給引物兩端設計好酶切位點,一般說來,限制酶的 選擇非常重要,盡量選擇粘端酶切和 那些酶
采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決:1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切;2
【實驗目的】1.掌握質粒提取的基本方法的原理;2.學習和掌握限制性內切酶的使用方法。【實驗原理】重組克隆的篩選和鑒定是基因工程中的重要環節之一。不同的克隆載體和相應的宿主系統,其重組克隆的篩選和鑒定方法不盡相同。從理論上說,重組克隆的篩選是排除自身環化的載體、未酶解完全的載體以及非目的DNA片斷插入
做了快7年的分子克隆,從加樣加不好,到現在輕松PCR,我想分子生物學這塊還是有很多經驗可以分享一下的。或許很多人會說分子克隆過程中出現問題最多的大概就是連接了,大家抱怨的也最多,我也陷入在個步驟上很久。經過長時間的摸索我在連接這個問題上有一些體會,我認為連接的問題多集中在連接的體系、DNA的用量、v
一、限制性內切酶限制性內切酶(restriction endonucleases,RE)是其中最重要的工具酶之一。它是一類核酸水解酶,能識別和切割雙鏈DNA分子中的特定核苷酸序列。(一)命名原則限制性內切酶大多從細菌中發現,根據來源進行命名,限制酶的第一個字母(大寫,斜體)為宿主菌的屬名,第二、第三
采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進行酶切以獲得相應的粘末端進行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時可以采用如下措施解決: 1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切
分子生物學產品常見問題分析問題原因解決辦法DNA完全沒有被內切酶切割1) 內切酶失活標準底物檢測酶活性2) DNA不純,含有SDS,酚,EDTA等內切酶抑制因子將DNA過柱純化,乙醇沉淀DNA3) 條件不適(試劑、溫度)檢查反應系統是否最佳4) DNA酶切位點上的堿基被甲基化換用對DNA甲基化不敏感
一、 建立一個標準的酶切反應目前大多數研究者遵循一條規則,即10個單位的內切酶可以切割1μg不同來源和純度的DNA。通常,一個50μl的反應體系中,1μl的酶在1X NEBuffer終濃度及相應溫度條件下反應1小時即可降解1μg已純化好的DNA。如果加入更多的酶,則可相應縮短反應時間;如果減少酶
目的:了解T4DNA連接酶的幾種生物學功能及用途;學習在T4DNA連接酶的作用下,載體與目的基因的幾種不同的連接方式以及在標準的連接反應體系中,質粒載體和插入的外源DNA的比率關系和各自的用量;掌握用Pmd18-Tvector與PCR產物進行T-A克隆的機理及其應用。原理:外源DNA片段和線狀質粒載
一、 建立一個標準的酶切反應目前大多數研究者遵循一條規則,即10個單位的內切酶可以切割1μg不同來源和純度的DNA。通常,一個50μl的反應體系中,1μl的酶在1X NEBuffer終濃度及相應溫度條件下反應1小時即可降解1μg已純化好的DNA。如果加入更多的酶,則可相應縮短反應時間;如果減少酶
實驗方法原理TA克隆 系統由Invitrogen公司(San Diego,CA)發展而來的商業性試劑盒,它用于PCR 產物的克隆 和測序。其原理是利用Taq酶能夠在PCR 產物的3'末端加上一個非模板依賴的A,而T載體是一種帶有3'T突出端的載體,在連接酶作用下,可以快速地、一步到位
實驗原理: DNA重組技術是用內切酶分別將載體和外源DNA切開,經分離純化后,用鏈接酶將其連接,構成新的DNA分子。限制性內切酶能特異地結合于一段被稱為限制性酶識別序列的DNA序列之內或其附近的特異位點上,并切割雙鏈DNA。如EcoRⅠ切割識別序列后產生兩個互補的粘性末端。 5’…G↓A
限制性內切酶是一類能識別雙鏈DNA分子中特異核苷酸序列的DNA水解酶,這類酶的發現和應用促進了以DNA重組為基礎的生物工程技術的迅猛發展。該類酶是體外剪切基因片段的重要工具,基因物理圖譜的繪制、核苷酸序列的測定、基因片段的重組,重組子的篩選、探針的制備及各種雜交、測量基因的拷貝數,基因文庫構建,分子
(一)重組T質粒的構建一.原理外源DNA與載體分子的連接就是DNA重組,這樣重新組合的DNA叫做重組體或重組子。重組的 DNA分子是在DNA連接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的連接緩沖系統中,將分別經酶切的載體分子與外源DNA分子進行連接。DNA連接酶有兩種:T4噬菌體DNA連接酶和大腸桿菌
實驗概要 通過酶切獲得可進行體外重組的載體和外源DNA實驗原理 DNA重組技術是用內切酶分別將載體和外源DNA切開,經分離純化后,用鏈接酶將其連接,構成新的DNA分子。 限制性內切酶能