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    我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜

    在國家自然科學基金項目(項目編號:31722027)等資助下,浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板測序技術繪制小鼠細胞圖譜)為題,于2018年2月23日在生命科學國際頂尖期刊Cell(《細胞》)雜志在線發表。論文鏈接:http://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30116-8。圖. 小鼠細胞圖譜的構建 長久以來,生命科學的研究主要針對群體細胞樣品進行處理、分析和統計進而獲得均值水平的實驗結果。直到近幾年單細胞組學技術的出現,才使我們能夠從單細胞的水平更加精確地解析每個細胞究竟在表達哪些基因,在機體分化、再生、衰老以及病變過程中這些基因的表達又發生哪些變化以及變化的幅度有多大等問題......閱讀全文

    Nature:人類細胞圖譜研究先鋒Aviv Regev

      Aviv Regev是一位生物分析專家。現在,她正致力于繪制人體的每一個細胞。  計算生物學家Aviv Regev喜歡做一些看似不可能完成的任務。2011年,她與分子遺傳學家Joshua Levin合作,測試了RNA測序的幾種方法。科學家們在測試幾種技術的極限,以查看哪種方法表現最佳。他們用降解

    Nature Methods:2016年最值得關注的八大技術

      《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc

    浙大郭國驥團隊繪制世界首個人類細胞圖譜

      近日,世界首個人類細胞圖譜在浙大繪制成功。  北京時間2020年3月26日,浙江大學醫學院郭國驥教授團隊的這項研究成果在線發表于《自然》。  而在兩年前,該研究團隊在《細胞》上發表了世界首個小鼠細胞圖譜。  “這項工作概括地說就是人體細胞數字化。”郭國驥表示,“我們能用數字矩陣描述每一個細胞的特

    研究揭示人類免疫系統起源

      人類胸腺的首個細胞圖譜可能會導致新的免疫療法來治療癌癥和自身免疫疾病。如今,在一項新的研究中,來自英國紐卡斯爾大學、韋爾科姆基金會桑格研究所和比利時根特大學等研究機構的研究人員繪制出胸腺組織在人類一生中的圖譜,以了解它如何發育和產生重要的稱為T細胞的免疫細胞。在未來,這些信息可能有助于科學家們構

    Nature重磅!利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜

      肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。  盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康

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      肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。  盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康

    單細胞測序技術“遍地開花”,精準醫療“如虎添翼”!

    作者:Carrie  單細胞測序技術  基因測序在體外診斷市場中的重要性日益突出。其中,單細胞測序技術自2009年問世,2013年被Nature Methods評為年度技術以來,越來越多地被應用在科研領域。2015年以來,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、S

    構建出人類肝臟的完整細胞圖譜,鑒定出新的肝細胞亞型

      肝臟是人體最大、功能最廣泛的器官之一。它將我們食物中的糖、蛋白和脂肪轉化為對身體有用的物質,并將它們釋放到細胞中。肝臟除了在人體新陳代謝中發揮作用外,還是一種免疫器官,對血液的排毒是必不可少的。最引人注目的是,當僅為原始質量的25%時,肝臟是唯一能夠恢復到原來大小的內臟器官。  肝病是世界上最大

    綜述推薦| 多維單細胞技術解析器官發育與維持

      近年來,依靠表觀遺傳組學、轉錄組學、細胞譜系示蹤和高通量mRNA分子原位分析等技術在單細胞分辨率上的突破,研究人員對脊椎動物器官發育與維持過程中細胞與分子機制的解析取得了一系列重大進展【1-3】。目前,運用各種先進的單細胞分析技術,研究人員可以從細胞圖譜繪制(cell atlas profili

    Nature:浙大領銜在構建人類單細胞圖譜方面取進展

      在一項新的研究中,來自中國浙江大學等研究機構的研究人員朝構建全面的人類單細胞圖譜邁出了一大步。相關研究結果于2020年3月25日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在這

    80后浙大教授《Cell》全球首次繪制哺乳動物細胞圖譜

       來自浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心,浙江大學生命科學研究院等處的研究人員發表了題為“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq”的文章,利用低成本、高效率、完全國產化的高通量單細胞測序平臺,全球首次繪制出了哺乳動物細胞圖譜。  這一研究成果公

    單細胞測序技術應用于發育生物學研究登頂三大學術雜志

      2019年即將結束,在這一年中,單細胞測序的火熱充分展示了該技術在科學研究領域的重要。發育生物學作為生命基本過程研究的基礎學科,單細胞測序技術是該領域研究突飛猛進的助推器。在這300多個日夜里,科學研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些發育生物學的成果跟單細胞技術

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    3月單細胞轉錄組重要研究文獻匯總

      1.單細胞測序用于生殖領域研究持續火熱   精子生成過程是一個復雜又具有嚴格分化過程的生理過程,繼18年10月份《Cell Research》上的成年人睪丸轉錄組圖譜研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生與成年人睪丸細胞單細胞水平鑒定分類[2]的步伐,本月在《Nature

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    抗瘧疾領域最新研究進展一覽

      本期為大家帶來的的抗瘧疾領域的最新研究進展,希望讀者朋友們能夠喜歡。  1. Science:重大突破!根治瘧疾有戲!選擇性抑制PfCLK3蛋白可殺死處于各個發育階段的瘧原蟲  doi:10.1126/science.aau1682.  在一項新的研究中,來自蘇格蘭格拉斯哥大學等研究機構的研究人

    發育生物學領域最新研究進展

      本期為大家帶來的是發育生物學領域的最新研究進展,希望讀者朋友們能夠喜歡。  1. Eur Respir J:新研究揭示肺臟發育高清圖譜  DOI: 10.1183/13993003.00746-2019  過早出生的嬰兒常常患有肺部發育不良,并可能面臨危及生命的后果。為了給這些嬰兒提供新穎的治療

    2017單細胞擴增測序技術的最新進展

      細胞是構成生命體的結構和功能的基本單位,不同類型的細胞形態迥異,功能也各不相同。即使是同類細胞間看似相同,相互間也存在著廣泛的細胞異質性。傳統的群體細胞分析檢測能更快速方便的獲得大量數據并利于進行有效的統計學分析,但是隨著研究的深入,這種基于群體細胞分析所獲得的平均性數據,往往忽略了細胞個體間的

    科學家將分類和測序人體所有細胞

      計算生物學家Aviv Regev 喜歡挑戰一些看似不可能完成的任務。2011年,她與分子遺傳學家Joshua Levin合作,測試了RNA測序的幾種方法。科學家希望找到這幾種技術的極限,以查看哪種方法表現最佳。最終,Levin指出,一些技術的靈敏度非常高,能檢測含量低于單細胞中含有的RNA量的樣

    2016值得關注的技術:綜合單細胞圖譜

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    高通量測序技術實現繪制人類視網膜高精度發育細胞圖譜

      人類胚胎發育從受精卵開始,經過著床前胚胎發育(胚內和胚外組織的產生),原腸胚產生(三胚層的特化)和器官發生等階段,最終新生兒出生。人類胚胎發育從單個細胞到上萬億個細胞,歷時二百八十天,整個過程的基因表達受到多種因素的精細調控,其中很多機制尚未明確。  為了解析人類胚胎發育各個階段的基因表達調控網

    湯富酬 喬杰再發文:繪制人類心臟高精度發育細胞圖譜

      人類胚胎發育是一個極其復雜的過程,從一個單細胞的受精卵開始,首先經過著床前胚胎發育產生胚內和胚外組織,再到著床后原腸胚階段三個胚層的特化,進而到器官發生、分化、成熟,及至新生命的誕生。整個兩百八十天的胚胎發育過程從一個單細胞受精卵增殖發育形成含有上萬億個細胞的嬰兒,期間基因表達受到嚴密、精準的調

    加州大學張鹍教授團隊合作繪制首份成人腎臟單細胞草圖

      自2006年在全世界第一個實現單細胞全基因組測序,華人科學家張鹍教授在單細胞測序領域的研究一直處于全球領先地位。2018年11月,張鹍教授團隊因在單細胞研究領域的杰出貢獻,榮獲美國國立衛生研究院(NIH)兩項共計1400萬美元的研究基金,用于構建單細胞水平的人體器官3D圖譜,推動精準醫學進入單細

    我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜

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    Nature | 肝硬化單細胞病理學全解析

      酗酒和乙型、丙型肝炎病毒感染是肝硬化最常見的原因。肝硬化最常見的癥狀是疲勞、虛弱、食欲不振和黃疸。世界上約有8億4千萬人患有各種肝臟疾病,每年的死亡人數高達兩百萬并且呈逐漸上升姿態【1】。無論何種原因導致的反復性肝損傷都會導致肝臟的纖維化,并最終引起肝硬化。而且,肝臟的纖維化程度越重,患者的預后

    Nat Comm| 張強鋒組利用人工智能算法分析單細胞ATAC-seq數據

      近年來,深度學習等人工智能技術在圖像識別,自然語言處理等領域取得了令人矚目的成就。人工智能技術應用于生命科學,對生物信息多個領域產生了重大的影響。深度學習算法借助于生命科學大數據的飛速發展,從海量大數據中自動高效地提取特征進行學習,極大超越了依賴人工提取特征的傳統人工智能算法,在醫療圖像處理、結

    單細胞研究指南:測序方法大比拼

      多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們,每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制,即使是同類型細胞,基因表達也會出現差異。  那么,細胞之間的哪些差異有生物學意義,哪些差異來自于技術偏好呢?要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢?這

    新年新氣象 2016值得關注的技術

      《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc

    9102,《Nature Methods》上scRNA-seq“天天”見

      《Nature Methods》是專門用來對生命科學研究領域具有顯著性意義的新方法和研究技術改進的經典雜志。單細胞轉錄組測序是2019年不折不扣的熱點領域,截至2019年9月,Nature Methods總共發表了10篇關于單細胞轉錄組測序相關的研究報道。本期,小編和大家一起分享這些重要的研究成

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