蛋白質組：解碼生命的“天書”
人類和老鼠的外貌可說是天淵之別，但實際上他們卻有著近99%相同的基因組。何以“失之毫厘差之千里”？正是蛋白質放大了他們基因上的細微差別。 日 前，中國人類蛋白質組計劃全面啟動。“基因組學中微小的差異，在蛋白質組學中可以被千倍甚至幾近萬倍地放大。”亞太蛋白質組組織主席、中國科學院院士賀福 初表示，這一計劃的實施將對基因組序列圖進行“解碼”，進而全景式揭示生命奧秘，為提高重大疾病防診治水平提供有效手段。 解碼生命的“密鑰” 提起蛋白質，大家并不陌生。它是生物體內一種極為重要的高分子有機物，約占人體干重的54%。 不過，“蛋白質組”一詞卻鮮有人了解。其實，蝴蝶由卵變蟲、成蛹、再破繭成蝶，幕后“操盤者”并非基因組，而是蛋白質組。“1994年澳大利亞科學家率先提出蛋白質組這個概念，指某個時刻、某個組織、器官或個體中所有蛋白質的集合。”賀福初說。 科學家們之所以對蛋白質組產生濃厚興趣，還要從人類基因組計劃說起。20......閱讀全文
蛋白質組的研究與發展
2014年5月28日，英國新一期《自然》雜志公布兩組科研人員分別繪制的人類蛋白質組草圖。這一成果有助于了解各個組織中存在何種蛋白質，這些蛋白質與哪些基因表達有關等，從而進一步揭開人體的奧秘。上世紀90年代，人類基因組計劃開始成形時，有科學家提出了破譯人類蛋白質組的想法。其目標是將人體所有蛋白質歸類并
蛋白質組色譜儀種類
?蛋白質組色譜儀種類有多種。1、按功能可分：分析型蛋白質組色譜儀和制備型蛋白質組色譜儀。2、按分離目的可分：實驗室蛋白質組色譜儀和工業蛋白質組色譜儀。3、按應用范圍可分：專用型蛋白質組色譜儀和通用型蛋白質組色譜儀。4、按作用可分：蛋白質組定量分析色譜儀和蛋白質組定性分析色譜儀。5、按分離特征可分：高
蛋白質組樣品制備程序1
一、樣品制備試劑的準備二、細菌細胞樣品的裂解處理步驟三、人培養細胞樣品的裂解處理步驟四、膜蛋白裂解方法步驟一、樣品制備試劑的準備1、裂解緩沖液儲備液的準備下述本樣品制備方法已經過優化, 并被證明配合使用PF-2D 試劑盒可獲得最佳的結果。您若選擇其他的樣品處理和細胞裂解方法，請務必避免使用離子型的表
蛋白質組樣品制備程序2
2）在4℃條件下以20000g的離心力冷凍離心60分鐘 （離心力務必達到或大于20000g）。3）移取上清溶液。若上清樣品不立即使用，則須儲存于-80℃（最佳條件）或-20℃的無霜冰箱中以防止蛋白質的降解。2、用初始緩沖液（Start buffer）交換處理細胞裂解液1）在上述細胞裂解液中，加入初始
蛋白質組學質譜分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
蛋白質組學工作流
樣品上質譜，獲得Raw data(質荷比+強度）使用MaxQuant等搜庫，獲得初始結果（肽段、蛋白信息）質控得到可信結果（包括修飾等）定性分析和定量分析數據注釋、數據挖掘、關聯功能
蛋白質組學鑒定技術流程
蛋白質組（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一個基因組（Genome），或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。蛋白質組學（Proteomics）以細胞、組織或生物體全體蛋白質為研究對象，通過高通量的色譜質譜聯用技術
蛋白質組學的研究內容
主要有兩方面，一是結構蛋白質組學，二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面： ①針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞，建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群，即組成性蛋白質組學。 ②以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋白質組學
關于蛋白質組的研究分析
主要有兩方面，一是結構蛋白質組學，二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面： ① 針對有關基因組或轉錄組數據庫的生物體或組織細胞，建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群，即組成性蛋白質組學。 ② 以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理病理體系或過程的局部蛋白質組或比較蛋
簡述蛋白質組的鑒定方法
如蛋白質鑒定結果、蛋白質的亞細胞定位、蛋白質在不同條件下的表達水平等信息。目前應用最普遍的數據庫是NRDB和dbEST 數據庫。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等幾個數據庫組成，dbEST是由美國國家生物技術信息中心（NCBI）和歐洲生物信息學研究所(EBI)共同編輯的核酸數據
定量蛋白質組學的誕生
在現代研究技術，如熒光顯微鏡，流式細胞儀和蛋白質芯片技術中，抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點，其中最大的限制就是，抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目，比如人類蛋白質圖譜（Human Protein Atlas），Antibodypedia，以及美國NIH
定量蛋白質組學方法分類
1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究，識別功能模塊和路徑，監控疾病的生物標志物，這些研究都
蛋白質組最新研究進展
蛋白質組（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一個基因組，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。 在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，一個蛋白質組不是一個基因組的直接產物，蛋白質組中蛋
蛋白質組學入門問題FAQ
常見問題———?HPLC 篇?1 ． HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法?樣品量不足：解決辦法為增加樣品量?樣品未從柱子中流出：可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子?樣品與檢測器不匹配：根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器?檢測器衰減太多：調整衰減即可。?檢測器時間常數太大：解決辦法為降低時間
蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新，蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多，但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前，先看看這篇技術簡介吧。一?蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中，例如DNA復制、mRNA轉錄與
蛋白質組學樣品處理方法
蛋白質組學研究已經成為后基因組時代的研究熱點，是生命科學研究領域又一個新的突破口。本文從對疏水性強的蛋白質、極性蛋白質、高豐度蛋白的處理、低豐度蛋白的富集和對樣品溶液中干擾性物質的去除以及對不同染色后質譜前處理等方面綜述了蛋白質樣品的一般處理方法。 1. 不溶性蛋白質的處理 天然狀態的蛋白質
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質，首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質，因此，蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中，存在一些差異，要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單，減少蛋白損失；盡量避免蛋白的降解；盡可能提高樣品蛋白的
蛋白質組學入門問題集錦
1 ． HPLC 靈敏度不夠的主要原因及解決辦法 樣品量不足：解決辦法為增加樣品量 樣品未從柱子中流出：可根據樣品的化學性質改變流動相或柱子 樣品與檢測器不匹配：根據樣品化學性質調整波長或改換檢測器 檢測器衰減太多：調整衰減即可。 檢測器時間常數太大：解決
對人結腸癌組織開展了基因組和蛋白質組分析
貝勒醫學院的研究人員近日對人結腸癌組織開展了基因組和蛋白質組分析，并將結果發表在《Cell》雜志上。這種全面的研究策略有助于深入了解結腸癌，并有望推動早期診斷和新型療法的開發。Bing Zhang博士 在貝勒醫學院分子和人類遺傳學教授Bing Zhang的領導下，研究團隊生成了基因組和蛋白質組
《基因組蛋白質組與生物信息學報》影響因子顯著提高
在日前舉行的第四屆中國英文版科技期刊研討會上，中國科學技術信息研究所發布了《2007年版中國英文版科技期刊引證報告》。根據這一報告提供的數據，中科院北京基因組研究所主辦的《基因組蛋白質組與生物信息學報》（Genomics,? Proteomics? &? Bioinformatics，簡稱GPB）的
轉錄組和蛋白質組有何異同之處
轉錄組是RNA轉錄后的全部產物,而轉錄后的產物經過加工修飾（例如甲基化、拼接、加尾等）后才變成蛋白質.相同之處就是他們的大部分結構相同.不同之處就是一個有加工過程,一個沒有.
人類結腸癌蛋白質基因組學分析揭示出新的治療策略
在一項新的研究中，來自美國國家癌癥研究所、貝勒醫學院、太平洋西北國家實驗室、華盛頓大學、范德堡大學和得克薩斯大學衛生科學中心等研究機構的研究人員通過對來自患者的結腸癌組織產生的全部基因和蛋白的分析，對這種腫瘤有了更全面的認識，并指出新的癌癥生物學機制和可能的新治療策略。這項研究強烈支持對腫瘤組織
蛋白質組學分離分析方法進展
分析測試百科網訊 2015年10月17日，第二屆全國質譜分析學術報告會（質譜大會）在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕。中國科學院大連化學物理研究所 張玉奎 來自中國科學院大連化學物理研究所的張玉奎院士帶來了題為《蛋白質組學分離分析方法進展》的報告。 張玉奎主要介紹了蛋白質樣品預處理、蛋白質組
蛋白質組的主要功能
蛋白質組學集中于動態描述基因調節，對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定，鑒定疾病、藥物對生命過程的影響，以及解釋基因表達調控的機制. 作為一門科學，蛋白質組研究并非從零開始，它是已有20多年歷史的蛋白質(多肽)譜和基因產物圖譜技術的一種延伸. 多肽圖譜依靠雙向電泳(Two-dimensional g
蛋白質組的主要功能
蛋白質組學集中于動態描述基因調節，對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定，鑒定疾病、藥物對生命過程的影響，以及解釋基因表達調控的機制. 作為一門科學，蛋白質組研究并非從零開始，它是已有20多年歷史的蛋白質(多肽)譜和基因產物圖譜技術的一種延伸. 多肽圖譜依靠雙向電泳(Two-dimensional g
擬南芥葉綠體蛋白質組學分析實驗
試劑、試劑盒HEPES-KOH山梨醇抗壞血酸維生素 C半胱氨酸PF-Percoll儀器、耗材濃縮離心設備實驗步驟建議在短日照條件下培養材料以誘導營養生長，并在照光的早期收取材料以提高獲得完整葉綠體的產率。所以試劑應在收集材料之前準備好，并連同其他一些設備，如離心機轉頭及離心管等在冰箱或冰上冷卻至 0
蛋白質組學相關問題與解答
1．為什么通過elisa、WB能檢測到的蛋白在itraq實驗中沒有檢測到？ 人血漿中的蛋白是有上萬種的，而一般質譜只能檢測到五六百種，也就是說只占了其中的百分之幾，這是普遍現象，說明咱們的方法是不存在問題的；其次，ELISA/WB與質譜相對來說靈敏度不一樣，前者具有放大效應，因為其間會用
蛋白質組實驗全套流程方案1
?蛋白質組實驗流程雙向電泳的樣品的制備樣品制備原則樣品制備是雙向電泳中最關鍵的一步，將直接影響2-DE結果好壞。目前并沒有一個通用的樣品制備方法，盡管處理方法多種多樣，但都遵循幾個基本的原則：1）盡可能的提高樣品蛋白的溶解度，抽提最大量的總蛋白，減少蛋白質的損失；2）減少對蛋白質的人為修飾；3）破壞
蛋白質組實驗全套流程方案2
聚丙烯酰胺凝膠的配制表1 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝膠電泳分離膠所用溶液溶液成分不同體積（ml）凝膠液中各成分所需體積（ml）5101520253040506%?? 水2.65.37.910.613.215.921.226.5?? 30%丙烯酰胺溶液123456810?? 1.
蛋白質組技術的研究進展
大規模基因組測序計劃的實施已改變生命科學的重心，在相當短的時期內，一些原核生物和某些低等真核生物的基因組序列已被測定. 1995年，流感嗜血桿菌基因組序列首次被破譯，在此后不到兩年的時間，近50個細菌的基因組序列已被完成. 然而，這僅僅是理解有機物功能的一個起點. 在基因組時代，許多DNA序列信息僅