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    細胞RNA的提取方法

    (一)細胞總RNA的提取1、6孔板細胞匯合度為90-100%時,取出無菌室,去其上清,用PBS洗兩次后,每孔加TRIZOL試劑 1 ml,搖勻,無菌罩內消化3-5 min。2、將各孔內消化好的細胞裂解液吸到一DEPC處理過的1.5 ml EP管中,加新開的氯仿0.2 ml,輕搖15 s。3、室溫靜置2-3 min后,12000 rpm,15 min,4 ℃,離心。然后取上清無色水相(約0.6 ml)到 EP管(DEPC處理過),加0.5 ml新開的異丙醇,室溫下靜置10 min。4、12000 rpm,10 min,4 ℃,離心。觀察總RNA在管底的白色沉淀,棄去上清,75%乙醇1.0 ml洗滌(用DEPC水新配制)后,7500 rpm,5 min,4 ℃離心。5、去上清,點離,用小Tip吸干液體。氣干沉淀5-10 min, DEPC處理水20-30 μl加入,中槍打勻,55-60 ℃水浴10 min溶解總RNA,測OD值。6、......閱讀全文

    基因技術專題-1

    專題一:RNA干擾技術(RNAi)1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA。這些

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除(1)

    1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA[1]。這些雙鏈RNA是體外

    RNA實驗方案和應用(一)

    RNA是具有多種不同的功能的生物大分子。信使RNA(mRNA)是DNA轉錄得到的,用做蛋白質合成的模板。蛋白質的合成是由核糖體完成的,核糖體由核糖體RNA(rRNA)和蛋白質組成。用于蛋白合成的氨基酸,是通過轉運RNA(tRNA)輸送到核糖體上的。RNA分子也是參與RNA轉運過程的核糖蛋白的一部分。

    外源性RNA的轉錄反應預測RNA病毒的廣譜抗病毒藥

      所有RNA病毒都通過與正常運輸細胞RNA轉錄本不同的過程將其基因組傳遞到目標宿主細胞中。來自正常的細胞RNA轉錄的運輸。病毒RNA的傳遞最多。進入大多數細胞的病毒DNA的運輸因此觸發了先天的抗病毒防御機制,將病毒RNA識別為異物。反過來,病毒已經進化出了破壞這些防御的機制,讓它們在其中茁壯成長。

    Cell子刊論文解答細胞生物學謎題

      在任何教科書的簡圖中,一組紅血細胞、皮膚細胞或神經細胞,通常大小都是相同的。但是,正如沒有哪兩個人的身高和體重是完全相同,在一個真正的細胞群體中,細胞的尺寸是有大有小的。  最近,賓夕法尼亞大學的一個研究小組表明,在大多數細胞染色體中的核DNA的兩個拷貝,可以使細胞具有任何的尺寸大小。相關研究結

    Science:生命的力量

    Jack Szostak正在調配地球早期起源生命的那一碗“原始肉湯”   Jack Szostak正一步一個腳印、堅實地朝著自己的科研目標前進,他要在自己的實驗室里人工合成出一個活細胞。   Jack Szostak知道他也許永遠也實現不了他的終極科學夢想了。然而,用英國劍橋醫學研究所分子生物學

    microRNA的實時定量莖環RT-PCR技術

      microRNA的實時定量莖環RT-PCR技術   摘要:   已開發出一種新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用莖環反轉錄,Taqman PCR分析。莖環RT引物在RT 效率和特異性方面比傳統的更好。TaqMan miRNA的檢測是很具體的,可以檢測成熟miRNA和區分

    曹雪濤課題組:m6A介導的細胞代謝重編程抑制病毒感染

      病毒感染可以調節宿主細胞的代謝,從而影響病毒的存活或清除。RNA修飾,特別是最為常見的哺乳動物mRNA修飾---N6-甲基腺苷(m6A)---能夠調節基因表達和病毒感染。比如,m6A甲基轉移酶復合物組分METTL3/14限制寨卡病毒產生,而m6A去甲基酶ALKBH5和FTO增強這種病毒的產生。在

    細胞RNA實時成像或將“成為可能”?!

      結合并激活熒光染料的適體熒光 RNA(FR)已用于對豐富的細胞 RNA 種類進行成像。然而,諸如低亮度和具有不同光譜特性的染料 / 適體組合的有限可用性的局限性,限制了這些工具在活的哺乳動物細胞和體內的使用。  2019 年 9 月 23 日,華東理工大學朱麟勇及楊弋共同通訊在 Nature B

    環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

      環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉

    PLOS:先天免疫系統如何區分病毒RNA和內源性RNA

      目前,慕尼黑大學的研究人員已經確定了可使活細胞內先天免疫系統區別病毒RNA和內源性RNA的結構特點。   當病毒感染細胞的時候,它們控制細胞代謝和劫持用于產生病毒蛋白的細胞資源。這個過程依賴于病毒RNA分子,在宿主細胞內它們被直接傳送給新合成的RNA病毒,并通過細胞的翻譯設備提供病毒蛋白的制造

    RNA的制備(mRNA的分離和RNA酶活性的控制)-2

    (一)實驗程序如不謹慎操作,外源性RNA酶可以通過下述途徑污染RNA制品:(1)玻璃制品、塑料制品和電泳槽 滅菌的一次性使用的塑料制品基本上無RNA〈, /SPAN〉酶,可以不經預處理直接用于制備和貯存RNA。實驗室用的普通玻璃器皿和塑料制品經常有RNA酶法染,使用前必須于180℃干烤8小時或更

    酵母三雜交系統檢測和分析RNA-蛋白相互作用實驗

    酵母三雜交系統(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白質與 RNA 間的相互作用。在酵母三雜交系統中,RNA 蛋白質相互作用導致報道基因的轉錄,可以通過細胞生長、克隆顏色或特異的酶活性檢測蛋白質與 RNA 的相互作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方

    Nature驚人發現:RNA,修復損傷的模板

      能夠準確地修復自發的錯誤、氧化或誘變劑導致的DNA損傷對于細胞生存至關重要。這種修復通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列來實現。但科學家們現在證實,在一種常見芽殖酵母細胞內RNA可充當模板用來修復破壞性最大的DNA損傷——DNA雙鏈斷裂。  盡管較早的研究表明了將RNA寡核苷酸導入到細胞中可

    張鋒連發Science,Nature文章:CRISPR下個技術趨勢—RNA編輯

      10月25日Science發表了CRISPR技術先驅張鋒研究組的最新成果:RNA editing with CRISPR-Cas13,咋一看這個標題還以為是張鋒一稿多投,因為實在是與本月初他們研究組發表在Nature的論文標題太像了(Nature論文:RNA targeting with CRI

    新生物計算機能并行處理多個復雜信號

       近日出版的《自然》雜志刊登了一篇研究論文:美國亞利桑那州立大學教授艾利克斯·格林和哈佛大學維斯生物啟發工程研究所合作,研制出迄今為止最復雜的生物計算機。該計算機由RNA(核糖核酸)制成,能在大腸桿菌活細胞內對12種不同指令同時作出反應,控制細菌細胞的行為。  研究團隊在大腸桿菌的活體細胞內誘導

    RNA酶活性的控制

    為了獲得高質量的真核細胞mRNA, 必須使用RNA酶的抑制劑或采用下述的破碎細胞和滅活RNA酶同步進行的方法,最大限度地降低細胞破碎過程中所釋放的RNA酶的活性。同時,避免偶然引入實驗室內其他潛在的痕量RNA酶也很重要。下面列舉避免RNA酶法染問題的一些注意事項。大多數有經驗的研究者并不拘泥于這些注

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    Nature:核糖核酸分子及其構造作用研究迎來新高潮

      當Philip Bevilacqua決定研究一個活體植物細胞中所有核糖核酸(RNA)分子的形態時,他面臨兩個問題:首先,自從中學時代起,他就沒有研究過與植物相關的生物學;其次,生物化學家傾向于檢測單個RNA分子,因為處理一個細胞內的眾多RNA分子是個更加棘手的挑戰。  Bevilacqua是美國

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    酵母三雜交系統檢測和分析RNA-蛋白相互作用實驗

    實驗方法原理 酵母三雜交系統(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白質與 RNA 間的相互作用。在酵母三雜交系統中,RNA 蛋白質相互作用導致報道基因的轉錄,可以通過細胞生長、克隆顏色或特異的酶活性檢測蛋白質與 RNA 的相互作用。試劑、試劑盒 YPD 和 SD 培養基鮭

    Nature子刊:首次實現活細胞RNA標記與無背景成像

       生物大分子標記技術是生物分子成像的關鍵。在科學歷史上,人們利用熒光蛋白“點亮”細胞內蛋白質, 實現了生命動態過程中蛋白質分子的可視化。熒光蛋白技術是當代生物科學研究中最重要的研究工具之一;在短短十余年內,其研究即被授予諾貝爾獎。RNA同樣具有獨特的結構、種類繁多的生物學功能以及復雜的時間空間分

    深入剖析單一神經元或能闡明大腦回路的信號問題!

      自閉癥對世界兒童健康影響頗深,患病比例大約為1/59,這給患者、父母及其護理人員都帶來了極大的挑戰,然而更為糟糕的是,至今并沒有藥物來治療自閉癥,這在很大程度上因為我們并不清楚自閉癥發生及其改變正常大腦功能的機制,難以破解引發疾病的過程的一大主要原因是自閉癥往往變化很大,那么我們應該如何理解自閉

    盤點2017年CRISPR技術突破

    圖片來源于網絡    CRISPR技術日新月異,研究人員不僅為這種精確且相對易于操作的基因編輯技術尋找新的應用,而且也在進一步的完善這種技術,賦予它更多新的功能,今年CRISPR引人注目的技術突破包括:  RNA編輯  雖然人體很多疾病是來自于DNA,但是由于基因承載著生命最根源的信息,因此直接對D

    酵母三雜交系統檢測和分析RNA-蛋白相互作用

    一、引入 RNA 質粒和 cDNA 文庫通常首先將 RNA 質粒轉化到宿主菌株-L40coat 內,得到包含 RNA 質粒的細胞,再轉化一個融合了轉錄激活區的 cDNA 文庫(雜交 RNA 對宿主細胞幾乎沒有毒性,與用于雙雜交篩選的一些雜交蛋白

    云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇

      RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星,也是國自然申請的大熱點;究其原因,是因為最近一兩年,RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展,病毒感染,神經發育,干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天,我們承接上一期的癌癥篇,為您帶來病毒領域的RNA甲基化

    多位專家指導:如何提取和研究血液DNA,RNA與蛋白

      血液是唯一與所有器官都有接觸的組織,攜帶著有關機體的大量寶貴信息。在理論上,檢測血液攜帶的 DNA、RNA、囊泡和細胞殘骸可以幫助人們診斷和監控各種疾病。  產前基因篩查是血液檢測的一個重要應用,通過分析孕婦血液中的胎兒DNA來鑒定染色體異常(比如唐氏綜合癥)。此外,越來越多的研究者開始關注血液

    Tornado表達系統實現RNA高水平表達和功能活性

      RNA適配體是一種短RNA,可通過結合細胞內的分子或蛋白質調節細胞內進程。盡管RNA適配體具有潛在的應用價值,但它并沒有其他RNA技術廣泛應用,主要問題是它們不能高濃度表達,從而不能有效調節蛋白質功能,同時也阻礙了RNA裝置,例如RNA代謝物生物傳感器在哺乳動物細胞中的應用。通常,基于RNA的生

    Nature:人類細胞圖譜研究先鋒Aviv Regev

      Aviv Regev是一位生物分析專家。現在,她正致力于繪制人體的每一個細胞。  計算生物學家Aviv Regev喜歡做一些看似不可能完成的任務。2011年,她與分子遺傳學家Joshua Levin合作,測試了RNA測序的幾種方法。科學家們在測試幾種技術的極限,以查看哪種方法表現最佳。他們用降解

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