DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7DNA...2
(1)過夜培養的宿主細胞(如NM522或JM101)用3ml TYP肉汁培養基以1:100稀釋。在37℃強烈震蕩1小時之后,細胞進入對數早期。此時,將一個合適的含有重組M13的噬菌斑(連同瓊脂)用滴管轉入該細胞培養液中。(2)37℃強烈震蕩(300rpm) 培養6小時。(3)把細胞培養液轉入兩只1.5ml eppendorf管,12000g離心15分鐘。上清液轉移到新的eppendorf管再離心15分鐘。小心地取出1-1.2ml上清液(注意不能觸及沉淀),再轉到新的eppendorf管。 .(4)將0.25體積的含20%PEG(-8000)的3.75M醋酸銨(pH7.5)加入上清液以沉淀噬菌體。混勻后置冰上30分鐘,再以 12000g離心15分鐘,傾去上清液,再以同樣方法離心一次,用吸液器尖頭將殘留的PEG充分吸干凈。此時應能見管底有芝麻大小的噬菌體顆粒沉淀。(5)將沉淀物重溶于400ml TE緩沖液中。(6)加等體積氯仿/......閱讀全文
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...2
(1)過夜培養的宿主細胞(如NM522或JM101)用3ml TYP肉汁培養基以1:100稀釋。在37℃強烈震蕩1小時之后,細胞進入對數早期。此時,將一個合適的含有重組M13的噬菌斑(連同瓊脂)用滴管轉入該細胞培養液中。(2)37℃強烈震蕩(300rpm) 培養6小時。(3)把細胞培養液轉入兩只1.
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA聚...
3、質粒膜板制備:參照第一章所述的方法。(二)超螺旋質粒DNA 的堿變性:1、取4mg(約2pmol)超螺旋質粒DNA 至一eppendorf管中,加無離子水到終體積18ml。2、加2ml 2mmol/L NaOH/2mmol/L EDTA 溶液,置于室溫(25℃下)保溫5分鐘。3、加2ml 2mo
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...5
(三)電泳:1、預電泳(1)當凝膠聚合完全后,撥出鯊魚齒梳,將該梳子反過來,把有齒的一頭插入凝膠中,形成加樣孔。(2)立即將膠板固定在測序凝膠槽中,一般測序凝膠槽的上下槽是分開的,因而只有在固定好凝膠板后,方能加入TBE緩沖液。(3)稀釋10×TBE緩沖液至1×TBE,將該緩沖液加入上下二個電泳槽中
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...3
二、材料待測的DNA 模板,可用雙鏈或單鏈模板。 三、設備高壓電泳儀,測序用電泳槽,照相顯影用大號塑料盆,制膠設備,吹風機,放射自顯影盒,X-光片。 四、試劑 1、5×T7 DNA 聚合酶緩沖液:200mmol/L Tris?Cl,pH7.5,100mmol/L MgCl2,
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...6
3、為阻止Taq DNA 聚合酶延伸非特異性退火引物, 熱循環儀必須預熱至95℃。溫度變換應越快越好。下面的循環時間不包括變溫時間。如果你無法確定使用何種模式,建議從模式1開始。 ? 模式1:適用于引物
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...4
7. 在超純水中浸洗凝膠兩次,每次2分鐘,注意在本操作中戴手套拿著膠板邊緣避免在膠上印上指紋。8. 將凝膠置于室溫干燥或用抽氣加熱法干燥。在可見光燈箱或亮白,黃色背景(如紙)上觀察凝膠,若需永久保存的記錄,則可用EDF膠片保留實驗結果。[注意] 測序產物的銀染是顯現序列信息的一種新方法,本系統的成敗
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...7
在分子生物學研究中,DNA 的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于測序的技術主要有Sanger等(1977)發明的雙脫氧鏈末端終止法和Maxam和 Gilbert(1977)發明的化學降解法。這二種方法在原理上差異很大,但都是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基
非同位素銀染測序系統操作技術
Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到的。 此外
影響DNA測序技術測序產物銀染的因素
1. 水的質量對于染色的成功極其重要。超純水(NANOpureR 或Milli-QR 的水)或雙蒸水可獲得較好的效果, 如果水中有雜質, 則低分子量條帶可能無法出現。 2. 碳酸鈉也非常重要。使用新鮮的,美國化學學會級碳酸鈉較好,如Fisher和Kodak ACS試劑級碳酸鈉(Fisher C
DNA測序——非同位素銀染
實驗方法原理Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。 銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到
關于DNA測序技術的測序凝膠的銀染介紹
染色過程要求凝膠浸在塑料盤中。因而至少使用兩個盤子,大小與玻璃板類似。在盤中加入新鮮溶液之前須用高質量的水洗滌盤子。 1.電泳完畢后用一個塑料片子小心地分開兩板,凝膠應該牢固地附著在短玻璃板上。 2. 固定凝膠:將凝膠(連玻璃板)放入塑料盤,用固定/停止溶液浸沒,充分振蕩20分鐘或直至樣品中
關于DNA測序測序凝膠的銀染
染色過程要求凝膠浸在塑料盤中。因而至少使用兩個盤子,大小與玻璃板類似。在盤中加入新鮮溶液之前須用高質量的水洗滌盤子。 1. 電泳完畢后用一個塑料片子小心地分開兩板,凝膠應該牢固地附著在短玻璃板上。 2. 固定凝膠:將凝膠(連玻璃板)放入塑料盤,用固定/停止溶液浸沒,充分振蕩20分鐘或直至樣品
DNA測序測序凝膠的銀染的影響因素
測序產物的銀染是顯現序列信息的一種新方法,本系統的成敗受幾個因素的影響 ① 水的質量對于染色的成功極其重要。超純水(NANOpureR或Milli-QR的水)或雙蒸水可獲得較好的效果,如果水中有雜質,則低分子量條帶可能無法出現。 ② 碳酸鈉也非常重要。使用新鮮的,美國化學學會級碳酸鈉較好,如
DNA測序技術非同位素銀染色法介紹
DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。 銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到的。 此外,SILVER SEQUENCETM系統用未修飾的5
T7-DNA聚合酶測序技術
一、概述T7 DNA聚合酶最初具有5'→3'聚合酶活性以及單鏈和雙鏈3'→5'外切酶活性。當T7 DNA聚合酶用適當方法處理后,可使3'→5'外切酶活力明顯下降。改造后的T7 DNA聚合酶又稱T7測序酶。使用T7測序酶得到的測序數據具有在每個堿
DNA測序的測序技術
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(Next-generation sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以
DNA測序非同位素銀染色法的測序反應
1. 對于每組測序反應,標記四個0.5 ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2 ml適當的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(約20 μl)礦物油,蓋上蓋子保存于冰上或4℃備用。 2. 對于每組四個測序反應,在一個eppendorf管中混合以下試劑:
概述DNA測序技術的操作
成功地使用銀染測序系統需要對提供的操作方法進行仔細考慮。銀染不如放射性檢測法靈敏,而需要更多的模板量,此外,也不可能通過延長X-光膠片曝光時間的方法增加信號強度。因此,請使用推薦的DNA模板量, 每次均使用所提供的對照檢查系統的可靠性,并且注意如下幾點: (1) DNA的濃度和純度必須經過瓊脂
DNA測序技術
目前還有一種基于半導體芯片的新一代革命性測序技術——Ion Torrent。該技術使用了一種布滿小孔的高密度半導體芯片, 一個小孔就是一個測序反應池。當DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸中的DNA鏈上時,會釋放出一個氫離子,反應池中的PH發生改變,位于池下的離子感受器感受到H+離子信號,H+離子信號再直
DNA測序非同位素銀染色法
SILVER SEQUENCETM DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。 銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到的。 此外,SILVER S
DNA測序技術的測序規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸
DNA測序技術的測序原理
化學修飾法測序原理化學試劑處理末段DNA片段,造成堿基的特異性切割,產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物,經凝膠電泳分離。化學切割反應:包括堿基的修飾,修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。Sanger法測序的原理就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物
DNA測序方法非同位素銀染色法的操作步驟
一、試劑準備1. SILVER SEQUENCETM DNA測序試劑盒。2. 丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺儲備液(38%丙烯酰胺 W/V,2%甲叉雙丙烯酰胺 W/V):95 g丙烯酰胺,5 g甲叉雙丙烯酰胺溶于140 ml 雙蒸水中,定容至250 ml,0.45 mm過濾器過濾后,貯于棕色瓶中,置于4℃
DNA測序技術綜述
1977年,Sanger團隊完成人類歷史上第一個基因組序列噬菌體X174測序,并在3年后,成為“兩度”獲得諾貝爾化學獎的人(前一次是1958年)。Sanger測序技術誕生,讓DNA片段的測序成為現實,此后這一技術獨領風騷20多年。再后來的20年里,二代測序走向成熟、三代測序嶄露頭角,DNA測序技術以
DNA測序技術的測序的規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸
DNA測序技術的研究與發展
70年代末,WalterGilbert發明化學法、FrederickSanger發明雙脫氧終止法手動測序,同位素標記80年代中期,出現自動測序儀(應用雙脫氧終止法原理)、熒光代替同位素,計算機圖象識別90年代中期,測序儀重大改進、集束化的毛細管電泳代替凝膠電泳2001年完成人類基因組框架圖
DNA測序技術的技術原理
化學修飾法測序原理化學試劑處理末段DNA片段,造成堿基的特異性切割,產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物,經凝膠電泳分離。化學切割反應:包括堿基的修飾,修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。Sanger法測序的原理就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物
DNA測序技術操作的注意事項
1、測序所用模板DNA的量一般按下面要求加入: 模板種類/長度 模板量 200bp (PCR產物) 16ng(120fmol) 3000-5000bp(超螺旋質粒DNA) 4mg (2pmol) 48000bp(λ,粘粒DNA) 1mg(31fmol) 由于超螺旋質粒產生的信號比松弛
DNA測序技術自動測序法介紹
自動測序法基因分析儀(即DNA測序儀),采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法),因此通過單引物PCR測序反應,生成的PCR產物則是相差1個堿基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈DNA混合物,使得四種熒光染料的測序PCR產物
DNA測序技術的測序反應的介紹
1. 對于每組測序反應,標記四個0.5ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2ml適當的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(約20ml)礦物油,蓋上蓋子保存于冰上或4℃備用。 2. 對于每組四個測序反應,在一個eppendorf管中混合以下試劑: (1