健康所在RNA結合蛋白調節信使RNA翻譯研究中取得新進展
近日,國際學術期刊Molecular and Cellular Biology在線發表了中科院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康所核酸與分子醫學研究組的最新研究進展:AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the Cooperation of Tristetraprolin and RCK/P54。 ARE-mRNA是3′-UTR區富含AU序列(AU-rich element, ARE)為特征的一類mRNA,它們在轉錄后水平受到多蛋白網絡多層次的嚴密調控。Tristetraprolin(TTP)是至今研究最為廣泛的ARE結合蛋白,其基因敲除小鼠會導致嚴重的自身免疫性疾病。已有研究表明,TTP調節ARE-mRNA的降解,但TTP是否通過其它機制調控ARE-mRNA的表達,尚不清楚。 祁美雁博士、研究生王志章等在荊清研究員的指導下,利......閱讀全文
RNA編輯的生物學意義
RNA編輯的生物學意義主要有:①校正作用,因4個核苷酸的插入移碼,使其肽鏈的序列和其他生物的相似;②調控翻譯,通過編輯可以引入或去除起始密碼子或終止密碼子;③擴充遺傳信息,經編輯后增加了肽鏈的編碼信息量。
信使RNA反轉錄的生物學意義
1.對分子生物學的中心法則進行了修正和補充,修正后的中心法則表示為: 2.在致癌病毒的研究中發現了癌基因,在人類一些癌細胞如膀胱癌、小細胞肺癌等細胞中,也分離出與病毒癌基因相同的堿基序列,稱為細胞癌基因或原癌基因。癌基因的發現為腫瘤發病機理的研究提供了很有前途的線索。 3.在實際工作中有助于
科學首次揭示“RNA編輯”生物學功能
棲息在南極冰冷海水中的章魚并沒有給自己的觸手帶上手套,但它卻找到了另一種方式來抵御寒冷。 一項新的研究表明,這種海洋生物利用一種被稱為核糖核酸(RNA)編輯的手段來定制在低溫下工作的關鍵神經系統蛋白質。這篇論文同時也第一次揭示了RNA編輯——不僅僅是改變一個特定的基因——能夠導致適應。
Nature聚焦小RNA-破解系統生物學大難題
最新一期的Nature Genetics在線版刊登了三篇文章,三個獨立的研究團隊解決了系統生物學理論中最重要的理論,三文章釋放了一系列的數據解答了系統生物學細胞定向分化的關鍵調控網絡。同期Nature配發了評論文章,FANTOM studies networks in cells。 系統生
Nature:小RNA生物學里程碑成果-解開piRNA生物合成謎題
PIWI相互作用的RNA,簡稱piRNAs,是一類小型的調控RNAs ——長度只有22–30個核苷酸的小塊核酸。它們可能很小,但是與它們相關的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能夠“沉默”轉座因子,所謂的自私基因,存在于植物、真菌和動物的基因組中。piRNA介導的沉默可以作用于染色質,以
“非編碼RNA在重大生物學過程中的功能和機制”
會議現場 6月5日至7日,主題為“非編碼RNA在重大生物學過程中的功能和機制”的香山科學會議第426次學術研討會在北京召開,會議邀請了多學科跨領域的專家學者與會,中心議題為非編碼RNA系統發現、功能鑒定及進化;非編碼 RNA與細胞分化發育與功能調控;非編碼RNA與重大疾病
Nature:小RNA生物學里程碑成果-解開piRNA生物合成謎題
PIWI相互作用的RNA,簡稱piRNAs,是一類小型的調控RNAs ——長度只有22–30個核苷酸的小塊核酸。它們可能很小,但是與它們相關的Argonaute蛋白一起,piRNAs就能夠“沉默”轉座因子,所謂的自私基因,存在于植物、真菌和動物的基因機制。 雖然科學家們很清楚piRNAs是如何
《自然—結構與分子生物學》:發現RNA調控基因新標靶
美國和加拿大科學家近日研究發現,RNA可以與DNA上稱為啟動子區(promoter region,位于實際基因前的一小段DNA片段)的非基因區相互作用。在基因被開啟前,啟動子必須先被激活。相關論文7月6日在線發表于《自然—結構與分子生物學》(Nature Structural and Molecul
挑戰生物學以往觀點-哺乳動物細胞可將RNA序列寫入DNA
美國費城托馬斯杰斐遜大學的研究人員首次發現,哺乳動物細胞可以將RNA序列轉換回DNA,這在病毒中比真核細胞更常見。這一發現可能會挑戰生物學長期以來的觀點,并可能對生物學的眾多領域產生廣泛影響。相關研究發表在6月11日的《科學進展》雜志上。 細胞含有一種機制,它可以將DNA復制成一組新的DNA,
我國科學家發現有重大生物學意義的全新RNA病毒
我國科學家從蜱中發現一種從未被報道過的分節段RNA病毒,該病毒在分類上可能代表著一個新病毒科。該病毒由中國疾控中心傳染病所張永振研究員及其研究團隊發現,文章日前發表在《美國科學院院報》雜志上,國際著名學術期刊《Nature Reviews Microbiology》高度評價了該論文的重要意義、《
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA
RNA標記
RNA labeling?(Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes??32P-pCp 3' End-labeling
RNA-Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
指導RNA
中文名稱指導RNA英文名稱guide RNA;gRNA定 義一種小分子RNA,約含60~80個核苷酸,在RNA編輯中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或刪除的信息。由小環DNA及大環DNA編碼的指導RNA均帶有編輯區的序列信息,可介導編輯過程。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調
RNA電泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and ?TransferUsing glyoxal
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
RNA標記
RNA標記是將標記物(如放射性同位素、熒光素或酶)共價地連接到RNA,通過檢測標記物,進而實現對RNA鑒別和檢測的目的。RNA標記在分子探針領域應用廣泛,在疾病診斷方面也很有前景。 理想的RNA標記方法應符合以下要求: 1. ?操作簡單,靈敏度高 2. ?不影響堿基配對的特異性 3. ?不影響RN
RNA降解
新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如? 果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2. 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組織
RNA電泳
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RNA-電泳
①電泳RNA 所用器械如制膠的模具、梳子、電泳槽等用肥皂粉洗干凈后用雙蒸水沖洗二遍后在室溫晾干備用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %瓊脂糖凝膠,倒膠時溴化乙錠(E直接加入凝膠中。③制備好的瓊脂糖凝膠板放入電泳槽后再加入經高壓滅菌過的1XTBE ,液面只能剛好同膠面平齊,緩沖液不要淹過膠面。④點樣