DNA測序技術的介紹
DNA測序技術，又叫基因測序技術。 人類基因組這部由A、T、G、C四個字母組成的卷帙浩繁的生命天書如同一座寶庫，保藏著幾千年來人們迫切想知道的秘密，DNA測序技術就好似“芝麻開門”這樣的咒語，是我們打開寶庫的金鑰匙。世界上第一個測定DNA序列的方法是由英國生化學家弗雷德里克·桑格爾發明的。自此DNA測序的速度就一直呈加速態勢。2001年人類基因組草圖耗資4.37億美元，耗時13年。到了2007年，第一個完整人類基因組序列圖譜的誕生只花費了150萬美元，3個月就搞定。2009年1月2日，美國加州太平洋生物科學公司的科學家喬納斯·考爾拉赫、斯蒂芬·特納及其研究小組在《科學》雜志上發表論文稱，他們將納米技術與芯片技術相結合，發明了一種新型測序方法，速度是現有技術的3萬倍。 DNA sequencing technology Sanger 法測序的原理就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止......閱讀全文
DNA測序
? ? ? ? ? ? ? ? 自動測序法 雙脫氧鏈末端終止法 非同位素銀染 鳥槍法 Maxam-Gilbert化學修飾法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法
DNA測序
實驗方法原理 ABI ?PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀)，采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳，應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法)，因此通過單引物PCR測序反應，生成的PCR產物則是相差1個堿基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈DN
DNA測序
DNA測序（主要內容如下）·?????????Sequencing Gel Preparation·?????????Preparation of Templates?·?????????DNA Sequencing by the Dideoxy Method·?????????DNA Sequen
關于DNA測序技術的測序凝膠的銀染介紹
染色過程要求凝膠浸在塑料盤中。因而至少使用兩個盤子，大小與玻璃板類似。在盤中加入新鮮溶液之前須用高質量的水洗滌盤子。 1.電泳完畢后用一個塑料片子小心地分開兩板，凝膠應該牢固地附著在短玻璃板上。 2. 固定凝膠：將凝膠(連玻璃板)放入塑料盤，用固定/停止溶液浸沒,充分振蕩20分鐘或直至樣品中
DNA測序技術（非同位素銀染測序系統操作技術與T7－DNA聚...
3、質粒膜板制備：參照第一章所述的方法。（二）超螺旋質粒DNA 的堿變性：1、取4mg（約2pmol）超螺旋質粒DNA 至一eppendorf管中，加無離子水到終體積18ml。2、加2ml 2mmol/L NaOH/2mmol/L EDTA 溶液，置于室溫(25℃下）保溫5分鐘。3、加2ml 2mo
DNA測序PCR測序反應
1. 取0.2 ml的PCR管，用記號筆編號，將管插在顆粒冰中，按下表加試劑： 所加試劑 測定模板管 標準對照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待測的質粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA － 1 μl 待測DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA測序的測序原理
DNA測序的測序原理是：利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成，每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團，使延長的寡聚核苷酸
第二代DNA測序技術
DNA總的說來，第一代測序技術的主要特點是測序讀長可達1000bp，準確性高達99.999%，但其測序成本高，通量低等方面的缺點，嚴重影響了其真正大規模的應用。因而第一代測序技術并不是最理想的測序方法。經過不斷的技術開發和改進，以Roche公司的454技術、illumina公司的Solexa，His
納米孔技術有望顛覆DNA測序市場
Christopher Mason有一個喜歡在會議上展示的技巧。通過從志愿者手機上收集的化驗樣本獲取DNA，他和同事能在1個小時內現場進行譜系分析，甚至詳細描述出捐贈者一天的生活細節。“我們能從手機上的殘留物預言誰剛吃了一個橘子或者誰吃了豬肉。”美國紐約威爾康奈爾醫學院計算生物學家Mason表示
關于DNA測序技術的試劑的介紹
（1）SILVER SEQUENCETM DNA測序試劑盒。 （2）丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺儲備液（38%丙烯酰胺 W/V，2%甲叉雙丙烯酰胺 W/V)：95g丙烯酰胺，5g甲叉雙丙烯酰胺溶于140ml 雙蒸水中，定容至250ml，0.45mm過濾器過濾后，貯于棕色瓶中，置于4℃冰箱可保存2周
DNA測序技術的上樣及電泳
關閉電泳儀，用移液槍吸緩沖液清洗樣品孔，去除在預電泳時擴散出來的尿素，然后立即用毛細管進樣器吸取樣品，加入樣品孔中。上樣順序一般為G、A、 T、C。加樣完畢后，立即電泳。開始可用30V/cm進行電泳，5分鐘后可提高至40-60V/cm，并保持恒壓狀態。一般來說，一個55cm長， 0.2mm厚的凝
DNA測序技術的現狀和發展（四）
1.1.3.2 模板制備程序完全的體外大規模模板制備工作是達成高通量、低價格測序技術的前提。已廣泛使用的乳液PCR擴增技術就是一種很好的方法。不過，由于很難在熱循環測序反應中保證乳液微滴的穩定性，因此最開始實驗的模板擴增方法是恒溫擴增法（isothermal）。乳液PCR不需要借助細菌的幫助就能擴增
DNA測序技術的現狀和發展（七）
3. 新一代測序技術的前景在2007年6月，James Watson的基因組序列登錄到了GenBank數據庫當中，這是第一次使用非Sanger測序法獲得了人類個體基因組序列，并且第一次將個人基因組序列公之于眾。整個測序過程在兩個月之內就完成了，花費不到100萬美元，這只占耗時10年之久的人類
DNA測序技術的現狀和發展（十）
五、更多閱讀1. 核糖體印記與深度測序技術將核糖體圖譜（ribosome profiling）和深度測序（deep sequencing）相結合，研究人員可以從基因組水平監測蛋白質的翻譯狀況。深度測序的強大功能對生物學研究的各個領域都產生了極大的影響。在諸如全基因組測序等方面，新技術的高效性和經濟性
關于DNA測序技術的設備相關介紹
DNA測序儀，性能特點，自動化程度高，提供連續、無需監控的操作，自動灌膠、上樣、電泳分離、檢測及數據分析，可連續運行24小時無需人工干預。樣品分析量大，一束毛細管可同時對16個樣品進行全自動分析，一天可完成數百個樣品的測序或片段分析工作。先進的熒光檢測系統，采用光柵分光，CCD攝像機成像技術，實
關于DNA測序技術的凝膠的制備
（1）玻璃板經粘合硅膠和Sigmacote處理后，即可固定玻璃板。該方法是用0.2mm或0.4mm厚的邊條置于玻璃板左右兩側，將另一塊玻璃板壓于其上。在長玻璃板的一側插入鯊魚齒梳平的一面邊緣，用夾子固定住。 （2）根據所需要的凝膠濃度，按下表制備測序凝膠，一般6%-8%的膠濃度可獲得較好的結果
DNA測序技術的現狀和發展（三）
1.1.1 摩爾定律對454測序儀的影響454測序儀的迅猛發展不是因為我們想要Sanger測序儀小型化，而是因為新型奔騰芯片的出現以及摩爾定律法則給我們帶來的希望。很明顯，常規的人類基因測序項目會對我們處理測序技術的能力提出更高要求，這與我們對計算機處理能力的要求是一樣的。不過，只有將計算機的電子管
DNA測序技術的現狀和發展（十二）
2.1.3 剪切后的短片段作圖軟件包要將RNA的逆轉錄片段cDNA重新定位到基因組當中需要更加復雜的專業化算法。要將不同外顯子經過剪切拼接之后生成的RNA短片段重新定位到基因組中和將一個外顯子生成的RNA短片段重新定位到基因組中是完全不一樣的（圖14）。在RNA逆轉錄產物cDNA的定位操作中用到的諸
Nat－Methods發布新的DNA測序技術
最近，英國諾丁漢大學的科學家們首次證明，我們有可能實時地、有選擇性地測定DNA序列片段，從而大大減少了分析生物樣品所需的時間。 在Nature子刊《Nature Methods》上發表的一篇論文，描述了一種新的技術，可高度選擇性的進行DNA測序，這種技術被稱為“'Read Until”。這種方
DNA測序技術操作的注意事項
1、測序所用模板DNA的量一般按下面要求加入： 模板種類/長度 模板量 200bp (PCR產物) 16ng(120fmol) 3000-5000bp（超螺旋質粒DNA) 4mg (2pmol) 48000bp(λ,粘粒DNA) 1mg(31fmol) 由于超螺旋質粒產生的信號比松弛
DNA測序技術的現狀和發展（十一）
2.1.2 短片段作圖軟件Maq和Bowtie（見表16）都屬于上述提及的程序。它們使用的是一種稱作“建立索引（indexing）”的策略。同時，人們也對大量的DNA序列建立了一份索引，借助這份索引就能快速地找到其中的短DNA片段了。Maq軟件是基于一種直接的但是很有效的策略——空位種子片段索引法（
第三代DNA測序技術
測序技術在近兩三年中又有新的里程碑。以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies納米孔單分子測序技術，被稱之為第三代測序技術。與前兩代相比，他們最大的特點就是單分子測序，測序過程無需進行PCR擴增。其中PacBio SMRT技術其實也應用了邊合成邊測序的思想
DNA測序技術的現狀和發展（六）
2. 用于處理新一代測序技術數據的軟件和標準各種新一代測序儀的飛速發展面臨著一個極其重要的問題，那就是生物信息學問題，這些問題包括序列質量評分（sequence quality scoring）問題、序列比對問題、序列組裝問題、數據發布問題等。下面將逐個進行討論。2.1 序列質量問題目前，序列質量評
DNA測序技術的現狀和發展（九）
與在掃描隧道顯微鏡（scanning tunneling microscope, STM）中一樣，使用合適的探針（電極），可以得到納安級（nano-ampere）的電子隧穿電流。使用這種納安級的電流檢測堿基的速度比在直徑不到 3nm的納米孔中使用皮安級的電流檢測要快得多。雖然這種方法只需
DNA測序技術的現狀和發展（二）
三、新一代DNA測序技術DNA測序技術已廣泛應用于生物學研究的各個領域，很多生物學問題都可以借助高通量DNA測序技術予以解決。過去三年，大規模平行 測序平臺（massively parallel DNA sequencing platform）已經發展為主流的測序技術，這項測序技術的出現不僅
第一代DNA測序技術
第一代DNA測序技術用的是1975年由桑格（Sanger）和考爾森（Coulson）開創的鏈終止法或者是1976-1977年由馬克西姆（Maxam）和吉爾伯特（Gilbert）發明的化學法（鏈降解）. 并在1977年，桑格測定了第一個基因組序列，是噬菌體X174的，全長5375個堿基[1]。自此，人
DNA測序技術的現狀和發展（一）
一、我們將如何應對海量的基因信息新一代測序技術帶給人們大量遺傳信息的同時，卻成為限制其廣泛應用的一個障礙。1980年，英國生物化學家Frederick Sanger與美國生物化學家Walter Gilbert建立了DNA測序技術并獲得諾貝爾化學獎，至今已有近三十年了。在這三十年，DNA測序技
DNA測序技術的現狀和發展（五）
1.3 AB SOLiD測序儀AB SOLiD測序儀可以對由任何方法制成的DNA文庫進行測序。AB SOLiD測序儀有一個極大的特點就是能夠將富集模板片段的微珠在芯片上進行高度可控的任意排列。AB SOLiD測序儀也是使用如圖5a中所示的微乳液PCR方法擴增模板片段的，不過，它這里使用的
DNA測序技術的現狀和發展（八）
雖然這些最初的納米孔實驗并沒有獲得預期結果，但它們至少顯示出納米孔在單分子技術方面的應用優勢，例如高度的敏感性，同時也帶動了納米孔核酸分析技術的研究熱潮，并在理論及實驗方面取得了一些成果。自從發現在電場力作用下，長達1000個堿基的單鏈DNA分子也能通過納米孔之后，人們就更加堅信， 廉價的納米孔
DNA測序技術（非同位素銀染測序系統操作技術與T7－DNA...3
二、材料待測的DNA 模板，可用雙鏈或單鏈模板。 三、設備高壓電泳儀，測序用電泳槽，照相顯影用大號塑料盆，制膠設備，吹風機，放射自顯影盒，X-光片。 四、試劑 1、5×T7 DNA 聚合酶緩沖液：200mmol/L Tris?Cl，pH7.5，100mmol/L MgCl2，