北大尚永豐院士Cancercell發表癌癥研究新成果
來自北京大學醫學部、天津醫科大學的研究人員在新研究中揭示了,GATA3功能喪失促進乳腺癌轉移的分子機制。研究論文發表在5月28日的《癌細胞》(Cancer cell)雜志上。 北京大學醫學部的尚永豐(Yongfeng Shang)院士以及天津醫科大學的王艷(Yan Wang)教授是這篇論文的共同通訊作者。尚永豐院士主要研究方向是基因轉錄調控的表觀遺傳機制及性激素相關婦科腫瘤分子機理的研究。曾在世界上首次建立哺乳動物細胞染色質免疫沉淀技術(ChIP),為研究DNA與蛋白質的相互作用做出了重要貢獻。2009年當選中國科學院生命科學和醫學學部院士。王艷教授的研究方向為惡性腫瘤發生與轉移過程中的表觀遺傳轉錄調控機制。 乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一,據資料顯示,發病率占全身各種惡性腫瘤的7-10%。全世界每年約有120萬婦女發生乳腺癌,有50萬婦女死于乳腺癌,我國乳腺癌的發病率呈逐漸上升的趨勢。而大多數乳腺癌相關死亡都是由于癌......閱讀全文
轉錄組測序揭示乳腺癌重排
即將在本周《美國科學院院刊》(PNAS)的網絡版上發表的一篇論文中,一個國際研究小組介紹了一項利用高通量的轉錄組測序來發現乳腺癌細胞系中的基因組重排的原理論證研究。美國克萊格凡特研究院(J.Craig Venter Institute)、Lugwig癌癥研究所的三個分所、以及紐約斯隆-凱特琳癌癥
乳腺癌全轉錄組關聯分析發現新的風險基因
美國范德堡大學和澳大利亞昆士蘭醫學研究所(QIMR Berghofer)領導的研究團隊利用全轉錄組關聯分析方法,找到與乳腺癌存在明顯關聯的48個基因。這項成果于6月18日發表在《Nature Genetics》上。 研究人員利用近12.3萬名乳腺癌患者和近10.6萬名對照的遺傳預測基因表達譜
Cell子刊:轉錄因子SLUG有助于決定乳腺癌的類型
最近,塔夫斯大學醫學院、塔夫斯醫學中心、德克薩斯大學、北卡大學和麻省理工學院等處的研究人員在Cell期刊旗下《Stem Cell Reports》雜志發表論文表明,在乳腺組織的發育過程中,轉錄因子SLUG在調節干細胞功能的過程中發揮作用,并能夠決定乳腺細胞將會長成管腔細胞還是基底細胞。 他們所
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達;也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達,還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目:表征人類基因組,選擇的模式生物的D
RNA的轉錄和逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程,經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中,再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的,以RNA分子中的一條鏈為模板,在逆轉錄酶的作用下,以四種脫氧核苷酸為原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
RNA復制、轉錄與逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程,經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中,再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的,以RNA分子中的一條鏈為模板,在逆轉錄酶的作用下,以四種脫氧核苷酸為原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
昆明動物所揭示KLF5轉錄因子在乳腺癌中的功能和機制
轉移是導致乳腺癌患者死亡的主要原因,因此防治轉移是乳腺癌研究的關鍵。而在乳腺癌中,基底型ER/PR/HER2三陰性乳腺癌惡性程度最高,具有較高的侵襲性,術后復發轉移風險高,疾病進展快,目前還沒有找到有效的藥物治療靶標,是乳腺癌治療的瓶頸和研究的熱點。中國科學院昆明動物研究所研究員陳策實領導的腫瘤
轉錄因子的轉錄調控區的介紹
同一家族的轉錄因子之間的區別主要在轉錄調控區。 轉錄調控區包括轉錄激活區(transcription activation domain)和轉錄抑制區(transcription repression domain)二種。近年來,轉錄的激活區被深入研究。它們一般包含DNA結合區之外的30-10
關于體外轉錄的轉錄條件介紹
轉錄模板必須滿足: 1. 在基因組全長克隆過程中,在正向引物5‘末端添加T7啟動子序列; 2. 以T7啟動子作為體外轉錄啟動子,在啟動子后面靶位序列連續帶有3個G,轉錄效率最 高; 3. 在正向引物5/端添加一個帽子G,有利于提高體外轉錄RNA分子的侵染活性。
關于轉錄因子的轉錄抑制區的介紹
也是轉錄因子調控表達的重要位點,但是對其作用機理研究尚不深入。可能的作用方式有三種:1)與啟動子的調控位點結合,阻止其它轉錄因子的結合;2)作用于其它轉錄因子,抑制其它因子的作用;3)通過改變DNA的高級結構阻止轉錄的發生。 轉錄因子必須在核內作用,才能起到調控表達的目的。因此,轉錄因子上的核
體外轉錄
·?????????In Vitro RNA Transcription?(Promega)For?in vitro?preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f
輔助轉錄因子
中文名稱輔助轉錄因子英文名稱ancillary transcription factor定 義協助RNA聚合酶同啟動子結合,并促進已結合的RNA聚合酶啟動轉錄速率的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
核轉錄分析
實驗材料 cDNA0.45um 硝酸纖維素 尼龍膜 酵母 tRNA試劑、試劑盒 PBS NP-40 裂解緩: 20XSSC LNaOH 甘油儲存緩沖液 10X 轉錄緩沖液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 無 RNase 的 DNase
RNA-反轉錄
?實驗材料 poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin實驗步驟 一材料與設備1)p
CCAAT轉錄因子
中文名稱CCAAT轉錄因子英文名稱CCAAT transcription factor定 義可與啟動子中的CCAAT元件發生特異性相互作用的轉錄因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
轉錄因子組成
真核生物在轉錄時往往需要多種蛋白質因子的協助。一種蛋白質是不是轉錄結構的一部分往往是通過體外系統看它是否是轉錄起始所需要的。一般這些促成轉錄起始所需的轉錄結構包括三個重要的組成部分:亞基RNA聚合酶的亞基,它們是轉錄必須的,但并不對某一啟動子有特異性。復合物某些轉錄因子能與RNA聚合酶結合形成起始復
RNA-反轉錄
? ? ? ? ? ? 實驗材料 poly(A)+RNA 反轉錄酶 鼠源反轉酶 ?或禽源反轉錄酶 試劑、試劑盒 oligo
轉錄的特點
轉錄時,細胞通過堿基互補的原則來生成一條帶有互補堿基的mRNA,通過它攜帶密碼子到核糖體中可以實現蛋白質的合成。與DNA的復制相比,轉錄有很多相同或相似之處,亦有其自己的特點。轉錄中,一個基因會被讀取并復制為mRNA。就是說,以特定的DNA片段作為模板,以DNA依賴的RNA聚合酶作為催化劑,合成前體
核轉錄分析
? ? ? ? ? ? 實驗材料 cDNA 0.45um 硝酸纖維素 尼龍膜 酵母 tRNA 試劑、試劑盒 PBS
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息,從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile):指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
RNA的轉錄與逆轉錄相關介紹
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程,經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中,再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的,以RNA分子中的一條鏈為模板,在逆轉錄酶的作用下,以四種脫氧核苷酸為原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術,可以全面獲取樣本中轉錄產物信息,結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制, 進行聯合分析,深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
RNA復制的轉錄與逆轉錄的過程介紹
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程,經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中,再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的,以RNA分子中的一條鏈為模板,在逆轉錄酶的作用下,以四種脫氧核苷酸為原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
信使RNA的反轉錄酶與反轉錄過程
定義:以反義RNA為模版,通過反轉錄酶,進行的RNA轉錄 1.概念反轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程,也稱逆轉錄。這是DNA生物合成的一種特殊方式。 2.反轉錄酶與反轉錄過程 反轉錄過程由反轉錄酶催化,該酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。合
3.3-核轉錄分析
核轉錄失控分析時,在體外將細胞核分離出來,然后在放射性同位素標記的核苷酸存在下進行轉錄,所合成的 KNA 均因摻入同位素而被標記,此混合 RNA 與固定在硝酸纖維素濾膜 h 的某一特定甚因的 DNA 探針雜交,就可以反映出該基因的轉錄狀態和轉錄速率。實驗材料cDNA0.45um 硝酸纖維素 尼龍膜酵
RNA-大量轉錄合成
實驗材料 模板 DNA 或質粒試劑、試劑盒 TE TE 飽和酚 氯仿異內醇 3mol LNaAc 無水乙醇 5X 轉錄緩沖液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 異戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸銨 無水乙醇 乙醇實驗
什么是轉錄作圖?
中文名稱轉錄作圖英文名稱transcription mapping定 義標明轉錄物序列在基因組上的位置。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
什么是轉錄中止?
轉錄終止: 當RNA鏈延伸到轉錄終止位點時,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯鍵,RNA-DNA雜合物分離,轉錄泡瓦解,DNA恢復成雙鏈狀態,而RNA聚合酶和RNA鏈都被從模板上釋放出來,這就是轉錄的終止(termination。
胞外轉錄反應
實驗概要RNA聚合酶由一條多勝肽 ?(polypeptides)所構成,其在進行轉錄反應時所須辨認的啟動子長度僅20bp左右,而且轉錄起始位置非常明確,轉錄效能良好,成了目前進行胞外轉錄反應時的最佳選擇。要進行胞外轉錄反應時,僅需將目標基因次選殖 ? (subclone)至帶有SP6,T3或T7啟動
3.5-RNA-反轉錄
利用 RNA 模板通過反轉錄獲得 DNA,進而復制和感染細胞實驗材料poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT