單細胞基因組測序如何實現：從實驗到分析，步步解析
隨著生命科學研究的微觀化，基于細胞群體的研究方法已不適用于某些研究領域（如腫瘤異質性、早期胚胎發育等）。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序，解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題，為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。 【應用概覽】 從2011年Navin等人將全基因組擴增技術與高通量測序技術結合起來進行乳腺癌細胞研究開始，單細胞基因組測序技術已逐漸被應用于神經科學、生殖系演化、器官發生、腫瘤、臨床診斷、免疫學、微生物學、組織嵌合、胚胎發育以及產前遺傳學診斷等研究領域，并被《自然方法》雜志( Nature Methods )列入2013年度值得期待的技術之一。單細胞測序發展歷程及出版物數量和類目[1]單細胞基因組測序技術被廣泛應用于生物科學和生物醫學領域[1] 【技術流程】 單細胞基因組測序主要包括四個步驟：單細胞分離→全基因組擴增→高通量測序→數據分析......閱讀全文
漫談單細胞測序及其臨床應用
一、概述隨著現代生物學的發展，細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題，為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的（即各細胞都是
單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助
單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來，然后移到合適的培養基進行培養，分離法對操作技術有比較高的要求，多限于高度專業化的科學研究中采用。 它不僅僅可以用于分離單細胞，還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選，對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞
Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用
9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆（上海）細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議，邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展，400余人報名參會，逾500人參加了會議，就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像，單細胞隔離，單細胞選擇功能于一體，自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管，PCR微孔板或其它反應微管中，在隔離單細胞后，它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像，采用倒置熒光顯微鏡，配備自動掃描顯微鏡載物臺，自
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
Science：單細胞分析？并行測序技術可以
近日，一項發表于國際雜志Science上的研究論文中，來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術，通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測；研究者表示，單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯，如果沒有這種分析的話，來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的
《自然—方法學》年度方法：單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道，將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重
Nature－methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術，可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
《細胞》：單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了來自一個成人男子91個
Nature新技術：CRISPR+單細胞測序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因（pooled CRISPR screens），可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因，同時編輯許多細胞，然后實驗篩選編輯細胞，gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物
解析古老的單細胞基因組
單細胞的古細菌用肉眼根本看不到，甚至在使用顯微鏡時，也必須特別用心才能觀察到它們。近日由丹麥奧爾胡斯大學地質微生物學中心領導的一個國際研究人員小組，卻成功地從海底淤泥中獲得了四個古細菌細胞，并繪制出了每個細胞的基因組圖譜。這一突破性研究成果發表在著名的《自然》(Nature)雜志上。 “直
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
一起來了解一下單細胞全基因組的測序技術吧
單細胞全基因組測序技術是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增，獲得高覆蓋率的完整的基因組后進行高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關系。 從方法學角度來看，獲得高覆蓋率高保真性的全基因組擴增產物是準確全面的測序結果的保障。多重置
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
Nature子刊：癌癥單細胞測序新技術
只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫，你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點，從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似，生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜，然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。 發布在7月22日《自然生物技術》(
單細胞研究指南：測序方法大比拼
??多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。??那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
單細胞測序預測化療的有效性
在近一項研究中，來自密歇根大學的Jun Hee Lee博士課題組使用一種單細胞RNA測序的技術，*展示了單個癌細胞群中的各個細胞對化學療法引起的DNA損傷的基因表達差異。他們發現，這些反應可以被分為三類：激控制細胞死亡，細胞分裂或應激反應。相關結果發表在近的《Cell Reports》雜志上。“不同
單細胞RNA測序發現新的免疫細胞
最近在《Nature Immunology》發表的一項新研究，詳細檢測了一組新發現的免疫細胞（被稱為ILC）。通過對單個扁桃體細胞的基因表達進行分析，瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們，發現了三個以前未知的ILC子群，并揭示了關于“這些細胞在人體中如何發揮功能”的更多信息。 先天淋巴細胞（ILC）是
計算小RNA分子的單細胞測序新法
最近，卡羅林斯卡學院的研究人員開發出了一種單細胞程序，測量了單個胚胎干細胞中短的非編碼RNA序列的絕對數量。這種新方法可以加深我們對于“基因是如何被調節、不同的細胞類型如何發展”的理解。相關研究結果發表在10月31日的《Nature Biotechnology》。當我們基因中的信息被使用時――例如構
單細胞測序有望揭示胃癌異質性
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514613.shtm
同濟大學發布單細胞測序新技術
單細胞轉錄組和甲基化組分析已經成為了單細胞研究的強大工具。然而，在單細胞中揭示DNA甲基化與基因表達的直接關聯還比較困難。這是因為細胞之間存在較大的差異，又不能同時檢測一個細胞的轉錄組和甲基化組。 加州大學范國平教授和同濟大學薛志剛教授領導團隊解決了這個問題。他們在五月五日的Geno
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
PNAS：單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表文章，介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法，他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型，并確定神經元的亞型。他們還觀察了
單細胞多組學高通量測序平臺（一）
一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息，如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程，而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息（如DNA層面的基因序列），從而解讀生物體運行機制，應用于疾病的診斷和治
單細胞研究指南：測序方法大比拼
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。The Scientist雜志最近聯系了單細胞研究領域的一些專家，請他們分享了在單細胞中進行轉錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構建文庫，處理和分析結果數據。 那么，細胞之間的哪
單細胞測序的主要步驟和特點介紹
單細胞測序的興起，不僅是新概念炒作，而是在相關領域，長時間由于技術的瓶頸很多生物學問題沒有解決，現在突然有一個技術可以高性價比地解決這些問題，導致這個技術被大量應用。 以單細胞轉錄組測序技術為例開展探討，單細胞轉錄組主要包括以下四個步驟，其中關鍵的一點就是如何進行單細胞的捕獲/分選，這是決定單細胞
單細胞測序的核心優勢及產品特點
單細胞測序技術被廣泛應用于基礎科研和臨床研究。單細胞在許多領域都占有一席之地，對于癌癥早期的診斷、追蹤以及個體化治療具有重要意義。 初次聽說細胞測序技術，又是什么噱頭？如果細胞測序就能測一個細胞或幾個細胞的話，這有什么意義？特別是對異質性高的腫瘤組織來講，測一個細胞能代表什么？ 無論是蠕蟲，藍
單細胞RNA測序，眾多研究都pick它
多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究，可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環