日前,北京林業大學張啟翔教授領銜的國家花卉工程技術研究中心,與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院以及賓夕法尼亞州立大學等單位通力合作完成了首個梅花全基因組重測序研究,構建完成了世界首張梅花全基因組變異圖譜,“梅花花部性狀的遺傳結構”(The genetic architecture of floral traits in the woody plant Prunus mume)研究論文在《自然通訊》(Nature Communications)在線發表。
梅花全基因組重測序的完成將為其分子標記輔助育種的研究提供重要的理論框架,也將在應用上為其花色、花型、株型等重要觀賞性狀基因的遺傳選育及品種改良提供重要平臺,對梅花重要觀賞性狀的遺傳解析具有里程碑的作用。
鑒于梅花栽培品種經過長期的人工馴化和自然授粉,其遺傳背景極為復雜,為了揭示梅花和李屬的演化歷史,開展梅花分子標記輔助育種工作,揭示梅花重要觀賞性狀的遺傳機理,該項目選取333株梅花品種、15株野生梅花以及梅花的近緣物種山杏、山桃和李開展全基因組重測序研究,利用Illumina HiSeq 2000的測序平臺,平均測序深度19.3X,挖掘到534萬個SNP標記(單核苷酸多態性標記),極大地推動了梅花群體遺傳學分析、全基因組關聯分析和李屬泛基因組研究的順利開展。
張啟翔教授指出,“梅花全基因組重測序順利完成,是繼梅花全基因組研究工作后的又一重要突破,將有助于開展梅花株型、花色和花型等重要觀賞性狀的分子標記輔助育種工作,有助于解析諸多重要性狀功能基因的遺傳機理,為梅花及相關種屬的分子育種奠定基礎;同時梅花全基因組重測序相關研究以及我們正在開展的其它后基因組學研究對于我國花卉的基礎研究進展將產生深遠的影響。”
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