清華學者揭示新的mRNA翻譯終止機制
2016年12月1日,清華大學生命科學學院、結構生物學高精尖創新中心高寧課題組和合作者在《Nature》在線發表題為Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2的研究論文。該論文報道了大腸桿菌中non-stop mRNA在核糖體上的翻譯終止狀態復合物的高分辨冷凍電鏡結構,并揭示了ArfA在non-stop mRNA翻譯終止過程中的作用機制。 核糖體上的蛋白翻譯是一個非常復雜的過程,包括翻譯起始、延伸和終止等多步嚴密調控的步驟。在細菌中,當蛋白翻譯進行到mRNA上的終止密碼子時,翻譯終止因子RF1或RF2可以直接識別終止密碼子,結合到核糖體上的活性中心,催化釋放共價偶聯在肽酰tRNA 3’末端上的新生肽鏈,這個過程受RF1/RF2上保守的催化活性基序Gly-Gly-Gln(GGQ)序列的調控。在細胞中,由于......閱讀全文
基因翻譯的終止
本過程細胞主要需完成以下目標:(1)使翻譯停止,不再有新的氨基酸摻入;(2)釋放合成的多肽鏈;(3)釋放結合在mRNA上的各組分;(4)確保核糖體大小亞基以及重要因子的重復利用。原核細胞和真核細胞在此過程的處理上有明顯不同,下面將分開介紹。?(一)原核細胞A.肽鏈的釋放(1)釋放因子RF1/2 (t
簡述翻譯的終止目標
本過程細胞主要需完成以下目標: (1)使翻譯停止,不再有新的氨基酸摻入; (2)釋放合成的多肽鏈; (3)釋放結合在mRNA上的各組分; (4)確保核糖體大小亞基以及重要因子的重復利用。
關于真核細胞翻譯的終止過程
A. 肽鏈的釋放 (1)eRF3充當類似于eEF1(或EF-Tu)的作用,以GTP結合狀態結合到eRF1/2上; (2)通過eRF3的介導,eRF1/2被運輸到A位點; (3)eRF1/2識別終止密碼子(類似于tRNA的密碼子配對),正確的構象傳遞使得核糖體FBS和eRF3的GTP結合位點
關于原核細胞翻譯的終止過程
A.肽鏈的釋放 (1)釋放因子RF1/2 (tRNA結構類似)結合A位點,識別并匹配終止密碼子; (2)RF1/2的GGQ 基序(tRNA受體臂結構類似)催化肽鏈的脫離(以HOH替代HO-進行反應); (3)RF1/2進一步招募RF3·GDP結合到核糖體大亞基上; (4)RF3將GDP換
清華學者揭示新的mRNA翻譯終止機制
2016年12月1日,清華大學生命科學學院、結構生物學高精尖創新中心高寧課題組和合作者在《Nature》在線發表題為Mechanistic insights into the alternative translation termination by ArfA and RF2的研究論文。該論
蛋白質生物合成翻譯模板
不同mRNA序列的分子大小和堿基排列順序各不相同,但都具有5ˊ-端非翻譯區、開放閱讀框架區、和3ˊ-端非翻譯區;真核生物的mRNA的5ˊ-端還有帽子結構、3ˊ-端有長度不一的多聚腺苷酸(polyA)尾。帽子結構能與帽子結合,在翻譯時參與mRNA在核糖體上的定位結合,啟動蛋白質生物的合成;帽子結構和p
Science:蛋白質翻譯的真相
Yeshiva大學的科學家們開發了一個新熒光標記技術,首次確定了蛋白質合成的時間和地點。該技術允許研究者在活細胞中直接觀察mRNA分子翻譯成蛋白質的過程,有助于揭示蛋白質合成異常引發人類疾病的具體機制。這項研究發表在三月二十日的Science雜志上。 “過去我們一直沒能確切查明mRNA翻譯成蛋
關于體外翻譯翻譯系統的選擇介紹
雖然不是必須,但一般說,選用真核系統來翻譯真核序列,選用原核系統來翻譯原核序列。 如果一個系統存在功能上或抗原的交叉反應,就得選擇另一個系統。使用微粒體膜進行翻譯后修飾或加工一般只與兔網織紅細胞系統兼容。僅在某些特定條件下麥胚芽翻譯系統才與微粒體膜兼容。
翻譯后修飾
中文名翻譯后修飾外文名Post-translational modification定義翻譯后修飾是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說,這是蛋白質生物合成的較后步驟。
翻譯的起始
(一)原核細胞原核細胞的翻譯起始過程大概可以分為以下幾個過程:(1)翻譯起始因子IF3結合到小亞基的E位點,同時也橫跨至P位點;(這一過程在起始之初就已經完成)起始因子IF1結合至A位點;(2)起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位點;(3)起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密碼子
發現線粒體翻譯與細胞質翻譯協調機制
中科院生物物理所與中科院動物所、軍事醫學科學院以及天津科技大學等機構合作,揭示了線粒體翻譯與細胞質翻譯之間的“協調”機制。研究還揭示了一種全新的男性不育發病途徑,對男性不育臨床干預具有重要借鑒意義。相關成果4月11日在線發表于《自然—結構域分子生物學》期刊。生物物理所研究員秦燕為通訊作者,該所
Cell解析蛋白質翻譯調控機制
一個細胞的內部運作涉及到不計其數的單個分子,它們參與到重復循環的相互作用之中來維持生命。蛋白質形成就是這種生命活動的基礎。 賓夕法尼亞大學的Joshua B. Plotkin教授說,由于蛋白質是細胞功能的基礎構件,科學家們一直以來對于細胞生成蛋白質的機制都極其地感興趣。 “蛋白質
蛋白質易位之翻譯后易位
盡管大多數分泌蛋白是共翻譯易位的,但有些分泌蛋白在胞質溶膠中翻譯,然后通過翻譯后系統轉運到ER/質膜。在原核生物中,這一過程需要某些輔助因子,例如SecA和SecB,并由Sec62和Sec63(兩種膜結合蛋白)促進。嵌入ER膜中的Sec63復合物導致ATP水解,使伴侶蛋白與暴露的肽鏈結合,并將多肽滑
蛋白質易位之共翻譯易位
大多數分泌蛋白和膜結合蛋白是共翻譯易位的。駐留在內質網(ER)、高爾基體或內體中的蛋白質也使用共翻譯易位途徑。這個過程開始于蛋白質在核糖體上合成時,此時信號識別粒子(SRP)識別新生蛋白質的N端信號肽。SRP的結合會暫時停止合成,而核糖體-蛋白質復合物會轉移到真核生物ER上的SRP受體和原核生物的質
什么是翻譯調控?
在mRNA翻譯成蛋白質的水平上進行控制,包括控制蛋白質合成的速度、mRNA穩定性的控制、翻譯起始的控制等。
翻譯的生化基礎
翻譯的化學本質是單個氨基酸脫水縮合形成肽鏈,這一過程需要多種酶的參與。而在體內,多種酶參與的多種化學反應組成了翻譯的生物化學途徑。就化學層面來看,翻譯主要涉及到三個化學步驟:氨基酸的腺苷化(Amino Acid Adenylation)、tRNA裝載(tRNA charging)、肽鍵的形成。腺苷化
基因翻譯的延伸?
此過程在真核細胞和原核細胞中高度類似,下面只以原核細胞為例進行討論。涉及到的因子主要有EF·Tu和EF·G,在真核細胞中對應的名稱分別是是eEF1和eEF2。A. tRNA的轉運和入位(1)非起始AA·tRNA結合EF·Tu·GTP形成一個三元復合物;(2)該三元復合物結合至核糖體P位點,tRNA反
翻譯的過程簡述
翻譯過程需要的原料:mRNA、tRNA、21種氨基酸、能量、酶、核糖體。翻譯的過程大致可分作三個階段:起始、延長、終止。翻譯主要在細胞質內的核糖體中進行,氨基酸分子在氨基酰-tRNA合成酶的催化作用下與特定的轉運RNA結合并被帶到核糖體上。生成的多肽鏈(即氨基酸鏈)需要通過正確折疊形成蛋白質,許多蛋
A翻譯成中文
一、事由 今天2012年5月9日《北京青年報》C1版《天天副刊》,刊登了晉平先生的文章,其中有如下一段文字: 一次我的一個外國朋友問我“知道ABCD的A翻譯成中文是什么嗎?”在我滿頭霧水之后告訴我“A翻譯過來就是假的意思。”因為他在這里買的假貨都叫A貨。在豐富了知識的同時,我被他的幽默感嚇著
關于基因表達的翻譯調控和翻譯后調控的介紹
1、基因表達的翻譯調控 翻譯調控的效果不如轉錄調控或調控mRNA的穩定性,但也偶爾得到使用。抑制蛋白質翻譯是毒素和抗生素的主要作用目標,因此它們可以通過超越其正常的基因表達控制來殺死細胞。蛋白質合成抑制劑包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。 2、基因表達的翻譯后調控 翻譯后修飾(PTM)是對蛋
Science:本不應出現的蛋白挑戰翻譯法則
在額顳癡呆FTD(也稱額顳葉變性FTLD)和肌萎縮側索硬化ALS等遺傳性神經退行性疾病中,細胞內有一種神秘蛋白在累積。這些本不應被翻譯出來的蛋白很可能就使疾病中的罪魁禍首。現在,研究人員揭開了上述蛋白的神秘面紗,有望使它們成為治療的新靶標。 FTD 和ALS屬于同一類神經退行性疾病,二
蛋白質翻譯后修飾的驗證問題
Why are proteins, detected by mass spectrometry, not validated by site-specific antibodies?The modified motif could be detected by mass spectrometry (
關于翻譯后修飾蛋白質的介紹
前體蛋白是沒有活性的,常常要進行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學修飾和剪切。當合成蛋白質時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質。蛋白質的翻譯后蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、
清華大學高寧研究員Nature:揭示重要的翻譯終止機制
生物通報道:在核糖體翻譯mRNA的過程中,許多情況都會導致翻譯停頓,終止步驟也常常發生。除了細胞編程好的停頓以外,停在mRNA上的核糖體需要被終止和回收,以維持細胞的翻譯能力。 有很大一部分核糖體停頓來自于缺乏終止密碼子的異常mRNA。轉錄錯誤、初級轉錄本錯誤加工、以及mRNA錯誤剪切,都會形
翻譯水平上的調控
蛋白質合成翻譯階段的基因調控有三個方面:① 蛋白質合成起始速率的調控;② MRNA的識別;③?激素等外界因素的影響。蛋白質合成起始反應中要涉及到核糖體、mRNA蛋白質合成起始因子可溶性蛋白及tRNA,這些結構和諧統一才能完成蛋白質的生物合成。mRNA則起著重要的調控功能。真核生物mRNA的“掃描模式
機器能否扛起翻譯大旗
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454879.shtm 將英語逐出中學必修課的話題余音未了,谷歌翻譯就“翻車”了。 近日,谷歌翻譯對一份英文藥物說明譯出:“您可以根據疼痛程度使用盡可能多的反坦克導彈”的句子。有研究者發布了谷歌翻譯
概述翻譯的生化基礎
翻譯的化學本質是單個氨基酸脫水縮合形成肽鏈,這一過程需要多種酶的參與。而在體內,多種酶參與的多種化學反應組成了翻譯的生物化學途徑。就化學層面來看,翻譯主要涉及到三個化學步驟:氨基酸的腺苷化(Amino Acid Adenylation)、tRNA裝載(tRNA charging)、肽鍵的形成。
mRNA的轉運和翻譯
mRNA的轉運真核生物和原核生物之間的另一個區別是mRNA的轉運。由于真核轉錄和翻譯是在不同的細胞器內進行的,真核mRNA必須從細胞核輸出到細胞質。 這一過程可能受不同信號通路的調節。成熟的mRNA通過其加工的修飾被識別,在結合帽結合蛋白CBP20和CBP80及轉錄/輸出復合物(TREX)后通過核孔
共翻譯運輸的概念
中文名稱共翻譯運輸英文名稱cotranslational transport定 義分泌蛋白合成過程中肽鏈邊合成邊轉移至內質網腔中的運輸方式。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞生理(二級學科)
基因的翻譯表達1
1體外TNTRT7 轉錄/翻譯系統表達重組基因體外翻譯是研究基因表達、基因調控的一類重要技術,該技術可廣泛用于基因表達量、啟動序列等調控因子的確立,并結合PTT實驗篩選天然突變或人工誘變的基因片段,還可用來進行蛋白和DNA結合方面的研究。早期的體外翻譯研究大多是提取mRNA然后通過網織紅細胞或麥胚系