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    營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展

    近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展:Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing repression。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制,并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁,也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中,mRNA前體被剪接成為成熟的mRNA一般需要在多種蛋白質及snRNA的幫助下,經歷兩步轉酯剪接反應來完成。目前對于第二步剪接反應的調控知之甚少。 馮英研究組在前期工作中發現了一種特殊的mRNA前體,該前體在剪接反應已經開啟的情況下,僅將轉酯反應進行到第一步即停止,第二步反應則被完全抑制。馮英研究員指導的博士生李璜等研......閱讀全文

    清華大學生科院Cell:釀酒酵母“催化后剪接體”的結構

      這篇題為Structure of the Post-catalytic Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae的論文首次展示了pre-mRNA中3’剪接位點的識別狀態,該結構為回答RNA剪接反應過程中pre-mRNA中的3’剪接位點如何被識別,第二步轉

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    楊力受邀發表MolecularCell綜述解析可變剪接

    中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組受邀在《分子細胞》(Molecular Cell)發表了題為RNA structure switches RBP binding 的專評文章,對該刊同期發表的一項題為RNA sequence context effects measured in

    歷時十一年!施一公組完成酵母剪接體結構最后拼圖

      3月15日,清華大學生命學院施一公教授研究組就剪接體的機理與結構研究,于《細胞》(Cell)期刊發表題為《催化激活狀態的酵母剪接體結構揭示RNA剪接分支反應的機理》(Structures of the Catalytically Activated Yeast Spliceosome Revea

    常興研究組發現RNA剪接基因編輯的新方法

      2018年10月5日,國際知名學術期刊《分子細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院(營養與健康研究院)常興研究組題為“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。證明可

    Cell Reports | 郭采薇等揭示RNA剪接在阿爾茨海默癥中的作用

      pre-mRNA剪接過程是基因表達調控的重要步驟,對于形成極具多樣性的神經細胞轉錄組尤為關鍵。因此,RNA 剪接失調能夠引起包括脊髓性肌肉萎縮癥和肌萎縮性脊髓側索硬化癥等多種神經疾病【1,2】。2013年,美國Emory大學的Seyfried教授課題組發現RNA剪接失調可能也是引起阿爾茲海默癥的

    中科院最新PNAS文章

      近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展:“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing re

    PNAS:RNA剪接調控研究方面新的進展

      近日,PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制,并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。   RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁,也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中,mRNA前體被剪

    環形RNA可變反向剪接和可變剪接表達圖譜被系統繪制

      6月30日,國際學術期刊Genome Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于環形RNA研究的最新進展:Diverse alternative back-splicing and alternative spl

    施一公再發Science 克服提純問題 發布最新酵母剪接體結構

      2018年5月25日,清華大學生命學院施一公教授研究組就剪接體的組裝機理與結構研究于《科學》(Science)雜志以長文形式再次發表重大研究成果。這篇題為《完全組裝的釀酒酵母剪接體激活前結構》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer

    施一公:克服提純問題,發布最新酵母剪接體結構

      2018年5月25日,清華大學生命學院施一公教授研究組就剪接體的組裝機理與結構研究于《科學》(Science)雜志以長文形式再次發表重大研究成果。這篇題為《完全組裝的釀酒酵母剪接體激活前結構》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer

    又1篇Science!施一公組發表冷凍電鏡新成果

      這篇題為《完全組裝的釀酒酵母剪接體激活前結構》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cerevisiae Spliceosome Before Activation)的論文報道了釀酒酵母剪接體處于被激活前階段的兩個完全組裝的關鍵構象——

    科學家首次展示RNA剪接分子時鐘精確原子模型

       西湖大學生命科學學院施一公教授研究組題為《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接體激活過程中結構重塑的分子機理》的論文,11月27日在《科學》雜志以長文形式發表。此文報道了釀酒酵母處于激活狀態的剪接體2.5埃的高分辨率電鏡結構,該結構是目前報道的最高分辨率

    Hippo-YAP信號通路在RNA加工水平上的調控新機制獲進展

      6月13日,國際期刊Nature Communications(《自然·通訊》)發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所王澤峰研究組及大連醫科大學汪洋研究組等研究人員的共同研究成果:A splicing isoform of TEAD4 attenuates the Hippo–YAP

    上海生科院揭示反向剪接RNA成環與RNA轉錄的偶聯機制

      4月19日,國際學術期刊Cell Reports 發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組與計算生物學研究所楊力研究組最新合作研究論文。此工作深入研究了環形RNA生成與RNA轉錄的偶聯機制,揭示了環形RNA在神經分化過程中表達上調原理。  環形RNA是一類通過反向

    中科院多項成果入選2016年中國科學十大進展

       2月20日,科學技術部基礎研究司與高技術研究發展中心聯合召開“2016年度中國科學十大進展解讀會”,發布了2016年度中國科學十大進展。中國科學院相關單位獨立或合作取得的7項重大科學成果入選,包括:研制出將二氧化碳高效清潔轉化為液體燃料的新型鈷基電催化劑;開創煤制烯烴新捷徑;揭示水稻產量性狀雜

    Nature子刊探究人類干細胞調控新層面

      來自新加坡科技研究局基因組研究所(GIS)的科學家們,與來自加拿大、香港與美國的同行展開協作,發現了一個蛋白質介質SON對人類胚胎干細胞(hESCs)的健康和正常發揮功能起至關重要的作用。這一研究發現報道在9月8日的《自然細胞生物學》(Nature Cell Biology)雜志上。   

    內含子的重要功能:幫助酵母應對壓力下的生存

      內含子(intron)的存在,是真核細胞蛋白質編碼基因與原核細胞最大的區別。在真核細胞基因表達的過程中,需要經過RNA剪接反應將其去除。一般來說,內含子的長度遠比編碼蛋白的外顯子序列長,并且執行剪接反應的酶——剪接體高度復雜,由170多個相關蛋白組成。剪接反應需要高度精準,移碼錯位一個堿基都會導

    Cell Systems:構建RNA結合蛋白的剪接調控作用預測模型

       基因組研究結果顯示,人體內超過90%的基因存在選擇性剪接(alternative splicing)。該過程在不同組織以及不同生理階段受到嚴格的調控,其失調會導致多種疾病的發生。選擇性剪接的體內調控主要由前體mRNA中的順式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a

    上海生科院揭示RNA可變剪接在細胞周期時序性的調控機制

      3月25日,國際學術期刊Elife 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所王澤峰研究組的最新論文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。該工作

    2016年度中國科學十大進展發布!

      鈷/氧化鈷雜化二維超薄結構電催化還原CO2為液體燃料01  1、研制出將二氧化碳高效清潔轉化為液體燃料的新型鈷基電催化劑  將二氧化碳在常溫常壓下電還原為碳氫燃料,是一種潛在的替代化石原料的清潔能源策略,并有助于降低二氧化碳排放對氣候造成的不利影響。實現二氧化碳電催化還原的關鍵瓶頸問題是將二氧化

    專訪汪洋:具有抑癌作用的“電影剪輯大師”

      人類基因組中大約有25,000個基因,這個數字不大,甚至和小小的果蠅基因數目相同,那區別于其它動物的人類智能,還有“千人千面”的多種族多面孔,又是如何而來呢?科學家告訴我們其中的一個重要原因就在于人類基因組DNA序列能以不同的方式拼接在一起,創建各種信使RNA,從而產生了人類需要的許多不同蛋白質

    北京生科院在環形RNA研究領域取得新進展

      6月28日,國際學術期刊Nature Communications 在線發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組實驗室趙方慶團隊題為Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even

    調控玉米性狀 可變剪接“火”起來

      最近,中國農業大學國家玉米改良中心田豐教授團隊與楊小紅教授團隊合作研究,以368份玉米自交系未成熟籽粒為實驗材料,定位玉米種全基因組水平QTL(數量性狀位點),全面解析了其可變剪接的調控機制,并為研究表型變異提供了重要線索。相關論文近日發表在《植物細胞》雜志上。   可變剪接,這個早在上世紀就

    轉錄組的重編寫:RNA編輯

      前 言   基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA

    環形RNA與線性RNA定量比較分析新系統CLEAR發布

      1月15日,國際學術期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在線發表了中國科學院-德國馬普計算生物學伙伴研究所楊力研究組關于環形RNA研究的最新進展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparis

    中科院Cell子刊發布選擇性剪接研究新發現

      來自中科院上海生命科學研究院營養科學研究所的研究人員證實,SRSF10通過調控選擇性剪接在成肌細胞分化及葡萄糖生成中起重要作用。這一研究發現發布在11月11日的《Cell Reports》雜志上。  領導這一研究的是中科院上海生命科學研究院營養科學研究所代謝性疾病的基因表達調控研究組組長馮英(Y

    施一公團隊破解結構生物學最大難題之一

    施一公  北京時間8月21日凌晨,著名的《科學》雜志在線發表了清華大學生命科學學院施一公教授研究組的兩篇具有里程碑意義的論文,宣布得到了高分辨率的剪接體三維結構和剪接體對前體信使RNA執行剪接的基本工作機理,從而將分子生物學的“中心法則”在分子機理的研究上大幅度向前推進。  “這項研究成果的意義很可

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      基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外, DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用,且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此,對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正,成為了

    調控玉米性狀 可變剪接“火”起來

      可變剪接,這個早在上世紀就被提出的概念,在近幾年的研究中,又“火”了起來。科學家們發現,可變剪接不僅豐富蛋白質組多樣性,還在生物體內起著重要的調控作用。  可變剪接是什么?這項研究有了什么新發現?是怎樣得出來的?實驗中的難點是什么?對之后的研究有怎樣的借鑒意義?科技日報就此采訪了該研究團隊。  

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