CircRNA422通過SP7/LRP5軸促進骨髓間充質干細胞早期成骨分化
環狀RNA(CircRNAs)在干細胞的增殖、自我更新和成骨分化等生物學活動中發揮重要作用。與其他線性RNA相比,CircRNA由于其共價封閉結構,在細胞和組織中具有高度的穩定性和獨特的構象。 目前,研究最多的是線性RNA(miR-21、antimR-138或siMIR31HG),它們被組裝在鈦表面以促進干細胞的成骨分化。然而,線性RNA的穩定性不如CircRNA,半衰期比CircRNA短。 環狀RNAs(CircRNAs)在生物學活動中發揮著重要作用,特別是在調節干細胞的成骨分化方面。然而,還沒有研究報道CircRNAs在早期骨整合中的作用。 近日,來自浙江大學醫學院的研究者們在Molecular Therapy雜志上發表了題為“circRNA422 enhanced osteogenic differentiation of bone marrow mesenchymal stem cells during ear......閱讀全文
微型RNA調控眼睛干細胞生物過程
據物理學家組織網28日報道,美國科學家研究發現,微型RNA-103/107家族(miRs-103/107)在調控眼角膜邊緣上皮細胞內干細胞的生物過程中扮演著重要角色。發表在《細胞生物學雜志》上的最新研究首次在自噬和巨胞飲這兩種重要的細胞過程間建立了關聯。 細胞自噬是細胞應對生存壓力而降解其內
RNA是決定干細胞命運的關鍵嗎?
深入觀察我們的細胞,你會發現每個細胞都有一個完全相同的基因組——一套完整的基因,但是如果每個藍圖都是相同的,為什么眼睛細胞的外觀和行為與皮膚細胞或腦細胞不同呢?干細胞——我們器官和組織細胞的原材料——怎么知道會變成什么樣?在7月8日發表的一項研究中,科羅拉多大學博爾德分校的研究人員離回答這個基本問題
新型RNA標記技術顛覆以往干細胞研究
干細胞研究大多是在實驗室的培養皿中開展的。然而,斯坦福大學的研究人員近日在《Cell Reports》上發表文章稱,體內的干細胞和培養皿中的干細胞在基因表達譜上大相徑庭。 研究人員認為,若人們對分離后的干細胞開展研究,并得出干細胞功能的結論,那么這些結論需要重新考慮,因為細胞在分離過程中發生了
干細胞先驅發表單細胞RNA測序新成果
人多能干細胞是研究人類胚胎發育的理想模型,可以揭示譜系分化背后的細胞和分子機制。不過,人們還不清楚單個干細胞如何退出多能狀態并轉化為相應的前體細胞。 Morgridge研究院的科學家們使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術,對來自人胚胎干細胞的譜系特異性前體細胞進行了轉錄組分析,揭示了
單細胞RNAseq發現調節干細胞發育的新基因
最近,Wellcome Genome Campus的一項新研究演示了單細胞基因組學的力量,揭示了它如何能幫助科學家了解細胞的早期發育。這項研究發現了參與干細胞調控網絡的新基因,以及新 的細胞亞群,可讓我們深入了解干細胞多能性——成為幾乎所有不同類型細胞的能力。研究人員還為干細胞群落開發了新的資源
環狀RNA在腸道干細胞自我更新中的重要作用
腸道是食物消化和吸收的主要場所,由單層上皮細胞形成腸上皮屏障。除了上皮細胞,腸道中還有大量的免疫細胞。即使在成體穩態(homeostasis)條件下,腸上皮仍經歷著快速的自我更新,在小鼠中大約5天可以更新一次【1】。定位于腸道隱窩中的干細胞可以分化為腸道中所有的上皮細胞類型【2】。腸干細胞的自我
中大學子與學術牛人解析RNA修飾與癌癥干細胞
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA上最常見的一種轉錄后修飾,這種可逆的RNA甲基化修飾與人類疾病有關。研究者們已經陸續定位了哺乳動物轉錄組中的m6A,鑒定了這種動態修飾所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白。不過,人們還對m6A起到的具體作用還知之甚少。 約翰霍普金斯
RNA表觀修飾在造血干細胞發育中的關鍵作用
血液是生命的源泉。不斷流動的血細胞既可以運輸營養物質,又是重要的免疫保護屏障。其中,所有的血細胞都來源于造血干細胞。這群干細胞不僅可以維持血液系統的長期穩定,也是骨髓移植治療惡性血液疾病的核心組分。目前,造血干細胞來源仍是制約臨床惡性血液疾病治療的瓶頸。因此,造血干細胞的體內發育和體外誘導擴增已
劉澎濤博士:單細胞RNAseq解析干細胞異質性
最近,在國際著名學術期刊《Genome Biology》發表的一項研究中,來自英國威康信托基金會桑格研究所、劍橋大學、上海交通大學等處的研究人員,采用單細胞轉錄組分析來解析造血干細胞(HSCs)的分子異質性。這項研究論證了單細胞轉錄學用于解析干細胞區室中的細胞過程和譜系異構性的效用。 英國威康
神經干細胞為RNA提供高速通道-其機制或決定腦細胞總數
美國杜克大學官網1日發布公告稱,該校科學家利用顯微成像技術首次發現,神經干細胞為許多RNA(核糖核酸)分子和其他蛋白分子提供高速通道,幫助這些分子快速移動到大腦外層。他們在可視化這一過程中還發現,一種與脆性X染色體綜合征有關的蛋白質缺失與這些分子移動具有重要關聯。相關研究在線發表于美國《當代生物
揭示特殊的非編碼RNA或是聯系干細胞和癌癥的標志物
近日,刊登在國際雜志Genome Biology上的一篇研究論文中,來自圣勞倫學院的研究者闡述了其在疾病系統生物學方面的研究成果。研究者在文中發現,一種名為vlincRNAs(較長基因間非編碼RNAs,very long intergenic, non-coding RNAs)的人類
揭示哺乳動物干細胞利用抗病毒Dicer抵御多種RNA病毒入侵
在一項新的研究中,來自英國弗朗西斯-克里克研究所的研究人員發現了一種以前認為隨著哺乳動物的進化而消失的重要機制有助于保護哺乳動物的干細胞免受SARS-CoV-2和寨卡病毒等RNA病毒的侵害。他們認為,這一發現有朝一日可能在開發新的抗病毒治療方法中得到利用。相關研究結果發表在2021年7月9日的S
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA
RNA標記
RNA labeling?(Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes??32P-pCp 3' End-labeling
RNA-Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
指導RNA
中文名稱指導RNA英文名稱guide RNA;gRNA定 義一種小分子RNA,約含60~80個核苷酸,在RNA編輯中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或刪除的信息。由小環DNA及大環DNA編碼的指導RNA均帶有編輯區的序列信息,可介導編輯過程。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
RNA電泳
·?????????RNA Gel?(Crawford Lab)·?????????Gel Electrophoresis of RNA?(Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.?·?????????Northern
RNA-電泳
①電泳RNA 所用器械如制膠的模具、梳子、電泳槽等用肥皂粉洗干凈后用雙蒸水沖洗二遍后在室溫晾干備用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %瓊脂糖凝膠,倒膠時溴化乙錠(E直接加入凝膠中。③制備好的瓊脂糖凝膠板放入電泳槽后再加入經高壓滅菌過的1XTBE ,液面只能剛好同膠面平齊,緩沖液不要淹過膠面。④點樣
RNA降解
新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如? 果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2. 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組織