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    農科院生物所研究團隊繪制水稻根組織單細胞圖譜

    近日,中國農業科學院生物技術研究所谷曉峰團隊和合作者繪制了單子葉模式植物水稻首個根組織單細胞分辨率轉錄組圖譜,為研究植物細胞類型特化、功能和進化提供了新的途徑。相關結果發表在國際學術期刊《分子植物(Molecular Plant)》上。 在植物整個生命過程中,根尖在不斷地分化發育,形成的根系從土壤中吸收水分和礦質元素,參與植物與生物或非生物信號的互作,并起到固定植株的作用。但是,植物根系的發育及與環境互作的分子機制還知之甚少。研究人員對兩個水稻栽培亞種粳稻Nip(Oryza sativa L. japonica. cv. Nipponbare, geng)和秈稻93-11(Oryza sativa L. indica. cv. 93-11, xian)10,968和12,564個根尖細胞進行了單細胞轉錄組測序和分析,鑒定出8個細胞型。對Nip和93-11每種細胞型差異表達基因進行功能富集分析,發現大多數基因與環境響應有關,......閱讀全文

    科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜

      水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源:錢文峰等  中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術,獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息,利用細胞類型標記基因和原位雜交技術,對每個細胞的身份進行了鑒定,構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄

    科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜

      中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術,獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息,利用細胞類型標記基因和原位雜交技術,對每個細胞的身份進行了鑒定,構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組

    農科院生物所研究團隊繪制水稻根組織單細胞圖譜

      近日,中國農業科學院生物技術研究所谷曉峰團隊和合作者繪制了單子葉模式植物水稻首個根組織單細胞分辨率轉錄組圖譜,為研究植物細胞類型特化、功能和進化提供了新的途徑。相關結果發表在國際學術期刊《分子植物(Molecular Plant)》上。  在植物整個生命過程中,根尖在不斷地分化發育,形成的根系從

    科學家揭示水稻根單細胞異質性和分化全景圖

    ??中國科學院分子植物科學卓越創新中心王佳偉研究組系統揭示了水稻根單細胞異質性,描繪了水稻根表皮細胞和基本組織細胞的分化軌跡,明確了在根尖干細胞分化過程中基因表達與基因染色質可及性的相關性,并同時闡明了單子葉植物水稻和雙子葉植物擬南芥在根尖細胞類型上的進化保守性。該研究成果4月6日在線發表于《自然—

    《自然》發布重要單細胞RNA圖譜:首張小腸細胞圖譜

      我們腸道上皮是人體內多樣性最高,最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一,組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能,還有影響它的疾病,麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞,完成了一

    《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜

      來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個

    2016值得關注的技術:綜合單細胞圖譜

      《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc

    PNAS:單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜

      斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表文章,介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。  研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法,他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型,并確定神經元的亞型。他們還觀察了

    單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就

      今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為

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