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日前，我國科學家在國際上首次完成仿刺參基因組測序和組裝，對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義，將對我國刺參產業發展產生重要推動作用。 該成果由中國科學院海洋研究所研究員楊紅生團隊和相建海團隊共同完成，在天津生物芯片技術公司的技術支撐下，突破了刺參復雜基因組測序和組裝技術瓶頸，采用新一代測序技術獲得132Gb高質量DNA序列數據，覆蓋全基因組160倍。科研人員利用針對高復雜度基因組組裝的創新策略，在國際上首次成功完成了野生刺參的基因組組裝，目前獲得的框架圖總長度達到765Mb，組裝疊連群Contig N50達112Kb，該數值優于國際迄今已發表的多數水產動物基因組圖譜的指標。初步檢測表明，功能基因區覆蓋達95%以上。該項研究得到了國家科技部“973”、“863”計劃，國家基金委，中國科學院和山東省、青島市科技廳的資助。 早在上世紀50年代，海洋所科研人員就開展了海參的形態分類和經典生物學研究，查清了我國海參的分布和生......閱讀全文
近日，記者從中國科學院海洋研究所獲悉，我國科學家正式完成仿刺參基因組測序和組裝，這在國際上尚屬首次。該研究成果對刺參生物學和遺傳育種研究具有重要科學意義，對我國刺參產業發展將產生重要推動作用。 據了解，該項研究得到了國家科技部973 、863計劃，國家基金委，中國科學院和山東省科技廳、青島市
海參屬于棘皮動物，是其中體型與形態最為特殊的種類，且處于從無脊椎向脊椎動物分化的獨特進化地位，也是國內外重要的海產經濟物種，具有極高的營養與醫用價值。 10月12號，國際學術期刊PLoS Biology在線刊發了天津生物芯片參與的海參全基因組精細參考圖譜項目文章-“The sea cucumb
近日，中國科學院海洋研究所海洋動物生殖與遺傳工程課題組利用高通量測序技術，對凡納濱對蝦的基因組進行了基因組探查（Survey）分析，并在此基礎上成功構建全球標記密度最高的對蝦遺傳連鎖圖譜。 基因組探查（Survey）分析結果顯示，凡納濱對蝦基因組中重復序列和雜合度比例均很高，其高復雜度使得國際
中國科學院海洋研究所（以下簡稱中科院海洋所）科研團隊歷時10年成功破譯凡納濱對蝦（又稱南美白對蝦）基因組，并獲得高質量的對蝦基因組參考圖譜，研究成果日前在《自然—通訊》上在線發表。 中科院海洋所研究員相建海介紹，對蝦基因組是世界上公認的高復雜基因組，科研團隊嘗試了從一代到三代的各種基因組測序平
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊，與國內外多家單位共同合作，歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組，獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜，研究成果于1月21日在《自然-通訊》（Nature communications）在線發表，為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
希望組面向全球釋放三代測序數據高效糾錯、組裝軟件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1 （https://github.com/Nextomics/NextDenovo），并免費開放用于學術和其他非商業用途。據悉，本次希望組發布的最新版本NextDenovo是專為三代測序數據開發的糾
近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖
在DNA測序過去的40年中，我們見證了諸多技術的變革和測序規模的極度增長。從幾千個堿基到第一個人體基因組，乃至當前數以萬計的人體和無數其它的基因組。包括作為大量分子現象的“計數器”在內，DNA測序被廣泛和創造性地應用于各個領域。從長遠來看，我們可以預測DNA測序技術所帶來的影響將會與顯微鏡的使用
近日，由山東圣豐種業科技有限公司、廣東省農業科學院、山東省農業科學院和Macrogen千年基因聯合啟動的中國花生基因組計劃取得了階段性研究成果，該成果報告會于Macrogen千年基因圓滿舉辦。本次會議總結了中國花生基因組計劃的階段性研究成果及國際上花生基因組研究的進展，并討論了花生基因組計劃后期
不久前，中國科學院遺傳與發育生物學研究所發表于國際著名期刊《自然》的論文稱，該所研究團隊已完成小麥A基因組測序和染色體精細圖譜繪制。這是繼2013年，該團隊成功繪制出小麥A基因組祖先種烏拉爾圖小麥基因組草圖并發表于《自然》之后，在此領域的又一項重大成果。圖片來源于網絡 中國科學院遺傳與發育生
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊，與國內外多家單位共同合作，歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組，獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜，研究成果于1月21日在《自然-通訊》（Nature communications）在線發表，為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
近日，由廣東省農業科學院作物研究所梁炫強研究員、陳小平博士，山東省農業科學院花生研究所所長禹山林研究員及國際半干旱熱帶作物研究所(ICRISAT)基因組中心負責人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生轉錄組de novo測序的結果發表于Plant Biotechnology
10月11日，深圳華大基因研究院宣布，大熊貓晶晶的基因組框架圖繪制完成，這是世界首例用短序列進行新物種測序與組裝新技術完成的大型基因組序列圖。 深圳華大基因研究院大熊貓基因組項目負責人田埂博士在接受記者采訪時表示：“目前的基因組框架圖涵蓋基因組95%區域，覆蓋基因區約98%。雖然這還不是最終的基因
2010年下旬，河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布，向全國征集曹姓男性DNA樣本，擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子，基因組科學成為熱門，這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上，伴隨著2
⑵小麥基因組研究小麥是全球最重要的糧食作物之一，小麥的穩產和增產對我國乃至全世界糧食安全的影響舉足輕重。近年來由于全球氣候變化、環境變化的影響，小麥生產面臨嚴峻的挑戰，對于小麥的育種和品種改良工作提出了新的要求。普通小麥（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ Ｌ．）是３個不同亞基因組形成的異源
隨著疫情進入攻堅階段，基于實時熒光RT-PCR法的核酸檢測技術在新冠病毒快速鑒定及確診中發揮了重要作用。然而，若要對新冠病毒來源、變異進化及致病機理等進行研究，需獲取完整的病毒基因組信息，這離不開高通量測序和病毒序列組裝。 為全面深入地揭示新冠病毒的相關特性，華大智造可為新型冠狀病毒高通量
時間總是過得很快，2016年馬上就要過去了，迎接我們的將是嶄新的2017年，2016年，我國有很多優秀科研機構的科學家們都做出了意義重大、影響深遠的研究成果，發表在國際頂級期刊上。本文中小編盤點了2016年我國科學家發表的一些重磅級研究，以饕讀者。 --結構生物學 -- 1.清華大學 施一
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜已經由中國煙草完成。這是全球第一套煙草全基因組序列圖譜，也是繼馬鈴薯和番茄基因組之后全球完成的第三種茄科植物全基因組序列圖譜。該絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結果最好的2個圖譜。絨毛
十年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 英國時間12月9日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 這篇論文只有兩位作者，
10年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 12月10日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 論文作者、中國農業科學院農業
10年前，Illumina基因組測序技術進入市場時，前所未有的龐大數據量淘汰了較早開發的測序分析工具。 歷史總是重演。如今，第三代測序技術已經達到低成本群體測序規模的臨界點。 12月10日，《自然—方法學》在線發表了第一個能夠跟上基因組測序產生速度的組裝算法。 論文作者、中國農業科學院農業
來自中科院遺傳與發育生物學研究所，四川農業大學的研究人員發表了題為“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，對一個秈稻基因組蜀恢498（R498）進行PacBio單分子測序，結合遺傳圖譜和
第二代測序是當今應用最為廣泛的技術，但讀長短是它的軟肋，并且它無法解決高度雜合的基因組、高度重復序列、高GC區域、拷貝數變異、大的結構變異等問題。第三代測序技術避免了第二代測序讀長短的缺點，近年來漸漸被應用于各大研究中。以前談到第三代測序，也許你想到的是病毒基因組或細菌基因組測序，而如今隨著技
在過去的2016年，第三代測序獲得了完美突破，首次登上了太空，首次完成人類基因組測序，首次確定了二代測序未能檢測到的致病性大片段缺失突變，最終確診了一種罕見遺傳病......第三代測序也被Science納入2016年十大科學突破之一。 第三代測序技術避免了第二代測序讀長短的缺點，在臨床上具有無
藥源短缺成為限制臨床治療和新藥研發的最大瓶頸，因此，開發新的藥物來源途徑是迫切需要解決的問題。利用現代生物技術和次生代謝工程手段是未來生產藥物最有潛力的發展方向。我國藥用植物有1 萬多種，大多數藥用植物遺傳背景不清楚，基因組信息缺乏，遺傳信息和功能基因的研究亦極為薄弱。例如人參屬（Panax）
由山東圣豐種業科技有限公司、廣東省農業科學院作物研究所、山東省花生研究所、Macrogen千年基因等共同發起的中國花生基因組計劃目前已全面啟動，并在“第十一屆中國專利高新技術產品博覽會”上舉行了盛大的簽約儀式。該項目計劃于全球范圍內首次完成對花生A基因組的全基因組測序、組裝及序列結果的注釋。
由山東圣豐種業科技有限公司、廣東省農業科學院作物研究所、山東省花生研究所、Macrogen千年基因等共同發起的中國花生基因組計劃目前已全面啟動，并在“第十一屆中國專利高新技術產品博覽會”上舉行了盛大的簽約儀式。該項目計劃于全球范圍內首次完成對花生A基因組的全基因組測序、組裝及序列結果的注釋。
截至2019年12月23日，中國學者在Cell，Nature及Science在線發表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已經全部更新），iNature團隊對于這些文章做了系統的總結： 按雜志來劃分：Cell 發表了31篇，Nature 發表了44篇，Scie
作為世界三大糧食作物之一，小麥養活了全球40%的人口，提供人類營養所需的20%的熱能和蛋白質。 隨著基因組學的發展，水稻和玉米的基因組相繼被破譯，但關于小麥基因組的測序研究依然困難重重、進展緩慢，小麥基因組成了橫在科學家面前的一座大山。 中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工
OpGen公司今日宣布，通過利用ARGUS? Whole Genome Mapping System技術結合新一代測序技術(NGS)，生成了首個家山羊(domestic goat)的高質量參考基因組。這一研究是由深圳華大基因研究院和中科院昆明動物研究所領導，相關成果發表在《自然生物技術》