組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質，以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg，但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前，需根據不同組織類型確定具體的染色質需要量。應先按照下述方法制備染色質溶液，再進行交聯免疫沉淀反應。所有溶液中均應添加蛋白酶抑制劑（10 μl/ml 的 PMSF，1 μl/ml 的抑肽酶和 1 μl/ml 的亮肽素，溶于 PBS 中）。實驗步驟1. 交聯1) 用刀片將冰凍或新鮮組織切成小塊 (1-3 mm3)。2) 取一個空的 15 ml 錐形離心管，稱重，放入組織后再次稱重，計算組織重量。3) 在通風櫥中配制交聯所用溶液。每克組織加 1......閱讀全文
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質，以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg，但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前，需根據不同
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質，以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg，但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前，需根據不同
染色質免疫沉淀分析
真核生物細胞狀態是由內源和外源因素共同影響的，所有信號傳遞途徑的終點都是DNA 。DNA 通過核蛋白復合物組成染色質，染色質是基因調控的一個重要作用位點。轉錄激活因子和輔助抑制因子的研究顯示存在一種新的調節機制--" 組蛋白密碼" ，其信息存在于組蛋白的轉錄后修飾等過程中。該類修飾包括組蛋白磷酸
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法，來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布（用芯片或 DNA 測序）。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法，來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布（用芯片或 DNA 測序）。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
染色質免疫沉淀技術的應用
隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域，要想提供蛋白因子直接調控的證據，需要直接檢測蛋白質-DNA的相互作用，而染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）就是一種研
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點
染色質免疫沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation，簡稱ChIP）是研究體內蛋白質與DNA相互作用的一種技術。它利用抗原抗體的特異性反應，可以真實地反映體內蛋白分子與基因組DNA結合的狀況。下面我們就最基本的實驗步驟，實驗中的小技巧以及需要注意的問題簡單介紹一下。1.
動物組織中DNA的制備
（一）原 理DNA是所有生物體的基本組成物質。真核生物DNA主要存在于細胞核中。制備DNA時應將細胞核膜打破方能釋放出來。細胞中的DNA和RNA分別與蛋白質相結合，形成脫氧核糖核蛋白及核糖核蛋白。在細胞破碎后，這兩種核蛋白將混雜在一起。因此，要制備DNA首先要將這兩種核蛋白分開。已知這兩種核蛋白在不
自然染色質免疫沉淀實驗設計
1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima
染色質免疫沉淀芯片（ChipChip）
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點，ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。（2）染色體活性狀態的定
技術和方案18－染色質免疫沉淀
試劑、試劑盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制劑裂解緩沖液免疫共沉淀洗脫液TESTE儀器、耗材超聲波粉碎儀實驗步驟1.培養要分析的細胞。每一個樣品，需要在三角瓶中培養 50~100ml 細胞至 OD600 大約為 1。2.甲醛處理細胞交聯蛋白質和 DNA。加甲醛到細胞中至終濃度為 1%(37% 的甲醛按 1
染色質免疫沉淀法（Chromatin－immunoprecitation，ChIP）
染色質免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP）是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具。它可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結合情況，還可以用來研究組蛋白與基因表達的關系。核小體組蛋白可以發生多種翻譯后的共價修飾，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等，這些
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點及應用1
序言隨著人類基因組測序工作的基本完成，功能基因組學的研究逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域。研究某個蛋白因子的調控功能，可以通過對蛋白活性（激活或抑制其活性），蛋白數量（過表達Overexpression或基因缺陷型Knockout）, 以及蛋白功能（功能缺陷
Active－Motif的染色質免疫沉淀試劑盒(ChIP)
ChIP（染色質免疫沉淀）方法是研究活體“蛋白質－DNA”相互反應的一種非常強大的工具。目前，這種方法用于染色質結構的動力學研究、轉錄因子的調節和輔助調節因子及其他表觀遺傳變化的研究。ChIP的使用過程分為三個主要步驟：第一步，在甲醛固定后分離和破碎染色質；第二步，使用感興趣的蛋白的抗體完成特定染色
染色質免疫沉淀（ChIP）技術的難點及應用2
3. 染色質免疫沉淀Input對照：在進行免疫沉淀前，需要取一部分斷裂后的染色質做Input對照。Input是斷裂后的基因組DNA，需要與沉淀后的樣品DNA一起經過逆轉交聯，DNA 純化，以及最后的PCR或其他方法檢測。Input對照不僅可以驗證染色質斷裂的效果，還可以根據Input中的靶序
不同植物組織中多糖的提取中AIR的制備
實驗概要本人總結的多糖提取前AIR制備過程實驗步驟AIR （alcohol insoluble residue）提取1）新鮮收取的植物在蒸餾水中清洗以除去培養基等物質，后凍干。2）將凍干的樣品在液氮中研磨成粉末。3）AIR （alcohol insoluble residue）制備浮萍、擬南芥葉及根
植物染色質免疫沉淀試劑盒的使用說明
EpiQuik?植物染色質免疫沉淀試劑盒包括全套的試劑，允許試驗者有效地在體內研究蛋白-DNA相互關系。整個過程可以在6小時內完成，產品效果遠遠優于任何競爭對手的試劑盒。EpiQuik?植物染色質免疫沉淀試劑盒適用于將特異性免疫沉淀與定性和定量PCR、ChIP-Seq、ChIP-on-chip結合使
免疫沉淀實驗——制備抗體Sepharose－偶聯物
實驗材料蛋白質試劑、試劑盒NaClNa2CO3乙腈溴化腈甘氨酸儀器、耗材透析管濾紙實驗步驟1. ?1 ~30 mg/ml 的抗體在 4℃對 0.1 mol/l NaHCO3?/ 0.5 mol/l NaCl透析 24 h，期間換液3次。透析液的體積應500倍于抗體溶液。2. ?于4℃10 000 g
植物染色質免疫沉淀試劑盒（CHIP）的使用說明
蛋白質和DNA的相互作用是調控細胞反應過程的要素之一。染色質免疫沉淀分析方法（chromatin immunoprecipitation, CHIP）是研究活體內DNA和蛋白質的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技術通過三大步驟實現：第一，甲醛固定后染色質分離和斷片；第二，運用特異蛋白
組織學——組織制備
·?????????Histological techniques?(William H. Heidcamp)Very detailed guide to histological techniques, like? fixation, dehydration, embedment and subs
從石蠟包埋固定的組織中制備－RNA－實驗
實驗材料 石蠟包埋的組織樣品試劑、試劑盒 甲酰胺消化緩沖液乙醇肝糖異丙醇苯酚 氯仿蛋白酶 KTrizol二甲苯儀器、耗材 微量離心管恒溫箱實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑去離子化的甲酰胺焦碳酸二乙酯（DEPC) 處理過的水消化緩沖液（lmol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巰基乙醇
從石蠟包埋固定的組織中制備－RNA－實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 石蠟包埋的組織樣品 試劑、試劑盒 甲酰胺 消化緩沖液 乙醇 肝糖
從石蠟包埋固定的組織中制備－RNA－實驗
該方案是由 Godfrey 等改進 Fisher 的方案發表的。此前已有從固定組織中純化 RNA 的方案發表。Ambion 和 Roche 發明了從石蠟包埋的組織中純化 RNA 的商品化試劑盒。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。實驗材料石蠟包埋的組織樣品試劑、試劑盒甲酰胺
組織芯片的制備
實驗方法原理 首先制作模具蠟塊（受體，recipient）。從供體蠟塊（donor）上取樣，取樣針分別有 0.6 mm、1.0 mm、1.5 mm 和 2.0 mm 幾種，在 1 個大小 45 mm×20 mm 的模具蠟塊上，以 0.6 mm 取樣針間隔 0.1 mm，可排列 1000 余個
組織芯片的制備——冰凍組織芯片
實驗材料新鮮組織試劑、試劑盒OCT 包埋劑切片黏合劑儀器、耗材1 mm 孔徑針載玻片實驗步驟將每個需要制備 TMA 的新鮮組織，不經固定包埋在 OCT 包埋劑中， -20℃ 中凍成塊。另外，再將 OCT 包埋劑倒在長 3 cm×寬 1.5 cm×高 lcm 的模具中， -20℃ 中凍成塊。用特制的
從實體組織中制備粗微體實驗
從大鼠肝臟制備微體 從狗的胰臟中制備粗微體 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 雄大鼠
從實體組織中制備粗微體實驗
實驗材料 雄大鼠試劑、試劑盒 蔗糖蔗糖HM儀器、耗材 玻璃板實驗步驟 1. 用斷頸法殺死約 150 g 重的雄大鼠，大鼠的數量取決于要制備的粗微體的數量。由于一個 150 g 重的大鼠肝（6 g）大約每克肝蛋白含有 10 mg 粗微體，所以大鼠的數量可以以回收率為 50% 來進行估計。2. 流干血液
從實體組織中制備粗微體實驗
從大鼠肝臟制備微體從狗的胰臟中制備粗微體實驗材料雄大鼠 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?試劑、試劑盒蔗糖 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
利用－Trizol－從植物組織中制備－RNA－實驗
實驗材料 植物組織試劑、試劑盒 Trizol氯仿異丙醇乙醇DEPC處理過的水液態N2NaCl檸檬酸鈉儀器、耗材 轉子-定子均化器研缽和杵圓錐形管實驗步驟 一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑Trizol(Invitrogen)氯仿異丙醇乙醇，70%，用焦碳酸二乙酯（DEPC) 處理過的水配制DEPC 處
利用－Trizol－從植物組織中制備－RNA－實驗
下述方案是經修改過的 Trizol 方案，用于從植物組織中分離 RNA，其中增加了一個高鹽異丙酵沉淀步驟，以選擇性地沉淀 RNA，而將多聚糖和蛋白多糖留在溶液里。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。實驗材料植物組織試劑、試劑盒Trizol氯仿異丙醇乙醇DEPC處理過的水液態