代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD、LipidBlast、KEGG和Metlin等，本期小編進行了歸納總結，希望對從事代謝組學研究的大家有所幫助。 Human Metabolome Database（HMDB） HMDB數據庫是由加拿大代謝組學創新中心（TMIC）于2007年創立的代謝組學綜合數據庫。網站主要收錄人體內源性代謝產物，包括化合物簡介、化學式、分子量、化學分類、化學性質、代謝通路、部分代謝產物濃度和部分MS/MS圖譜等。目前為HMDB Version 4.0，數據庫主要包含化學數據、臨床數據和分子生物學/生物化學數據，共計114183個代謝物條目。......閱讀全文
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
GCMS－HRAM－代謝組學數據庫－探索代謝組學的奧秘
鹽城4公分厚外墻巖棉板報價 巖棉制品是以精選的優質玄武巖為主要原料、經沖天爐熔化后，采用的四輥離心制棉工序，將玄武巖高溫熔體甩扭成4-7μm的非連續性纖維，再在巖棉纖維中加入一定量的粘結劑、防塵油、憎水劑，經過沉降、固化、切割等工藝，根據不同用途制成棉氈、半硬板、保溫帶、管殼等系列產品。
非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫？
據相關介紹表明非靶向代謝組學的研究成果為眾多的藥物靶學、疾病機理研究以及疾病診斷提供有力依據。它還推動了免疫組化以及免疫熒光等技術的發展，事實上長期供應非靶向代謝組學更是由此迅速推進了研究步伐，現在就非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫作簡要闡述：1.HMDB非靶向代謝組學的代謝通路必須借
Bruker在ASMS－2016上推出最新代謝組學數據庫
新型MetaboBASE Personal Library提高分析人員深入進行代謝物鑒定的信心 分析測試百科網訊 2016年6月6日—在ASMS 2016會議上，Bruker推出最新質譜數據庫，被稱為Bruker MetaboBASE Personal Library?，該數
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？? ? ? ?代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組服務介紹??
代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科，是系統生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從基因和蛋白質層面探尋生命的活動，而實際上細胞內許多生命活動是與代謝物相關的，如細胞信號（cell signaling）、能量傳遞等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝物——在某一
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代，蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管，相對于發展迅速的醫學等領域，水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚，但目前已有不少高質量文章發表，這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期，小編將為大家帶來一篇
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代，蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管，相對于發展迅速的醫學等領域，水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚，但目前已有不少高質量文章發表，這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期，小編將為大家帶來一篇1
北京基因組所開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示
長生不老是人類自古以來的夙愿。 中國古代神話故事中，有菩提老祖的大品天仙訣，王母娘娘盛會上的蟠桃，太上老祖煉丹爐里的不老丹，還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中，《史記》記載秦始皇東巡碣石，攜童男童女入海求仙，尋求長生不老藥；在現代科學中，衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之
研究開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
中國BIGD躋身國際生物組學數據庫
測序技術的發展將生命科學領域帶入組學時代，海量的數據產出成為常態。組學是將基因、蛋白及代謝物等生物分子以整體為單位進行系統性的研究，基因組學、蛋白質組學和代謝物組學等相應產生。相較于此前以個體為單位的研究，組學最主要的特征就是大數據。隨著組學數據的產出，搭建組學數據庫，實現海量信息的存儲、整合及
研究發布大豆多維組學數據庫SoyOmics
大豆（Glycine max (L.) Merr.）是重要的糧油作物之一，其產量提升、品質改進關乎全球人口的需求和利益。高通量測序技術的發展促使大豆組學研究不斷深入。實現大豆多維組學數據的整合分析，將會為大豆遺傳育種提供有力支持。 近日，中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜團隊聯合北京基因組
代謝物組的定義
中文名稱代謝物組英文名稱metabolome定 義細胞內在某一特定生理和發育階段的所有小分子量的代謝物質。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），總論（二級學科）
代謝組學科學哲學思路
代謝組學突出的是一種整體性的研究思路。它通過現代超高效液相色譜/高分辨質譜聯用儀等技術分析體液中的代謝物組成譜，并利用多變量統計分析技術，把所有代謝物的組成信息都整合到一起，為在系統和整體的層面上比較和分析生物的代謝特性。 眾所周知，西方醫學的哲學基礎是從分析開始的，如魏爾嘯的細胞論。隨著分析
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
代謝組學新工具：METLIN
METLIN是由美國Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak開發出的新型數據庫，將能用于解決代謝組學等領域研究中關于數據處理這個大問題。 超過上萬個代謝物 目前METLIN包括有超過10,000個代謝產物中帶有詳細，高分辨率串聯質譜信息的六萬化合物，
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
科學家構建涵蓋五大植物類群的150+物種參考代謝組及數據庫
11月11日，中國科學院分子植物科學卓越創新中心李軒團隊在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上，在線發表了題為RefMetaPlant: reference metabolome database for plants across five major phyla的研
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣，中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明，已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息，減輕繁重的數據處理工作量，成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
代謝組學－|－腫瘤治療之靶向葡萄糖代謝
能量代謝重編程是腫瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代謝異常是腫瘤代謝最突出的特征。在氧氣充足的情況下，腫瘤細胞依然傾向于進行糖酵解，將葡萄糖代謝為乳酸。腫瘤細胞有氧糖酵解能力是正常細胞的20 ～ 30倍，為腫瘤代謝提供 大量能量和中間產物。因此，靶向糖酵解等異常環節的代謝酶是抗腫瘤治療的重點。一些研
非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些...
非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些方面?非靶向代謝組學已實現了對眾多生物體系代謝物進行定性和相對定量分析，其結果的分析為各類醫學研究以及藥物開發提供重要參考數據。特別是那些比較好的非靶向代謝組學更是致力挖掘基因與細胞間更深層的關系，現在就非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志，標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database