雙雜交系統的技術方法和應用
雙雜交系統是在體內檢測蛋白-蛋白相互作用的極強有力方法。 雙雜交系統的基礎是在一些轉錄因子上發現的模域(modular domains):一個DNA結合域,它可以結合一段特異的DNA序列,和一個轉錄激活域,這個轉錄激活域與基礎轉錄機制相作用。一個轉錄激活域聯合一個DNA結合域可能在TATA盒啟動RNA聚合酶II復合體的裝配,同時增強轉錄。在CheckMateTM 哺乳動物雙雜交系統中,DNA結合域和轉錄激活域分別由不同質粒產生,融合于DNA結合域的一個蛋白質 (“X")與融合于轉錄激活域的第二個蛋白質(“Y”)相互作用時,DNA結合域就與轉錄激活域緊密關聯。在這個系統中,蛋白X與Y的相互作用導致報告基因的轉錄。......閱讀全文
雙雜交系統的技術方法和應用
雙雜交系統是在體內檢測蛋白-蛋白相互作用的極強有力方法。?雙雜交系統的基礎是在一些轉錄因子上發現的模域(modular domains):一個DNA結合域,它可以結合一段特異的DNA序列,和一個轉錄激活域,這個轉錄激活域與基礎轉錄機制相作用。一個轉錄激活域聯合一個DNA結合域可能在TATA盒啟動RN
雙雜交系統的定義和應用
中文名稱雙雜交系統英文名稱two-hybrid system定 義分別帶有轉錄激活功能域與DNA結合功能域的兩個雜合蛋白在酵母細胞內相互作用重組成轉錄因子,可報告基因轉錄表達,從而檢測蛋白質之間相互作用的一種實驗系統。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
酵母雙雜交系統的發展和應用
隨著對多種重要生物的大規模基因組測序工作的完成,基因工程領域又迎來了一個新的時代---功能基因組時代。它的任務就是對基因組中包含的全部基因的功能加以認識。生物體系的運作與蛋白質之間的互相作用密不可分,例如:DNA合成、基因轉錄激活、蛋白質翻譯、修飾和定位以及信息傳導等重要的生物過程均涉及到蛋白質復合
酵母雙雜交系統的功能特點和應用
酵母雙雜交系統是將待研究的兩種蛋白質分別克隆(融合)到酵母表達質粒的轉錄激活因子(如GAL4等)的DNA結合結構域(DNA-BD)和轉錄激活域(AD)上,構建成融合表達載體,從表達產物分析兩種蛋白質相互作用的系統。
酵母雙雜交系統的應用
酵母雙雜交系統能在體內測定蛋白質的結合作用,具有高度敏感性。主要是由于:①采用高拷貝和強啟動子的表達載體使雜合蛋白過量表達。②信號測定是在自然平衡濃度條件下進行, 而如免疫共沉淀等物理方法為達到此條件需進行多次洗滌,降低了信號強度。③雜交蛋白間穩定度可被激活結構域和結合結構域結合形成轉錄起始復合物而
簡述酵母雙雜交系統的應用
酵母雙雜交系統能在體內測定蛋白質的結合作用,具有高度敏感性。 主要是由于: ①采用高拷貝和強啟動子的表達載體使雜合蛋白過量表達。 ②信號測定是在自然平衡濃度條件下進行, 而如免疫共沉淀等物理方法為達到此條件需進行多次洗滌,降低了信號強度。 ③雜交蛋白間穩定度可被激活結構域和結合結構域結合
逆雙雜交系統的應用介紹
在研究蛋白質的結構功能特點、作用方式過程中,有時還要通過突變、加抑制劑等手段破壞蛋白質間的相互作用。針對實際工作中的這種需要,Vidal等人發展了所謂的逆雙雜交系統(reverse two-hybrid system)。這項技術的關鍵是報道基因URA3的引入。URA3基因在這里起到了反選擇的作用,它
酵母雙雜交系統的技術步驟
1.將待測基因與Gal4或LexA或其他合適蛋白的DNA結合域融合構建誘餌質粒;2.將誘餌質粒轉化缺乏報告基因啟動子的酵母細胞株中,選擇被轉化的酵母;3.再將文庫質粒轉化到酵母中;4.通過報告基因的功能篩選相互作用的蛋白。
酵母雙雜交系統逆雙雜交系統的介紹
在研究蛋白質的結構功能特點、作用方式過程中,有時還要通過突變、加抑制劑等手段破壞蛋白質間的相互作用。針對實際工作中的這種需要,Vidal等人發展了所謂的逆雙雜交系統(reverse two-hybrid system)。這項技術的關鍵是報道基因URA3的引入。URA3基因在這里起到了反選擇的作用
簡述酵母雙雜交系統的技術步驟
1.將待測基因與Gal4或LexA或其他合適蛋白的DNA結合域融合構建誘餌質粒; 2.將誘餌質粒轉化缺乏報告基因啟動子的酵母細胞株中,選擇被轉化的酵母; 3.再將文庫質粒轉化到酵母中; 4.通過報告基因的功能篩選相互作用的蛋白。
酵母雙雜交系統
·?????????Yeast Two-Hybrid System?(Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast two-hybrid system technique with intro
雙雜交和其他雙成分系統實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 載體和酵母菌 試劑、試劑盒 緩沖液和溶液 SDS 凝膠上樣緩沖液 SDS 聚丙烯酰胺凝膠
酵母雙雜交系統簡介
酵母雙雜交系統酵母雙雜交系統是在真核模式生物酵母中進行的,研究活細胞內蛋白質相互作用,對蛋白質之間微弱的、瞬間的作用也能夠通過報告基因的表達產物敏感地檢測得到,它是一種具有很高靈敏度的研究蛋白質之間關系的技術。大量的研究文獻表明,酵母雙雜交技術既可以用來研究哺乳動物基因組編碼的蛋白質之間的互作,也可
雙雜交和其他雙成分系統實驗(一)
實驗材料 載體和酵母菌試劑、試劑盒 緩沖液和溶液SDS 凝膠上樣緩沖液SDS 聚丙烯酰胺凝膠核酸和寡核苷酸抗體培養基儀器、耗材 專用設備實驗步驟 第一階段 ?誘餌-LexA 融合蛋白的鑒定材料緩沖液和溶液將貯存液稀釋到適當濃度。2XSDS 凝膠上樣緩沖液100 mmol/L Tris-Cl(pH6.
雙雜交和其他雙成分系統實驗(二)
方法誘餌-LexA 融合蛋白的構建1.將編碼誘餌蛋白的靶 DNA 克隆到 LexA 融合載體(如,pMW101 或 pMW103) 的多聚接頭處,以合成一種框架內的 LexA 融合基因。確定誘餌序列的羧基端存在翻譯終止序列。形成的質粒作為 pBait。2. 采用下列 LexA 融合基因和報道質粒的組
雙雜交和其他雙成分系統實驗(五)
離心機和轉子Sorvall RT6000 離心機,H1000B MPC 和 H6000A MPC 轉子(離心微量滴定板用)專用設備玻璃珠(直徑 0.45 mm, 無菌;Sigma)微量滴定板(24 孔或 96 孔 [可選])重復用移液管可選,請參見步驟 1。附加試劑此方案的步驟 2 需要第 1 章方
雙雜交和其他雙成分系統實驗(三)
第三階段? 陽性相互作用的再次確定材料緩沖液和溶液乙酸銨(7.5 ml/L)氯仿乙醇異丙醇裂解液酶解酶 100T 以 2~5 mg/ml 溶解于拯救緩沖液中或β-葡糖醛酸酶 100000 單位/ml(Sigma)按 1:50 稀釋于拯救緩沖液中每次使用均需配置新鮮的溶液。酚(早衡至 pH8.0)拯救
雙雜交和其他雙成分系統實驗(四)
21. 測定轉錄活化。這個實驗可以利用牙簽重新劃線培養或利用多支管/蛙形器來進行,在分析大量陽性克隆時,多支管/蛙形器是非常有用的(有關蛙形器的詳細情況請參見圖 18-10)。1) 通過直接劃線培養測定a. 使用一個平頭牙簽分別在下面的 4 個平板上復制和主板上相同的柵格。使用相同的牙簽在四個平板上
雙雜交和其他雙成分系統實驗(二)
第二階段? 篩選一個相互作用子材料緩沖液和溶液將貯存液稀釋至適當的濃度二甲基亞砜(DMSO)乙醇可選擇,請參見步驟 9。凍存轉化體用的無菌甘油溶液65% 無菌甘油0.1mol/LMgS0425 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)TE(pH7.5)(無菌)TE(pH7.5),含 0.1mol/
雙雜交和其他雙成分系統實驗(三)
方法轉化文庫1. 挑選一個在第一階段的原始對照試驗中狀態最好的表達誘餌蛋白和 lexAop-lacZ 報道子的酵母菌落,接種于 20 ml CM(Glu)-Ura-His 液體培養基中,30°C 搖動過夜培養。重要:應該在用文庫重新轉化之前 7~10d 內,將誘餌蛋白和 lexAop-lacZ 報道
雙雜交和其他雙成分系統實驗( 一)
實驗材料載體和酵母菌試劑、試劑盒緩沖液和溶液SDS 凝膠上樣緩沖液SDS 聚丙烯酰胺凝膠核酸和寡核苷酸抗體培養基儀器、耗材專用設備實驗步驟第一階段? 誘餌-LexA 融合蛋白的鑒定材料緩沖液和溶液將貯存液稀釋到適當濃度。2XSDS 凝膠上樣緩沖液100 mmol/L Tris-Cl(pH6.8)20
酵母雙雜交系統的研究過程
Fields等人的工作標志雙雜交系統的正式建立。他們以與調控SUC2基因有關的兩個蛋白質Snf1和Snf2為模型,將前者與Gal4的BD結構域融合,另外一個與Gal4的AD結構域的酸性區域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分別稱之為“誘餌”(bait)和“獵物”或靶蛋白(prey or targe
關于酵母雙雜交系統的簡介
酵母雙雜交系統是將待研究的兩種蛋白質分別克隆(融合)到酵母表達質粒的轉錄激活因子(如GAL4等)的DNA結合結構域(DNA-BD)和轉錄激活域(AD)上,構建成融合表達載體,從表達產物分析兩種蛋白質相互作用的系統。
酵母雙雜交系統的研究過程
Fields等人的工作標志雙雜交系統的正式建立。他們以與調控SUC2基因有關的兩個蛋白質Snf1和Snf2為模型,將前者與Gal4的BD結構域融合,另外一個與Gal4的AD結構域的酸性區域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分別稱之為“誘餌”(bait)和“獵物”或靶蛋白(prey or tar
酵母雙雜交系統的實驗步驟
酵母雙雜交系統的實驗步驟?1.?將報告基因p8op-LacZ轉化酵母EGY48菌株,用培養基SD/-Ura篩選。2.?同時構建DNA文庫,并純化足夠的質粒以轉化酵母細胞。3.?構建DNA-BD/靶蛋白質粒pLexA-X,作為釣餌(bait)。4.?將上述釣餌質粒pLexA-X轉化EGY48(p8op
關于酵母雙雜交系統的發展介紹
發展起來的各種雙雜交系統大多是以Fields等人建立的系統為基礎的。這些新系統主要對報道基因、“誘餌”表達載體以及“獵物”表達載體等做了一些改進。其中一個重要改進是引入額外的報道基因,如廣泛采用的HIS3基因。經過改造帶有HIS3報道基因的酵母細胞,只有當HIS3被啟動表達才能在缺乏組氨酸的選擇
LexA酵母雙雜交系統的設計原理
?LexA酵母雙雜交系統的設計原理?報告質粒p8op-LacZ的GAL4 UAS編碼序列被完全去除,因此在缺乏LexA融合激活劑的情況下,報告基因LacZ的轉錄活性為零,該基因的篩選標志為URA3,可以作為有自主復制能力的質粒存在于酵母EGY48菌株中,也可以被整合到EGY48基因組DNA上。質粒p
凝膠成像系統技術進展和應用
隨著分子生物學研究逐步普及,凝膠成像系統在國內的需求在不斷增長 ?? 不管是什么用途,凝膠成像系統的組件都是相似的。都有一個拍攝系統、一個帶有特殊光源的暗箱與獲取和分析凝膠圖片的軟件組成。”但是,大部分凝膠成像系統提供了不同的產品特性來滿足不同科學研究的需要。快速發展的電子技術、光學技術和成像
酵母雙雜交系統的基本內容介紹
酵母雙雜交系統(Yeast two-hybrid system)的建立是基于對真核生物調控轉錄起始過程的認識。細胞起始基因轉錄需要有反式轉錄激活因子的參與。反式轉錄激活因子,例如酵母轉錄因子 GAL4在結構上是組件式的(modular),往往由兩個或兩個以上結構上可以分開,功能上相互獨立的結構域
酵母雙雜交檢測的原理及應用
檢測原理:酵母雙雜交系統(Yeast two-hybrid assay)是用于體內研究蛋白相互作用的一種非常便利的工具,常用的如GAL4為基礎的系統,使用酵母轉錄因子GAL4來檢測轉錄激活后的蛋白相互作用。某些轉錄因子(如GAL4)由兩個可以分開,功能上相互獨立的結構域組成,N端有一個147個氨