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    測序簡史(一)

    序這幾天天氣很熱,熱的人心惶惶。因此一直提上日程的所謂的測序簡史,也沒有時間去好好的落實。中途找過一個行業內的頗有影響力的人,但是他由于種種原因,也沒有能踏踏實實的去做這件事情。幾經周折,這個任務還是落到了我自己的肩上。于是乎,我鼓鼓勇氣,嘗試著去把這段從1977年到2017年的漫長而又渺小的四十年說的有趣些兒。當我起筆去寫這篇文章的時候,小伙伴們還在工作室因為某個服務器后臺技術爭論不了,這樣看來生信人團隊還是非常有希望的。另外,關于測序簡史這一塊,我一直不知道怎么去娓娓道來,不知道如何才能說得清楚,還不讓大家反感,我只能硬著頭皮利用自己知道的皮毛知識給大家編織一個我所認為的測序簡史,博君一笑。由于這篇文章內容過長,我覺得還是輕松點,大家才能閱讀下去,畢竟很少有人能夠逼著自己去做一些事情,一點一點的誘惑,不僅有用,而且高效,為啥不用呢,廢話到此結束,言歸正傳。啥叫測序?這個官方有官方的解釋,大家可以自行百度,我覺得通俗意義上跟測......閱讀全文

    DNA測序技術的現狀和發展(七)

    3. 新一代測序技術的前景在2007年6月,James Watson的基因組序列登錄到了GenBank數據庫當中,這是第一次使用非Sanger測序法獲得了人類個體基因組序列,并且第一次將個人基因組序列公之于眾。整個測序過程在兩個月之內就完成了,花費不到100萬美元,這只占耗時10年之久的人類

    三分鐘了解4代基因測序技術

      基因檢測技術是近年來伴隨“精準醫療”概念的提出而迅速發展起來的一門科學技術,它可以從基因組機制上闡釋遺傳學、發育生物學、進化生物學等學科的經典概念,在全基因組水平延伸了染色體高級構象、細胞異質性、功能模塊等新概念,為精準醫學開辟了應用性新領域。  近年來,隨著分子水平的基因檢測技術平臺不斷發展和

    高通量測序技術——第二代測序技術

    高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(de

    RNA-seq綜述(二)

    短讀長cDNA測序短讀長已經成了在整個轉錄組范圍內對基因進行檢測和定量的事實方法(de facto method),部分原因是這種方法比芯片成本更低,操作更方便,但是其主要原因還是因為這種方法能生成更全面,更高質量的數據,這種方法能夠 對整個轉錄組中的基因表達水平進行定量。使用Illumina短讀長

    數十個測序平臺技術參數盤點

    1.第二代測序技術1.1 Roche 454 測序平臺Roche 454(Genome Sequencer 20 System)是第一個NGS測序平臺,由美國454 Life Sciences公司于2005年推出,2007年被瑞士Roche公司收購。此后Roche公司在此基礎上開發了Roch

    2018年全球TOP10頂尖基因測序公司及測序市場規模預測

    隨著“精準醫療”的深化,基因測序逐漸成為科技醫療領域備受矚目的話題,得益于平臺技術的進步、測序應用的拓展、各機構合作的拓寬以及測序成本的下降,行業正在以驚人的速度發展。2005年首代測序儀Roche454單次產生400MB的基因序列文件,到2010年第二代測序儀IlluminaHiseq2000單次

    DNA測序40周年:DNA測序的過去、現在和未來(上篇)

      在DNA測序過去的40年中,我們見證了諸多技術的變革和測序規模的極度增長。從幾千個堿基到第一個人體基因組,乃至當前數以萬計的人體和無數其它的基因組。包括作為大量分子現象的“計數器”在內,DNA測序被廣泛和創造性地應用于各個領域。從長遠來看,我們可以預測DNA測序技術所帶來的影響將會與顯微鏡的使用

    DNA測序技術的現狀和發展(四)

    1.1.3.2 模板制備程序完全的體外大規模模板制備工作是達成高通量、低價格測序技術的前提。已廣泛使用的乳液PCR擴增技術就是一種很好的方法。不過,由于很難在熱循環測序反應中保證乳液微滴的穩定性,因此最開始實驗的模板擴增方法是恒溫擴增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助細菌的幫助就能擴增

    三代測序技術和原理介紹(二)

    Solid技術??Solid測序技術是ABI公司于2007年開始投入用于商業測序應用的儀器。它基于連接酶法,即利用DNA連接酶在連接過程之中測序(圖6)2,4。它的原理是:???圖6-a. Solid測序技術??(1)DNA文庫構建??片段打斷并在片段兩端加上測序接頭,連接載體,構建單鏈DNA文庫。

    2016年基因檢測行業現狀及發展趨勢分析

      目前全國涉及基因檢測概念的公司有200余家,按照業務范圍劃分,這些公司可以分為:  ①最上游的基因檢測儀器開發企業(測序儀、芯片掃描儀、PCR設備);  ②提供樣本處理試劑和耗材的中上游企業(建庫試劑盒、檢測試劑盒、工具酶、基因芯片);  ③提供第三方基因檢測服務的中游企業;  ④提供測序數據存

    三代基因測序技術以及基因檢測技術的發展綜述

    基因是指攜帶有遺傳信息的DNA序列,是控制性狀的基本遺傳單位,一段具有功能性的DNA序列。基因通過指導蛋白質的合成來表達自己所攜帶的遺傳信息,從而控制生物個體的性狀表現。人類約有兩萬至兩萬五千個基因。廣義上的基因檢測指通過血液、組織或細胞分泌物,對染色體、DNA分子進行檢測的一系列技術。目前在醫療領

    2019年中國基因測序產業全景圖譜

      近年來,基因測序行業得到迅速發展,吸引了大量資本和企業的進入。目前,在行業上游儀器設備環節,國外企業競爭優勢顯著,而在國內的基因測序與應用終端領域華大基因競爭力強勁。但是,基因測序技術在終端應用領域還未實現完全推廣,未來發展仍具有巨大的想象空間。全景圖:下游應用領域廣泛,但尚未完全推廣  從基因

    干貨:三代測序技術和原理(一)

       摘要:從1977年第一代DNA測序技術(Sanger法)1,發展至今三十多年時間,測序技術已取得了相當大的發展,從第一代到第三代乃至第四代,測序讀長從長到短,再從短到長。雖然就當前形勢看來第二代短讀長測序技術在全球測序市場上仍然占有著絕對的優勢位置,但第三和第四代測序技術也

    基因測序“摩爾定律”初現,“三代測序”要革“二代”的命?

      在“二代測序”(NGS)尚未迎來投資熱潮的情況下,技術突破捷報連連的“三代測序”(3GS)又進入到了投資人的視野中。1986年,第一臺商用基因測序設備正式出現,到第二代測序設備出現,期間間隔了19年時間。而第二代設備問世,到第三代設備的誕生,僅僅用了5年,基因測序設備的更新換代速度正在不斷加快。

    2019年中國基因測序行業發展現狀及趨勢預測

    一、基因測序行業發展現狀分析    基因測序技術應用范圍較廣,主要分為科研服務、醫療應用服務以及非醫療基因檢測服務。其中,醫療應用服務是目前應用基因測序技術中活躍度較高且發展潛力較大的部分,涉及無創產前篩查、遺傳病診斷、植入前胚胎遺傳學診斷、腫瘤診斷等諸多領域。近年來,隨著“二胎

    淺談NGS的這10年(三)

      454平臺和Ion Torrent平臺相比于其他的短讀長平臺而言,能夠提供較長的read讀長,分別大約在700bp與400bp,因此在基因組結構較為復雜的研究上應用 較多。然而,由于同樣都是基于SNA技術,它們都擁有相同的缺點。雖然,其在非堿基多聚體(non-homopolyme

    下一代測序技術將改變生物學現狀

      新一代非基于“桑格技術”的基因測序法以空前的快速測序速度問世了,它為人類帶來了重大的科學成果和先進的生物學應用軟件。然而,要研發出新一代基因測序法,必須克服30年來以桑格技術為基礎的慣性思維。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson發表了兩篇關于快速測序技

    測序過程常見問題分析與解答

    DNA測序樣品用什么溶液溶解比較好?    答:溶解DNA測序樣品時,用滅菌蒸餾水溶解最好。DNA的測序反應也是Taq酶的聚合反應,需要一個最佳的 酶反應條件.如果DNA用緩沖液溶解后,在進行了測序反應時,DNA溶液中的緩沖液組份會影響測序反應的體 系條件,造成Taq酶的聚合性能

    DNA序列測定技術

    DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam-Gilbert DNA化學降解法測序策略  目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的

    漫談單細胞測序及其臨床應用

    一、概述隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的(即各細胞都是

    干貨:三代測序技術和原理(二)

    Solid技術??Solid測序技術是ABI公司于2007年開始投入用于商業測序應用的儀器。它基于連接酶法,即利用DNA連接酶在連接過程之中測序(圖6)2,4。它的原理是:??(1)DNA文庫構建??片段打斷并在片段兩端加上測序接頭,連接載體,構建單鏈DNA文庫。??(2)Emulsion PCR?

    九大測序平臺對比(二)

    Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨機打

    基因測序前景:上游市場增速放緩 中下游市場潛力巨大

      基因測序服務市場增速快,預計2016年超過測序儀器市場。據Markets&Markets預測,2014-2020年上游市場中測序儀的復合增長率是15.4%。中游測序服務市場重資產、技術附加值低,將是產業鏈中增速最快的,據BCC Research預測2011-2016年復合增長率為29%。

    專訪華大基因蔣慧:測序儀“規模化量產”是順應市場需求

      兩年前,華大基因發布了其自主研發的新型桌面化測序系統BGISEQ-500,這款儀器的問世備受矚目。本月初,開放期刊GigaScience公布了BGISEQ-500測序平臺完成的首個人類基因組重測序數據,由華大基因、中國食品藥品檢定研究院(NIFDC)和國家食品藥品監督管理局湖北醫療器械質量監督檢

    華大智造發布“桌面”測序儀等3款產品 構建測序“生態”

    2019年10月25日于深圳召開的第十四屆國際基因組學大會(ICG-14)上,華大智造發布三款新產品,分別是其自主研發的新型“桌面”一站式測序解決方案、便攜式單細胞組學產品及CoolMPS高通量測序試劑套裝。新產品聚焦便攜式、智能化、自動化等未來發展方向,打破傳統測序的時間、空間、人員限制,進一步滿

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話,那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組,進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術,在臨床診療上發揮更大的作用。  在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail

    我國精準醫療如何讓基因測序“言聽計從”

      基因測序技術是臨床分子診斷中的重要手段,其起源早于PCR技術。1968年華裔科學家吳瑞(Ray Wu)博士獨創地提出了引物延伸的測序策略,在這一策略基礎上基因測序方法得到發展,Sanger和Gilbert因開發不同的測序方法于1980年獲得諾貝爾獎。目前的基因測序技術可以分為三類:毛細管電泳測序

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

    如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話,那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組,進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術,在臨床診療上發揮更大的作用。在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail,致力于

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail,致力于開發一種不超過1000美元的血液檢測,用于多類型癌癥的早期篩查。這種腫瘤DNA測序的主要目的是在無癥狀的個體中診斷各種各樣的癌癥,從而實現提前預防或治療。  隨著技術的不斷進步,

    華大智造:我們的這種測序方法吊打傳統MPS

      在生物醫學大數據的重要價值日益凸顯的今天,大規模組學計劃成為世界各國的重要戰略布局,如何能夠更準確、更快速、更低成本地開展基因測序變得愈發迫切,驅動著技術之輪飛馳向前。高通量測序誕生和發展的歷史,鐫刻著科學家和產業先驅們在“更準、更全、更快、更便宜”的道路上所作出的種種努力。近日,由華大智造聯合

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