近日,德克薩斯州西南醫學中心的徐劍教授課題組與復旦大學附屬中山醫院及生物醫學研究院(IBS)周峰研究員課題組合作,首次利用了“biotinylated dCAS9”的方法建立了高分辨率,位點特異原位DNA-蛋白質以及其他元件的互作網絡 。8月24日,相關研究成果以《通過dcas9原位捕捉染色質相互作用網絡》(“In Situ capture of chromatin interactions by biotinylated dCAS9”)為題在國際頂級學術期刊《細胞》(Cell)雜志上發表,徐劍教授和周峰研究員為共同通訊作者。徐劍教授為該文章的Lead Contact。
隨著功能基因組學的飛速發展,對調控基因表達的順式(cis-)和反式(trans-)作用元件進行系統研究成為當前急需填補的領域空白。此前也有利用3D基因組圖譜的方法來研究染色質結構的組學技術:染色質免疫沉淀技術CHIA-PET能夠鑒定到全基因組范圍內的染色質互作水平,最近幾年發展起來的Hi-C技術可以在更大范圍內捕獲包含各種拓補結構在內的與染色體相關的互作關聯信息。但遺憾的是,目前為止,這些技術都無法得到與基因位點特異性相關的互作圖譜,同時也缺乏反式作用原件(trans-)參與介導的互作圖譜信息。
據介紹,此次研究建立的“CAPTURE方法”可以針對感興趣的基因位點進行全面的挖掘,在原位發現對DNA的轉錄起到重要調控作用的蛋白質及其他元件,這種3D互作組學手段有助于科研人員今后就調控元件與疾病和發育的關系作進一步深入研究。
圖胚胎肝細胞通過分泌Fetuin-A蛋白維持造血干祖細胞基因組的穩定性在國家自然科學基金項目(批準號:81920108005、U23A20417、81730007、31872842、91442106)......
該圖說明了成纖維細胞生長因子4和抗壞血酸的組合如何激活信號通路,促進誘導心肌細胞的成熟。這種方法有效地將成纖維細胞重新編程為具有改進結構和功能的心肌細胞。圖片來源:高麗大學韓國高麗大學研究團隊開發了一......
12月13日,在北京市科學技術委員會和中關村科技園區管理委員會的支持下,細胞出版社與清華大學醫學院在清華校園聯合舉辦了2024中關村論壇系列活動暨北京國際學術交流季——從實驗室到臨床:細胞與基因治療的......
12月5日,記者從良渚實驗室獲悉,該實驗室張進研究員團隊與中國科學院動物研究所宋默識博士研究組合作,首次報道靶向嵌合抗原受體巨噬細胞療法在治療心肌缺血再灌注導致的組織損傷和纖維化中的應用潛力。相關論文......
初步繪制復旦大學科創地圖、明確投資策略、超額完成5億元首關目標、組建一支專業化管理團隊……12月3日,正值復旦科創母基金啟動一周年之際,2024首屆復旦科技創新投資大會順利舉辦。會上,復旦科創母基金正......
科技日報北京12月4日電(記者張夢然)荷蘭胡布雷希特研究所團隊開發出一種新型類器官。這種類器官能夠模擬人類胎兒胰腺的早期發育過程。這項技術的重大突破是重建了胰腺完整結構,包含三種關鍵細胞類型——腺泡細......
11月11日下午,以“AIforScience雙螺旋引擎驅動科研新范式”為主題的2024科學智能創新論壇在復旦大學楓林校區舉行。中國科學院院士、北京科學智能研究院理事長、北京大學國際機器學習研究中心主......
11月8日,中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所副研究員李雪飛團隊與香港浸會大學副教授田亮團隊展開合作的最新成果發表于《美國科學院院刊》。合作團隊開發了一種基于深度學習與公開單細胞數據集的解卷......
根據市科技計劃項目管理辦法有關規定,現將上海市2024年度“科技創新行動計劃”細胞與基因治療專項擬立項項目予以公示。公示鏈接:http://svc.stcsm.sh.gov.cn/public/gui......
約翰霍普金斯金梅爾癌癥中心的科學家們已經確定了16個基因,乳腺癌細胞在逃離腫瘤的低氧區后,利用這些基因在血液中存活。每一種都是阻止癌癥復發的潛在治療靶點,其中MUC1已經在臨床試驗中。這項研究于9月2......