利用MS/MS研究燕麥中表達球蛋白儲存蛋白的基因組鑒定
最近發表在《植物科學前沿》(1)上的一篇論文介紹了一整套表達的球蛋白基因,這些基因編碼燕麥中的主要儲存蛋白及其染色體位置。為了獲取這些信息,研究人員利用串聯質譜法 (MS/MS) 分析分離的球蛋白,以確認種子中的身份和表達。研究人員在燕麥基因組上確定了 32 個球蛋白基因序列;其中,可以確認 RNA 水平上的表達,并且 27 個基因序列也被 MS 檢測到為表達蛋白。這些結果提供了迄今為止最廣泛的鹽溶性燕麥球蛋白序列集,為進一步了解它們對人類營養的影響鋪平了道路。燕麥是一種營養豐富的谷物,以其健康益處而聞名,其中約 60% 的燕麥粒由淀粉組成,是其中最豐富的碳水化合物 (2)。然而,燕麥粒的蛋白質含量根據品種和栽培條件不同,從 12% 到 20% 不等,是蛋白質含量最高的糧食作物之一 (3,4)。盡管燕麥中蛋白質含量很高,且在飲食過程中非常重要,但其在燕麥中的存在尚未得到廣泛研究。作者表示,更好地了解燕麥蛋白質的豐度、表達和潛在特......閱讀全文
利用-MS/MS-研究燕麥中表達球蛋白儲存蛋白的基因組鑒定
最近發表在《植物科學前沿》(1)上的一篇論文介紹了一整套表達的球蛋白基因,這些基因編碼燕麥中的主要儲存蛋白及其染色體位置。為了獲取這些信息,研究人員利用串聯質譜法 (MS/MS) 分析分離的球蛋白,以確認種子中的身份和表達。研究人員在燕麥基因組上確定了 32 個球蛋白基因序列;其中,可以確認 RNA
利用LCMS/MS等方法-發現線粒體基因組編碼蛋白質的新模式
圖 線粒體編碼基因CYTB的雙重翻譯模式 在國家自然科學基金項目(批準號:92254301、92357302、32025010)等資助下,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國研究員團隊在線粒體基因組編碼研究方面取得進展,研究成果以“線粒體基因CYTB編碼的新蛋白質CYTB-187AA調控哺乳動
基因調節蛋白
中文名稱基因調節蛋白英文名稱gene regulatory protein定 義與基因的DNA序列相互作用調控轉錄的蛋白質。即反式作用因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
LC/MS/MS測定植物源性蛋白中三聚氰胺殘留
2007年3月中旬以來,美國發生多起寵物貓、狗中毒死亡事件。美國食品藥品管理局(FDA)從江蘇和山東兩家公司出口美國的部分小麥蛋白粉和大米蛋白粉中檢出三聚氰胺成分,并初步認定為寵物食品中含有的大量三聚氰胺是導致貓、狗中毒死亡的原因。 研究報導了高效液相色譜-電噴霧串聯質譜聯用(HPLC/MS/MS
1132.2萬!浙江大學采購高通量基因測序儀、LCMS/MS等
分析測試百科網訊 近日,浙江大學高通量基因測序儀、液相色譜串聯三重四級桿質譜儀項目公開招標,此次采購預算金額1132.2萬元(人民幣)。招標詳情如下: 項目名稱:浙江大學高通量基因測序儀、液相色譜串聯三重四級桿質譜儀項目 項目編號:ZUPC-GK-HW-2019033 投標截止時間:201
蛋白質和多肽MALDIMS分析方法
ABSTRACTFor MALDI-TOF-MS analysis of proteins and peptides, samples are cocrystallized with an excess of organic matrix that absorbs at a specific wav
方案5-利用-NanoLC-耦聯-MS/MS-分析復雜蛋白質混合物實驗
實驗材料蛋白分部收集物試劑、試劑盒乙腈(HPLC級)乙 腈(5%) 5%甲酸HPLC 溶液甲醇(HPLC級)儀器、耗材酒精燈二元泵或四元泵C18反相層析填料C18固相抽提移液吸頭陶瓷劃片熔融石英毛細管金線有刻度的玻璃毛細管帶壓力計的氦氣罐高效液相色譜系統激光拉針器Nano-LC 離子源PEEK 微型
實驗室分析技術基于HPLCMS/MS的蛋白質組學技術
基于高效液相色譜串聯質譜(HPLC-MS/MS)的蛋白質組學技術的發展主要取決于液相色譜-質譜聯用分析設備、樣品分離和制備技術、鑒定以及生物信息學。目前,shotgun鳥槍法是最常用的大規模蛋白質鑒定策略。如下圖所示,在自下而上分析策略中,蛋白質通過蛋白水解酶水解成肽的混合物,然后通過色譜法或親和分
MS4A3基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼一個跨膜4a基因家族的成員。該蛋白家族成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接邊界,在造血細胞和非淋巴組織中表現出獨特的表達模式。該家族成員可能在信號轉導中發揮作用,并可能作為與受體復合物相關聯的亞單位發揮作用。編碼這種蛋白質的基因定位于11q12,在一組相關的家族成員中。選擇性
MS4A1基因編碼功能及結構描述
B淋巴細胞抗原CD20或CD20是一種活化糖基化的磷蛋白,表達于所有B細胞表面,從pro-B期開始(CD45R +,CD117 +),并逐漸增加,直至成熟。 在人類中,CD20由MS4A1基因編碼。 該基因編碼跨膜4A基因家族的成員。 該新生蛋白家族的成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接
MS12基因的結構特點和生理作用
這個基因編碼一個rna結合蛋白,它是武藏蛋白家族的一員。編碼蛋白是一種轉錄調節因子,其作用靶向參與發育和細胞周期調控的基因。這種基因突變與某些類型癌癥的預后不良有關。這種基因在某些癌細胞中也被重新排列。
GCMS,LCMS,LCMSMS,HPLC的區別
1、概念不同:GC-MS是氣相色譜和質譜聯用,GC分離,MS檢測;LC-MS是液質聯用,LC是分離,MS是檢測;2、精密度不同:LC-MS-MS是液相色譜-串聯質譜,比LC-MS更精密一些;3、物質不同:HPLC又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”,是可以分離和檢測溶解在溶液中的微量物質。LCMS
GCMS,LCMS,LCMSMS,HPLC的區別
1、概念不同:GC-MS是氣相色譜和質譜聯用,GC分離,MS檢測;LC-MS是液質聯用,LC是分離,MS是檢測;2、精密度不同:LC-MS-MS是液相色譜-串聯質譜,比LC-MS更精密一些;3、物質不同:HPLC又稱“高壓液相色譜”、“高速液相色譜”,是可以分離和檢測溶解在溶液中的微量物質。LCMS
MSMS操作模式
串聯質譜儀通常使用的都是離子模式來鑒定蛋白質的氨基酸序列(圖1A)。目前所有的MS/MS質譜儀都具有該功能。不過表1中列舉的其它特殊的質譜儀也具有MS/MS功能。如果要發現蛋白質中的某個功能基團則需要用到母離子掃描功能或者中性丟失掃描功能,而這就必須用到三重四級桿質譜儀,如,Q-Q-Q質譜儀,或四級
lcms-與lcms/ms的區別
LC-MS可以通過采集質譜得到總離子色譜圖。由于電噴霧是一種軟電離源,通常很少或沒有碎片,譜圖中只有準分子離子,因而只能提供未知化合物的分子量信息,不能提供結構信息。很難用來做定性分析,可以用來定量分析。但單級MS如果不用軟電離源,而是EI之類的話,就有碎片峰,可以提供分子結構信息。 LC-M
MS4A3基因突變與藥物因子介紹
這個基因編碼一個跨膜4a基因家族的成員。該蛋白家族成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接邊界,在造血細胞和非淋巴組織中表現出獨特的表達模式。該家族成員可能在信號轉導中發揮作用,并可能作為與受體復合物相關聯的亞單位發揮作用。編碼這種蛋白質的基因定位于11q12,在一組相關的家族成員中。選擇性
MS4A3基因的結構特點和主要作用
這個基因編碼一個跨膜4a基因家族的成員。該蛋白家族成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接邊界,在造血細胞和非淋巴組織中表現出獨特的表達模式。該家族成員可能在信號轉導中發揮作用,并可能作為與受體復合物相關聯的亞單位發揮作用。編碼這種蛋白質的基因定位于11q12,在一組相關的家族成員中。選擇性
MS4A3基因的結構特點和主要作用
這個基因編碼一個跨膜4a基因家族的成員。該蛋白家族成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接邊界,在造血細胞和非淋巴組織中表現出獨特的表達模式。該家族成員可能在信號轉導中發揮作用,并可能作為與受體復合物相關聯的亞單位發揮作用。編碼這種蛋白質的基因定位于11q12,在一組相關的家族成員中。選擇性
MS4A1基因的結構特點和生理作用
B淋巴細胞抗原CD20或CD20是一種活化糖基化的磷蛋白,表達于所有B細胞表面,從pro-B期開始(CD45R +,CD117 +),并逐漸增加,直至成熟。 在人類中,CD20由MS4A1基因編碼。 該基因編碼跨膜4A基因家族的成員。 該新生蛋白家族的成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接
MS4A1基因突變與藥物因子介紹
B淋巴細胞抗原CD20或CD20是一種活化糖基化的磷蛋白,表達于所有B細胞表面,從pro-B期開始(CD45R +,CD117 +),并逐漸增加,直至成熟。 在人類中,CD20由MS4A1基因編碼。 該基因編碼跨膜4A基因家族的成員。 該新生蛋白家族的成員具有共同的結構特征和相似的內含子/外顯子剪接
Fas基因蛋白的檢測
實驗步驟 ? ? ? ? ? ? 展開
Fas基因蛋白的檢測
實驗步驟展開
載脂蛋白基因結構
載脂蛋白基因的分離是通過用相應的cDNA作為探針篩選基因文庫而完成的。比較基因的核苷酸序列與cDNA的核苷酸序列得以鑒定基因的內含子與外顯子數目以及它們的分界線。大部分真核細胞的基因含有內含子,內含子不編碼氨基酸,但有些內含子參與基因表達的調控。外顯子通常占據基因內的三個區域:第一個區域不編碼氨
骨橋蛋白的基因結構
OPN人的OPN基因定位在染色體4q13,是單一編碼基因,8kb大小,具有7個外顯子和6個內含子組成。小鼠位于5號染色體上,基因長約7Kb,包括7個外顯子,其5’端有啟動子序列,該啟動子中IKb長度也被測序并用GCG程序分析了轉錄因子的可能識別部位,這些轉錄因子包括API-5、PEA-3、PEA
Fas基因蛋白的檢測
實驗步驟 ? ? ? ? ? ? 展開
使用UPC2/MS/MS對蛋白沉淀血漿中的極性化合物直接進樣
Jennifer L. Simeone and Paul D. Rainville目的對蛋白沉淀血漿中的強極性化合物直接進樣分離,以進行生物分析。背景大多數生物分析方法都采用蛋白質沉淀(PPT)提取法,這是因為該技術簡單、快速且成本較低。典型的PPT使用3:1的有機溶劑與生物樣品,可得到大約75%的
877萬!廈門食藥質檢院采購涉及ICPMS、LCMS/MS、UPLCMS/MS
分析測試百科網訊 近日,廈門市食品藥品質量檢驗研究院電感耦合等離子體質譜-液相色譜聯用儀貨物類采購項目、液相色譜-三重四極桿質譜聯用儀采購項目及超高效液相/大氣壓氣相雙色譜串聯四級桿質譜聯用儀貨物類采購項目三項進行公開招標。總計預算金額:877萬元(人民幣)。詳情如下:一、電感耦合等離子體質譜-
組蛋白修飾基因通路MEN1-基因
這個基因編碼腦膜,一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明,腦膜定位于細胞核,具有兩種功能性核定位信號,并通過JUND抑制轉錄激活,但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息,但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路HDAC2基因
該基因產物屬于組蛋白脫乙酰基酶家族。組蛋白脫乙酰基酶通過形成大的多蛋白復合物起作用,并負責核心組蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端賴氨酸殘基的脫乙酰化。這種蛋白通過與許多不同的蛋白質結合形成轉錄抑制復合物,包括哺乳動物鋅指轉錄因子YY1。因此,它在轉錄調控、細胞周期進展和發育事件中起著重要作用。
組蛋白修飾基因通路TAF1基因
rna聚合酶ii啟動轉錄需要70多種多肽的活性。協調這些活動的蛋白質是基礎轉錄因子tfiid,它與核心啟動子結合以正確定位聚合酶,充當組裝其余轉錄復合物的支架,并充當調控信號的通道。tfiid由tata結合蛋白(tbp)和一組進化上保守的蛋白質(tbp相關因子或taf)組成。tafs可能參與基礎轉錄