營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪接成為成熟的mRNA一般需要在多種蛋白質及snRNA的幫助下，經歷兩步轉酯剪接反應來完成。目前對于第二步剪接反應的調控知之甚少。 馮英研究組在前期工作中發現了一種特殊的mRNA前體，該前體在剪接反應已經開啟的情況下，僅將轉酯反應進行到第一步即停止，第二步反應則被完全抑制。馮英研究員指導的博士生李璜等研......閱讀全文
RNA－剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子，連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
PNAS：RNA剪接調控研究方面新的進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪
關于RNA剪接的簡介
大多數脊椎動物基因的編碼序列,無論是編碼多肽的基因還是編碼除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非編碼的間隔序列(內含子)分隔為各個外顯子部分。這些基因的外顯子和內含子都轉錄在一條初級RNA轉錄分子中,接下來,此初級RNA轉錄分子要經過RNA剪接,此過程包括一系列的加工反應：RNA的內含子部分
概述RNA剪接的類型
RNA剪接及其機制的研究,不僅解決了不連續基因“連續”轉錄產物的問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至整個生命起源與進化等問題,均產生極大的推動作用,另外,由此發現了核酸分子的催化功能,進一步拓寬了對于酶的認識。不連續基因中的介入序列稱為內含子；被內含子隔開的基因序列稱為外顯子(exon)。一個
關于RNA剪接第Ⅱ類內含子的自我剪接介紹
第Ⅱ類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列多為…外顯子…↓GUGCG…內含子…嘧啶堿AU↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,在離3’剪接點上游6-12bp有一段比較保守的序列,一致序列為CUCAC,在這一保守序列A的兩側各有一段3~5核苷酸的短序列能與上游方向的核苷酸互補,而A總是不包含在這
營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
RNA剪接為什么會出錯
“這項研究不僅提出了用小分子藥物治療維斯科特-奧爾德里奇綜合征的新目標，而且為RNA剪切的基礎生物學提供了新的線索，這是一個重要的但尚未完全被理解的過程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte說，他是Salk基因表達實驗室的教授和Roger Guillemin主席。患
關于RNA剪接的基本介紹
RNA剪接 （RNA splicing）是指從DNA模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子,并將外顯子連接起來形成一個連續的RNA分子的過程。RNA剪接機制的研究,是80年代生物化學和分子生物學領域中最有生機的研究課題之一,它不僅解決不連續基因轉錄產物的剪接問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至
關于RNA剪接的定義介紹
RNA剪接是真核細胞基因表達中非常重要的一個生物過程,通過RNA剪接,可以產生許多具有功能的,帶有編碼信息的mRNA,它對生物的發育及進化至關重要。所以RNA剪接識別是正確理解基因表達過程的重要一步,而剪接的識別的關鍵是依賴于剪接位點的判定。真核細胞pre-mRNA的剪接位點處存在一定的序列保守
Cell－Systems：構建RNA結合蛋白的剪接調控作用預測模型
基因組研究結果顯示，人體內超過90%的基因存在選擇性剪接(alternative splicing)。該過程在不同組織以及不同生理階段受到嚴格的調控，其失調會導致多種疾病的發生。選擇性剪接的體內調控主要由前體mRNA中的順式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
環形RNA可變反向剪接和可變剪接表達圖譜被系統繪制
6月30日，國際學術期刊Genome Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于環形RNA研究的最新進展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
調控玉米性狀－可變剪接“火”起來
最近，中國農業大學國家玉米改良中心田豐教授團隊與楊小紅教授團隊合作研究，以368份玉米自交系未成熟籽粒為實驗材料，定位玉米種全基因組水平QTL(數量性狀位點），全面解析了其可變剪接的調控機制，并為研究表型變異提供了重要線索。相關論文近日發表在《植物細胞》雜志上。 可變剪接，這個早在上世紀就
調控玉米性狀－可變剪接“火”起來
可變剪接，這個早在上世紀就被提出的概念，在近幾年的研究中，又“火”了起來。科學家們發現，可變剪接不僅豐富蛋白質組多樣性，還在生物體內起著重要的調控作用。 可變剪接是什么？這項研究有了什么新發現？是怎樣得出來的？實驗中的難點是什么？對之后的研究有怎樣的借鑒意義？科技日報就此采訪了該研究團隊。
GUT揭示癌癥治療靶點調控RNA可變剪接的分子機制
來自浙江大學基礎醫學院，中國藥科大學等處的研究人員發表了題為“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
異常剪接?
中文名異常剪接定????義指對序列庫中異常剪接mRNA的鑒定和分析隸屬領域生物領域主要功能處理多順反子性轉錄單元，調控轉錄效率和mRNA的穩定性，同時可以增加產物蛋白的多樣性
自剪接
自剪接(self-splicing)出現在稀少的內含子組成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情況下代替了剪接體的功能。自剪接的內含子有兩種，稱為I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型內含子以與剪接體類似的方式進行剪接，但不需要任何蛋白質。這種相似性使人相信這些內含子與剪接體在演化過程上有著關連。自剪接亦可能是非常古老，且
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析,所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析,來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
內含肽剪接調控以作為藥物“開關”
含肽作為藥物靶標的研究于內含肽這種可調控的作用機制，Bonnanl51為，通過改變剪接結構域上、下游的序列，自主設蛋白質內含肽，可以調控蛋白質的剪接。因為包含內含肽的前體蛋白無活性的，所以那些能阻斷剪接的化學物質將具有重要的藥用價值。由于目前在動物和人體正常新陳代謝中沒有發現內含肽的報道，作為藥
Nature：針對RNA轉錄和剪接的新觀點！
細胞通常產生區室來控制重要的生物功能。細胞核就是一個很好的例子；它被核膜包圍著，容納著基因組。然而，細胞還含有未被膜包圍的較為短暫存在的封閉室，就像水中的油滴。在過去兩年中，這些稱為液滴狀“凝聚物（condensates）”的封閉室已越來越多地被認為是控制基因的主要參與者。如今，在一項新的研究中
簡述RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必
上海生科院揭示新RNA剪接因子調控植物脫落酸信號途徑
9月25日，國際學術期刊Nature Communications 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為An Arabidopsis PWI and RRM motif-containing protein is critical for pre-mR
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中，發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合，促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
剪接位點
中文名稱剪接位點英文名稱splicing site;splice site定 義剪接體可識別的RNA前體中內含子和外顯子連接邊界的序列和接頭位點。根據位置不同可以分為供體和接納體剪接位點。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），基因表達與調控（二級學科）
剪接體
剪接體（英文：spliceosome）定義：由核小RNA(snRNA，U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白質因子(約100多種)動態組成、識別RNA前體的剪接位點并催化剪接反應的核糖核蛋白復合體。只與SMT蛋白理解與糖性一致。
METTL16介導通過阻礙對剪接位點的識別從而抑制RNA剪接
RNA m6A修飾是目前RNA表觀遺傳領域研究的熱點，對于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能詳。事實上，大名鼎鼎的METTL3僅能結合約22%的m6A位點，這提示還有其他m6A甲基化酶。確實，在METTL3之后，METTL16也被鑒定為m6A甲基化酶，但是它的底物遠不如METTL3
上海生科院揭示RNA可變剪接在細胞周期時序性的調控機制
3月25日，國際學術期刊Elife 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所王澤峰研究組的最新論文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。該工作
簡述第Ⅳ類內含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因組共有約400個tRNA基因,含有內含子的基因僅占十分之一。內含子的長度從14到46個堿基對不等,它們之間并無保守序列,切除內含子的酶識別僅是共同的二級結構,而不是共同的序列。通常內含子插入到靠近反密碼子處,與反密碼子堿基配對,未成熟tRNA的反密碼子環不存在,而是以插入的內含子所構成的
內含肽的應用剪接調控以作為藥物“開關”
含肽作為藥物靶標的研究于內含肽這種可調控的作用機制，Bonnanl51為，通過改變剪接結構域上、下游的序列，自主設蛋白質內含肽，可以調控蛋白質的剪接。因為包含內含肽的前體蛋白無活性的，所以那些能阻斷剪接的化學物質將具有重要的藥用價值。由于目前在動物和人體正常新陳代謝中沒有發現內含肽的報道，作為藥靶標