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  • 《自然》獲得首創性全基因組RNAi庫

    來自奧地利科學院維也納分子生物學研究院(Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences)的研究人員以果蠅為研究對象,利用一套完整的基因組序列數據,從達到了88%覆蓋率的蛋白編碼基因中獲得了全基因組范圍內特異組織 RNAi轉基因文庫,這在之前并未完成過。這一研究得到的數據庫有助于對功能的喪失進行快速的基因篩選,使得科學家基本上有可能在生物體的生命過程中的任何階段在任何一種組織中或細胞中來研究基因功能。 原文檢索:Nature 448, 151-156 (12 July 2007) |doi:10.1038/nature05954; Received 28 February 2007; Accepted 22 May 2007A genome-wide transgenic RNAi library for conditional g......閱讀全文

    《自然》:新一代高速測序技術完成沃森基因組

    該成果向個人化基因組的目標又邁進了一步 圖片說明:新測序出的堿基代碼排出的沃森頭像。(圖片來源:Nature)? 在4月17日的《自然》雜志上,美國的科學家發表了首個利用新一代高速測序技術得到的全基因組,而接受這一全基因組測序的不是別人,正是“DNA之父”詹姆斯?沃森。該成果標志著人類基因

    貝瑞和康建成全球最大婦科腫瘤基因組數據庫

      基因組大數據的重大意義開始凸顯,貝瑞和康與阿里云合作開展的“神州基因組數據云”項目取得的階段性成果,便已經收效顯著。  9月23日,在第十九屆全國臨床腫瘤學大會暨CSCO學術年會上,北京貝瑞和康生物技術股份有限公司(以下簡稱“貝瑞和康”)公布了在生物信息分析領域和大數據建設方面做出的重要成果。 

    首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布

      近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展,首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋,搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》(Molecular Plant)上。  黃瓜是葫蘆科的重要經濟蔬菜作物。黃瓜基因組中有近3

    Nature子刊公布世界最大的自閉癥基因組數據庫

      自閉癥,或稱為自閉癥譜系障礙,是指包括了社會技能、重復行為、語言和非語言交流、以及與眾不同的優勢或差異等多表征型障礙。我們現在得知,自閉癥分好多亞型,大多數由遺傳和環境共同作用造成。據估計,每68名兒童中就有一人患有自閉癥。雖然,目前自閉癥的干預方法很多。但是大多數缺乏循證醫學的證據。尚無最優治

    北京基因組所構建出多物種轉錄圖譜綜合數據庫

      隨著高通量測序技術的發展,轉錄組測序(RNA-seq)已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法,并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生,以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息,服務生物醫學基礎研究領域需求,構

    Nature子刊:用于百萬級生物樣本庫的基因組序列分析工具

      人類的疾病易感性和生理特征等常見性狀的差異,往往由DNA序列變化造成,這些DNA片段缺失、增加、異位等變化被統稱為遺傳變異。全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通過比對大量人群的遺傳信息,利用統計學檢測遺傳變異和性狀之間關聯性的方法。西湖大學

    首個近完整黃瓜基因組及多組學綜合數據庫發布

    近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所葫蘆科蔬菜遺傳育種創新團隊在黃瓜基因組學方面取得重要進展,首次完成接近完整的黃瓜參考基因組組裝和基因注釋,搭建了第一個黃瓜多組學綜合數據庫。相關研究成果發表在《分子植物》(Molecular Plant)上。黃瓜參考基因組“9930”和核心種質資源。中國農科院蔬菜所

    RNAi

    1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果是二者都同樣

    高內涵細胞分析儀的細胞生物學應用——人類基因組RNAi文...

    高內涵細胞分析儀的細胞生物學應用——人類基因組RNAi文庫篩選Acumen eX3高內涵細胞分析儀的細胞生物學應用(一)——人類基因組RNAi文庫篩選得益于高通量技術的廣泛應用,在過去的幾年里關于基因組學、蛋白組學、細胞組學等“組學”的研究都得到了空前的發展。科學家們從來沒有像今天這樣能夠借助各種自

    奧地利研究發現使果蠅適應不同溫度的基因

      果蠅原產于熱帶或亞熱帶地區,但目前世界上許多地區都能發現它們的蹤影。奧地利一項最新研究發現,果蠅身上攜帶的一種基因或許是它們能夠適應不同溫度環境的原因。   奧地利維也納獸醫大學群體遺傳學研究所所長克里斯蒂安·施洛特雷爾領導的研究小組4月 27日發表公報說,果蠅種類繁多,它們生存的空間早已

    《自然》:管軼等對新流感起源的基因組學研究

      H1N1流感病毒由2種豬流感病毒的基因重組而形成   據生物通報道,香港大學醫學院、愛丁堡大學、亞利桑那大學以及牛津大學合作的新型流感研究成果Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A

    誰在先?“雞基因組”和“雞蛋基因組”

    是先有雞還是先有雞蛋?這個問題相當惱人,恐怕很難說清楚。現在,研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題:是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中,那個是第一個產生的?那些被復制了? 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據,這種

    最新RNAi技術可媲美轉基因小鼠模型

      基因編輯技術一直都是生命科學的熱門研究領域,近來編輯領域出現了可與轉基因小鼠技術相媲美的新RNAi干擾技術,該技術由洛克菲勒大學的研究人員研制出,在全基因組水平上首次對小鼠進行RNAi篩查研究,并在數月內發現了導致表皮腫瘤生長的基因,研究成果發表在《自然》期刊上。   RNAi技術篩查致病基因

    RNAi在探索基因功能中的應用

    人類基因組計劃的完成標志著后基因組時代的來臨。闡明人類基因組中功能基因表達產物的生物學作用對醫學發展有著深遠意義。在RNAi技術出現以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遺傳學(reverse genetics)研究手段,但其技術難度較高、操作復雜、周期長。由于RNAi技術可以利用

    RNAi在基因治療領域中的應用

    RNAi作為一種高效的序列特異性基因剔除技術在傳染性疾病和惡性腫瘤基因治療領域發展極為迅速。在利用RNAi技術對HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等進行基因治療研究中發現,選擇病毒基因組中與人類基因組無同源性的序列作為抑制序列可在抑制病毒復制的同時避免對正常組織的毒副作用。同時將抑制序列選擇在特定的位點,

    RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除(2)

    在構建雙鏈RNA的表達載體時,使用RNA多聚酶Ⅲ來指導RNA的合成。這是因為RNA多聚酶Ⅲ有明確的啟始和終止序列,而且合成出的RNA不會帶有polyA尾。當RNA多聚酶Ⅲ遇到連續5個胸腺嘧啶時,它指導的轉錄就會終止,并且轉錄產物在第二個尿嘧啶處被切下來。U6啟動子能被RNA多聚酶Ⅲ識別, 合

    RNAi在探索基因功能中的應用

    人類基因組計劃的完成標志著后基因組時代的來臨。闡明人類基因組中功能基因表達產物的生物學作用對醫學發展有著深遠意義。在RNAi技術出現以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遺傳學(reverse genetics)研究手段,但其技術難度較高、操作復雜、周期長。由于RNAi技術可以利用

    RNAi在基因治療領域中的應用

    RNAi作為一種高效的序列特異性基因剔除技術在傳染性疾病和惡性腫瘤基因治療領域發展極為迅速。在利用RNAi技術對HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等進行基因治療研究中發現,選擇病毒基因組中與人類基因組無同源性的序列作為抑制序列可在抑制病毒復制的同時避免對正常組織的毒副作用。同時將抑制序列選擇在特定的位點,

    RNAi在探索基因功能中的應用

    人類基因組計劃的完成標志著后基因組時代的來臨。闡明人類基因組中功能基因表達產物的生物學作用對醫學發展有著深遠意義。在RNAi技術出現以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遺傳學(reverse genetics)研究手段,但其技術難度較高、操作復雜、周期長。由于RNAi技術可以利用

    RNAi在基因治療領域中的應用

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    RNAi在探索基因功能中的應用

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    RNAi在探索基因功能中的應用

    人類基因組計劃的完成標志著后基因組時代的來臨。闡明人類基因組中功能基因表達產物的生物學作用對醫學發展有著深遠意義。在RNAi技術出現以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遺傳學(reverse genetics)研究手段,但其技術難度較高、操作復雜、周期長。由于RNAi技術可以利用

    RNAi在基因治療領域中的應用

    RNAi作為一種高效的序列特異性基因剔除技術在傳染性疾病和惡性腫瘤基因治療領域發展極為迅速。在利用RNAi技術對HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等進行基因治療研究中發現,選擇病毒基因組中與人類基因組無同源性的序列作為抑制序列可在抑制病毒復制的同時避免對正常組織的毒副作用。同時將抑制序列選擇在特定的位點,

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    人類基因組計劃的完成標志著后基因組時代的來臨。闡明人類基因組中功能基因表達產物的生物學作用對醫學發展有著深遠意義。在RNAi技術出現以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遺傳學(reverse genetics)研究手段,但其技術難度較高、操作復雜、周期長。由于RNAi技術可以利用

    RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除(1)

    1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA[1]。這些雙鏈RNA是體外

    科學家得到詳細的惡性膠質細胞瘤細胞基因組數據庫

      科學家啟動了腫瘤基因組圖譜計劃(The Cancer Genome Atlas,TCGA),打算分析所有組織的腫瘤細胞的基因組。腦組織腫瘤是科學家的第一個目標,因為其挑戰性大回報也最大。   TCGA收集了多形性成膠質細胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)的組

    北京基因組所合作開發完成長非編碼RNA數據庫

      長非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是近年來國際研究的新熱點,與人類癌癥、神經系統等疾病發生密切相關,在疾病診療方面表現出了潛在的重大應用價值。雖然長非編碼RNA表達量相對較低,但由于其在轉錄、基因組印記、翻譯、可變剪切、轉錄后表達調控、蛋白運輸與定位等過程的

    北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫

      DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記,在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用,不同物種所采用的機制亦各不相同。因而,整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析,可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異,并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。   

    上海生科院發布基因組多樣性和祖源信息數據庫

    ?? 該研究分析了涵蓋全球范圍107個國家的356個人類族群的基因組多樣性和祖源信息,并發布了開放獲取的專門數據庫——PGG.Population(群體基因組學·族群)。PGG.Population是迄今唯一在基因組水平專門解析人類族群遺傳關系和祖源信息的公開數據庫,也是目前收集族群數量最大的群體基

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