生物學術語表達序列標簽的方法
EST作為表達基因所在區域的分子標簽因編碼DNA序列高度保守而具有自身的特殊性質,與來自非表達序列的標記(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系與種的限制,因此EST標記在親緣關系較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣,對于一個DNA序列缺乏的目標物種,來源于其他物種的EST也能用于該物種有益基因的遺傳作圖,加速物種間相關信息的迅速轉化。......閱讀全文
生物學術語表達序列標簽的方法
EST作為表達基因所在區域的分子標簽因編碼DNA序列高度保守而具有自身的特殊性質,與來自非表達序列的標記(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系與種的限制,因此EST標記在親緣關系較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣,對于一個DNA序列缺乏的目標物種,來源于其
生物學術語表達序列標簽的原理
EST是從一個隨機選擇的cDNA克隆進行5’端和3’端單一次測序獲得的短的cDNA部分序列,代表一個完整基因的一小部分,在數據庫中其長度一般從20到7000bp不等,平均長度為360±120bp 。EST來源于一定環境下一個組織總mRNA所構建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達水
生物學術語表達序列標簽的定義
表達序列標簽從互補DNA(cDNA)分子所測得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。從cDNA文庫所得到的許多表達序列標簽集合組成表達序列標簽數據庫,代表在一定的發育時期或特定的環境條件下,特定的組織細胞基因表達的序列。可用于驗證基因在特定組織中的表達,推導全長cDNA序列,或作為標簽標志
表達序列標簽的方法
首先從樣品組織中提取mRNA,在逆轉錄酶的作用下用oligo(dT)作為引物進行RT-PCR合成cDNA,再選擇合適的載體構建cDNA 文庫,對各菌株加以整理,將每一個菌株的插入片段根據載體多克隆位點設計引物進行兩端一次性自動化測序,這就是EST序列的產生過程。
表達序列標簽的作用
⑴ 用于構建基因組的遺傳圖譜與物理圖譜;⑵ 作為探針用于放射性雜交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以尋找新的基因;⑸ 作為分子標記;⑹ 用于研究生物群體多態性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于藥物的開發、品種的改良;⑼ 促進基因芯片的發展等方面。正是因為EST 表現出了這些巨大潛能,使其得到了充分的利用
表達序列標簽的應用
EST作為表達基因所在區域的分子標簽因編碼DNA序列高度保守而具有自身的特殊性質,與來自非表達序列的標記(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系與種的限制,因此EST標記在親緣關系較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣,對于一個DNA序列缺乏的目標物種,來源于其
什么是表達序列標簽?
表達序列標簽從互補DNA(cDNA)分子所測得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。從cDNA文庫所得到的許多表達序列標簽集合組成表達序列標簽數據庫,代表在一定的發育時期或特定的環境條件下,特定的組織細胞基因表達的序列。可用于驗證基因在特定組織中的表達,推導全長cDNA序列,或作為標簽標志
表達序列標簽的應用原理
EST是從一個隨機選擇的cDNA克隆進行5’端和3’端單一次測序獲得的短的cDNA部分序列,代表一個完整基因的一小部分,在數據庫中其長度一般從20到7000bp不等,平均長度為360±120bp 。EST來源于一定環境下一個組織總mRNA所構建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達水
表達序列標簽的作用表現
⑴ 用于構建基因組的遺傳圖譜與物理圖譜;⑵ 作為探針用于放射性雜交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以尋找新的基因;⑸ 作為分子標記;⑹ 用于研究生物群體多態性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于藥物的開發、品種的改良;⑼ 促進基因芯片的發展等方面。正是因為EST 表現出了這些巨大潛能,使其得到了充分的利用
表達序列標簽圖的定義
中文名稱表達序列標簽圖英文名稱expressed sequence tag map定 義標明表達序列標簽在基因組上位置的物理圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
序列標簽位點的簡介
任何DNA序列,只要知道它在基因組中的位置,都能被用作STS標簽。作為基因組中的單拷貝序列,是新一代的遺傳標記系統,其數目多,覆蓋密度較大,達到平均每1kb一個STS或更密集。這種序列在染色體上只出現一次,其位置和堿基順序都是已知的。在PCR反應中可以檢測出STS來,STS適宜于作為人類基因組的一種
序列標簽位點的定義
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
表達基因的克隆策略與分離表達基因序列的技術方法
人類基因組計劃的主要任務之一就是要從大片段基因組區域或整條染色體DNA 上鑒定出基因表達序列(gene expressed sequences)或轉錄單位(transcription units)。在人類基因組30億個堿基對中,發生轉錄的表達序列(即基因)僅占總序列的3~5%。基因組中絕大部
序列標簽位點圖的定義
中文名稱序列標簽位點圖英文名稱sequence tagged site map定 義標明序列標簽位點在基因組上位置的物理圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
什么是序列標簽位點?
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
生物學術語穩態
穩態(Homeostasis )指的是把正常機體通過調節作用,使得各個器官、系統的協調活動,共同維持內環境的相對穩定狀態。內環境保持相對穩定是生物體自由生存的條件。
生物學術語底物
底物為參與生化反應的物質,可為化學元素、分子或化合物,作用可形成產物。一個生化反應的底物往往同時也是另一個化學反應的產物。
生物學術語別構酶
當某些化合物與酶分子中的別構部位可逆地結合后,酶分子的構象發生改變,使酶活性部位對底物的結合與催化作用受到影響,從而調節酶促反應速度及代謝過程,這種效應稱為別構效應。具有別構效應的酶稱為別構酶。別構酶常是代謝途徑中催化第一步反應或處于代謝途徑分支點上的一類調節酶,大多能被代謝最終產物所抑制,對代謝調
BIORAD-采用-Profinity-eXactTM融合標簽表達系統純化無標簽...
BIORAD 采用 Profinity eXactTM融合標簽表達系統純化無標簽的重組蛋白親和標簽已成為后基因組學時代純化重組蛋白常用手段。此方法無需了解蛋白質的生化特性或生理活性,就可通過帶標簽的重組融合蛋白選擇性地與層析基質上的配體結合,從而得以純化任何蛋白質。此方法與常規的層析方法不同之處在于
用于蛋白質表達的標簽實驗
實驗步驟一、設計具有標簽的蛋白質時需要考慮的因素親和力和可溶性的選擇在大腸埃布氏菌中生產外源蛋白時面臨兩個挑戰: 一? 是所用蛋白質表達系統的表達水平很低; 二是所表達的蛋白質被錯誤折疊進不溶性的聚集體—包涵體中。弱啟動子、低轉錄起始或稀有密碼子的存在引起的表達問題都可以通過在裝配過表達質粒時將矯正
用于蛋白質表達的標簽實驗
實驗步驟 一、設計具有標簽的蛋白質時需要考慮的因素 親和力和可溶性的選擇 在大腸埃布氏菌中生產外源蛋白時面臨兩個挑戰: 一? 是所用蛋白質表達系統的表達水平很低; 二是所表達的蛋白質被錯誤折疊進不溶性的聚集體—包涵體中。弱啟
生物學術語穩態的意義
對人和高等動物而言,內環境的穩態是細胞維持正常生理功能,乃至機體維持正常生命活動的必要條件。內環境的穩態就是指在正常情況下機體內環境的各種成分和理化性質只在很小的范圍內發生變動。例如體溫維持在37°C左右,血漿pH維持在7.4左右,動脈血壓、血漿中的氧和二氧化碳分壓、葡萄糖濃度等也都維持在相對恒定的
生物學術語前穩態
酶-底物復合物的濃度隨時間的增加而增加,尚未達到穩態的狀態。其反應非常快,只有應用測定快速反應的停流裝置或弛豫技術才有可能跟蹤。
生物學術語假底物
可以特異地結合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物結合的物質。有些酶具有假底物結構域,其中的特定序列或殘基作為假底物結合到酶的活性部位,抑制酶活性,當酶與配基結合后發生構象變化,釋放假底物,恢復催化功能。這是體內調節酶活性的一種重要方式。
生物學術語-滲透作用
滲透作用(Osmosis)指兩種不同濃度的溶液隔以半透膜(允許溶劑分子通過,不允許溶質分子通過的膜),水分子或其它溶劑分子從低濃度的溶液通過半透膜進入高濃度溶液中的現象。或水分子從水勢高的一方通過半透膜向水勢低的一方移動的現象。
關于外顯子的表達序列介紹
在反式剪接中,不同mRNA的外顯子可以被接合在一起。外顯子在剪接(Splicing)后仍會被保存下來,并可在蛋白質生物合成過程中被表達為蛋白質。外顯子是最后出現在成熟RNA中的基因序列,又稱表達序列。既存在于最初的轉錄產物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術語外顯子也指編碼相應RNA外
用于蛋白質表達的標簽實驗(一)
一、設計具有標簽的蛋白質時需要考慮的因素親和力和可溶性的選擇在大腸埃布氏菌中生產外源蛋白時面臨兩個挑戰: 一? 是所用蛋白質表達系統的表達水平很低; 二是所表達的蛋白質被錯誤折疊進不溶性的聚集體—包涵體中。弱啟動子、低轉錄起始或稀有密碼子的存在引起的表達問題都可以通過在裝配過表達質粒時將矯正
用于蛋白質表達的標簽實驗(二)
二、可溶性標簽在重組蛋白表達中,特別是當在細菌中表達真核蛋白時,主要的瓶頸在于蛋白質的正確折疊與可溶性。一些可溶性蛋白已被作為標簽用來改善目標蛋白質的折疊。這些標簽應該與其他方法共同使用來促進蛋白質的折疊,如誘導后降低培養溫度或者共表達伴侶蛋白(BaneyxandMujacic,2004;deMar
用于蛋白質表達的標簽實驗2
三、標簽的去除由于蛋白標簽可能會干擾目標蛋白質的正常功能,所以在完成其促進溶解或親和純化的作用后,標簽的去除對于生物學和功能研究很有幫助,對 GST 或 MBP 這樣的大標簽尤其如此,盡管有一些例子顯示融合了標簽的蛋白質更易結晶 (Smythetal.,2003)。大多數用來向目標蛋白質添加標簽的商
重組蛋白表達的幾種常用標簽介紹
?重組蛋白表達技術現已經廣泛應用于生物學各個具體領域。特別是體內功能研究和蛋白質的大規模生產都需要應用重組蛋白表達載體。本文將簡要介紹幾個常用載體標簽及其功能和優點。一. GST標簽GST(谷胱甘肽巰基轉移酶) 標簽蛋白本身是一個在解毒過程中起到重要作用的轉移酶,它的天然大小為26KD。將它應用在原