定量蛋白質組學的誕生

定量蛋白質組學的誕生

　　在現代研究技術，如熒光顯微鏡，流式細胞儀和蛋白質芯片技術中，抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點，其中最大的限制就是，抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目，比如人類蛋白質圖譜（Human Protein Atlas），Antibodypedia，以及美國NIH

定量蛋白質組學方法分類

1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究，識別功能模塊和路徑，監控疾病的生物標志物，這些研究都

定量蛋白質組學的研究內容

　　1.蛋白質鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結合Western等技術，利用蛋白質芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術對蛋白質進行鑒定研究。　　2.翻譯后修飾：很多mRNA表達產生的蛋白質要經歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原激活等。翻譯后修飾是蛋白質調節功能的重要方式，因此對蛋白質翻譯后修飾的研究對

定量蛋白質組學方法分類介紹

　　【蛋白研究系列專題】-4丨定量蛋白質組學方法，您值得擁有 　　1 背景和意義 　　 從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下

定量蛋白質組學的技術發展

　　以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短，早在上個世紀70年，三重四極桿質譜儀就已經出現，并在80年代首次在發表的文章中，證明可以被用來檢測肽段。　　過去幾年間，更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升，而且新方法，新工具，新資源和新一代方法，也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技

定量蛋白質組學的優勢有哪些？

　　質譜方法比抗體方法更先進的一個原因，就是已經開發出了一種新的定向分析技術，比生產一個新的抗體要快得多，并大大減少了檢測特異性方面的問題（抗體方法存在交叉反應的問題）。　　雖然抗體方法在低豐度蛋白的檢測方面更加靈敏，但是質譜技術的一個明顯優勢就是能在單個實驗中檢測多種蛋白，比如說，系統生物學研究人

安捷倫科技資助定量蛋白質組學研究

　　安捷倫科技通過都柏林國立大學 Newman 獎學金計劃 　　資助定量蛋白質組學研究　　2010 年 5 月 12 日，加利福尼亞州圣克拉拉市和愛爾蘭都柏林市 — 安捷倫科技公司(紐約證交所：A)和都柏林國立大學(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben

蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀

　　 上期分享的蛋白組學內容，是不是有些小伙伴還繞在云里霧里呀？這次，小編用實例說話，幫您梳理清楚。 　　一、Label-free定量 　　 Label-free定量，顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化

wkh：label－free定量蛋白質組學研究要點

定量定性蛋白質組學新工具亮相ASMS

賽默飛世爾科技在ASMS 2010展示定量定性蛋白質組學工具 　　美國猶他州鹽湖城(2010年5月25日)– 全球服務科學領域的領導者賽默飛世爾科技，今日公布了其在蛋白質組學工具方面的重大進步，并表示這些進步將推動定量和定性蛋白質組學研究取得突破性的進展。這些新產品與賽默飛世爾科技其它的試劑和耗材

“鳥槍法(shotgun)”定量蛋白質組學技術

　　1999年，Yates研究組提出“鳥槍法”(shotgun)，其基本技術路線是針對液體或SDS-PAGE條帶的復雜混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后對肽混合物進行多維毛細管液相色譜分離和串聯質譜分析以及數據庫檢索，從而確定蛋白質的種類，可同時鑒定成百上千種蛋白質。他們把這種思路稱

定量蛋白質組學揭開巨噬細胞活化的秘密

巨噬細胞活化是許多疾病發展過程中的關鍵步驟，包括動脈疾病。最近，布萊根婦女醫院和哈佛醫學院的研究人員通過蛋白質組學及其他分析，強調了PARP9和PARP14在調節巨噬細胞活化中的作用。這項成果發表在《Nature Communications》上。布萊根婦女醫院的Masanori Aikawa及其同

蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀（一）

一、Label-free定量Label-free定量，顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free技術又可分為基于譜圖數（Spectra Co

蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀（二）

經典案例題目：A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis（一種基于多胺Hypusine軸（Polyamine-hypusine axis）的新型腫瘤抑制網絡）期刊：Nature主要技術：iTRAQ定量文章摘要：

蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀（三）

經典案例題目：Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells（采用甾醇探針結合SILAC定量技術在哺乳動物細胞中分析膽固醇-蛋白質相互作用）期刊：Nat Methods主要技術：SILAC定量文

定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有

定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）

摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋

定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）

無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決

定量蛋白質組學質譜采集技術進展（二）

同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,

代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？? ? ? ?代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生

代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

　　什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 　　代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生

代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

　　什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 　　代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生

代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹

　　什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 　　代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生

研究人員開發定量蛋白質組學數據的下游分析工具

原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm

蛋白質組與蛋白質組學簡介1

一、蛋白質組概念：一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表

蛋白質組與蛋白質組學簡介2

3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合，然后將DNA從被修飾的堿基處切割，電泳分離，結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾，不能切斷，可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

CPSA－2013分會：目標蛋白質組學——蛋白質定量的創新和應用

　　2013年4月25日，上海CPSA 2013各個分會在浦東淳大萬麗酒店不同宴會廳同期舉行。本次在宴會廳Rhine廳的會議主要圍繞目標蛋白質組學——蛋白質定量的創新和應用展開專題討論。 美國匹茲堡大學的Nathan Yates先生 　　首先，來自美國匹茲堡大學的Nathan

馬來酸酐二次衍生技術的定量蛋白質組學方法研究

基于馬來酸酐二次衍生技術的定量蛋白質組學方法研究田姍姍1，柏雪1，翟貴金1，張鍇*,1，張玉奎2（1天津醫學表觀遺傳學協同創新中心，天津醫科大學基礎醫學院，天津 3000702中國科學院大連化學物理研究所，國家色譜研究分析中心，遼寧省大連市 116023）摘要：定量蛋白質組學在當前生物醫學研究中發揮

上海交大教授：定量蛋白質組學技術揭示新分子機理

　　上海交通大學農業與生物學院的研究人員發表了題為“Cellulase from Trichoderma harzianuminteracts with roots and triggers induced systemic resistance to foliar disease in maize

方案10－定量蛋白質組學的體內蛋白質同位素標記實驗

實驗材料釀酒酵母試劑、試劑盒丙酮乙腈NH4HCO3細胞生長培養基干冰冰水2-巰基乙醇甲醇鐵氰化鉀蛋白提取試劑組合蛋白酶抑制劑硫代硫酸鈉儀器、耗材離心蒸發儀離心管血細胞計數器孵育器MALDI- TOF 質譜儀和 LC-MS MS 系統超聲波破碎儀分光光度計實驗步驟一、培養細胞二、提取蛋白的細胞準備三、