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    活躍基因詮釋牡蠣生存智慧

    昨天凌晨,英國《自然》雜志網站在線發表了來自中國科學家的一項成果:他們完成了牡蠣的基因組測序,并從中窺視到了牡蠣應對極端生活環境的種種生存智慧。 牡蠣是動物界中的一大支系――冠輪動物(特點為身體柔軟,體型多變)的代表,是一種具有重要經濟、生態價值的貝類。論文通訊作者、中國科學院海洋研究所張國范研究員介紹,牡蠣是世界上養殖產量最大的海洋動物,而我國的產量占到世界的3/4。同時,它從水中濾食有機碎屑、浮游生物等,可幫助消除富營養化,對河口海岸的生態穩定有重要作用。此外,牡蠣有10對染色體,在貝類中屬于染色體比較簡單的,因此課題組決定選擇牡蠣作為研究對象。 他們聯合深圳華大基因研究院、美國新澤西州立大學等5個國家9個實驗室的80多位研究人員一起對牡蠣的基因組開展研究。經過4年多努力,在完成測序、分析基因的過程中,他們發現了造物主在牡蠣身上留下的許多“生存智慧”。 牡蠣生活在潮起潮落的海陸交界處、淺海泥沙中,生存環境十分惡劣......閱讀全文

    我國科學家發現黃花蒿首個染色體級別基因組圖譜

      瘧疾至今仍威脅著人類的健康。黃花蒿是全球普遍使用的抗瘧疾藥物——青蒿素的主要天然資源,保障全球優質廉價的青蒿素原料供應對于全球瘧疾防控有重要價值。但黃花蒿基因組雜合度和重復度很高,致使高質量的黃花蒿基因組組裝成為該領域難題。  在重大新藥創制科技重大專項、國家重點研發計劃“中醫藥現代化研究”重點

    染色體水平冬瓜參考基因組發布

    近日,廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data,廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者,廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基

    科學家獲取染色體級別的高質量橡膠樹參考基因組圖譜。

       橡膠樹(Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. )是大戟科(Euphorbiaceae)植物。在植物界大約2,500種產膠植物中(如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡膠草 Taraxacum kok-sagh

    研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組

      蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進

    染色體級別的銀杏參考基因組公開

    銀杏果實 曹福亮供圖  作為裸子植物銀杏綱唯一的孑遺物種,銀杏不僅具有特殊的科學研究價值,而且具有重要的應用價值。  近日,南京林業大學聯合中國農業科學院農業基因組研究所在《自然—植物》在線發表了染色體級別的銀杏參考基因組,是目前已發表的組裝質量最高的裸子植物參考基因組。  論文共同通訊作者、中國工

    科學家破譯藍鯨基因組

      新華社柏林4月8日電 藍鯨是地球上現存體型最大的動物。德國和瑞典研究人員最新報告說,他們破譯了藍鯨以及其他3種須鯨的完整基因組。   研究團隊在新一期美國《科學進展》雜志上發表了相關論文。他們認為,這將有助于科學界以“前所未有的細節”追尋藍鯨及其“親戚”的進化歷程。   須鯨包括藍鯨、座頭鯨

    科學家破譯藍鯨基因組

    ? 藍鯨是地球上現存體型最大的動物。德國和瑞典研究人員最新報告說,他們破譯了藍鯨以及其他3種須鯨的完整基因組。 研究團隊在新一期美國《科學進展》雜志上發表了相關論文。他們認為,這將有助于科學界以“前所未有的細節”追尋藍鯨及其“親戚”的進化歷程。 須鯨包括藍鯨、座頭鯨、灰鯨、長須鯨等種類。來自

    科學家首次成功合成酵母染色體

      由美、英、法等多國研究人員組成的科研小組27日宣布,他們成功合成了第一條能正常工作的酵母染色體。這一成果被譽為攀上了合成生物學的新高峰,也是向合成人造微生物等生命體邁出的一大步。   研究人員在新一期《科學》雜志上報告說,他們利用計算機輔助設計技術,歷時7年成功構造了源于釀酒酵母的被稱作syn

    科學家揭示Y染色體演化歷程

      4月24日,《自然》發表的兩篇論文給雄性的Y染色體演化和功能提供了新見解。眾所周知,Y染色體在演化歷史中丟失了大量基因,不過丟失基因的過程在大約2500萬年前停止了,留下了一組穩定的祖先基因。這兩篇文章共同指出,由于劑量原因,這些基因被“精心”保留下來,因為它們的功能和其他基因以及其他基因的產物

    上海師大團隊破解染色體級別基因組密碼

      中新網上海12月16日電 (記者 許婧)上海師范大學16日發布消息稱,該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化

    龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功

    ? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日,《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所(以下簡稱茶葉所)和中國農業科學院深圳農業基因組研究所(以下簡稱基因組所)主導并攜手中國科學院昆明動物研究所(以下簡稱昆

    染色體級別橡膠基因組研究揭秘乳膠生物合成

       橡膠樹是大戟科植物。在植物界大約2500種產膠植物中,橡膠樹產生的以聚異戊二烯為主要功能成分的天然膠乳約占全球天然橡膠的98% 以上。圖片來源于網絡  比起可能造成巨大環境污染的人工合成橡膠產業,天然橡膠因其良好的彈性、伸展性、耐老化等綜合理化性能而具有不可替代性,是任何國家必須具備的重要戰略

    昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組

      蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進

    染色體級別的鐵線蕨基因組首次繪制

       日前,中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內外8家科研院所首次繪制了染色體級別的鐵線蕨基因組,揭示了蕨類植物孢子發育、真葉植物起源和種子演化、茉莉素信號通路進化等分子機制。相關研究成果發表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子體和配子體均具有光合自養能力為主要特

    微陣列—比較基因組雜交技術檢測染色體異常

    【摘要】近年微陣列一比較基因組雜交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技術被應用到臨床細胞遺傳學領域。該技術是選擇DNA特殊片段作為靶,固化在載體上,形成密集、有序的分子微陣列。然后,從測試標本中提取DNA,將測試DNA

    用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗

    實驗方法原理比較基因組雜交(CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序,描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染(wcp)的常規熒光原位雜交(FISH)和多色FISH之處,是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源,而且還可將該片段定位于特定的染色體區帶

    我科學家破譯龍眼基因組

      記者11日從福建農林大學獲悉,該校賴鐘雄科研團隊的論文于牛津大學出版社出版的《Giga  Science》雜志上在線發表。這是首次在國際公布的龍眼全基因組數據庫,也是無患子科植物第一個全基因組數據庫,標志著我國在相關領域的研究處于國際領先水平。  據賴鐘雄研究員介紹,龍眼與近緣屬果樹荔枝、紅毛丹

    科學家完成柑橘基因組測序

      美國佛羅里達大學研究人員帶領的一個國際研究小組日前完成了對甜橙和克萊門氏小柑橘(為柑橘與酸柑雜交的品種)樹的基因測序工作,并公布了相關基因圖譜,這在柑橘屬果樹中尚屬首次。   研究人員稱,該基因圖譜的公布將有助于科學家找到新方法來對抗包括柑橘黃龍病(又稱黃枯病、青果病,對柑橘危

    科學家進行基因組測序 成功破譯金雕基因組

    ?? 作為一種知名度極高的猛禽,金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在,英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作,希望從基因層面深入了解這一物種,以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名,其成鳥的翼展平均超過2米,體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區

    科學家畢生研究鳥類染色體進化

      在過去25年間,每到夏季,生物學家Rusty Gonser就與妻子Elaina Tuttle都會到阿第倫達克山脈克蘭伯里湖的野外臺站。  現在,當把船系在搖搖晃晃的木碼頭后,Gonser聽到了熟悉的鳥鳴聲。這是白喉帶鹀在唱求偶歌。但他卻再也聽不到妻子的笑聲了,這是數十年來,Gonser第一次獨自

    用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(二)

    二、正常男性中期染色體標本的制備1.準備一個封閉環境,其相對濕度約55%(可在50%?60%變化),溫度24?26.5℃。2.將巴斯德吸管置于玻璃載片上方2?4in處,讓一滴細胞懸液滴在玻片的左側。然后迅速將第二滴細胞懸液滴在玻片右側(見注釋7)3.在固定液全部蒸發前,將玻片浸入盛有新鮮固定液的染色

    用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(三)

    六、中期染色體標本的變性1.在染色缸中加入大約50mL變性液,將染色缸放于75?76℃水浴中。預熱變性液使其溫度達到(73±2)℃。2.從-20℃冰箱中取出實驗所需的標本,室溫下系列乙醇脫水,各2min。3.室溫干燥片子(5min),或在實驗室抽風櫥中微風吹過標本使標本干燥。4.在37?40℃電熱板

    用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗(一)

    實驗方法原理 比較基因組雜交(CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序,描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染(wcp)的常規熒光原位雜交(FISH)和多色FISH之處,是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源,而且還可將該片段定位于特定的染色體區

    研究從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律

      染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜,但這些研究的分辨率比較低,尚沒有深入到精細的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以

    “六谷”豐登?——首個染色體水平基因組組裝完成

    中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 (Zizania latifolia) 原產于中國,屬于禾本科稻族菰屬,主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米,在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研

    象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展

    中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊,在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者,華

    象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展

    象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉類植物,原產于中國云南和東南亞地區,具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊,采用單分子納米孔、Illumina測序策略,結合染色體構像捕獲技術,發表了首個象腿蕉染

    鴨嘴獸基因組圖譜揭秘獨特的性染色體

      鴨嘴獸可能是世界上長得最奇怪的動物。據說,當歐洲學者第一次見到這種鴨子嘴、海貍尾、水獺足的動物時,他們認為這是一場精心設計的騙局。它看上去既像爬行動物又像哺乳動物,還像鳥類。實際上,它屬于稀有的單孔類動物。  鴨嘴獸不僅有一些奇特的身體特征,其新的基因組版本也強調了它一些不尋常的遺傳特性。在上周

    科學家啟動“獅虎豹基因組計劃”

      日前,我國科學家在深圳宣布啟動“獅虎豹基因組計劃”,將在1年內完成獅虎豹基因組的序列框架圖,并且在行為科學和保護生物學等眾多學科領域探索基因組測序成果的應用。計劃由深圳華大基因研究院、北京大學、黑龍江虎林園、中科院昆明動物所、美國圣·迭亞哥動物保護研究所等中外科學家共同發起并承擔。   深圳華

    科學家完成古老綠藻基因組測序

      已知最小的真核生物Micromonas之一的電子斷層切片( 0.5微米厚)   一個國際研究小組日前對兩株被認為屬于同一種藻類的古老綠藻進行了基因組測序,結果發現二者的基因只有90%相同。由于研究所用的綠藻位于真核生物生命樹底部,科學家認為,這一發現為研究藻類以及陸地植物的進化提供了新線索

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