用“全景地圖”破解腫瘤“混亂社區”
腫瘤組織具有高度異質性，細胞類型多樣、基因表達雜亂無章，區域界限模糊，傳統的空間轉錄組技術難以全面揭示腫瘤的特性。傳統方法通常將采樣點視為獨立的“房子”，統計每個點的細胞類型和基因表達信息，容易產生誤差。 為了解決這一難點問題，西安交通大學葉凱教授團隊提出以基因表達的空間分布來構建整體計算框架，相關研究成果以“STMiner：以基因為中心的空間轉錄組學解析腫瘤組織”為題，于近日發表在《細胞·基因組學》（Cell Genomics）雜志上。 葉凱教授團隊長期致力于生物信息學方法研究，并將開發的方法運用于遺傳病和腫瘤的早診和精準治療。由于腫瘤組織的高異質性和空間轉錄組數據的高稀疏性，傳統側重局部臨近特征的策略往往在腫瘤空間轉錄組數據分析中出現遺漏和偏差。因此，葉凱教授團隊開發了STMiner方法，利用二維高斯混合模型和最優傳輸理論，將離散的采樣點轉化為連續的基因分布地圖，就像從零散的“房屋信息”中繪制出一張完整的“居民分布圖......閱讀全文
用“全景地圖”破解腫瘤“混亂社區”
腫瘤組織具有高度異質性，細胞類型多樣、基因表達雜亂無章，區域界限模糊，傳統的空間轉錄組技術難以全面揭示腫瘤的特性。傳統方法通常將采樣點視為獨立的“房子”，統計每個點的細胞類型和基因表達信息，容易產生誤差。 為了解決這一難點問題，西安交通大學葉凱教授團隊提出以基因表達的空間分布來構建整體計算框架
銀河系全景氫氣地圖問世首次揭露恒星間結構細節
歐洲《天文與天體物理學》雜志23日公開的一篇論文稱，澳大利亞和德國科學家利用超大可操縱射電望遠鏡，繪制出了前所未有的詳細銀河系氫氣地圖，首次揭示了銀河系恒星間的結構細節，有助于解釋銀河系星系形成的最終奧秘。 中性原子氫是宇宙空間中最豐富的元素，并且是恒星和星系間的主要成分。此次，天體物理學
中外科學家聯合實現全球首批生命全景地圖繪制
日前，由中國科學家主導，6個國家、32個科研團隊共同參與完成了全球首批生命時空圖譜。科學家們首次繪制了小鼠、斑馬魚、果蠅、擬南芥四種模式生物胚胎發育或器官的時空圖譜，并在《細胞》（Cell）期刊及其子刊《發育細胞》（Developmental Cell）上在線發表。研究已通過倫理審查，嚴格遵循相
全球首批！中外科學家聯合實現首批生命全景地圖繪制
日前，由中國科學家主導，6個國家、32個科研團隊共同參與完成了全球首批生命時空圖譜。科學家們首次繪制了小鼠、斑馬魚、果蠅、擬南芥四種模式生物胚胎發育或器官的時空圖譜，并在《細胞》（Cell）期刊及其子刊《發育細胞》（Developmental Cell）上在線發表。研究已通過倫理審查，嚴格遵循相
安捷倫推出用于腫瘤全景變異分析的NGS產品
——SureSelect Cancer CGP產品通過快速高效的工作流程，擴展了用于實體瘤分析的生物標志物的數量 2023年4月20日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）近日宣布推出Agilent SureSelect Cancer CGP產品，該產品設計用于泛實體瘤的體細胞變異分析。泛癌種
這張圖譜為理解腫瘤血管生成過程提供全景視角
7月10日，重慶大學附屬三峽醫院聯合清華大學、北京協和醫院以及中南大學湘雅醫院，在《自然》上發表最新研究成果。此項研究首次構建了最大規模的泛癌種脈管系統全息細胞圖譜，為充分理解腫瘤血管生成的復雜過程提供了全景視角，同時為臨床提升抗血管生成療效提供科學方案。腫瘤的發生與進展和血管的生成息息相關。血管通
“谷歌地圖”展示腫瘤生長所需的結構和功能性血管變化
近日，一份發表在《Nature Scientific Reports》的研究稱，約翰·霍普金斯大學醫學研究人員開發了一種類似于“谷歌地圖”的方法，可以更準確地計算和可視化腫瘤生長所需的結構和功能性血管變化。通過將來自動物模型的腫瘤標本的高質量3D成像數據與復雜的數學公式配對，研究人員表示，他們現
國家測繪局推出在線地圖網站“天地圖”
今天上午11時，中國區域內數據資源最全的地理信息服務網站“天地圖”在京正式開通，此舉標志著國家地理信息公共服務平臺建設取得重大進展，將從根本上改變我國傳統地理信息服務方式。 據介紹，國家地理信息公共服務平臺包括公眾版、政務版、涉密版三個版本，“天地圖”就是公眾版成果，是由國家
“聲音地圖”幫鴿子導航
如果不能追蹤次聲，鴿子很容易迷失方向。圖片來源：Mill56/Flickr/Creative Commons 鳥類也許沒有發達的大腦，然而它們知道如何確定正確的航行路線。就在人類觀察和徘徊的時候，它們以令人驚奇的準確路線飛過村鎮、穿越大洲。生物學家認為視力、嗅覺和內在的指南針都有助
環保地圖搭建互動平臺
圖為環保地圖平臺的中國重點污染源地圖 我的目標是建成一款綜合環境終端，人們無論走到哪里，都可以查到周邊環境的狀況，比如大氣、污染源、污水處理廠、有毒化學品等，可以對所有的環境信息進行查看。除此之外，還可以在線進行舉報、投訴、互動和分享。
北京發布“腦卒中救治地圖”
2017年世界卒中日暨第七屆全國卒中宣傳周系列活動啟動儀式29日在京舉行。北京市衛計委聯合北京市腦卒中質控中心發布了北京地區“腦卒中救治地圖”，旨在讓急性卒中患者快速送達最適合的醫療機構，提升救治效率。 北京市腦卒中救治地圖由69家具有腦卒中溶栓能力的醫院、1個質控中心和120、999急救網絡
《Nature－Methods》大腦地圖圖解
多年來，出現了多種“大腦地圖”，每一種都關注不同的大腦過程，從新陳代謝到認知功能。雖然這些地圖很重要，但單獨使用它們會限制研究人員從中得出的發現。 現在，來自蒙特利爾神經學研究所的一個團隊和其他研究人員在一個地方匯集了40多張現有的大腦地圖。這個被稱為神經圖譜的數據庫有望幫助科學家發現不同大腦
三項研究描繪肺癌“全景”
與任何其他形式的癌癥相比，肺癌能夠導致更多的死亡。作為頭號癌癥殺手，全世界每年有160萬人被確診患上肺癌，且只有不到兩成的患者能夠活過5年。 如今，發表在上周的3項基因組測序研究結果為更加有效的肺癌個性化治療奠定了基礎，即用最適合其腫瘤遺傳特征的治療來匹配患者。 其中兩項最新的研究描
《走進地圖世界》獲2020年全國優秀地圖作品裴秀獎銀獎
10月28日，中國測繪學會正式公布2020年全國優秀地圖作品裴秀獎獲獎名單。由地圖學資深專家陳昱、廖克、施曼麗編著的科普圖書《走進地圖世界》獲得銀獎。 《走進地圖世界》以揭開地圖歷史、文化和科學面紗為主旨，梳理了古今中外有關地圖趣聞及中外500余幅地圖產品，并生動介紹現代地圖的學科耦合與地圖的
古地圖－新地圖：從二維空間到多維空間
2018年中非合作論壇峰會剛剛結束，此次會議推進了中非各領域的交流合作。有意思的是，從目前的地圖來看，中國是最早在地圖上表達非洲大陸的，中國與非洲“聯結”在明朝就有了。 地圖是地理學的語言。地圖是人類對地理空間認知的工具。當下，地圖已成為大數據的集中體現，運用于現代人生活，以及經濟、軍事、環
公益人士繪制癌癥村地圖
一份由公益人士制作的“中國癌癥村地圖”正在互聯網上被關注，村子數量被認為超過200個。 環保部2月20日發布《化學品環境風險防控“十二五”規劃》稱個別地方因環境污染出現癌癥村。 此前，地下水污染導致癌癥高發甚至牛羊絕育的報道，在諸多地區出現。在一些地區，污染
《北京工業文化體驗地圖》發布
9月21日，2024北京文化論壇專業沙龍“數字技術與實體經濟融合引領生產生活新潮流”在京舉辦。沙龍上，北京市經濟和信息化局首次對外發布了《北京工業文化體驗地圖》，并向全社會推介100個工業文化體驗項目。北京工業文化體驗地圖。北京市經濟和信息化局供圖北京市經濟和信息化局黨組書記、局長姜廣智表示，北京經
高校青年教師“壓力地圖”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518038.shtm
中國環境產業戰略地圖發布
在日前舉行的第八屆環境技術產業論壇上，E20環境產業研究院首次發布了《中國環境產業發展展望――面向未來五年的環境產業戰略地圖》。該研究報告預測，5年后中國環境產業將產生240家上市公司，由20家重資產集團、20家區域環境綜合服務集團、100家細分領域系統解決方案領跑者、100家裝備和材料生產制
武漢發布“湖泊水質地圖”
武漢市重點湖泊水質發布系統 ??? 武漢市89個重點湖泊，根據水質現狀不同，分別用紅、黃、橙、藍、綠等不同色塊標識，在武漢市地圖上清晰標注。近日，武漢市環保局官方網站“武漢市重點湖泊水質發布系統”正式上線，市民查詢全市重點湖泊的水質情況或發現涉湖排污行為投訴，均可直接點擊進入。 登錄市環保
《自然》：人類癌癥的致癌全景圖
用于新型癌癥治療方法的臨床試驗設計，一般來說都是集中在腫瘤起源所在的組織，然而近期由紀念斯隆-凱特琳癌癥中心的研究人員完成的一項研究則發現了一種新的方法：基于基因組標記進行研究，而不是針對機體器官組織進行研究。 這一研究成果公布在9月26日的Nature Genetics雜志上，同時還
全球礁石記錄項目為珊瑚拍全景
水下世界就在你的指尖之間。近日，卡特林海景調查啟動了全球礁石記錄項目。該項目受國際保險公司卡特林保險集團資助，是一個含有高分辨率珊瑚礁圖像的數據庫，它最終將把全世界礁石的圖像和數據(比如水溫和渾濁度)記錄下來。通過使用特制的高分辨率攝像機，調查小組可以分別從左、右、下三個方位同時拍攝圖像。
NASA合成40億像素火星全景照
據英國《每日郵報》網站3月31日報道，美國國家航空航天局(NASA)科學家安德魯·博德羅夫(Andrew Bodrov)近日利用“好奇”號火星車所拍攝的照片合成了一張火星表面的全景照片，像素超過40億。借助這一照片，人們可以身臨其境地體驗一把置身火星的感覺。 “‘好奇’號上面的攝像頭只
全景碳排放數字地球“碳星球”發布
9月2日，中科星圖維天信（北京）科技有限公司（簡稱“星圖維天信”）在2022年中國國際服務貿易交易會上發布全球首個高分辨率近實時全景碳排放數字地球產品——“碳星球beta”。 “碳星球”是全球首個具有日尺度分辨率、近實時更新的全景碳排放數字地球產品。該產品充分利用碳數據模型、納入衛星遙感監測數
－美一機構推出研究經費地圖
想知道你的州從美國國立衛生研究院（NIH）獲得多少經費嗎？這意味著多少工作崗位？將鼠標固定在醫學研究聯盟（生物醫學研究游說組織）發布的一張在線地圖上，你就能知道答案。例如，2013年，加利福尼亞州從NIH獲得33億美元，直接支持了超過5.9萬個工作崗位，幾乎是產業崗位的4倍。相比之下，愛達荷州僅
“深挖”衛星數據，精準繪制人口地圖
尼日利亞衛生部門今后將不必只依靠不完整的人口普查數據發放麻疹疫苗了。《自然》官網10日報道稱，由比爾·梅琳達·蓋茨基金會日前交付尼日利亞政府的、基于衛星圖像建筑物的分析詳圖中，對當地人口分布做出了明確標示。 蓋茨基金會與美國橡樹嶺國家實驗室、英國南安普頓大學研究人員一起，制作了尼日利亞北部各州
世界瘧疾地圖可以指導控制政策
非洲首當其沖，98%的高風險地區在該大陸 科學家繪制了據稱是40多年來首幅關于全球瘧疾感染率的地圖，這是為了在防控這種疾病的過程中為政策提供信息并監測進展。 今天(3月24日)出版的《公共科學圖書館?醫學》雜志發表了惡性瘧原蟲范圍地圖，惡性瘧原蟲是最致命的一種瘧疾寄生蟲。該地圖是由2
“最新中國癌癥地圖”不靠譜
近日，一則名為“中國腫瘤登記年報首次發布最新版中國癌癥地圖”的消息在網上熱傳。但記者向專家求證發現，所謂最新版中國癌癥地圖純屬誤讀。 數據不具代表性 所謂的“中國腫瘤登記年報首次發布最新版中國癌癥地圖”的消息稱，該調研在全國25個省份城鄉18～60歲人群中抽取了有效樣本39966個。文中提
最新銀河系多維地圖發布
天文學家關于銀河系的主要參考指南剛剛得到重大更新。正在追蹤近20億顆恒星的“蓋亞任務”發布了一幅大幅改進的銀河系多維地圖，其中包括數千萬顆恒星和許多顆小行星的三維運動，探測到的恒星“地震”和可能的太陽系外行星。 6月13日，蓋亞團隊在一場新聞發布會上公布了這一地圖，以及大約50篇科學論文，
發現新物種？參考這幅地圖吧
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454931.shtm 2020年，貢扎加葉蛙在巴西東北部被發現，那里可能有更多未被描述的脊椎動物。圖片來源：DIEGO J. SANTANA 參與繪制地球上所有生命的地圖的生態學家現在已經邁