九大測序平臺對比(四)
5.Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨機打斷成小片段,在每個小片段(~200 bp)的末端加上poly-dA,并于玻璃芯片上隨機固定多個poly-dT引物,其末端皆帶有熒光標記,以利于精確定位。首先,將小片段DNA模板與檢測芯片上的poly-dT引物進行雜交并精確定位,然后逐一加入熒光標記的末端終止子。這個終止子與Illumina的終止子可不一樣,不是四色的,是單色的,也就是說所有終止子都標有同一種染料。在摻入了單個熒光標記的核苷酸后,洗滌,單色成像,之后切開熒光染料和抑制基團,洗滌,加帽,允許下一個核苷酸的摻入。通過摻入、檢測和切除的反復循環,即可實時讀取大量序列。......閱讀全文
九大測序平臺對比(五)
7.The PacBio RS system企業: Pacific Biosciences推出時間: 2010年2月開始早期試用主流型號: PacBio RS樣品要求: 1kb以下500ng,純化的基因組 DNA, BACs, cDNA 文庫 或PCR 產物測序原理: 邊合成邊測序,single m
九大測序平臺對比(三)
4.HiSeq2000企業: Illumina推出時間: 2010/1/1主流型號: Illumina HiSeq2000樣品要求: 6ug/sample,無RNA、蛋白污染,無降解,OD260/OD280=1.8-2.0測序原理: 邊合成邊測序這種測序技術通過將基因組DNA的隨機片斷附著到光學透明
基因測序的云計算平臺
?? 自二代測序的技術問世以來,就一直是研究和臨床領域關注的重點。隨著整個行業的技術發展,二代測序也帶動了整個基因研究的產業鏈。在二代測序的產業鏈中,上游做檢測,中游做分析,下游做應用。在測序價格持續下降的情況下,中游測序數據的生物信息學分析成為了提高效率最大的瓶頸。 傳統的測序數據分析依賴于本地
九大測序平臺對比(二)
2.454企業: Roche推出時間: 2005年主流型號: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)樣品要求: 5 μg of DNA,濃度≥300 ng/μL測序原理:焦磷酸測序在測序時,使用了一種叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它
九大測序平臺對比(一)
1.sanger企業:Life Technology推出時間:1977年發明,1986年第一臺商業化測序儀主流型號:3730XL樣品要求:PCR產物:濃度≥50ng/ul 體積≥10ul;質粒:含量≥5ug;菌液:體積≥1ml。測序原理:雙脫氧鏈終止法:Sanger法測序的原理就是,每個反應含有所有
九大測序平臺對比(六)
8.PGM企業: Ion Torrent推出時間: 2010年主流型號: Ion Personal Genome Machine?(2010年)樣品要求: 5 μg DNA,起始DNA體積不超過130μL測序原理: 半導體芯片測序該測序儀使用了一種高密度半導體小孔芯片。該芯片置于一個離子敏感層和離子
九大測序平臺對比(四)
5.Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨
九大測序平臺對比(二)
Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨機打
九大測序平臺對比(一)
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq??sanger企業:Life Technology推出時間:1977年發明,1986年第一臺商業化測序儀主流
llumina高通量測序平臺的應用
Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收