北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cancers為題在國際學術期刊Nucleic Acid Research在線發表。 單細胞分辨率的全轉錄組測序技術（scRNA-seq）具有研究細胞異質性的顯著優勢，已成為研究腫瘤微環境、癌癥發病機制、轉移與侵襲以及各類癌癥治療與診斷不可或缺的手段。截至2021年11月，PubMed已有超過1300個癌癥相關的單細胞轉錄組學研究，極大提升了人們對人類癌癥發生發展的理解，推動了癌癥臨床診斷與治療的進程。大規模癌癥scRNA-seq數據在過去十年中呈現爆炸式增長，迫切需要對這些數據進行規范化整合與處理，對各類癌癥的腫瘤微環境進行深入挖掘與比......閱讀全文
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
利用DNA圖譜診斷癌癥
作為無創產前診斷等相關領域技術的首創者，來自香港中文大學的盧煜明（DennisLo）教授最早就曾發現孕婦外周血中存在“漂流”的胎兒DNA，也就是說，假設每毫升母親樣品相當于1000個基因組，則總共含有1900條母親的21號染色體，100條整倍體胎兒的21號染色體或150條21三體胎兒的21號染色
全球首份癌癥病例圖譜發布
日前，《科學》雜志刊登了瑞典科學家的重磅成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”，將數千種特定癌癥相關基因與患者生存情況聯系起來，發掘出32種不以癌癥類型分類、但與80%人類癌癥相關的“公共”基因，可作為潛在新藥研發的精準靶點。新圖譜被認為是腫瘤臨床實踐革命性改進的重要推手。 據《麻省理工技
基于八大基因組學數據庫 構建迄今最完整的癌癥eRNA圖譜
增強子RNA（eRNA）是一種從增強子轉錄的非編碼RNA。目前，科學家已經在人類細胞中鑒定出數以萬計的eRNA，其中許多都在RNA轉錄過程中發揮重要作用，以介導靶基因的激活。在人類癌癥中，癌基因或致癌信號通路的激活通常引起增強子的激活和eRNA的產生。例如，ESR1的激活可以整體上增加乳腺癌中e
Nature：癌癥數據庫ClinVar打破Myriad壟斷
??????? 去年，美國最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列測試專利無效，美國最高法院判定也意味著未來美國國內的癌癥檢查價格將變得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的發現和致病相關性是Mary-Claire King博士在1990年發現，盡管當時她的研
全球最大癌癥基因數據庫發布
美國國家癌癥研究所(NCI)科學家發布了有史以來規模最大的癌癥相關基因變異數據庫，為研究者們提供了迄今為止最全面的方式，搞清楚如何將治療藥物靶向疾病。 周一NCI在一份聲明中稱，基于基因組學研究的新數據庫，將對全球開放獲取，預計將有助于研究人員加快新藥的開發，同時能夠更
多物種轉錄圖譜綜合數據庫已對用戶免費開放
隨著高通量測序技術的發展，轉錄組測序（RNA-seq）已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法，并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生，以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息，服務生物醫學基礎研究領域需求，構
癌癥eRNA表達圖譜并揭示其在癌癥臨床中的應用
2019年10月8日，德克薩斯大學休斯敦健康研究中心的韓冷、李文博課題組合作在Nature Communications上在線發表題為“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted
美基因圖譜研究將癌癥重新“歸類”
美國國家衛生研究院資助的科學家團隊完成大規模癌癥基因組圖譜繪制，他們根據基因變異和表達的相似性，提出可以按照分子類型給癌癥“歸類”。研究人員認為，這將為癌癥診斷和治療提供新思路。5日發表在美國《細胞》雜志上的研究，對33種癌癥、1萬多個腫瘤病例的基因、表觀遺傳和蛋白質組學變化進行分析，確認約3