德科學家義舉:序列上網免費下載
西伯利亞的丹尼索瓦洞。 德國研究人員于2月7日在馬普學會進化人類學研究所網站上貼出了一個滅絕人類基因組的首個高分辨率版本。他們的目標就是讓同行能夠免費下載最完整的序列數據。 1年前,研究人員公布了至少3萬年前生活在西伯利亞丹尼索瓦洞中的一名史前女孩的首張基因組草圖。 今年1月,馬普學會的古基因學家Svante Paabo在瑞典參加一次會議時注意到,其他實驗室的研究人員還在關注這個1年前發布的序列數據,而與他的同事在實驗室用更靈敏的新方法對序列的古DNA進行分析后得出的結果相比,前者遠不是那么完整。Paabo說:“在得知我們已經擁有了相同基因組的更佳版本,并且他們要再過幾個月才能夠使用時,我感到很難受。” 因此,Paabo及其同事決定允許他們的同行下載該序列數據的高分辨率版本——盡管他們正在準備發表一篇有關該基因組研究的論文。利用從史前女孩的手指骨中提取的不足10毫克的DNA,研究小組......閱讀全文
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定
前導序列
中文名前導序列外文名leader sequence前導序列是結構基因中編碼區之前的一段序列,這部分序列能被轉錄,但不被翻譯,在mRNA是從5′端起至結構基因第一編碼子開始點(通常 AUG)為止,在蛋白質合成過程中不被翻譯。
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱,他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序,繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱,這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程,對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?(記者張夢然)美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具,用于組裝來自各種物種的真正完整(即無縫)的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
-震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤!
?震驚!Genbank參考基因組序列多處錯誤! 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低,全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源,但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用,使得基因組數據面臨很多問題。 近日,約翰霍
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明,白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道,加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中,對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因,從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一,提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖,但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上,兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列,以及小麥染色體3B基因組序列,另外兩個研究小組
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,
《Genome-Research》:根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型,與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性,破壞宿主細胞膜和粘附的能力,粘附到人體組織的能力,是許多細菌病原體的主要毒力因子,包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌,自從上世紀40
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列(論文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示,該病毒與此前在
核酸序列分析
【實驗目的】1、?掌握已知或未知序列接受號的核酸序列檢索的基本步驟;2、?掌握使用BioEdit軟件進行核酸序列的基本分析;3、?熟悉基于核酸序列比對分析的真核基因結構分析(內含子/外顯子分析);4、?了解基因的電子表達譜分析。【實驗原理】針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因,找出基因的位置和
沖激序列信號與階躍序列信號各有什么特性
單位脈沖序列只在n=0 處有一個單位值1,其余點上皆為0;單位階躍序列只有在n>=0時,才取非零值1,當n
設計引物用cds序列和cdna序列的區別
cDNA和mRNA的序列是互補的,如果用兩個引物,最后的兩條DNA序列分別對應于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向從5‘至3’,所以兩個引物對應于mRNA和cDNA中相應序列即可。
《自然》:美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
科學家破譯“純種馬”基因組序列
馬有90多種遺傳疾病與人類的遺傳疾病相似??? ? ?一個國際科研小組11月5日報告說,他們破譯了“純種馬”的基因組序列。這項研究成果將刊登在6日出版的新一期《科學》雜志上。??? ? ?報告中所指的“純種馬”最早是300多年前英國培育的一種名貴賽馬品種,后被一些歐美和亞洲國家引進,主要用于賽馬和馬
首次測定南極抗凍魚基因組序列
近,包括美國東北大學H. William Detrich教授在內的一個國際研究小組,首次測定了南極抗凍魚(Antarctic notothenioid fish)的基因組序列。他說,這一突破性成果,將闡明動物對寒冷水域獨特的進化適應性,將有助于揭示魚類如何應對海水溫度上升,由于氣候變化,預計接下
三篇Nature-Methods:定位基因組的調控序列
科學家們利用染色質對DNase消化和Tn5轉座的敏感性,對基因組的調控序列進行定位和解讀。 近來越來越多的證據顯示,許多遺傳學差異并非直接影響基因,而是改變控制基因開/關的調控序列。近期Nature Methods雜志上發表了三篇文章,介紹了在基因組中定位調控序列的新技術,闡述了進行數
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日,深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜,這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后,我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只,這一研究成果將對于挽救和保護朱
科學家完成辣椒全基因組序列測定
由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文,今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表,標志著辣椒基因組序列成功解碼,我國辣椒基礎性研究取得重大進展,進入分子育種階段。 美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學
首個完整人類基因組序列公布
? 由美國國家人類基因組研究所、加利福尼亞大學圣克魯斯分校、華盛頓大學等機構研究人員領銜的國際科研團隊3月31日公布了首個完整、無間隙的人類基因組序列。與這項重大成果相關的6篇論文當天發表在美國《科學》雜志上。美國國家人類基因組研究所在一份公報中表示,人類基因組含有約30億個DNA(脫氧核
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示,他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型,因此,最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
DNA微序列技術
·?????????Protocols for Making Drosophila Arrays?(Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,?
AluI序列的定義
人基因組約有50萬~70萬份拷貝,AluI序列長282個核苷酸,由兩個同源但略有差別的亞基組成。
DNA-序列分析技術
試劑、試劑盒 瓊脂糖TE 水飽和酚無水乙醇70%乙醇TEMED測序酶溴化乙錠儀器、耗材 電泳儀離心管離心機冰浴箱恒溫板DNA 測序儀