5000bp！單分子測序讀長再次升級
PacBio RS單分子測序在發布時就以其超長的讀長引起研究者的極大興趣。在不到一年的時間里，隨著年初C2試劑的升級，Pacbio RS的平均讀長達到了3000bp，并迅速在測序的各個領域，特別是De novo中發揮了巨大的讀長優勢。Pacific Biosciences公司在11月6日正式發布新的超長測序試劑：XL系列。該試劑將主要針對De novo應用，平均讀長將達到5000bp，其中5%的讀長將超過13000bp，最長超過20000bp。美國冷泉港實驗室前期試用于水稻基因組的組裝，得到9倍覆蓋率的長片段讀序中50%在4800bp以上，大大提高了其通過NGS mate-pair拼接的程度。相信隨著該新試劑的正式全面投入使用，將會對現有基因組的完善帶來更大的突破。 對于研究者所關心的一些問題，我們也聯系了Pacific Biosciences公司的技術支持，并一一做了解答。 問：XL試劑有哪些更......閱讀全文
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現，人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異（CNV）。在此之前人們對CNV的了解并不多，因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序，全面分析了基因組中的SN
Science揭示基因組的捍衛者
從細菌到人類，生物體都必須要保護自身對抗稱作為轉座子的寄生遺傳元件，并且賭注下得很大。這些DNA片段可在基因組中四處跳躍破壞基因，其可以造成極大的破壞因此細胞有專門的監視機制來抑制它們。 為了保護后代對抗基因組破壞，這些天然防御系統發生缺陷通常會導致不育不孕。在動物中，對抗搗亂轉座子的主要防御
Science解析熱點基因組編輯工具
近來，Cas9酶作為一種有力的新基因組編輯工具，引起了人們極大的研究熱情。現在加州大學伯克利分校的研究人員，首次成像了這種酶的精細三維結構，這一成果無疑會進一步提高Cas9的應用價值。文章于二月六日發表在Science雜志上。 加州大學的生化學家Jennifer Doudna和生物物理學家
Science揭示古老基因組的秘密
馬克斯?普朗克研究所的研究人員描述了丹尼索瓦人(Denisovans)的基因組，闡明了丹尼索瓦人與現代人類之間的關系。相關研究發表在8月30日的《科學》(Science)雜志上。 由德國馬克斯?普朗克進化人類學研究所的Svante P??bo領導的一個國際研究人員小組在新研究中證實了丹
Science公布最新基因組測序結果
來自法國農業科學研究院（Institut National de Recherche Agronomique）的研究人員發表了題為“Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome”
Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現，人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異（CNV）。在此之前人們對CNV的了解并不多，因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序，全面分析了基因組中的SN
Science子刊：基因組醫學顯神威
最新一項研究公布了針對超過100個患有廣泛神經功能和發育障礙的兒童的家庭，進行基因組測序分析的大規模研究成果，這一成果公布在12月3日Science Translational Medicine.雜志上。 這項研究第一次利用基因組診斷方法直接對神經系統疾病嬰兒和兒童進行分析，其中45%的家庭完
Science：新技術實現精確基因組編輯
麻省理工學院、布洛德研究所以及洛克菲勒大學的研究者開發出了一種新穎的技術，可以通過添加或去除基因來對活細胞的基因組進行修改。研究者表示，這種技術易于操作且成本低，可以用于對產生物燃料的生物將進行基因工程操作，設計用于人類疾病研究的動物模型，開發新的疾病療法，以及其他的潛在應用
Science發表CRISPR基因組編輯重要成果
利用兩種互補的分析方法，Whitehead研究所和麻省理工學院-哈佛大學Broad研究所的科學家們，第一次在人類基因組中鑒別出了人類細胞系或培養人類細胞生存及增殖必需的基因宇宙。 他們的研究結果和在該研究中開發出的材料，不僅為全球科研團體提供了寶貴的資源，還可應用于發現各種人類癌癥藥物可靶向的
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
華大基因再發Science進行基因組比對
來自深圳華大基因研究院，丹麥哥本哈根大學，澳洲科學院等處的研究人員利用Illumina的 HiSeq 系統，完成了兩種蝙蝠的高通量全基因組測序分析，并進行了基因比對，為解析蝙蝠的飛行起源，以及蝙蝠為何會攜帶多種致病性強的病毒，提出了新的觀點。相關成果公布在Science雜志上。 文章的
Science：揭示大腦回路的表觀基因組成
表觀基因組學的變化，包括DNA的化學修飾，可以作為基因組的一層額外信息。表觀基因組學在學習和記憶及年齡相關的認知度方面扮演著重要的角色。新的研究發現DNA甲基化，一種特殊的表觀基因組學修飾的形式。從出生到成年，DNA甲基化形式在大腦細胞中是動態變化的。從而幫助理解大腦細胞中基因組學的信息是如何控
Science：人類基因組編輯指南
人類基因組編輯在研究和治療方面不斷取得進展，同時也在世界各地的科學家中引發了倫理問題。 一方面，技術進步可以使醫生能夠修改那些包含在精子和卵子中的種系基因，防止后代罹患毀滅性的遺傳疾病。但與此同時，基因編輯改變人類遺傳的可能性，也警示著許多科學家，促使他們認為應該無限期禁止種系編輯。 來自麥
中科院Science公布最新基因組
繼2012年中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成了首個山羊全基因組圖譜之后，6月昆明動物研究所，華大基因等處的研究人員又公布了綿羊基因組序列，并且將這一基因組與其它哺乳動物基因組進行了比對，構建了相關的系統發育樹。這一研究成果公布在6月6日Science雜志上。 參與這項
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子
第三代基因組測序儀實現單分子速讀
在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核糖核酸）分子進行測序，而目前市場上的主流測序
小麥基因組測序－為第三代育種繪制“高清地圖”
不久前，中國科學院遺傳與發育生物學研究所發表于國際著名期刊《自然》的論文稱，該所研究團隊已完成小麥A基因組測序和染色體精細圖譜繪制。這是繼2013年，該團隊成功繪制出小麥A基因組祖先種烏拉爾圖小麥基因組草圖并發表于《自然》之后，在此領域的又一項重大成果。圖片來源于網絡 中國科學院遺傳與發育生
第三代基因組測序儀問世－實現單分子速讀
據《自然》雜志網站2月8日報道，在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。 研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(
Nature，Science子刊：肺癌的基因組分類
兩項最新的研究顯示，如何根據腫瘤的遺傳結構來特別定制肺癌的治療，這可能會最終改善現有的治療方法，甚至有助于發現新的治療方法。 第一項研究發表在Science Translational Medicine雜志上，研究者們發現了一種根據其遺傳組成將肺癌腫瘤進行分類的方法，能夠為一些患者治療
Science：全基因組測序探究瘧疾傳播機制
近日，發表在國際雜志Science上的一篇研究論文中，來自加拿大西蒙弗雷澤大學等處的研究人員對可傳播瘧疾的16種按蚊進行了遺傳測序，從而為揭示人類為何對其易感提供了新的思路和線索。 文章中，研究者Cedric Chauve表示，我們利用計算機方法來重新構建蚊子祖先的基因組，并且分析在過去1億年
Science、Nature聚焦人類基因組研究
生物通報道 兩項研究探究了被認為是人類起源的撒哈拉以南非洲狩獵采集者和牧民的遺傳學，研究結果揭示盡管南非click語言人群居住地相互靠近，但他們屬于不同的遺傳群體。 為了評估遺傳差異程度，兩個研究小組均檢測了不同種群DNA中的單核苷酸多態(SNPs)。由瑞典烏普薩拉大學Carina
Science：宏基因組研究挑戰DNA編碼規則
人們一直認為DNA編碼的指令是所有生命通用的，例外情況極少。但本期Science雜志上的一項新研究顯示，自然界中的生物又一次打破了既定的規則。 美國能源部聯合基因組研究所的Edward Rubin領導研究團隊，獲得來自1776種環境（包括17個人體區域）的微生物宏基因組數據，以便在其中尋找重編
Science：基因組測序揭示電魚的驚人秘密
第一次，研究人員完成了對電鰻（electric eel）的基因組測序。研究發現揭示出了帶有發電器官的魚類如何在生命史中進化6次，實現體外發電的驚人秘密。 發表在最新一期《科學》（Science）雜志上的這項研究，闡明了被利用來進化出這些復雜的新奇器官的遺傳藍圖。密歇根州立大學、威斯康辛麥迪遜大
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一，提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖，但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上，兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列，以及小麥染色體3B基因組序列，另外兩個研究小組
Science：基因組衛士piRNA如何發揮作用？
piRNA（Piwi-interacting RNA）被稱為基因組的衛士，它與特定蛋白相互作用形成分子防御系統，來捍衛基因組的穩定性。那么，piRNA究竟如何區分外源和內源的基因序列呢？芝加哥大學的研究人員近日找到答案并發表在《Science》雜志上。 piRNA是一類長度約為26-31 n
第三代基因組測序儀問世－實現了單分子速讀
?據《自然》雜志網站2月8日報道，在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上，來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀，該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。???? 研究人員指出，第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA（脫氧核
遺傳學大牛Science發現基因組新奧秘
來自斯坦福大學，霍德華休斯醫學院的一組研究人員發現，當基因組中相似的基因不斷“彈出來”的時候，通常這些基因會丟失，但如果能被留下來（也就成為了多余基因），就會由于一個基因發生一次表達消減這一理論，而在哺乳動物中受到保護。 這一研究成果公布在5月20日的Science雜志上。文章的通訊作者是斯坦
廈門大學Science文章：令人驚奇的基因組
甲藻（dinoflagellate）并不快樂。在好的時候，這些微小的海洋生物自由漂浮生活在海洋中，或是與珊瑚（corals）共生，成為一大群軟體動物、小魚和珊瑚物種的午餐。其中的一些甲藻能夠生物發光，因此會在夜里發光。但在不好的時候，甲藻會用赤潮毒害貝類養殖區，拋棄珊瑚礁讓其緩慢地白化死亡。