RNA實驗和方案新手必讀(五)
起始材料的有效破碎和勻漿對于所有總RNA分離操作來說都是必須的要求。破碎和勻漿是兩個獨立分開的步驟。破碎:對于組織結構、細胞壁和細胞質膜的徹底破碎對于釋放樣本中所有的RNA是絕對必要的。不同樣本需要使用不同的方法以達到徹底的破碎效果。不完全的破碎會導致RNA得率的顯著降低。勻漿:勻漿對于減少破碎后細胞裂解產物的粘性是十分必要的。勻漿能夠切斷高分子量的基因組DNA及其他高分子量的細胞組分,得到均勻的裂解產物。勻漿不夠徹底會導致RNA結合效率的下降而顯著降低得率。某些破碎方法能夠同時對樣本起到勻漿作用,而其他方法還是需要專門的勻漿步驟。表針對不同樣本進行破碎和勻漿的準則全面概述了適用于多種起始材料的不同破碎和勻漿方法。當您針對所使用的起始材料選擇合適的操作方法時,該表格可用來作為參考。下面也將針對破碎和勻漿方法進行更為詳細的論述。使用玻珠研磨機進行破碎和勻漿在使用玻珠研磨機破碎樣本的過程中,樣本與珠子被一起進行高速攪拌。通過珠子與細......閱讀全文
RNA干涉實驗
RNA 干涉(RNA1) 是指在真核細胞中引入雙鏈 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子從而導致具有序列同源性的基因產生特異件基內沉默(gene silencing ) 的現象。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理當確定了靶基因上的 siRN
RNA干涉實驗
實驗方法原理 當確定了靶基因上的 siRNA 分子作用位點以后,根據靶位點的序列可以很方便地推導得到相應的 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈序列。它們包含 19 bp 的互補雙鏈區和兩側的不配對區(每側為 2 個 U 成 2 個 T ),在合成時用 T 替代 U 可以降低成本并可以提
RNA干涉實驗
化學合成siRNA分子實驗 體外轉錄合成siRNA分子實驗 采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子 采用RNaseⅢ制備siRNA分子實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗方法
純化RNA實驗
從培養的細胞中純化總RNA 從組織中純化總RNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 細胞
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA實驗方法
Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci, Yale UniversityResuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et
RNA干擾實驗技術
實驗概要本文介紹了RNA干擾的原理及基本實驗方法,包括了siRNA的設計、siRNA的制備和siRNA的轉染等方法,及RNA干擾實驗中的注意事項。實驗原理近年來的研究表明,將與mRNA對應的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞,可以使mRNA發生特異性的降解,導致其相應的基因
病毒RNA提取實驗
病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯
真菌RNA提取實驗
真菌RNA的提取可以:(1)用于真菌RNA干擾機制研究;(2)用于cDNA文庫構建等研究;(3)用于真菌分子生物學相應研究。實驗方法原理液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
真菌RNA提取實驗
實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開。?實驗材料 菌絲體試劑、試劑盒 NaCl蒸餾水SDSTr
病毒RNA提取實驗
實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料 TMV病毒液試劑、試劑盒 TE-飽和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE緩沖液雙菌水儀器、耗材 冷凍臺式離心機低溫真空干燥儀電泳儀電泳槽實驗步驟 一、實驗
細菌RNA制備實驗
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 STET氯仿乙酸鈉氯化銫無水乙醇EDTA儀器、耗材 離心機分光光度計搖床實驗步驟 1. ?培養100 ml 大腸桿菌或500 ml 藍細菌至對數生長期,加入1/20體積終止緩沖液,置于冰上。2. ?于4℃用JA-10轉子17 700 g 離心5 min 收集細胞。3.
動物RNA提取實驗
實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA 純化系統)可在1小時內從組織、培養細胞和白細胞中提取純化完整總RNA,方法簡單、快速。該系統以膜為基礎,根據組織類型的不同,每次最多可純化60 mg 組織。系統包含DNase 處理步驟,直接在小離
總RNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一些公司推出的總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統采用兩種著名的RNA 酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的
動物RNA提取實驗
SV總RNA試劑盒提取法 Trizol試劑提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA
病毒RNA提取實驗
TE-飽和酚/氯仿提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲
細菌RNA制備實驗
革蘭氏陰性細菌中提取 革蘭氏陽性細菌中提取 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
植物RNA提取實驗
實驗方法原理 獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離心去除,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜,再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質去除,
植物RNA提取實驗
直接研磨法 液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過裂解液β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
總RNA提取實驗
實驗方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯合使用,將促使核蛋白復合體的解離,使RNA 與蛋白質分離,并將RNA 釋放到溶液中。而進一步從復合體中純化RNA ,則根據Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA 進入水相
真菌RNA提取實驗
液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
RNA點雜交實驗
實驗概要了解RNA點雜交實驗,包括純化的RNA的點雜交和狹線雜交,RNA斑點印跡。實驗步驟純化的RNA的點雜交和狹線雜交:1. 安裝印跡裝置?? 1) 切一張合適大小的帶正電荷尼龍膜。用鉛筆標上表示方向的記號。用水把膜簡單弄濕,在20×SSC中室溫泡1 h。?? 2) 在膜浸泡期間,先用0.1 mo
純化RNA實驗——從組織中純化總RNA
實驗材料組織試劑、試劑盒RNA 抽提緩沖液氯仿實驗步驟1. 從動物取下組織,直接進行第 2 步或在液氮中快速冷凍新鮮解剖的組織。冷凍后的組織可以貯存在 -70℃。2. 組織(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提緩沖液中勻漿。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均勻,冰浴 15 分鐘
動物RNA提取實驗原理
RNA提取技術不僅是分子生物學技術的重要組成部分,也是功能基因組 學科研技術的重要基礎。從RNA水平研究生物體內基因的調控機制,已成為分子生物學研究的一個重要手段。對某一生物或組織進行性狀研究,首先要獲得該性狀基因,從組織細胞中分離完整的RNA對于分子克隆 和基因表達分析等實驗是至關
RNA分離與分析實驗
實驗材料 標記細胞試劑、試劑盒 乙酸緩沖液儀器、耗材 漩渦器實驗步驟 1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,