如何進行獸醫檢測熒光定量PCR實驗?
實時熒光定量PCR技術(real-time fluorescent quantitative PCR,后文簡稱qPCR)作為目前核酸檢測和定量中最主要的分子生物學工具之一,以其特異性強、靈敏度高、重復性好、定量準確、自動化程度高、速度快等多個優點在疾病快速檢測、食品安全檢測、靶向用藥基因檢測等多種應用領域中一直發揮著巨大的作用。 自2018年8月起,國內爆發非洲豬瘟疫情,非洲豬瘟具有多種表現形式,最常見的是急性發病形式,相關致死率高達 100%。非洲豬瘟嚴重威脅著養豬業的健康生產和相關供應鏈的發展,但目前還不存在有效的疫苗或治療方法,專業人員意識到僅靠傳統的臨床癥狀判斷,并不能有效的控制疫情,人們的目光越來越多的集中到了具有準確、靈敏、快速等優勢的實時熒光定量PCR技術。 qPCR作為一項成熟的實驗技術,實驗操作看起來也并不復雜,但知易行難......閱讀全文
如何進行獸醫檢測熒光定量PCR實驗?
實時熒光定量PCR技術(real-time fluorescent quantitative PCR,后文簡稱qPCR)作為目前核酸檢測和定量中最主要的分子生物學工具之一,以其特異性強、靈敏度高、重復性好、定量準確、自動化程度高、速度快等多個優點在疾病快速檢測、食品安全檢測、靶向用藥基因檢測等多種應
如何做好熒光定量PCR實驗
熒光定量PCR實驗指南 一、基本步驟: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對; 2、引物、探針的設計; 3、引物探針的合成; 4、反應體系的配制; 5、反應條件的設定; 6、反應體系和條件的優化; 7、熒光曲線和數據分析;
如何做好熒光定量PCR實驗
熒光定量PCR實驗指南一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備;二、技術關鍵:1、?目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;從
熒光定量PCR實驗時,熒光基團如何選擇?
?原則一? ? 每個反應只檢測一個基因的,方法就比較簡單,對5’端熒光基團的選擇以及3’端淬滅基團的選擇余地都是比較大的。比如5’-FAM? +? 3’-BHQ,就是比較常見的方案。? ? 下表為常用熒光染料(基團)的顏色及波長參數,供參考。? ??? ? 原則二? ? 如果在每個反應中要檢測的目的
核酸檢測實驗室如何評價熒光定量PCR儀!
熒光定量PCR的檢測是一系列從采樣、保存運輸、樣品處理、核酸提取、擴增等一系列流程的組合,任何一個環節出現問題都會導致最終結果的錯誤。雖然在前面一系列的文章中講述了提取試劑、擴增試劑的評價但是這些仍遠遠不夠,因此我在后續的文章中會盡可能覆蓋到所有的檢測環節。 熒光定量PCR的檢測離不開熒光定量
如何做好熒光定量PCR實驗?(六)
其他問題:1)、文獻上找到的引物和探針序列能否直接使用?通常國外的文獻可信度比較高,可直接使用;但為了保險起見,最好用blast對引物探針的序列進行必要的驗證;或者再進一步用primer軟件對引物探針的二級結構和退火溫度進行分析,這樣更有利于您對整個實驗的把握。2)、在實驗之前要進行哪些準備工作?首
如何做好熒光定量PCR實驗?(一)
熒光定量PCR實驗指南一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備;二、技術關鍵: 1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;從h
如何做好熒光定量PCR實驗?(五)
5、反應體系配制:e? A2010A0101試劑盒:(探針體系)FQ-PCR MasterMix-UNG混合物(2X) 25ul(終濃度為1×);上游引物(終濃度為50~900nM),下游引物(終濃度為50~900nM);探針(終濃度為200nM);待檢樣品 5ul(終濃度為10~100ng);無菌
如何做好熒光定量PCR實驗?(三)
3.3 引物、探針的純度和穩定性定制引物的標準純度對于大多數PCR應用是足夠的。部分應用需要純化,以除去在合成過程中的任何非全長序列。這些截斷序列的產生是因為DNA合成化學的效率不是100%。這是個循環過程,在每個堿基加入時使用重復化學反應,使DNA從3'到5'合成。在任何一個循環都
如何做好熒光定量PCR實驗?(四)
3.7 模板濃度起始模板的量對于獲得高產量很重要。對大多數PCR擴增和熒光PCR擴增,104到106個起始目的分子就足以觀測到好的熒光曲線(或在溴化乙錠染色膠上觀察到)。所需的最佳模板量取決于基因組的大小(下表)。舉例說,100ng到1μg的人類基因組DNA,相當于3×104到3×105個分子,足以
如何做好熒光定量PCR實驗?(二)
2.4 實時多重PCR探針的選擇:多重實時PCR的多種含意有兩種:一為選擇保守的探針和引物,利用不同的染料標記探針,在檢測時可根據熒光的顏色來判定不同的產物。另一種為選擇保守的引物,擴增不同長度的目的片段,反應中加入SYBRN染料,最后根據不同目的片段的Tm值來判定不同的物品。多重實時PCR的熒光探
使用熒光定量PCR方法進行核酸檢測的步驟
進行核酸檢驗,需要經過取樣、留樣、留存、核酸提取、上機檢測五個步驟。? ? 核酸檢測的第一步就是采集人體分泌物,用鼻試子或咽試子擦拭鼻腔或咽后壁及雙側咽扁桃體處。? ? 第二步醫務人員進行留樣,將試子頭浸入細胞保存液中,折斷尾部后立即旋緊管蓋。? ? 第三部要將樣本放入密閉袋中,保存好并及時送檢。?
熒光定量PCR實驗步驟
1、總RNA抽提(槍頭和離心管均經過濕熱滅菌,無RNA酶) 1)取勻漿器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上預冷。 2)取100mg組織,加入到勻漿器中。 3)充分研磨直至無可見組織塊。 4)12000rpm離心10min取上清。 5)加入250 μl三氯甲烷,顛倒離心管
熒光定量PCR檢測方法
所謂實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。 檢測方法 1.SYBRGreenⅠ法: 在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發射熒光信
如何選擇熒光定量PCR儀?
熒光定量PCR 因操作方便、運行速度快、實驗結果準確,受到越來越多的分子生物學研究者青睞。在實驗技術成熟的今天,也許對你來說,最難得不是實驗技術上的問題——而是選擇哪一種熒光定量PCR儀——你要征詢實驗室成員的意見、分析實驗室目前乃至將來的需求、平衡實驗室的預算,更要詳細研究各種極富誘惑力的宣傳
熒光定量PCR實驗指南-1
第一部分一、基本步驟:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;4、反應體系的配制;5、反應條件的設定;6、反應體系和條件的優化;7、熒光曲線和數據分析;8、標準品的制備; 二、技術關鍵: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;
熒光定量PCR實驗設計
?設置對照組:熒光定量PCR檢測一般流程如下圖,選擇檢測靶標基因,進行引物篩選及體系構建,后續進行樣本處理核酸提取,檢測分析結果。對照組是實驗的監控系統,監測實驗是否有存在異常,也是排除實驗異常關鍵所在;實驗對照設置: 通常有陽性對照,陰性對照組等。? ??? 具體可根據實驗類型進行對照組的設置;對
熒光定量PCR具體實驗步驟
熒光定量PCR具體實驗步驟,1 樣品RNA的抽提①取凍存已裂解的細胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。②兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色
熒光定量PCR實驗指南-2
2.3TaqmanMGB探針設計介紹MGB探針的優點:2MGB探針較短(14-20bp),更容易找到所有排序序列的較短片段的保守區。2短片段探針(14-20bp)加上MGB 后,Tm值將提高10℃,更容易達到熒光探針Tm值的要求。2MGB探針的設計原則2探針的5’端避免出現G,即使探針水解為單個堿基
熒光定量PCR實驗指南-5
您可以選擇熒光染料SYBGREEN體系,具體請參照說明書。您可靈活使用20-50ul間其他體積,注意保證終濃度相同。A2010A0106試劑盒:反應體系終濃度(自配熱啟動熒光系統):1-2U的hotstartTaq酶、3-5.5mM的Mg2+ 、0.2mM的dNTPs、1×PCRbuffer(A
熒光定量PCR實驗指南-3
3.3 引物、探針的純度和穩定性定制引物的標準純度對于大多數PCR應用是足夠的。部分應用需要純化,以除去在合成過程中的任何非全長序列。這些截斷序列的產生是因為DNA合成化學的效率不是100%。這是個循環過程,在每個堿基加入時使用重復化學反應,使DNA從3'到5'合成。在任何一個循環都
熒光定量PCR實驗指南-4
3.8 防止殘余(Carry-over)污染PCR易受污染的影響,因為它是一種敏感的擴增技術。小量的外源DNA污染可以與目的模板一塊被擴增。當前一次擴增產物用來進行新的擴增反應時,會發生共同來源的污染。這稱之為殘余污染。從其他樣品中純化的DNA或克隆的DNA也會是污染源(非殘余污染)。可以在PCR過
熒光定量PCR實驗基本步驟
1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比對;2、引物、探針的設計;3、引物探針的合成;? ??4、反應體系的配制;? ??5、反應條件的設定;? ??6、反應體系和條件的優化;? ??7、熒光曲線和數據分析;? ??8、標準品的制備;
熒光定量PCR檢測流程
熒光定量PCR檢測一般流程如下圖,選擇檢測靶標基因,進行引物篩選及體系構建,后續進行樣本處理核酸提取,檢測分析結果。? ??
如何做實時熒光定量 PCR (realtime PCR)
標簽: 實時 熒光定量 PCR realtime PCR 本生生物 所謂實時熒光定量 PCR 技術,是指在 PCR 反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個 PCR 進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。 原理及材料: 實驗材料:細胞樣品 試劑、
如何看熒光定量PCR的結果
按公式計算:對照組-ΔΔCt =對照組(Ct 目的基因-Ct 內參基因)-對照組(Ct 目的基因-Ct 內參基因)
如何看熒光定量PCR的結果
按公式計算:對照組-ΔΔCt =對照組(Ct 目的基因-Ct 內參基因)-對照組(Ct 目的基因-Ct 內參基因)
實時熒光定量pcr數據如何統計
首先你這樣做出來的統計沒有意義。應該是至少3次獨立實驗,而不是重復3次PCR。如果3次試驗,每次重復3次(取平均值算一次)。然后先定各個基因在對照組的值為一,再算出其他組該基因的相對量,比如內參CT值一樣(都是15),而TNF的CT值對照組是20,而模型組是19,則相對量是2(對照組為1)。△△ct
熒光定量PCR體系如何加樣?
?PCR反應體系中,各試劑加樣量是如何確定的,DNA模板怎么提取,PCR體系。這個小小管子里都有什么東西、需要加多少呢?今天一起來看一下關于PCR體系的加樣各種問題。? ? 關于體系? ? PCR技術問世于上世紀80年代。問世之初的PCR體系比較大,動輒以毫升計。現在的PCR體系要精巧多了,總體積可
熒光定量PCR
熒光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR,RTFQ PCR) 是1996 年由美國Applied Biosystems 公司推出的一種新定量試驗技術,它是通過熒光染料或熒光標記的特異性的探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時在線監控反應過程,結