高通量測序鎖定病原體“命門”
《科學》雜志的歷史上,刊載過一篇沉重的學術文章。2014年一篇關于通過基因組學手段監測埃博拉病毒的起源和傳播的論文,在刊登時已有6名研究人員因感染埃博拉而死亡。“對埃博拉病毒的研究和控制是高通量測序技術(二代測序技術)全面應用的首次‘實戰’。”日前,在由中國醫學科學院、北京協和醫學院主辦的第二屆感染性疾病精準醫學高峰論壇上,參加過與埃博拉病毒一線作戰的研究人員,對中國團隊與埃博拉病毒“作戰”的戰略戰術進行了揭秘。中國科學院武漢病毒研究所研究員劉翟表示,病原體能使人類群體性致病甚至致死,二代測序技術及宏基因組學能幫助人類追溯病原體、捕捉放大它們在分子水平上的變化、鎖定病原體“命門”,最終贏得“人毒之戰”“人菌之戰”。測準遺傳物質 新策略抓住病毒“七寸”在2014西非埃博拉病毒爆發期間,美國的團隊最初斷言病毒可能在加速進化。劉翟回憶,這一發現在當時是一個“面臨強敵”的信號,它意味著傳統的檢測防治方法或許失效,如果埃博拉病毒是......閱讀全文
高通量測序
高通量測序技術又稱“下一代”測序技術,以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序包括:大規模平行簽名測序、聚合酶克隆、454焦磷酸測序、離子半導體測序和DNA 納米球測序等技術。 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DN
高通量測序技術
沒有測序的癌癥診斷是不完整的,完整的癌癥診斷應該包括一系列基于細胞遺傳學技術、熒光原位雜交技術、標準分子技術以及NGS的預后與預測性分析。對于早期癌癥患者來說,NGS序列分析在多種癌癥的篩查技術中具有不容忽視的代表性;而對于晚期癌癥患者,大量的侵入性測試往往只能篩查出少數幾個藥物靶點。 隨
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
高通量測序原理
高通量測序原理是將基因組 DNA 片斷化,然后克隆到質粒載體上,再轉化大腸桿菌。對于每個測序反應,挑出單克隆,并純化質粒 DNA。高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。高通量
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
什么是高通量測序
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titanium第二代
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
Solexa高通量測序方法
高通量測序發展的背景基因決定了一個人的相貌、身高甚至疾病,它存在于每個人體細胞的DNA中。而組成DNA的基本物質則是由A、T、G、C表示的4種堿基,一個人的基因組測序就是排列出其DNA上所有堿基的順序。如果每個人都能擁有一份屬于自己的基因組圖譜,那么科學家們長期以來期待的“個性化醫療時代”就會可能成
轉錄組高通量測序
(第二代高通量測序技術-454) 轉錄組即特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。羅氏GS-FLX-Titaniu
高通量測序的步驟
當然,首先地提取出您想要測序的東西,比如RNA、DNA 。再就是建庫-測序-分析。建庫需要將序列片段化、加接頭、PCR。不同的業務有細微的差別,比如RNA要先反轉錄成cDNA等等。然后就是上機測序了!最后就是數據分析了。數據分析分為流程分析(基本分析)和個性分析(根據老師課題分析)。這些以后呢,就是
高通量測序的意義
高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單堿基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼, 而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單堿
高通量測序技術包括
高通量測序技術及原理介紹如下:高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation” sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。測序技術推進科學研
高通量測序的相關介紹
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。 名詞解釋 根據發展歷史、影響力、測序原
高通量測序技術的應用
測序技術推進科學研究的發展。隨著第二代測序技術的迅猛發展,科學界也開始越來越多地應用第二代測序技術來解決生物學問題。比如在基因組水平上對還沒有參考序列的物種進行重頭測序(de novosequencing),獲得該物種的參考序列,為后續研究和分子育種奠定基礎;對有參考序列的物種,進行全基因組重測
高通量測序的實驗過程
1.樣本準備(sample fragmentation)2.文庫構建(library preparation)3.測序反應(sequencing reaction)4.數據分析(data analysis)
高通量測序分的原理
對DNA分子進行序列測定。1.對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。2.根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以下幾種:大規模平行簽名測序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S
高通量測序的實驗過程
1.樣本準備(sample fragmentation)2.文庫構建(library preparation)3.測序反應(sequencing reaction)4.數據分析(data analysis)
高通量測序技術SOLiD簡介
目前市場上有四種高通量測序儀,分別是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根據測序原理,它們可以被分為兩大類:使用合成法測序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用連接法測序(Sequencing by Ligat
高通量測序技術及原理
高通量測序技術及原理介紹如下:1.什么是高通量測序高通量測序技術也被稱作二代測序技術(Next Generation Sequencing, NGS),這是相對一代測序技術(Sanger Sequencing)而言的,同時由于高通量測序的出現使得我們能對一個物種的基因組和轉錄組進行全面、細致的分析成
高通量測序技術總結與展望
第一代測序技術憑借其長的序列片段和高的準確率,適合對新物種進行基因組長距框架的搭建以及后期GAP填補,但是成本昂貴,而且難以勝任微量DNA樣品的測序工作。第二代測序技術中,454序列片段最長,比較適合對未知基因組從頭測序,搭建主體結構,但是在判斷連續單堿基重復區時準確度不高。Solexa較454
高通量測序數據分析
1. 是不是一定要用大型計算機? 除了序列拼接組裝以外,其它分析不是一定要大型計算機,在普通的PC上也可以進行一些處理,當然,買一臺或幾臺高性能的工作站電腦,能顯著加快數據處理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系統? 也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分數據處理。
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
高通量測序技術核酸片段分選
近年來,高通量測序技術已經日漸成為基因組學研究項目的標準。從樣品制備到文庫制備及最終測序,大多步驟都要求精確高效化、易于自動化操作,并且許多高通量測序應用都要求核酸片段在特定范圍內緊密分布,因此精準快速的進行片段選擇步驟更具挑戰性。在進行核酸片段分選的過程中,傳統的瓊脂糖凝膠回收法不適于安全、高通量
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收
高通量測序(NGS)的原理簡介
高通量測序(High-Throughput Sequencing)又名下一代測序(Next Generation Sequencing,NGS),是相對于傳統的桑格測序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量測序的主要平臺代表有羅氏公司(Roche)的454測序儀(Roch
高通量測序的應用及前景
一、高通量測序的應用 高通量測序可以幫助研究者跨過文庫構建這一實驗步驟,避免了亞克隆過程中引入的偏差。 依靠后期強大的生物信息學分析能力,對照一個參比基因組(reference genome)高通量測序技術可以非常輕松完成基因組重測序(re-sequence),2007年van Orsouw
高通量測序技術及原理介紹
高通量測序技術及原理介紹如下:1.什么是高通量測序高通量測序技術也被稱作二代測序技術(Next Generation Sequencing, NGS),這是相對一代測序技術(Sanger Sequencing)而言的,同時由于高通量測序的出現使得我們能對一個物種的基因組和轉錄組進行全面、細致的分析成
高通量測序技術-中的“高通量”-是什么意思
高通量是相對于第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本。在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。不過到2005年以后,高通