單鏈DNA探針技術簡介
用雙鏈探針雜交檢測另一個遠緣DNA時,探針序列與被檢測序列間有很多錯配。而兩條探針互補鏈之間的配對卻十分穩定,即形成自身的無效雜交,結果使檢測效率下降。采用單鏈探針則可解決這一問題。單鏈DNA探針的合成方法主要有下列兩種:(1) 以M13載體衍生序列為模板,用Klenow片段合成單鏈探針; (2) 以RNA為模板, 用反轉錄酶合成單鏈cDNA探針。1. 從M13載體衍生序列合成單鏈DNA探針 合成單鏈DNA探針可將模板序列克隆到噬粒或M13噬菌體載體中,以此為模板,以特定的通用引物或以人工合成的寡合苷酸為引物, 在[a-32P]-dNTP的存在下,由Klenow片段作用合成放射標記探針,反應完畢后得到部分雙鏈分子。在克隆序列內或下游用限制性內切酶切割這些長短不一的產物,然后通過變性凝膠電泳(如變性聚丙烯酰胺凝膠電泳)將探針與模板分離開。雙鏈RF型M13 DNA也可用于單鏈DNA的制備,選用適當的引物即可制備正鏈或負鏈單鏈探針。材......閱讀全文
從M13噬菌體模板合成非固定長度的單鏈DNA探針
在合成過程中,低濃度的放射性標記的 dNTP 使探針的長度限制為 200~300 個核苷酸。但是新合成的 DNA 可通過改變投入的模板量和 dNTP 的濃度使其長度為 100~1000 個核苷酸,如此長度范圍內的探針適用于大多數雜交實驗。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理在
隨機引物合成法雙鏈DNA探針標記法
隨機引物合成雙鏈探針是使寡核苷酸引物與DNA模板結合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探針。合成產物的大小、產量、比活性依賴于反應中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,產物平均長度為400-600個核苷酸。利用隨機引物進行反應的優點是:(1)Klenow片段沒有5'→3'外切酶活
RNA探針技術簡介
許多載體如pBluescript, pGEM等均帶有來自噬菌體SP6或E.coli噬菌體T7或T3的啟動子,它們能特異性地被各自噬菌體編碼的依賴于DNA的RNA聚合酶所識別,合成特異性的RNA。在反應體系中若加入經標記的NTP,則可合成RNA探針。RNA探針一般都是單鏈,它具有單鏈DNA探針的優點,
單鏈DNA結合蛋白的基本內容
單鏈結合蛋白(SSB,single strand DNA-binding protein):結合于螺旋酶沿復制叉方向向前推進產生的單鏈區,防止新形成的單鏈DNA重新配對形成雙鏈DNA或被核酸酶降解的蛋白質。 螺旋酶沿復制叉方向向前推進產生了一段單鏈區,但是這種單鏈DNA不會長久存在,會很快重新
DNA探針的技術優勢
①DNA探針多克隆在質粒載體中,制備方法簡便;②DNA探針相對RNA探針(RNA probe)而言不易降解,一般能有效抑制DNA酶活性;③DNA探針的標記方法較成熟,可用同位素或非同位素標記,有多種方法可供選擇。
末端標記DNA探針技術
現以Klenow片段標記3'末端為例說明末端標記的方法。1、材料:待標記的雙鏈含凹缺3'末端的DNA。2、設備:高速臺式離心機,水浴鍋等。3、試劑:(1)3種不含標記的dNTP各為200mmol/L。(2)合適的限制酶。(3)[α-32P] dNTP:3000Ci/mmol, 10m
如何從單鏈dna中獲取核酸適配體
加隨機序列進行封閉
牛單鏈DNA(ssDNA)酶聯免疫分析(ELISA)
牛單鏈DNA(ssDNA)酶聯免疫分析(ELISA)試劑盒使用說明書本試劑僅供研究使用???????目的:本試劑盒用于測定牛血清,血漿及相關液體樣本中單鏈DNA(ssDNA)的含量。實驗原理:??本試劑盒應用雙抗體夾心法測定標本中牛單鏈DNA(ssDNA)水平。用純化的牛單鏈DNA(ssDNA)抗體
M13噬菌體單鏈DNA的制備
M13 噬菌體單鏈 DNA 是從感染細胞分泌至周圍培養液中的病毒顆粒中制備的,首先在高鹽存在下,絲狀病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀濃縮,然后用酚抽提釋放單鏈 DNA,最后乙醇沉淀收集單鏈 DNA。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理M13 噬菌體單鏈 DNA 是從感染細胞分泌
用噬菌粒載體制備單鏈DNA
噬菌粒巧妙地組合了質粒和絲狀噬菌體的特征。除了基本特征外,這些質粒通常是高拷貝數的,并帶有一個修飾后的絲狀噬菌體的主要基因間區。這個區域 ( 野生型為 508 bp)不表達蛋白,但含有全部的順式作用序列,該作用是病毒 DNA 合成起始和結束及噬菌體顆粒的形態發生必不可少的。本實驗來源「分子克隆實驗指
抗單鏈DNA(ssDNA)抗體檢測的介紹
抗單鏈DNA(ssDNA)是抗DNA抗體中臨床意義和重要性都不如抗dsDNA的一種,DNA是一個大分子的復合物,由兩條核苷酸鏈形成的雙螺旋結構。加熱時堿基間的氫鍵斷裂,DNA變性產生ssDNA。抗ssDNA的反應位點主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶構成的堿基。
M13噬菌體單鏈DNA的制備
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 M13 噬菌體單鏈 DNA 是從感染細胞分泌至周圍培養液中的病毒顆粒中制備的,首先在高鹽存在下,絲狀病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀濃縮,然后用酚抽提釋放單鏈 DNA,最后乙醇沉淀收集單鏈 DNA。
用噬菌粒載體制備單鏈DNA
實驗方法原理 噬菌粒巧妙地組合了質粒和絲狀噬菌體的特征。除了基本特征外,這些質粒通常是高拷貝數的,并帶有一個修飾后的絲狀噬菌體的主要基因間區。這個區域 ( 野生型為 508 bp)不表達蛋白,但含有全部的順式作用序列,該作用是病毒 DNA 合成起始和結束及噬菌體顆粒的形態發生必不可少的。實驗材料
M13噬菌體單鏈DNA的制備
實驗方法原理 M13 噬菌體單鏈 DNA 是從感染細胞分泌至周圍培養液中的病毒顆粒中制備的,首先在高鹽存在下,絲狀病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀濃縮,然后用酚抽提釋放單鏈 DNA,最后乙醇沉淀收集單鏈 DNA。實驗材料 M13 單鏈噬菌體載體感染 M13 噬菌體的大腸桿菌培養物未感染的大腸桿菌的培養
用噬菌粒載體制備單鏈DNA
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 噬菌粒巧妙地組合了質粒和絲狀噬菌體的特征。除了基本特征外,這些質粒通常是高拷貝數的,并帶有一個修飾后的絲狀噬菌體的主要基因間區。這個區域 ( 野生型為 508 bp)不表達蛋白,但含有全部的順式作用序列,該作用是病毒 DNA
分子遺傳學詞匯單鏈DNA結合蛋白
中文名稱:單鏈DNA結合蛋白外文名稱:Single-stranded DNA-binding protein定義:單鏈DNA結合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,縮寫SSB或SSBP)又稱單鏈結合蛋白,是專門負責與DNA單鏈區域結合的一種蛋白質,為DNA復
抗雙鏈DNA抗體(aniDNA)的簡介
抗DNA抗體包括抗雙鏈DNA抗體、抗單鏈DNA抗體和抗zDNA抗體。 檢驗中一般是指與雙鏈DNA和單鏈DNA都反應的抗雙鏈DNA抗體。 抗雙鏈DNA抗體陽性是系統性紅斑狼瘡的標志,陽性率達90%以上,有較高的特異性,因而抗雙鏈DNA抗體對系統性紅斑狼瘡的診斷和治療監控極重要。抗雙鏈DNA抗體在其
單鏈構象多態性的原理簡介
單鏈構象多態性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以檢測DNA序列之間的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群體的多樣性。在低溫條件下,單鏈DNA呈現一種由內部分子相互作用形成的三維構象,它影響了DNA在非變性凝膠中
寡核苷酸指導的單鏈-DNA-誘變實驗
實驗材料 適用于轉化的大腸桿菌菌株 用于轉化的大腸桿菌 TG1 感受態菌試劑、試劑盒 ATPPE1緩沖液PE2 緩沖液噬菌體 T4 DNA 連接酶噬菌體 T4 多核苷酸激酶大腸桿菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌體通用測序引物含 4 種 dNTP 的 dNTP 溶液誘變的 M
寡核苷酸指導的單鏈-DNA-誘變實驗
本文介紹了由 Zoller 和 Smith 的雙引物技術(1984,1987) 結合 Kunkel 的誘變體產量富集方法(1985) 構成的經典方案。本方案中使用的單鏈 DNA 模板含有較高的尿嘧啶殘基,因為它們是從生長于 dut 和 ung 基因突變大腸菌中的 M13 噬菌體中制備的(見方案 1)
研究發現全新DNA單鏈磷硫酰化修飾系統
DNA單鏈磷硫酰化修飾-感應修飾限制系統的工作機理 近日,武漢大學藥學院教授王連榮課題組在《自然·微生物學》在線發表了細菌DNA磷硫酰化領域的最新研究成果,首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修飾系統——DNA單鏈磷硫酰化修飾Ssp系統,并解析了感應基因組修飾抗噬菌體系統的分子機制。 細菌磷硫酰化
寡核苷酸指導的單鏈-DNA-誘變實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 適用于轉化的大腸桿菌菌株 用于轉化的大腸桿菌 TG1 感受態菌 試劑、試劑盒 ATP
臨床化驗單詳解抗雙鏈DNA抗體介紹
抗雙鏈DNA抗體介紹:?抗雙鏈DNA抗體(抗ds DNA)是抗DNA抗體中的一種。其反應位點位于DNA脫氧核糖磷酸框架上。抗ds DNA主要出現于SLE患者的血清中,對SLE患者的組織器官損傷有致病作用。在SLE患者血循環中,大分子的DNA濃度顯著高于正常人,DNA還可與多種器官的微血管結構包括腎小
免疫學實驗抗單鏈DNA(ssDNA)抗體介紹
抗單鏈DNA(ssDNA)抗體介紹: 抗ssDNA是抗DNA抗體中臨床意義和重要性都不如抗dsDNA的一種,DNA是一個大分子的復合物,由兩條核苷酸鏈形成的雙螺旋結構。加熱時堿基間的氫鍵斷裂,DNA變性產生ssDNA。抗ssDNA的反應位點主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶構成的堿基。 抗單鏈D
單鏈和雙鏈M13噬菌體DNA的大規模制備
實驗方法原理 這個方案主要用于制備大量 M13 噬菌體的雙鏈 DNA,因在實驗室中 M13 噬菌體經常被用作克隆載體,以及在某些特殊用途時需要制備大量的單鏈噬菌體 DNA,如當一個特定的重組體被多次用于制備反射性標記探針或構建大量定點突變體時。實驗材料 大腸桿菌 F' 菌株M13 噬菌體原液
單鏈和雙鏈M13噬菌體DNA的大規模制備
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 這個方案主要用于制備大量 M13 噬菌體的雙鏈 DNA,因在實驗室中 M13 噬菌體經常被用作克隆載體,以及在某些特殊用途時需要制備大量的單鏈噬菌體 DNA,如當一個特定的重組體被多次用于制備反射性標記探針或構建大量定點突變體時
單鏈和雙鏈M13噬菌體DNA的大規模制備
這個方案主要用于制備大量 M13 噬菌體的雙鏈 DNA,因在實驗室中 M13 噬菌體經常被用作克隆載體,以及在某些特殊用途時需要制備大量的單鏈噬菌體 DNA,如當一個特定的重組體被多次用于制備反射性標記探針或構建大量定點突變體時。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理這個方案主
制備DNA測序模板實驗——制備單鏈M13噬菌體DNA
本實驗包含了用于制備適用于雙脫氧測序的模板及適用于末端標記和化學測序的DNA的實驗方案。所有用于雙脫氧測序的雙鏈模板在與引物退火前必須變性,在一般應用上,堿變性在測序中的效果比熱變性好。實驗材料大腸桿菌試劑、試劑盒LBTEM13聚乙二醇容易讓頂層瓊脂乙酸鈉乙醇儀器、耗材巴斯德吸管試管離心機實驗步驟1
單鏈構象多態性分析(SSCP)技術
SSCP是一種簡便快速的檢測DNA或cDNA突變的技術。??????? 其技術原理和過程是:將PCR擴增到的待測DNA或cDNA片段變性,成為單鏈DNA,在一定條件下,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳將單鏈DNA變性。??????? 由于單鏈DNA的空間構象與分子內堿基組成密切相關,一個堿基的差異即可形成不同
臨床化學檢查方法介紹抗單鏈DNA(ssDNA)抗體介紹
抗單鏈DNA(ssDNA)抗體介紹: 抗ssDNA是抗DNA抗體中臨床意義和重要性都不如抗dsDNA的一種,DNA是一個大分子的復合物,由兩條核苷酸鏈形成的雙螺旋結構。加熱時堿基間的氫鍵斷裂,DNA變性產生ssDNA。抗ssDNA的反應位點主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶構成的堿基。抗單鏈DNA(s